用生物合成的长链开环探针进行SNP分型

由于化学合成长链开环探针面临许多困难,因此需要开发一种长链开环探针的生物合成方法。该研究利用生物合成的146 bp长链开环探针进行单核苷酸多态性(SNP)分型,以验证长链开环探针生物合成的可行性。结果表明:长链开环探针能够特异地与目的DNA结合,完美配对的长链开环探针能够被DNA连接酶连接,形成环状单链DNA分子,不能完美配对的开环探针不能被DNA连接酶连接,也就不能形成环状单链DNA分子。长链开环探针的连接产物经过DNA外切酶处理后用5%PAGE检测,可以准确进行SNP分型,同时利用RCA反应也能进行SNP分型。该试验的成功为利用不同长度的长链开环探针进行SNP的多元分型提供了基础。