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基于平均交互信息量的DNA序列相似性分析
被引量:
1
1
作者
詹青
王亚东
《智能计算机与应用》
2011年第2X期31-34,52,共5页
序列相似性分析是生物信息学中一个重要问题,对于研究物种的进化起源有着重要的意义。序列相似性算法包括基于序列比对的方法及非比对方法两种。基于比对的方法对于序列整体的衡量略有欠缺;非比对算法中有DNA曲线化方法以及比较序列...
序列相似性分析是生物信息学中一个重要问题,对于研究物种的进化起源有着重要的意义。序列相似性算法包括基于序列比对的方法及非比对方法两种。基于比对的方法对于序列整体的衡量略有欠缺;非比对算法中有DNA曲线化方法以及比较序列各自整体碱基分布间的信息量差异的方法,只是考虑了序列整体信息间的差异,但未考虑序列各个位点间的差异。因此,提出了一种基于信息熵的相似性度量模型,把序列比对与信息量差异结合起来,将两条比对后的序列间的平均交互信息量与其联合熵之比作为两条序列的相似性度量。使用该度量构建了11个物种的相似性矩阵,对各物种间的相似性进行了分析,结果在一定程度上与生物分类学相契合。通过距离矩阵所构建的进化树,也反映了各物种间的进化关系,表明该模型的设计具有合理性。
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关键词
生物
信息
学
DNA序列相似性
信息
熵
平均交互信息量
进化树
下载PDF
职称材料
QKD系统在Breidbart基窃听下BB84协议的信息量研究
被引量:
9
2
作者
陈志新
唐志列
+3 位作者
魏正军
刘景锋
廖常俊
刘颂豪
《光子学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2004年第12期1469-1472,共4页
给出了BB84协议的Breidbart基窃听的方案,分析并计算了各种截取/重发策略下施行QKD标准纠错手续后Alice/Eve的有效平均交互信息量和对Bob引起的错误率.结果显示了Breidbart基窃听/Breidbart基重发策略(B/B策略)最为有效,并提出了各种窃...
给出了BB84协议的Breidbart基窃听的方案,分析并计算了各种截取/重发策略下施行QKD标准纠错手续后Alice/Eve的有效平均交互信息量和对Bob引起的错误率.结果显示了Breidbart基窃听/Breidbart基重发策略(B/B策略)最为有效,并提出了各种窃听方案下Alice和Bob采取相应的反攻击策略.
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关键词
量子密码
Breidbart基窃听
有效
平均交互信息量
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职称材料
题名
基于平均交互信息量的DNA序列相似性分析
被引量:
1
1
作者
詹青
王亚东
机构
哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院
出处
《智能计算机与应用》
2011年第2X期31-34,52,共5页
文摘
序列相似性分析是生物信息学中一个重要问题,对于研究物种的进化起源有着重要的意义。序列相似性算法包括基于序列比对的方法及非比对方法两种。基于比对的方法对于序列整体的衡量略有欠缺;非比对算法中有DNA曲线化方法以及比较序列各自整体碱基分布间的信息量差异的方法,只是考虑了序列整体信息间的差异,但未考虑序列各个位点间的差异。因此,提出了一种基于信息熵的相似性度量模型,把序列比对与信息量差异结合起来,将两条比对后的序列间的平均交互信息量与其联合熵之比作为两条序列的相似性度量。使用该度量构建了11个物种的相似性矩阵,对各物种间的相似性进行了分析,结果在一定程度上与生物分类学相契合。通过距离矩阵所构建的进化树,也反映了各物种间的进化关系,表明该模型的设计具有合理性。
关键词
生物
信息
学
DNA序列相似性
信息
熵
平均交互信息量
进化树
Keywords
Bioinformatics
Similarity of DNA Sequences
Information Entropy
Average Mutual Information
Phylogenetic Tree
分类号
TP39 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
QKD系统在Breidbart基窃听下BB84协议的信息量研究
被引量:
9
2
作者
陈志新
唐志列
魏正军
刘景锋
廖常俊
刘颂豪
机构
华南师范大学物理系
华南师范大学信息光电子科技学院
出处
《光子学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2004年第12期1469-1472,共4页
基金
国家"973"计划(2001CB309300)
广州市重大科技攻关1999-2-035-01资助项目
文摘
给出了BB84协议的Breidbart基窃听的方案,分析并计算了各种截取/重发策略下施行QKD标准纠错手续后Alice/Eve的有效平均交互信息量和对Bob引起的错误率.结果显示了Breidbart基窃听/Breidbart基重发策略(B/B策略)最为有效,并提出了各种窃听方案下Alice和Bob采取相应的反攻击策略.
关键词
量子密码
Breidbart基窃听
有效
平均交互信息量
Keywords
Quantum cryptography
Breidbart eavesdropping
Effective average mutual information
分类号
TN918 [电子电信—通信与信息系统]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于平均交互信息量的DNA序列相似性分析
詹青
王亚东
《智能计算机与应用》
2011
1
下载PDF
职称材料
2
QKD系统在Breidbart基窃听下BB84协议的信息量研究
陈志新
唐志列
魏正军
刘景锋
廖常俊
刘颂豪
《光子学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2004
9
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职称材料
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