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异构并行编程模型研究与进展 被引量:13
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作者 刘颖 吕方 +3 位作者 王蕾 陈莉 崔慧敏 冯晓兵 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2014年第7期1459-1475,共17页
近年来,异构系统硬件飞速发展.为了解决相应的编程和执行效率问题,异构并行编程模型已被广泛使用和研究.从异构并行编程接口与编译/运行时支持系统两个角度总结了异构并行编程模型最新的研究成果,它们为异构架构和上层应用带来的技术挑... 近年来,异构系统硬件飞速发展.为了解决相应的编程和执行效率问题,异构并行编程模型已被广泛使用和研究.从异构并行编程接口与编译/运行时支持系统两个角度总结了异构并行编程模型最新的研究成果,它们为异构架构和上层应用带来的技术挑战提供了相应的解决方案.最后,结合目前的研究现状以及异构系统的发展,提出了异构并行编程模型的未来方向. 展开更多
关键词 异构并行编程模型 异构系统 GPU 编程接口 编译 运行时系统
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UPPA:面向异构众核系统的统一并行编程架构 被引量:5
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作者 吴树森 董小社 +2 位作者 王宇菲 王龙翔 朱正东 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2020年第6期990-1009,共20页
主流异构并行编程方法如CUDA和OpenCL,其编程抽象层次低,编程接口靠近底层,无法为用户屏蔽底层硬件和运行时细节,导致编程逻辑复杂,编程困难易错.同时应用性能绑定于底层运行时环境,在硬件架构变化时需要根据硬件特征进行针对性改动和优... 主流异构并行编程方法如CUDA和OpenCL,其编程抽象层次低,编程接口靠近底层,无法为用户屏蔽底层硬件和运行时细节,导致编程逻辑复杂,编程困难易错.同时应用性能绑定于底层运行时环境,在硬件架构变化时需要根据硬件特征进行针对性改动和优化,无法保证上层应用的统一.为了简化异构并行编程,提高编程效率,实现上层应用的统一和跨平台,本文提出了一种面向异构众核系统的高层统一并行编程架构UPPA(Unified Parallel Programming Architecture).架构中首先提出了数据关联计算编程模型,实现了不同层级不同模式并行性的统一描述,简化了异构并行编程逻辑,提供了高层统一的并行编程抽象;继而设计了数据关联计算描述语言为用户提供简便易用的统一编程接口,通过高层语义结构保留了应用的并行特征,可以指导编译和运行时系统实现向不同硬件架构的自动映射,保证了上层应用的统一,并采用C语言兼容的语法提供针对高层语义结构的语言扩展,保证编程接口的易学易用;最后提供了基于OpenCL的编译和运行时原型系统,以OpenCL为中间语言实现了高层应用在不同异构系统上的执行,提供了良好的跨平台特性.我们使用数据关联计算描述语言对Parboil和Rodinia测试集中的多个测试用例进行了重构,并在NVIDIA GPU和Intel MIC两种异构平台上进行了验证测试.每个测试用例重构的代码量与测试集提供的串行代码相当,仅为测试集OpenCL代码的13%~64%,有效地降低了异构编程的工作量.在编译和运行时系统的支持下,重构代码无需改动就可以在两种平台上执行.相比于人工编写且经过优化的测试集OpenCL代码,重构代码在GPU和MIC两种平台下分别能够达到其性能的91%~100%和76%~98%,这表明了本文方法的有效性和编译与运行时系统的高效. 展开更多
关键词 异构并行编程 数据关联计算 并行编程模型 统一编程架构 OPENCL
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异构混合并行计算综述 被引量:12
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作者 阳王东 王昊天 +2 位作者 张宇峰 林圣乐 蔡沁耘 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2020年第8期5-16,共12页
随着人工智能和大数据等计算机应用对算力需求的迅猛增长以及应用场景的多样化,异构混合并行计算成为了研究的重点。文中介绍了当前主要的异构计算机体系结构,包括CPU/协处理器、CPU/众核处理器、CPU/ASCI和CPU/FPGA等;简述了异构混合... 随着人工智能和大数据等计算机应用对算力需求的迅猛增长以及应用场景的多样化,异构混合并行计算成为了研究的重点。文中介绍了当前主要的异构计算机体系结构,包括CPU/协处理器、CPU/众核处理器、CPU/ASCI和CPU/FPGA等;简述了异构混合并行编程模型随着各类异构混合结构的发展而做出的改变,异构混合并行编程模型可以是对现有的一种语言进行改造和重新实现,或者是现有异构编程语言的扩展,或者是使用指导性语句异构编程,或者是容器模式协同编程。分析表明,异构混合并行计算架构会进一步加强对AI的支持,同时也会增强软件的通用性。文中还回顾了异构混合并行计算中的关键技术,包括异构处理器之间的并行任务划分、任务映射、数据通信、数据访问,以及异构协同的并行同步和异构资源的流水线并行等。根据这些关键技术,文中指出了异构混合并行计算面临的挑战,如编程困难、移植困难、数据通信开销大、数据访问复杂、并行控制复杂以及资源负载不均衡等。最后分析了异构混合并行计算面临的挑战,指出目前关键的核心技术需要从通用与AI专用异构计算的融合、异构架构的无缝移植、统一编程模型、存算一体化、智能化任务划分和分配等方面进行突破。 展开更多
关键词 异构计算 并行计算 异构并行编程 异构混合编程 异构架构
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Programming for scientific computing on peta-scale heterogeneous parallel systems 被引量:1
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作者 杨灿群 吴强 +2 位作者 唐滔 王锋 薛京灵 《Journal of Central South University》 SCIE EI CAS 2013年第5期1189-1203,共15页
Peta-scale high-perfomlance computing systems are increasingly built with heterogeneous CPU and GPU nodes to achieve higher power efficiency and computation throughput. While providing unprecedented capabilities to co... Peta-scale high-perfomlance computing systems are increasingly built with heterogeneous CPU and GPU nodes to achieve higher power efficiency and computation throughput. While providing unprecedented capabilities to conduct computational experiments of historic significance, these systems are presently difficult to program. The users, who are domain experts rather than computer experts, prefer to use programming models closer to their domains (e.g., physics and biology) rather than MPI and OpenME This has led the development of domain-specific programming that provides domain-specific programming interfaces but abstracts away some performance-critical architecture details. Based on experience in designing large-scale computing systems, a hybrid programming framework for scientific computing on heterogeneous architectures is proposed in this work. Its design philosophy is to provide a collaborative mechanism for domain experts and computer experts so that both domain-specific knowledge and performance-critical architecture details can be adequately exploited. Two real-world scientific applications have been evaluated on TH-IA, a peta-scale CPU-GPU heterogeneous system that is currently the 5th fastest supercomputer in the world. The experimental results show that the proposed framework is well suited for developing large-scale scientific computing applications on peta-scale heterogeneous CPU/GPU systems. 展开更多
关键词 heterogeneous parallel system programming framework scientific computing GPU computing molecular dynamic
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生物医疗健康大数据应用支撑平台与关键技术 被引量:7
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作者 卢宇彤 陈志广 杜云飞 《科研信息化技术与应用》 2017年第1期3-9,共7页
随着生物信息学的不断发展,生物医学领域积累了大量的数据,大数据已经贯穿基础研究、临床诊断、医药开发、健康管理等生物医学领域的各个环节。如何有效存储、管理、分析这些海量数据面临严峻的而挑战。基于超级计算机的计算分析和存储... 随着生物信息学的不断发展,生物医学领域积累了大量的数据,大数据已经贯穿基础研究、临床诊断、医药开发、健康管理等生物医学领域的各个环节。如何有效存储、管理、分析这些海量数据面临严峻的而挑战。基于超级计算机的计算分析和存储能力,在生物医学大数据处理的异构融合架构,面向生物医学大数据的层次式存储系统,生物医学大数据处理的异构并行计算和多源数据的汇聚机制与分析方法,突破生物医学大数据的汇聚、存储、分析等方面的关键技术,构建一个计算、分析处理和存储融合平台,以满足多种类型生物医学大数据应用的不同需求。 展开更多
关键词 融合大数据平台 生物医药数据 异构并行编程
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