目的:基于网络药理学方法探讨当归-黄柏治疗慢性前列腺炎(chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选当归-黄柏中的活性成分与作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校正,应用Gene...目的:基于网络药理学方法探讨当归-黄柏治疗慢性前列腺炎(chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选当归-黄柏中的活性成分与作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校正,应用GeneCards、OMIM数据库筛选疾病CP靶点,应用R语言软件筛选药物与疾病共同靶点,应用Cytoscape3.5.1软件构建药物-活性成分-靶点-疾病可视化网络图,应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,利用R语言软件通过基因功能注释(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)对核心靶标进行基因功能和通路的注释分析。结果:筛选出46个当归-黄柏的活性成分,预测相关靶点212个,其中与疾病有关的靶点159个,这些靶点主要涉及异源生物刺激反应、氧化与抗氧化反应等生物学过程,并主要富集在PI3K-Akt、丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)、低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)等相关信号通路上。结论:通过网络药理学证实了当归-黄柏多成分、多靶点、多途径的作用特点,预测当归-黄柏治疗CP的可能作用机制,为进一步实验验证其作用机制提供了理论依据。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法探讨当归-黄柏治疗慢性前列腺炎(chronic prostatitis,CP)的作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台(TCMSP)并结合文献检索,筛选当归-黄柏中的活性成分与作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点进行校正,应用GeneCards、OMIM数据库筛选疾病CP靶点,应用R语言软件筛选药物与疾病共同靶点,应用Cytoscape3.5.1软件构建药物-活性成分-靶点-疾病可视化网络图,应用STRING平台构建共同靶点蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,利用R语言软件通过基因功能注释(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)对核心靶标进行基因功能和通路的注释分析。结果:筛选出46个当归-黄柏的活性成分,预测相关靶点212个,其中与疾病有关的靶点159个,这些靶点主要涉及异源生物刺激反应、氧化与抗氧化反应等生物学过程,并主要富集在PI3K-Akt、丝裂原活化蛋白激酶(mitogenactivated protein kinase,MAPK)、低氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)等相关信号通路上。结论:通过网络药理学证实了当归-黄柏多成分、多靶点、多途径的作用特点,预测当归-黄柏治疗CP的可能作用机制,为进一步实验验证其作用机制提供了理论依据。