豌豆肌动蛋白异型体PEAc3基因的克隆及生物信息学分析

根据NCBI文库中检索到的序列,采用RT-PCR技术克隆了豌豆肌动蛋白异型体PEAc3完整编码区的cD-NA序列,基因全长1134bp,开放阅读框编码377个氨基酸。氨基酸序列分析表明,该基因的编码蛋白PEAc3为可溶性蛋白,分子量41 668.7Da,没有信号肽部分,呈酸性,PEAc3包括ACTINS_1(编号:PS00406)、ACTINS_ACT_LIKE(编号:PS01132)以及ACTINS_2(编号:PS00432)3组肌动蛋白序列指纹图谱(Signature)。序列同源性分析表明,PEAc3与其它上百种植物肌动蛋白同源性高达89.07%。并讨论了模体中可结合配体的位点与功能之间的联系。

不同特异种质罗汉果的遗传差异及杂交优势预测

利用简单序列重复区间扩增多态性(ISSR)技术分析了罗汉果航天、无籽、野生、栽培4类种质的遗传差异,构建DNA指纹图谱和UPGMA聚类图,并进行杂交优势预测的应用研究。结果表明,筛选出的19个ISSR引物中的5个可直接鉴别罗汉果21份特异种质,种质间的遗传相似性系数为0.656~0.896,在相似性系数为0.795处的聚类结果分为5类。不同种质间存在一定的遗传变异,尤其是广西金秀(S17)、湖南永州(S18)和广西百色(S19)的野生种质与桂林主产区种质间,航天种质内以及雌雄株间都产生了较大的遗传差异。根据遗传差异的大小,对9个雌株预测了20个可能获得理想杂交优势的组合,推测雄株S13、S7和S9是较好的父本材料。该研究补充完善了罗汉果种质资源的遗传背景信息,从而为罗汉果种质的保护、创新和利用提供了理论基础及依据。