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干扰素诱导基因IFIT1与卵巢癌免疫浸润及预后的相关性
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作者 王瑞伟 李凤杰 +5 位作者 梁小龙 周鑫 刘丽萍 李秋蓉 何明敏 李宇迪 《陆军军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第10期1132-1141,共10页
目的探讨干扰素诱导基因IFIT1与卵巢癌免疫浸润及预后的相关性。方法通过GEO数据库筛选肿瘤免疫相关基因,Kaplan-Meier与Prognoscan预后数据库筛选与卵巢癌预后显著相关的差异基因。GEPIA、Human Protein Atlas与Timer数据库分析IFIT1... 目的探讨干扰素诱导基因IFIT1与卵巢癌免疫浸润及预后的相关性。方法通过GEO数据库筛选肿瘤免疫相关基因,Kaplan-Meier与Prognoscan预后数据库筛选与卵巢癌预后显著相关的差异基因。GEPIA、Human Protein Atlas与Timer数据库分析IFIT1在卵巢癌组织与正常组织中的表达差异。UALCAN数据库分析IFIT1在不同分级和分期的卵巢癌组织中的表达情况。David数据库对String和Genemania数据库筛选的相互作用基因与蛋白进行GO富集分析。Timer和Tisidb数据库相互验证IFIT1与免疫细胞的相关性。IFIT1干扰质粒成功构建后,利用IFIT1干扰稳转株构建裸鼠移植瘤模型,观察IFIT1敲降后肿瘤生长情况,免疫组化检测中性粒细胞浸润。结果GEO数据库、Kaplan-Meier与Prognoscan预后数据库筛选出IFIT1是与卵巢癌预后显著负相关的肿瘤免疫基因。GEPIA、Human Protein Atlas、Timer数据库以及UALCAN数据库表明IFIT1在卵巢癌组织中表达显著高于正常卵巢组织(P<0.05),但与肿瘤的分期、分级并不存在显著相关性。String、Genemania、David数据库分析发现IFIT1的互作基因与蛋白富集于2’-5’寡聚腺苷酸合成酶的活化、病毒防御、先天性免疫等过程。Timer数据库表明IFIT1与卵巢癌中CD8+T细胞、B细胞、树突状细胞、中性粒细胞和巨噬细胞浸润呈正相关,其中与中性粒细胞相关性最为明显(P<0.001)。Tisidb与GSCA均验证了IFIT1与卵巢癌组织的中性粒细胞浸润呈高度正相关(P<0.05)。RT-qPCR和Western blot证明卵巢癌细胞中IFIT1被成功敲降后,IFIT1干扰细胞的移植瘤生长显著减缓(P<0.05),肿瘤中性粒细胞浸润减少。结论IFIT1可能促进中性粒细胞浸润影响卵巢癌的恶性进程。 展开更多
关键词 卵巢癌 干扰素诱导的四肽重复蛋白1 生信分析 免疫浸润 中性粒细胞
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三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2在肺癌中的表达及其临床意义 被引量:1
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作者 苏文雅 冯珺 +4 位作者 范佳琳 陈陆俊 吴昌平 蒋敬庭 王智刚 《临床检验杂志》 CAS 2019年第6期407-412,共6页
目的研究三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2,IFIT2)在肺癌组织中的表达,并分析其表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。方法用组织芯片技术和免疫组织化学染色法分别检... 目的研究三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2(interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2,IFIT2)在肺癌组织中的表达,并分析其表达水平与患者临床病理特征及预后的关系。方法用组织芯片技术和免疫组织化学染色法分别检测90例肺腺癌、78例肺鳞癌组织,以及相应癌旁组织中IFIT2的表达,用Wilcoxon秩和检验比较肺癌及癌旁组织中IFIT2表达水平的差异,χ^2检验分析肺癌组织中IFIT2表达水平与患者临床病理特征的关系,用Kaplan-Meier生存分析法分析IFIT2表达水平与患者预后的关系,拟合Cox模型评价不同指标与患者预后的关系。结果 IFIT2在肺腺癌、肺鳞癌组织中不表达和低表达为主,在癌旁组织中高表达,在癌组织及癌旁组织中的表达差异有统计学意义(P<0.01);IFIT2染色强度与肺腺癌、肺鳞癌患者临床病理特征无相关性(P>0.05);Kaplan-Merier生存分析显示,在肺腺癌中,IFIT2低表达患者总生存期(OS)较IFIT2高表达患者短(HR=2.392,95%CI:1.103~5.186,P=0.027),多因素Cox比例风险模型显示,远处转移(HR=8.033,95%CI:3.664~17.614,P=0.000)可作为肺腺癌患者预后评判的独立风险因素;在肺鳞癌中,IFIT2低表达患者总生存期(OS)较IFIT2高表达患者短(HR=2.907,95%CI:1.118~7.559,P=0.029),多因素Cox比例风险模型显示,淋巴结转移(HR=3.390,95%CI:1.029~11.175,P=0.045)和IFIT2低表达(HR=3.762,95%CI:1.236~11.451,P=0.020)均可作为肺鳞癌患者预后评判的独立风险因素。结论 IFIT2在肺癌组织中下调表达,提示其在肺癌发生发展过程中发挥重要作用,可作为肺癌患者预后评估的重要因素。 展开更多
关键词 肺癌 三角形重复干扰素诱导蛋白2 组织芯片 预后
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IFIT1负反馈上调干扰素β表达促进抗HSV-1病毒保护 被引量:2
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作者 方义军 胡好 +2 位作者 蔡少丽 丰志华 傅雅娟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期88-96,共9页
Ⅰ型单纯疱疹病毒(HSV-1)是危害人类健康的常见病原体之一,能够通过受损皮肤或黏膜感染宿主细胞并引起多种疾病。HSV-1的侵入激活先天免疫模式识别受体,诱导干扰素β(IFN-β)的产生,通过表达干扰素刺激基因(ISG)发挥抗病毒功能。近年来... Ⅰ型单纯疱疹病毒(HSV-1)是危害人类健康的常见病原体之一,能够通过受损皮肤或黏膜感染宿主细胞并引起多种疾病。HSV-1的侵入激活先天免疫模式识别受体,诱导干扰素β(IFN-β)的产生,通过表达干扰素刺激基因(ISG)发挥抗病毒功能。近年来,干扰素诱导的四肽重复蛋白1(IFIT1)在病毒感染过程中的作用引起了广大研究者的关注。然而,其具体机制尚未完全清楚。本研究利用CRISPR/Cas9技术构建了小鼠成纤维细胞(L929)IFIT1敲除细胞株,免疫印迹方法检测敲除细胞株IFIT1在蛋白质水平的表达。转染HT-DNA和Poly[I:C]刺激L929 WT和IFIT1敲除细胞株,实时定量PCR技术检测发现,HT-DNA刺激敲除细胞时,IFN-β及下游ISGs的表达量显著升高。IFN-β的表达量比L929-WT组平均高出13.4倍,IFIT1和趋化因子10(CXC chemokine ligand-10,CXCL10)的表达量比L929 WT组分别平均高出6.7倍和21倍(P<0.001),而Poly[I:C]刺激无明显变化(P>0.05),表明IFIT1是通过DNA信号通路来行使其负反馈调节作用。为研究IFIT1基因的抗病毒作用,利用CRISPR/Cas9技术改造的HSV-1-VP26-mCherry病毒感染该敲除细胞株,通过测定病毒荧光数及病毒拷贝数,发现IFIT1敲除细胞株与L929 WT细胞相比,存活率提高了60%(P<0.001),病毒增殖能力在48 h后降低28.6倍(P<0.001)。该结果表明,IFIT1基因的缺失有利于抵抗HSV-1的感染。综上所述,IFIT1通过DNA信号通路负反馈上调IFN-β及ISG的表达,IFIT1的缺失对病毒入侵发挥了保护作用。该结果为后续研究开发治疗HSV-1感染相关的治疗药物提供了一个新思路。 展开更多
关键词 Ⅰ型单纯疱疹病毒 CRISPR/Cas9 干扰素诱导的四肽重复蛋白1 干扰素Β
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三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2在食管癌组织中表达及临床意义 被引量:2
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作者 徐婷 吴敏 +5 位作者 陈陆俊 郑晓 胡文蔚 徐斌 蒋敬庭 吴昌平 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期1113-1116,共4页
目的 观察三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2(IFIT2)在食管癌组织中的表达,探讨IFIT2与食管癌患者临床指标及预后的关系.方法 采用免疫组织化学法检测99例食管癌组织芯点及4例正常食管组织中的IFIT2表达,并分析其临床意义,运用Cox模型分... 目的 观察三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2(IFIT2)在食管癌组织中的表达,探讨IFIT2与食管癌患者临床指标及预后的关系.方法 采用免疫组织化学法检测99例食管癌组织芯点及4例正常食管组织中的IFIT2表达,并分析其临床意义,运用Cox模型分析其与食管癌患者死亡的相关性.结果 IFIT2主要表达于食管癌细胞及食管正常组织的细胞质和细胞核,在食管癌肿瘤细胞中呈低表达为主,在正常的食管上皮细胞中呈高表达为主.男性患者IFIT2染色H-score≥50的比率显著高于女性患者(x^2=9.349,P<0.01);IFIT2染色强度与年龄、T分期、淋巴结转移、远处转移、TNM分期、肿瘤大小等预后相关因素的关系差异均无统计学意义(P>0.05).Log-rank生存分析结果显示,IFIT2高表达组[57.16(50.83 ~63.50)个月]比低表达组[41.58(31.36 ~51.80)个月]平均术后生存时间显著延长15.58个月,差异有统计学意义(x^2=6.531,P<0.05).食管癌组织多因素Cox模型分析显示,IFIT2是食管癌独立的正性预后因素[风险比(HR) =0.41,95%可信区间(CI):0.19 ~0.88,P<0.05].结论 IFIT2在食管癌中呈低表达,其对食管癌的预后判断具有潜在价值. 展开更多
关键词 食管癌 三角形重复干扰素诱导蛋白2 组织芯片 预后
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三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2在胃癌组织中的表达及预后 被引量:1
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作者 谢荃沁 陈陆俊 +3 位作者 熊玉琪 吴晨 郑晓 蒋敬庭 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期202-204,共3页
目的探讨三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2(IFIT2)在胃癌组织中的表达,并分析IFIT2的表达水平与胃癌患者临床病理特征及预后的关系。 方法采用免疫组织化学染色法检测胃癌组织芯片中90例胃癌组织和对应癌旁组织中IFIT2的表达,采用秩... 目的探讨三角形四肽重复干扰素诱导蛋白2(IFIT2)在胃癌组织中的表达,并分析IFIT2的表达水平与胃癌患者临床病理特征及预后的关系。 方法采用免疫组织化学染色法检测胃癌组织芯片中90例胃癌组织和对应癌旁组织中IFIT2的表达,采用秩和检验比较胃癌及癌旁组织中IFIT2表达水平的差异,χ2检验分析IFIT2表达水平与患者临床病理特征的关系,采用Kaplan-Meier生存分析法分析IFIT2表达水平与患者总生存期关系,拟合Cox模型评价不同指标与患者预后的关系。 结果胃癌组织中IFIT2高表达比例(77.4%)显著低于癌旁组织(95.20%),差异有统计学意义(χ2=11.334,P=0.001)。Ⅲ~Ⅳ期胃癌组织中IFIT2高表达比例(72.00%)显著低于Ⅰ~Ⅱ期胃癌组织(90.91%),差异有统计学意义(χ2=4.364,P=0.037)。IFIT2高表达较IFIT2低表达胃癌患者总生存期(OS)延长,差异有统计学意义(χ2=10.990,P=0.001)。Cox模型分析结果显示远处转移[风险比(HR)=2.693,95%可信区间(CI):1.164~6.232,P=0.021]、IFIT2高表达(HR=0.350,95%CI:0.169~0.727,P=0.005)可作为胃癌患者的预后因素。 结论IFIT2在胃癌的发生及发展中具有重要作用,可作为胃癌患者预后评估的重要风险因素。 展开更多
关键词 胃癌 三角形重复干扰素诱导蛋白2 预后
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干扰素诱导的三角形四肽重复蛋白2抗体基因在胃癌进展中的作用
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作者 翟文斯 陈陆俊 +5 位作者 郑晓 胡文蔚 吴晨 王琦 卢斌峰 蒋敬庭 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期638-641,共4页
目的探讨干扰素诱导的三角形四肽重复蛋白2抗体(IFIT2)在人胃癌进展中的作用及机制。 方法通过使用RNA干扰(RNAi)技术构建IFIT2稳定下调表达的人胃癌细胞株SGC-7901及AGS,聚合酶链反应(PCR)和Western blot分别在RNA水平和蛋白... 目的探讨干扰素诱导的三角形四肽重复蛋白2抗体(IFIT2)在人胃癌进展中的作用及机制。 方法通过使用RNA干扰(RNAi)技术构建IFIT2稳定下调表达的人胃癌细胞株SGC-7901及AGS,聚合酶链反应(PCR)和Western blot分别在RNA水平和蛋白水平验证两株细胞株LV-IFIT2-短发卡RNA(shRNA)组的IFIT2的表达水平,进一步研究IFIT2在人胃癌细胞株中的生物学功能。 结果Real-time PCR检测结果显示,SGC-7901以及AGS细胞系中LV-IFIT2-shRNA组IFIT2 mRNA表达水平均显著低于LV-NC组(SGC-7901:0.426±0.140比1.000±0.157,P=0.004;AGS:0.232±0.090比1.000±0.194,P=0.003);蛋白质印迹检测结果显示,SGC-7901以及AGS细胞系中LV-IFIT2-shRNA组的IFIT2的蛋白表达水平均显著低于LV-NC组(SGC-7901:0.344±0.041比1.000±0.062,P=0.002;AGS:0.091±0.001比1.000±0.106,P=0.000)。对稳定转染LV-IFIT2-shRNA及LV-NC的人胃癌细胞系SGC-7901和AGS进行CCK-8增殖实验、划痕实验、Transwell实验和细胞周期测定。在培养的48、72 h shRNA组的吸光度值显著高于LV-NC组,提示下调IFIT2的表达可以显著抑制人胃癌细胞系SGC-7901和AGS的增殖能力(SGC-7901:48 h:0.348±0.031比0.276±0.026,P=0.013;72 h:0.523±0.042比0.411±0.027,P=0.004;AGS:48 h:0.454±0.034比0.362±0.038,P=0.011;72 h:0.696±0.053比0.553±0.030,P=0.003);划痕实验显示SGC-7901和AGS细胞IFIT2干扰组的迁移能力明显高于NC组的迁移能力,提示IFIT2表达的降低可明显增强SGC-7901和AGS细胞的迁移能力(SGC-7901:0.640±0.029比0.447±0.056,P=0.006;AGS:0.444±0.036比0.166±0.034,P=0.001);Transwell侵袭实验中,LV-IFIT2-shRNA组的结晶紫染色迁移细胞数明显多于LV-NC组,表明SGC-7901和AGS细胞下调IFIT2表达后的侵袭能力提高(SGC-7901:299.3±45.6比162.3±25.9,P=0.011;AGS:404.0±44.5比235.0±30.0,P=0.003);流式细胞术分析细胞周期显示,LV-IFIT2-shRNA组的S期细胞比例高于LV-NC组,提示人胃癌细胞系中IFIT2的敲除可显著影响细胞周期。 结论IFIT2表达降低可促进胃癌进展,并可预测患者的不良预后。 展开更多
关键词 干扰素诱导的三角形重复蛋白2抗体 胃癌 RNA干扰
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IFIT1通过激活Wnt/β-catenin通路促进胆管癌进展 被引量:2
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作者 王鹏 张迪 +3 位作者 黄嘉槟 刘均立 洪健 向国安 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期769-778,共10页
目的:探讨干扰素诱导的三十四肽重复蛋白1(IFIT1)对胆管癌进展的影响及其调控机制。方法:RT-qPCR和Western blot法分别测定人正常胆管上皮细胞系HIBEpiC和6种不同分化程度胆管癌细胞系中IFIT1的mRNA和蛋白表达水平;检测人胆管癌和癌旁... 目的:探讨干扰素诱导的三十四肽重复蛋白1(IFIT1)对胆管癌进展的影响及其调控机制。方法:RT-qPCR和Western blot法分别测定人正常胆管上皮细胞系HIBEpiC和6种不同分化程度胆管癌细胞系中IFIT1的mRNA和蛋白表达水平;检测人胆管癌和癌旁组织中IFIT1的表达水平,分析其与临床病理特征的相关性及预后价值。采用CCK-8、平板集落和Transwell实验检测IFIT1下调对胆管癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响;选用胆管癌细胞系HuCCT1构建IFIT1稳定敲减的细胞株,分别采用裸鼠皮下移植瘤及肺转移瘤模型,观察IFIT1对胆管癌生长及转移的影响。通过公共数据库基因富集分析富集于IFIT1的相关信号通路,并进行验证。结果:相对于正常胆管上皮细胞和低侵袭性的胆管癌细胞系,高侵袭性的胆管癌细胞系中IFIT1呈高表达;人胆管癌组织中IFIT1表达水平显著高于癌旁组织(P<0.01),且与肿瘤恶性特征(肿瘤大小、淋巴结转移和肿瘤TNM分期)呈正相关,肿瘤组织中IFIT1高表达的患者总生存期相对较短(P<0.01)。IFIT1下调显著抑制胆管癌细胞的增殖、迁移和侵袭。在皮下移植瘤模型中,敲减IFIT1后皮下移植瘤生长速度减慢,体积缩小,重量减轻(P<0.01);在尾静脉肺转移瘤模型中,敲减IFIT1可显著减少裸鼠肺表面转移瘤结节数目(P<0.01)。生物信息学分析提示,与上皮-间充质转化(EMT)相关的Wnt/β-catenin通路在IFIT1高表达组富集。胆管癌细胞中敲减IFIT1可抑制Wnt/β-catenin通路,且EMT标志物vi⁃mentin和Snail表达减少。结论:IFIT1通过激活Wnt/β-catenin通路增强胆管癌细胞EMT,从而促进肿瘤进展。 展开更多
关键词 干扰素诱导的三十重复蛋白1 胆管癌 上皮-间充质转化 WNT/Β-CATENIN信号通路
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红霉素对过氧化氢刺激的支气管上皮细胞表达白细胞介素-8与谷胱甘肽的影响 被引量:15
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作者 何志义 邹朝霞 +3 位作者 于亮 钟南山 冉丕鑫 钟小宁 《中华医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第14期976-980,共5页
目的探讨红霉素对过氧化氢(H2O2)诱导的支气管上皮细胞表达炎症介质白细胞介素8(IL8)及抗氧化剂谷胱甘肽(GSH)的影响和可能的作用机制。方法培养16HBE株的人支气管上皮细胞,应用四甲基偶氮唑蓝(MTT)法观察过氧化氢及红霉素对细胞生长的... 目的探讨红霉素对过氧化氢(H2O2)诱导的支气管上皮细胞表达炎症介质白细胞介素8(IL8)及抗氧化剂谷胱甘肽(GSH)的影响和可能的作用机制。方法培养16HBE株的人支气管上皮细胞,应用四甲基偶氮唑蓝(MTT)法观察过氧化氢及红霉素对细胞生长的影响。将传代后的细胞按24、36、48h3个时间段分组,每个组再分为对照组、H2O2组、红霉素+H2O2组。通过酶联免疫吸附实验检测细胞上清中IL8的浓度;通过凝胶迁移率阻滞实验(EMSA)来检测转录因子核因子κB(NFκB)和激活蛋白1(AP1)的活性;通过酶联免疫检测仪检测细胞内GSH、谷氨酰半胱氨酸合成酶(γGCS)的含量;应用Western印迹检测谷氨酰半胱氨酸合成酶重链亚单位(γGCSHS)蛋白表达。结果红霉素(5μg/ml)预孵育36、48h后可以抑制H2O2(0.01mmol/L)诱导的HBE上清中IL8的含量;红霉素(5μg/ml)预孵育36、48h后可以下调H2O2(0.01mmol/L)诱导的支气管上皮细胞转录因子NFkB、AP1的活性;红霉素(5μg/ml)预孵育48h抑制H2O2(0.01mmol/L)诱导的HBE细胞GSH和γGCS的含量(3.46±0.41)以及γGCSHS蛋白表达、γGCSHS启动子区域AP1转录活性。结论红霉素通过下调NFκB、AP1的活性而抑制H2O2诱导的炎症介质IL8的释放,进而影响GSH及γGCS的合成调控。 展开更多
关键词 过氧化氢 细胞表达 红霉素 白细胞介素-8(IL-8) Western印迹 转录因子NF-KB 抗氧化剂谷胱甘 人支气管上皮细胞 甲基偶氮唑蓝 转录因子核因子 酶联免疫吸附 AP-1 H2O2诱导 炎症介质 半胱氨酸 蛋白表达 凝胶迁移率 启动子区域
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转录因子HIF-1α通过正调控TPARM基因表达影响人结肠癌细胞株SW480的增殖、凋亡
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作者 陈科全 叶展晖 杨洪伟 《中华生物医学工程杂志》 CAS 2022年第3期254-260,共7页
目的探讨转录因子HIF-1α是否通过调控TPARM的表达从而影响结肠癌细胞的增殖及凋亡。方法通过生物信息学分析转录因子HIF-1α与TPARM的启动子序列是否结合。敲低和过表达HIF-1α后检测TPARM的mRNA和蛋白表达水平。双荧光素酶报告实验验... 目的探讨转录因子HIF-1α是否通过调控TPARM的表达从而影响结肠癌细胞的增殖及凋亡。方法通过生物信息学分析转录因子HIF-1α与TPARM的启动子序列是否结合。敲低和过表达HIF-1α后检测TPARM的mRNA和蛋白表达水平。双荧光素酶报告实验验证HIF-1α是否与TPARM的启动子序列有结合。CCK-8和免疫印迹实验检测HIF-1α和TPARM对结肠癌细胞株SW480增殖和调亡的影响。结果生物信息学网站提示转录因子HIF-1α与TPARM启动子的部分序列有结合位点。敲低和过表达HIF-1α能调控TPARM的mRNA和蛋白表达水平, 两者关系为正相关。双荧光素酶报告实验验证了转录因子HIF-1α能促进TPARM启动子活性。CCK-8和免疫印迹实验验证了HIF-1α通过上调TPARM来发挥促进结肠癌细胞株SW480增殖以及抗凋亡的作用。结论转录因子HIF-1α通过促进TPARM的mRNA和蛋白水平表达, 影响结肠癌细胞SW480的增殖、凋亡水平, 为确定结肠癌治疗的有效分子靶点提供了实验依据。 展开更多
关键词 缺氧诱导因子-1Α 重复结构域12 结直肠癌 增殖 凋亡
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