微卫星技术及在动物遗传多样性研究中的应用

微卫星作为第二代分子遗传标记 ,已经在很多领域得到广泛应用 .微卫星位点的获得有两条常用技术途径 :1)利用已发现的微卫星位点寻找新的位点 ;2 )用经典分子生物学方法克隆特定基因组的微卫星位点 .微卫星分析的一般步骤包括 :DNA的提取 ,PCR扩增 ,扩增产物及大小的检测和数据分析 .DNA芯片技术的出现 ,为微卫星技术的应用提供了更广阔的前景 .在动物遗传多样性研究中 ,可以通过微卫星技术进行种间、种内、群体之间。

微卫星技术分析地方鸡种群体的遗传结构

利用微卫星技术和 1 4对引物MCW1 5 0、MCW1 3 4、MCW1 45、MCW1 0 4、ADL2 1 0、MCW88、ADL2 3 7、ADL2 0 1、ADL2 89、MCW5、MCW2 1 7、MCW2 9、ADL1 76、MCW4对 7个地方鸡种和 1个引进鸡种的群体遗传结构特征进行了分析。根据池DNA所获得的品种间相似指数计算遗传距离。结果表明 :AA鸡与其它品种鸡遗传距离最远 ,白耳鸡次之 ,其余品种间较近。这些鸡种的遗传结构特征与其地理分布有关 ,说明微卫星技术作为畜禽遗传结构分析的辅助手段是可行的 。

微卫星技术路线的发展及在海洋生物中的应用

微卫星技术是目前应用最广泛的分子标记技术之一,关于其技术路线也在不断的改进和更新,本文主要结合近年来海洋生物应用中的进展情况对此进行了阐述。微卫星技术路线主要涉及4个方面:微卫星位点的开发、引物设计与合成、结果检测和数据分析。在这4个方面,微卫星技术正朝着结果分析更精确和自动化分析等方向发展,同时也存在着一定的问题,本文对此进行了展望。

采用微卫星技术进行大麦及麦芽的品种鉴定

本研究将微卫星技术应用于大麦及麦芽的品种鉴定.首先对46个SSR引物进行了筛选,选择出其中多态性较为丰富的引物.同时研究了麦芽DNA的提取方法,并利用微卫星技术对麦芽进行品种鉴定研究.

基于微卫星技术的赣南脐橙溃疡病菌遗传多样性分析

在赣南18个县（市、区）收集到508份柑桔溃疡病菌样品，采用已报道的柑桔溃疡病菌A菌系306菌株（GenBankAccessionno．AE008923）基因组上的14个SSR位点分析遗传多样性。从14个SSR位点中，筛选出用于赣南地区溃疡病菌种群多样性研究的SSR位点7个（XL1、XL2、XL3、XL4、XL5、XL8和XL7），测试得到的Nei’s基因多样性指数在0．66-O．83之间。通过这7个位点分析赣南不同地域的样品发现，大余县样品的遗传多态性最高，定南县样品的遗传多态性最低。采用Structure3．25和PowerMarker2．3．4软件聚类分析发现，赣南18县（市、区）的柑桔溃疡病菌样品分成两个组群，且某些县（区）群体结构构成单一。其中，信丰、定南和章贡区样品群体属于同一组群，兴国和会昌样品群体属于另一组群，其他县（区）样品群体则是由两个组群菌株按不同比例混合构成。

应用微卫星技术对野鲤和两种鲤选育品系的遗传多样性分析

用自行设计的 16对微卫星引物研究了野鲤、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系的群体内遗传变异及相互间的关系。微卫星分析结果表明 :野鲤、高寒鲤和荷包红鲤抗寒品系平均扩增条带分别为 4.91、2 .82和 2 .45 ,平均杂合度观测值分别为 0 .6 4、0 .40和 0 .38。表明野鲤的遗传多样性水平最高 ,高寒鲤次之 ,荷包红鲤抗寒品系最低。说明了人工繁育和养殖实践会造成物种遗传多样性的降低。本试验共发现了 1个群体特异性标记2 0 9bp ,为进一步研究此标记与性状的连锁关系和分子标记辅助育种奠定了基础。同时 ,还对三群体间的遗传距离作了估算 ,并进行了聚类分析 。

系统性红斑狼疮相关基因与微卫星技术

系统性红斑狼疮(SLE)是自身免疫性疾病原型,为多基因遗传病,其致病基因或易感基因的定位一直是近年来的研究热点。微卫星是近年大力开发的一种遗传标记。微卫星作为第二代分子遗传标记,已经在很多领域得到广泛应用。本文介绍了微卫星技术在人和鼠系统性红斑狼疮相关基因研究中的应用,为其他系统性红斑狼疮相关基因研究提供新的方法和思路。

多态性微卫星标记技术与重复序列PCR在近平滑念珠菌基因分型中的比较

目的比较多态性微卫星标记（PMM）技术与重复序列聚合酶链反应（PCR）在近平滑念珠菌基因分型中的应用。方法收集2012年3月至2013年11月间上海5家医院临床分离的近平滑念珠菌55株,经内转录间隔区序列分析（ITS）进一步鉴定菌种,共有狭义近平滑念珠菌43株,之后采用重复序列PCR和PMM技术进行基因分型,比较2种分型方法的结果和效率。结果 43株狭义近平滑念珠菌经重复序列PCR分型只有1种基因型;经PMM技术分型有22种基因型,以Ⅰ型（10株）、Ⅱ型（6株）为主,Ⅲ~Ⅶ型见于2或3株菌,其余15种基因型均只有1株菌。结论 PMM技术用于狭义近平滑念珠菌的基因分型,分辨率高、重复性好,适用于狭义近平滑念珠菌基因组微进化的监测,而重复序列PCR不适用于狭义近平滑念珠菌的基因分型。

微卫星多态性和重复序列PCR分析技术在热带假丝酵母菌基因分型中的应用

目的:评估微卫星多态性分析技术和重复序列PCR分析技术在临床热带假丝酵母菌基因分型中的应用。方法:收集2014年8月到2015年11月来自上海4家医院临床分离的热带假丝酵母菌共50株,分别以Ca21、Ca22、Com21两两组合为引物,选用最合适的引物组合进行重复序列聚合酶链反应(repetitive extragenic palindromic polymerase chain reaction,REP-PCR)后电泳获得REP-PCR分型。采用Ctrm1、Ctrm10、Ctrm12这3种微卫星标记进行微卫星多态性分析。比较2种基因分型方法的结果和分辨力。结果:REP-PCR以Ca21-Com21引物组合的分型效果最好,50株热带假丝酵母菌经REP-PCR分型得到共7种REP-PCR型,鉴别力指数(index of discriminatory power, DP)为0.75。经多态性分型得30种基因型,DP为0.97。结论:微卫星多态性分析简便、快捷,分辨力高于REP-PCR检测,可作为实验室基因分型的首选方法。

微卫星DNA标记技术及其在猪近交系遗传检测中的应用前景

首先对家畜核基因组中DNA微卫星标记作了简要的介绍 ,包括微卫星标记的定义、结构、分布、组成、保守性、优点及丰富的多态性等。其次主要介绍微卫星DNA标记技术在猪近交系遗传检测方面的应用。微卫星标记出现以前 ,只能通过公式来简单的计算近交系数 ,现在通过微卫星标记技术结合PCR(聚合酶链式反应 )技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,可以计算出近交系猪的等位基因频率 ,进一步得到它的多态信息含量。从而可以从分子水平上真正验证近交系猪的基因纯合度及同基因性 ,在转基因研究。

天女木兰遗传多样性微卫星标记的研究

以中国7个省份9个天女木兰种群为研究对象,采用微卫星技术(SSR)探讨天女木兰分子遗传多样性。结果显示:(1)9个天女木兰种群间存在较低的遗传多样性,种群平均Nei基因多样性指数(H)0.098 5,平均Shannon信息指数(I)0.146 8;种群间基因流为0.597 9(<1),处于很低的水平。(2)天女木兰不同种群在长期进化过程中发生了一定的遗传分化,9个天女木兰种群的遗传距离为0.068 8~0.214 2,遗传相似度介于0.82~0.93之间。(3)聚类分析结果显示,9个天女木兰种群在进化上形成2个主要分枝,贵州麻江种群为一支,其他地区的种群为另一支,其中贵州麻江的天女木兰生存状况较差。(4)天女木兰的遗传多样性与种群分布的经度呈正相关。研究表明,天女木兰种群间的遗传多样性低,缺乏基因交流,可能是导致其濒危的主要遗传学机制。

精子冷冻保存对大菱鲆后代遗传结构影响的微卫星分析

用微卫星技术对大菱鲆冻精和鲜精受精鱼苗的遗传结构进行了分析比较,以期间接地检验冷冻保存没有对精子的遗传结构产生影响.精子冷冻按三步法进行,冻后成活率为65%(对照为85%).精子在液氮中保存半小时后解冻授精,冻精受精率和孵化率与鲜精的没有显著差异.实验用冻精和鲜精受精鱼苗各15条,且来自相同的父母本,这减少了亲本遗传结构不同对实验结果的干扰.10对微卫星引物的分析结果显示,15条鲜精受精大菱鲆苗共得到等位基因30个,基因型25个,杂合度为0.5747;15条冻精受精大菱鲆苗共得到等位基因30个,基因型25个,杂合度为0.5714.在鲜精受精大菱鲆和冻精受精大菱鲆的30个等位基因中,只有7个等位基因的频率发生了比较显著变化.

微卫星标记在绵山羊育种中的应用研究

微卫星技术是20世纪80年代发展起来的一种能有效区别不同物种、不同群体以及不同基因型个体的分子标记,因此微卫星标记被广泛应用于各种动植物的分子领域的研究,微卫星标记在家畜遗传育种与繁殖中的研究随着人类基因组计划的进展而得到了空前的发展,当对猪、鸡和牛的物理图谱构建完成了一部分之后,国内外的学者已经开始了对绵羊和山羊的基因组的研究分析,并且取得了一些可喜的成绩。本文就微卫星标记在绵山羊育种中的应用进展做一介绍。

中国西门塔尔牛第6号染色体上部分微卫星的特征

利用微卫星技术对牛第6号染色体上9个微卫星位点进行了研究,检测其在中国西门塔尔牛育种核心群中152头母牛的多态性。本试验9个位点中,BM4528为单态,BM4203属于中度多态位点(0.5>PIC>0.25),而其它的7个位点均是高度多态位点(PIC>0.5)。

微卫星DNA的研究进展及其在寄生虫学的应用

微卫星DNA是广泛存在于原核生物和真核生物基因组中的短串联重复序列,具有快速突变性、多态性信息丰富、易于检测等特点。在动植物遗传育种、遗传图谱的构建、群体遗传学研究、肿瘤学、亲子鉴定、濒危野生动物保护及法医鉴定等方面的研究中被广泛应用。论文综述了微卫星DNA技术的研究进展及其在寄生虫学中的应用。