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通用真菌引物和探针检测人全血标本中侵袭性真菌DNA载量的方法
被引量:
3
1
作者
徐云飞
马恩陵
+1 位作者
康军仁
崔希增
《中华临床营养杂志》
CAS
2012年第4期229-233,共5页
目的建立实时定量PCR(RQ-PCR)以真菌通用引物和探针快速准确检测人全血标本中侵袭性真菌DNA载量的方法,并与细菌相鉴别及进行初步临床应用。方法选择临床常见的真菌基因组多拷贝基因5.8S rDNA作为靶基因设计特异性通用真菌引物和Taq...
目的建立实时定量PCR(RQ-PCR)以真菌通用引物和探针快速准确检测人全血标本中侵袭性真菌DNA载量的方法,并与细菌相鉴别及进行初步临床应用。方法选择临床常见的真菌基因组多拷贝基因5.8S rDNA作为靶基因设计特异性通用真菌引物和TaqMan探针,采用QIAamp血液DNA小提试剂盒提取多种致病真菌基因组DNA,建立20 μl RQ-PCR反应体系,对含有不同载量致病真菌的模拟人全血标本和71份外科发热患者全血标本进行侵袭性真菌基因组的定量检测。结果本方法的特异性良好,检测限为101拷贝/μl上机待测液 (即约105 拷贝/ml 全血);检测灵敏度和特异度分别为95.5%和97.6%,阳性预告值和阴性预告值分别为98.7%和92.0%;标准曲线R2在0.9931~0.9977;批内及批间平均变异系数分别为(10.4±4.0)%和(27.9±2.0)%;人血标本中真菌基因组DNA平均回收率为(91.0±7.6)%,相对回收率平均变异系数为(14.9±4.0)%。71份外科发热患者血标本中未检测出侵袭性真菌基因组。结论RQ-PCR可以借通用真菌引物和TaqMan探针快速、特异、灵敏地定量检测人血标本中侵袭性真菌DNA的载量并可与细菌相鉴别,且有着较好的准确度与精密度。外科发热患者血中侵袭性真菌基因组的存在率可能很低。
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关键词
肠外营养
实时定量PCR
通用真菌
引物和探针
肠黏膜屏障
外科感染
原文传递
家蚕传染性软化病病毒荧光定量PCR检测技术及浙江省流行病学调查
2
作者
董强
鲁兴萌
吴姗
《中国蚕业》
2016年第4期45-49,共5页
荧光定量PCR检测技术可实现对病原微生物的早期或快速检测,根据家蚕传染性软化病病毒(BmIFV)的RNA序列,设计了具有物种特异性的引物和探针,建立了荧光PCR检测BmIFV的方法。将设计的引物和探针同时对BmIFV、家蚕微孢子虫(Nb)、家蚕核型...
荧光定量PCR检测技术可实现对病原微生物的早期或快速检测,根据家蚕传染性软化病病毒(BmIFV)的RNA序列,设计了具有物种特异性的引物和探针,建立了荧光PCR检测BmIFV的方法。将设计的引物和探针同时对BmIFV、家蚕微孢子虫(Nb)、家蚕核型多角体病毒(BmNPV)、家蚕浓核病病毒(BmDNV)和桑叶进行特异性验证,结果显示只有BmIFV得到阳性结果。该方法对含BmIFV目标片段质粒的检测灵敏度达10^(-3)ng/μL,对目标病毒的检测灵敏度为3.4ng/μL。同时,对浙江省嘉兴市秀洲区、湖州市南浔区、嘉兴市桐乡市、嘉兴市海宁市、杭州市淳安县5个蚕区家蚕感染BmIFV情况进行了流行病学调查,结果显示这5个蚕区BmIFV感染率约为3.6%,为浙江省家蚕传染性软化病防治提供参考。
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关键词
家蚕
家蚕传染性软化病病毒
荧光定量PCR
引物和探针
流行病学
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职称材料
题名
通用真菌引物和探针检测人全血标本中侵袭性真菌DNA载量的方法
被引量:
3
1
作者
徐云飞
马恩陵
康军仁
崔希增
机构
中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院肠外肠内营养科
出处
《中华临床营养杂志》
CAS
2012年第4期229-233,共5页
基金
卫生部临床学科重点项目基金(20010103)和北京市联合攻关项目基金(2002-1024)
文摘
目的建立实时定量PCR(RQ-PCR)以真菌通用引物和探针快速准确检测人全血标本中侵袭性真菌DNA载量的方法,并与细菌相鉴别及进行初步临床应用。方法选择临床常见的真菌基因组多拷贝基因5.8S rDNA作为靶基因设计特异性通用真菌引物和TaqMan探针,采用QIAamp血液DNA小提试剂盒提取多种致病真菌基因组DNA,建立20 μl RQ-PCR反应体系,对含有不同载量致病真菌的模拟人全血标本和71份外科发热患者全血标本进行侵袭性真菌基因组的定量检测。结果本方法的特异性良好,检测限为101拷贝/μl上机待测液 (即约105 拷贝/ml 全血);检测灵敏度和特异度分别为95.5%和97.6%,阳性预告值和阴性预告值分别为98.7%和92.0%;标准曲线R2在0.9931~0.9977;批内及批间平均变异系数分别为(10.4±4.0)%和(27.9±2.0)%;人血标本中真菌基因组DNA平均回收率为(91.0±7.6)%,相对回收率平均变异系数为(14.9±4.0)%。71份外科发热患者血标本中未检测出侵袭性真菌基因组。结论RQ-PCR可以借通用真菌引物和TaqMan探针快速、特异、灵敏地定量检测人血标本中侵袭性真菌DNA的载量并可与细菌相鉴别,且有着较好的准确度与精密度。外科发热患者血中侵袭性真菌基因组的存在率可能很低。
关键词
肠外营养
实时定量PCR
通用真菌
引物和探针
肠黏膜屏障
外科感染
Keywords
Parenteral nutrition Real-time quantitative PCR Universal fungi primers and probe Gut barrier Surgical infection
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
家蚕传染性软化病病毒荧光定量PCR检测技术及浙江省流行病学调查
2
作者
董强
鲁兴萌
吴姗
机构
浙江大学动物科学学院
浙江省检验检疫科学技术研究院
出处
《中国蚕业》
2016年第4期45-49,共5页
基金
现代农业产业技术体系建设专项(编号CARS-22)
浙江省重大科技专项(编号20lOCl2005-2)
浙江出入境检验检疫局科技项目[编号Zl(2006lO)]
文摘
荧光定量PCR检测技术可实现对病原微生物的早期或快速检测,根据家蚕传染性软化病病毒(BmIFV)的RNA序列,设计了具有物种特异性的引物和探针,建立了荧光PCR检测BmIFV的方法。将设计的引物和探针同时对BmIFV、家蚕微孢子虫(Nb)、家蚕核型多角体病毒(BmNPV)、家蚕浓核病病毒(BmDNV)和桑叶进行特异性验证,结果显示只有BmIFV得到阳性结果。该方法对含BmIFV目标片段质粒的检测灵敏度达10^(-3)ng/μL,对目标病毒的检测灵敏度为3.4ng/μL。同时,对浙江省嘉兴市秀洲区、湖州市南浔区、嘉兴市桐乡市、嘉兴市海宁市、杭州市淳安县5个蚕区家蚕感染BmIFV情况进行了流行病学调查,结果显示这5个蚕区BmIFV感染率约为3.6%,为浙江省家蚕传染性软化病防治提供参考。
关键词
家蚕
家蚕传染性软化病病毒
荧光定量PCR
引物和探针
流行病学
分类号
S884.53 [农业科学—特种经济动物饲养]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
通用真菌引物和探针检测人全血标本中侵袭性真菌DNA载量的方法
徐云飞
马恩陵
康军仁
崔希增
《中华临床营养杂志》
CAS
2012
3
原文传递
2
家蚕传染性软化病病毒荧光定量PCR检测技术及浙江省流行病学调查
董强
鲁兴萌
吴姗
《中国蚕业》
2016
0
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