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基于网络药理学和分子对接探讨“当归-全蝎-地龙”药对治疗缺血性脑卒中的作用机制
1
作者
兰宁
肖波
李富勇
《内蒙古中医药》
2024年第1期161-166,共6页
目的:运用网络药理学和分子对接技术探究“当归-全蝎-地龙”药对治疗缺血性脑卒中(IS)的作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、BATMAN、Herb、ETCM或SymMap中查找并筛选得到药物的活性成分,通过Pubchem数据库检索活性成分...
目的:运用网络药理学和分子对接技术探究“当归-全蝎-地龙”药对治疗缺血性脑卒中(IS)的作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、BATMAN、Herb、ETCM或SymMap中查找并筛选得到药物的活性成分,通过Pubchem数据库检索活性成分的SMILES号,并将其传入SwissTargetPrediction数据库获得药物活性成分预测靶点;选用关键词“Ischemic Stroke”在Genecards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库检索与该病相关的主要靶点;运用Venny2.1.0绘制韦恩图,获取该药对与缺血性脑卒中的交集靶点。将以上得到的数据分别通过STRING获得交集靶点的蛋白网络;Cytoscape3.10.0构建“药物-活性成分-靶点”及蛋白互作(PPI)网络图;Metascape数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;AutoDockTools对药物有效成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:“当归-全蝎-地龙”治疗缺血性脑卒中共有28个有效活性成分和363个对应靶点,主要有效成分有亚油酸、花生四烯酸、二十碳五烯酸等;缺血性脑卒中共3790个,药物与疾病交集靶点245个,包括白细胞介质6(IL6)、白蛋白(ALB)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)等。GO功能富集共有2420个条目,其中生物过程2023个、分子功能260个、细胞组分127个;KEGG通路富集得到200条通路,主要有神经活性配体-受体相互作用(Neuroactive ligandreceptor interactionu)、癌症通路(Pathways in cancer)、钙信号通路(Calcium signaling pathway)、环腺苷酸信号通路(cAMP signaling pathway)等。分子对接显示该药物主要有效成分和核心靶点蛋白有较好结合力。结论:多成分-多靶点-多途径是“当归-全蝎-地龙”治疗缺血性脑卒中的特点。
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关键词
网络药理学
分子对接
当归-全蝎-地龙
缺血性脑卒中
作用机制
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题名
基于网络药理学和分子对接探讨“当归-全蝎-地龙”药对治疗缺血性脑卒中的作用机制
1
作者
兰宁
肖波
李富勇
机构
四川省岳池县中医医院
出处
《内蒙古中医药》
2024年第1期161-166,共6页
文摘
目的:运用网络药理学和分子对接技术探究“当归-全蝎-地龙”药对治疗缺血性脑卒中(IS)的作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、BATMAN、Herb、ETCM或SymMap中查找并筛选得到药物的活性成分,通过Pubchem数据库检索活性成分的SMILES号,并将其传入SwissTargetPrediction数据库获得药物活性成分预测靶点;选用关键词“Ischemic Stroke”在Genecards、OMIM、TTD、DisGeNET数据库检索与该病相关的主要靶点;运用Venny2.1.0绘制韦恩图,获取该药对与缺血性脑卒中的交集靶点。将以上得到的数据分别通过STRING获得交集靶点的蛋白网络;Cytoscape3.10.0构建“药物-活性成分-靶点”及蛋白互作(PPI)网络图;Metascape数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;AutoDockTools对药物有效成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:“当归-全蝎-地龙”治疗缺血性脑卒中共有28个有效活性成分和363个对应靶点,主要有效成分有亚油酸、花生四烯酸、二十碳五烯酸等;缺血性脑卒中共3790个,药物与疾病交集靶点245个,包括白细胞介质6(IL6)、白蛋白(ALB)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)等。GO功能富集共有2420个条目,其中生物过程2023个、分子功能260个、细胞组分127个;KEGG通路富集得到200条通路,主要有神经活性配体-受体相互作用(Neuroactive ligandreceptor interactionu)、癌症通路(Pathways in cancer)、钙信号通路(Calcium signaling pathway)、环腺苷酸信号通路(cAMP signaling pathway)等。分子对接显示该药物主要有效成分和核心靶点蛋白有较好结合力。结论:多成分-多靶点-多途径是“当归-全蝎-地龙”治疗缺血性脑卒中的特点。
关键词
网络药理学
分子对接
当归-全蝎-地龙
缺血性脑卒中
作用机制
分类号
R277.7 [医药卫生—中医学]
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作者
出处
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1
基于网络药理学和分子对接探讨“当归-全蝎-地龙”药对治疗缺血性脑卒中的作用机制
兰宁
肖波
李富勇
《内蒙古中医药》
2024
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