药物研发领域中的开放访问数据库

开放访问数据库的发展极大推动了各领域的科学研究.本文以药物研发的几个代表性阶段为主线,介绍了该领域涉及的一批主流开放数据库,旨在为读者描绘药物研发领域值得关注的信息资源.另外,本文介绍了本课题组开发的PDBbind-CN数据库的构建过程和基本内容,这是一个致力于收集生物大分子复合物结构和亲合性数据的开放访问数据库,在药物分子设计领域中得到了国内外同行的广泛应用.

开放式空间数据库访问接口的开发应用

GIS应用的快速发展对异构空间数据库互联互访提出了更高的要求。本文对现有的多种异构空间数据库互操作模式进行了对比分析,指出了各种模式的特点及其不足,在此基础上,提出了一种开放式空间数据库互联互访(OGDC,Opening Geospatial Database Connectivity)的策略与规范,以及由各家GIS平台软件厂商共同制定标准接口,再由数据库开发厂商或数据提供厂商按照标准接口进行开发实现的新模式。本文对OGDC的设计思路、技术特点和应用情况进行了分析,设计了地理空间数据库的数据访问对象模型及接口,并使用国产空间数据库软件BeyonDB,对OGDC作了开发和实验验证。实验表明,OGDC可以较好地兼顾空间数据互联互访中系统功能、效率和易用性等方面的需求,为异构空间数据库的标准化共享和持续利用提供了一种较为可行的解决方案。