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基于28S rDNA D1-D2基因片段与16S rDNA部分序列联合分析的叶肢介系统发育研究
被引量:
2
1
作者
孙晓燕
夏旭华
杨群
《微体古生物学报》
CSCD
北大核心
2011年第4期370-380,共11页
叶肢介(Conchostraca)的系统发育问题一直是甲壳动物研究中颇具争议的一个课题。本研究测定了我国2种叶肢介(Eocyzicus mongolianus,Eocyzicus orientalis)的28S rDNA D1-D2区基因序列和16S rDNA E-G区序列,并与GenBank中的20种叶肢介...
叶肢介(Conchostraca)的系统发育问题一直是甲壳动物研究中颇具争议的一个课题。本研究测定了我国2种叶肢介(Eocyzicus mongolianus,Eocyzicus orientalis)的28S rDNA D1-D2区基因序列和16S rDNA E-G区序列,并与GenBank中的20种叶肢介序列一起进行系统发育分析。基于28S rDNA D1-D2区和16S rDNA E-G区联合序列,采用最大简约法、最大似然法和贝叶斯演绎法构建的叶肢介12属系统发育树显示,叶肢介可分为三个支系:圆蚌虫科、刺尾部和光尾部;叶肢介是一个并系类群;光尾部位于双甲目的基部;原隶属于刺尾部的圆蚌虫科与枝角目互为姊妹群,两者组成枝角形类(cladoceramorpha)。我们首次采用28S rDNA和16S rDNA得到与Richter等(2007)和Olesen(2009)基于形态分析相一致的谱系关系。这一结果打破了传统的系统分类体系,意味着原来定义"叶肢介目"的形态特征(包裹躯体的双瓣壳、附肢携卵、具1—2对执握肢)并非"叶肢介"特有,而应解释为双甲类的共同衍征,尽管枝角类的这些性状退化或丢失或有所变异;而复眼整体愈合、尾爪强壮并具两排尾刺等特征(枝角形类+刺尾部)应该是单次起源的;直接发育(缺无节幼虫阶段)、周期性孤雌生殖等特征(枝角形类)也应是单次演化的结果。
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关键词
叶肢介
系
统发育
28S
RDNA
D1-D2
16S
RDNA
并系群
原文传递
从形态分类到准分支系统分类——修订版Treatise双壳纲卷分类系统简介
被引量:
1
2
作者
方宗杰
《古生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期16-32,共17页
修订版Treatise双壳纲卷首卷即将正式出版,其分类系统的纲要已提前公开发表。在古生物学家、现代生物学家和分子生物学家的共同努力下,终于顺利地实现了化石和现生双壳类分类系统的初步融合,与1969版的形态分类相比,整个分类系统已经面...
修订版Treatise双壳纲卷首卷即将正式出版,其分类系统的纲要已提前公开发表。在古生物学家、现代生物学家和分子生物学家的共同努力下,终于顺利地实现了化石和现生双壳类分类系统的初步融合,与1969版的形态分类相比,整个分类系统已经面目全非。为此,有必要全面介绍其分类方法和原则,介绍新分类系统带来的种种重大变化。新分类系统将进化学派的系统发育概念与分支系统分析方法的合理内核有机结合,发挥后者在方法论方面的优势,摒弃其系统发育即分岐演化的错误概念和某些不合理的分类学原则,如拒绝接受并系群和姐妹群必须具有相同级序等;充分发挥林奈系统的长处并加以改进,形成由共同衍征主导同时也考虑前进演化的林奈式级序体系,准分支系统分类方法由此形成。新方法兼顾分支发生和进化级这两个不同的方面,注重恢复可能的祖-裔关系;主要根据系统树但借鉴分支图方法来确定级序格架,将级序与系统树的分枝点对应,即与衍征的分歧时间对应,使级序的划分不再主观任意;一般将姐妹分类单元置于同一级序,必要时将并系群与其后裔类群置于同一级序,而姐妹群则可能被置于不同的级序。采用近亲单元和准近亲单元分别作为无级序的单系群和并系群的标识,解决了将化石分类群融入现代生物分类系统的技术难题,可简化并有效地保持分类系统的稳定性。新方法使双壳纲完成从形态分类向准分支系统分类的转变,这代表着分类学未来发展的新趋势,而林奈式级序体系则为林奈系统今后的改革提供了新的范例。
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关键词
双壳纲
分类学
系
统发育
林奈级序体
系
准分支
系
统分类
并系群
近亲单元
原文传递
山东诸城的东武山东龟化石
3
作者
孙佳凤
《大自然》
2015年第1期66-67,共2页
林得霍姆龟科是曲颈龟中亚洲陆龟总科的并系群,由于化石罕见,资料匮乏,人们对这一科知之甚少。难得的是,2010年4月,我国山东诸城发现了林得霍姆龟科新成员—东武山东龟,它的发现将为龟鳖类生存演化、古生态、古环境等研究提供新的线索...
林得霍姆龟科是曲颈龟中亚洲陆龟总科的并系群,由于化石罕见,资料匮乏,人们对这一科知之甚少。难得的是,2010年4月,我国山东诸城发现了林得霍姆龟科新成员—东武山东龟,它的发现将为龟鳖类生存演化、古生态、古环境等研究提供新的线索。龟鳖类是古老的爬行动物,化石记录表明它们已在地球上生存了2亿多年,大致与恐龙同期出现在中生代的舞台上。被誉为"世界恐龙化石宝库"的山东诸城是白垩世恐龙骨骼化石。
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关键词
东龟
东武山
山东诸城
龟鳖类
并系群
陆龟
霍姆
红土崖组
白垩世
古生物学家
原文传递
题名
基于28S rDNA D1-D2基因片段与16S rDNA部分序列联合分析的叶肢介系统发育研究
被引量:
2
1
作者
孙晓燕
夏旭华
杨群
机构
现代古生物学和地层学国家重点实验室中国科学院南京地质古生物研究所
渥太华大学生物系
出处
《微体古生物学报》
CSCD
北大核心
2011年第4期370-380,共11页
基金
中国科学院地学与生命科学交叉项目(KZCX2-YW-JC104)
中国科学院-国家外国专家局创新团队国际合作伙伴计划
+3 种基金
中国科学院南京地质古生物研究所现代古生物学和地层学国家重点实验室重点项目资助
国家自然科学基金(40902004
40572070
TSXK0801)
文摘
叶肢介(Conchostraca)的系统发育问题一直是甲壳动物研究中颇具争议的一个课题。本研究测定了我国2种叶肢介(Eocyzicus mongolianus,Eocyzicus orientalis)的28S rDNA D1-D2区基因序列和16S rDNA E-G区序列,并与GenBank中的20种叶肢介序列一起进行系统发育分析。基于28S rDNA D1-D2区和16S rDNA E-G区联合序列,采用最大简约法、最大似然法和贝叶斯演绎法构建的叶肢介12属系统发育树显示,叶肢介可分为三个支系:圆蚌虫科、刺尾部和光尾部;叶肢介是一个并系类群;光尾部位于双甲目的基部;原隶属于刺尾部的圆蚌虫科与枝角目互为姊妹群,两者组成枝角形类(cladoceramorpha)。我们首次采用28S rDNA和16S rDNA得到与Richter等(2007)和Olesen(2009)基于形态分析相一致的谱系关系。这一结果打破了传统的系统分类体系,意味着原来定义"叶肢介目"的形态特征(包裹躯体的双瓣壳、附肢携卵、具1—2对执握肢)并非"叶肢介"特有,而应解释为双甲类的共同衍征,尽管枝角类的这些性状退化或丢失或有所变异;而复眼整体愈合、尾爪强壮并具两排尾刺等特征(枝角形类+刺尾部)应该是单次起源的;直接发育(缺无节幼虫阶段)、周期性孤雌生殖等特征(枝角形类)也应是单次演化的结果。
关键词
叶肢介
系
统发育
28S
RDNA
D1-D2
16S
RDNA
并系群
Keywords
Conchostraca,Phylogeny,28S rDNA D1-D2,16S rDNA,paraphyletic groups
分类号
Q915 [天文地球—古生物学与地层学]
原文传递
题名
从形态分类到准分支系统分类——修订版Treatise双壳纲卷分类系统简介
被引量:
1
2
作者
方宗杰
机构
现代古生物学和地层学国家重点实验室
出处
《古生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第1期16-32,共17页
基金
现代古生物学和地层学国家重点实验室课题(No.123114)资助
文摘
修订版Treatise双壳纲卷首卷即将正式出版,其分类系统的纲要已提前公开发表。在古生物学家、现代生物学家和分子生物学家的共同努力下,终于顺利地实现了化石和现生双壳类分类系统的初步融合,与1969版的形态分类相比,整个分类系统已经面目全非。为此,有必要全面介绍其分类方法和原则,介绍新分类系统带来的种种重大变化。新分类系统将进化学派的系统发育概念与分支系统分析方法的合理内核有机结合,发挥后者在方法论方面的优势,摒弃其系统发育即分岐演化的错误概念和某些不合理的分类学原则,如拒绝接受并系群和姐妹群必须具有相同级序等;充分发挥林奈系统的长处并加以改进,形成由共同衍征主导同时也考虑前进演化的林奈式级序体系,准分支系统分类方法由此形成。新方法兼顾分支发生和进化级这两个不同的方面,注重恢复可能的祖-裔关系;主要根据系统树但借鉴分支图方法来确定级序格架,将级序与系统树的分枝点对应,即与衍征的分歧时间对应,使级序的划分不再主观任意;一般将姐妹分类单元置于同一级序,必要时将并系群与其后裔类群置于同一级序,而姐妹群则可能被置于不同的级序。采用近亲单元和准近亲单元分别作为无级序的单系群和并系群的标识,解决了将化石分类群融入现代生物分类系统的技术难题,可简化并有效地保持分类系统的稳定性。新方法使双壳纲完成从形态分类向准分支系统分类的转变,这代表着分类学未来发展的新趋势,而林奈式级序体系则为林奈系统今后的改革提供了新的范例。
关键词
双壳纲
分类学
系
统发育
林奈级序体
系
准分支
系
统分类
并系群
近亲单元
Keywords
Bivalvia, taxonomy, phylogeny, Linnaean ranks, paracladistic classification, paraphyletic taxa, plesion
分类号
Q915 [天文地球—古生物学与地层学]
原文传递
题名
山东诸城的东武山东龟化石
3
作者
孙佳凤
机构
山东诸城恐龙文化研究中心
出处
《大自然》
2015年第1期66-67,共2页
文摘
林得霍姆龟科是曲颈龟中亚洲陆龟总科的并系群,由于化石罕见,资料匮乏,人们对这一科知之甚少。难得的是,2010年4月,我国山东诸城发现了林得霍姆龟科新成员—东武山东龟,它的发现将为龟鳖类生存演化、古生态、古环境等研究提供新的线索。龟鳖类是古老的爬行动物,化石记录表明它们已在地球上生存了2亿多年,大致与恐龙同期出现在中生代的舞台上。被誉为"世界恐龙化石宝库"的山东诸城是白垩世恐龙骨骼化石。
关键词
东龟
东武山
山东诸城
龟鳖类
并系群
陆龟
霍姆
红土崖组
白垩世
古生物学家
分类号
Q915.2 [天文地球—古生物学与地层学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于28S rDNA D1-D2基因片段与16S rDNA部分序列联合分析的叶肢介系统发育研究
孙晓燕
夏旭华
杨群
《微体古生物学报》
CSCD
北大核心
2011
2
原文传递
2
从形态分类到准分支系统分类——修订版Treatise双壳纲卷分类系统简介
方宗杰
《古生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
原文传递
3
山东诸城的东武山东龟化石
孙佳凤
《大自然》
2015
0
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