造血干细胞移植综合风险指数对血液系统恶性肿瘤患者异基因造血干细胞移植预后的预测作用

目的:探讨造血干细胞移植综合风险(hematopoietic cell transplant composite risk,HCT-CR)指数对于血液系统恶性肿瘤患者接受异基因造血干细胞移植(allogeneic hematopoietic stem cell transplantation,allo-HSCT)后总生存(overall survival,OS)、无进展生存(progress free survival,PFS)、无移植物抗宿主病(graft versus host disease,GVHD)并无复发生存(GVHD relapse free survival,GRFS)以及非复发死亡(non-relapse mortality,NRM)的预测作用。方法:选取我科2018年1月至2019年12月接受allo-HSCT的血液系统恶性肿瘤患者67例纳入研究队列随访并总结临床资料,多因素分析患者性别、供者类型以及HCT-CR指数对OS、PFS、GRFS及NRM率的预测作用。结果:67例患者1年总体OS、PFS、GRFS及NRM率分别为73.6%、69.6%、57.9%及18.3%。组间比较显示,HCT-CR评分低危组与高危组患者移植后1年OS、PFS及NRM率差异均有统计学意义(P值分别为0.007、0.021及0.026),而GRFS率差异无统计学意义(P=0.257)。Cox回归模型多因素分析示HCT-CR评分影响患者OS率与PFS率(P值分别为0.016、0.031),对于NRM率、GRFS率无影响(分别P=0.05、P=0.245),移植供者类型影响患者OS、PFS及GRFS率(P值分别为0.021、0.028及0.036),对于NRM率无作用(P=0.062),患者性别对于移植后OS、PFS、GRFS及NRM率均未见明显影响(P值分别为0.646、0.590、0.181及0.879)。结论:HCT-CR可以对血液恶性肿瘤患者接受allo-HSCT的预后做出预测,GVHD相关指标有待加入以提升其预测GRFS功能。

基于整合生物信息学分析识别骨肉瘤干性相关基因

目的本研究通过整合生物信息学分析骨肉瘤(osteosarcoma,OS)干性相关基因(stemness-related genes,SRGs)及预后价值。方法从TARGET数据库中获取OS转录组测序数据。采用“edgeR”包对基因表达谱进行标准化。基于一类逻辑回归机器学习算法计算干性指数(mRNA expression-based stemness index,mRNAsi)。采用皮尔逊相关性分析识别SRGs。采用“survival”包分析SRGs的预后价值。从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载数据集GSE152048,利用主成分分析、降维和细胞类型注释来分析OS细胞的分子特征及异质性,并通过“iTALK”包预测OS细胞间通信。结果OS样本间mRNAsi有显著差异,死亡样本显著高于存活样本;转移样本显著高于无转移样本。通过对皮尔逊相关性分析结果(5131个SRGs)、Cox回归分析结果(1640个风险相关基因)和K-M生存分析结果(7066个生存相关基因)取交集,共识别了658个关键基因。NDUFB9与mRNAsi的正相关性最强,EHD2与mRNAsi的负相关性最强。通过降维分析将OS肿瘤细胞划分为10个细胞亚群。NDUFB9在有干性特征的细胞亚群中高表达,包括间充质干细胞和成骨细胞等;而EHD2在各肿瘤细胞亚群中的表达量极低或不表达。结论本研究刻画了OS干性特征和单细胞转录组图谱,识别了预后相关SRGs,为揭示OS干性特征调控机制及发掘潜在治疗靶点提供了理论依据。

基于泛癌分析法的WASH基因亚型在肿瘤中的意义

目的:利用泛癌分析法初步探讨WASH2P、WASH3P、WASH4P、WASH6P、WASH7P、WASH8P、WASH9P在33种癌症中的意义。方法:从TCGA数据库下载33种癌症的转录组数据,利用Perl软件提取WASH2P、WASH3P、WASH4P、WASH6P、WASH7P、WASH8P、WASH9P在33种癌症中的表达水平。采用R软件的limma包鉴定部分肿瘤类型(癌旁样本≥5)中的差异基因,结合TCGA的临床信息,利用Kaplan-Meier和Cox分析WASH亚型的临床预后意义。通过ESTIMATE包探讨WASH与肿瘤免疫浸润微环境的相关性,结合TCGA数据,分析WASH亚型与干细胞指数、免疫亚型间的相关性。最后,分析WASH亚型与单个肿瘤的免疫亚型、干细胞指数、临床分期及肿瘤免疫浸润微环境间的关系。结果:WASH3P和WASH8P在33种癌症类型中总体表达水平相对其他亚型呈高表达。WASH基因亚型在大部分肿瘤中(癌旁样本≥5)显著差异表达,共同协作影响肿瘤进展。生存分析显示其与多种癌症的预后相关(P<0.05)。在大部分肿瘤中,WASH基因亚型与肿瘤干细胞指数呈正相关。WASH基因亚型在C6免疫亚型中低表达,在C1~C4中等水平表达,在C5中高表达。WASH基因亚型表达水平越高,免疫成分、基质成分越少。单肿瘤分析结果显示,在部分单个肿瘤中,WASH基因亚型与TNM分期、免疫亚型、肿瘤微环境、干细胞指数存在相关性。结论:WASH在肿瘤发生发展中扮演重要角色,有望成为多种类型癌症的临床评估标志物。

不同合并症评分系统对多发性骨髓瘤预后判断的价值

目的：探讨造血干细胞移植合并症指数（HCT-CI）与查尔逊合并症指数（CCI）两种合并症评分系统对预测多发性骨髓瘤（MM）患者预后的判断价值。方法回顾性分析58例MM患者的临床资料。对MM患者的实验室指标进行单因素及Cox比例风险模型多因素分析，依据HCT-CI、CCI评分系统对患者合并症进行评分，采用ROC曲线检验比较不同分值对患者预后的影响。结果单因素分析显示血红蛋白（Hb）、血清肌酐、白蛋白、骨髓浆细胞比例、ISS分期、D-S分期、β2微球蛋白、乳酸脱氢酶（LDH）及合并症与预后相关（P＜0.05）。 Cox比例风险模型多因素分析显示有无合并症、β2微球蛋白、血肌酐、白蛋白是独立的预后危险因素。 HCT-CI、CCI和两者合并对MM患者预后预测的ROC曲线下面积[AUC （95%CI）]分别为0.719（0.512-0.827）、0.667（0.513-0.822）、0.743（0.664-0.918）。结论合并症是MM预后的独立危险因素，HCT-CI、CCI两种合并症评分系统可较好地评价预后。HCT-CI较CCI更能准确判读预后。重视并积极治疗合并症，可能有助于改善预后延长生存。