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题名下一代测序纠错方法综述
被引量:1
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作者
江育娥
黄伟
林劼
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机构
福建师范大学软件学院
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出处
《北京工业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期377-386,共10页
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基金
国家自然科学基金资助项目(61472082)
福建省自然科学基金资助项目(2014J01220)
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文摘
在面向下一代的测序技术中,前期纠错方法决定着测序的最终序列质量,因此成为当前研究热点,很多不同的纠错方法被提出,对于这些方法的优缺点以及它们适合的应用,应该有清晰的认识和公正的评估.介绍了现存的各种下一代测序的纠错技术.首先,从各种不同工具所基于的底层算法进行分析;接着,从测序不同平台来看读段错误形成的特点;然后,从各种不同的测序应用角度来观察读段序列错误特征;最后,总结并阐述读段序列纠错工具存在的问题和发展趋势.
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关键词
下一代测序
序列分析
纠错方法
平台错误特征
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Keywords
next-generation sequencing
sequence analysis
error correction
NGS application error characteristics
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分类号
TP319
[自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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