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用微卫星探针的DNA指纹技术分析9个家猪群体的遗传结构 被引量:2
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作者 徐晓立 杨建军 许宗运 《塔里木农垦大学学报》 2002年第4期5-8,共4页
本研究用微卫星探针 (GT) 10 得到了 9个家猪品种的DNA指纹图。 1~ 9品种依次为 :1 3 /1 7罗伯逊易位纯合子猪群体、1 3 /1 7罗伯逊易位杂合子猪群体、1 3 /1 7罗伯逊易位杂合子猪互交所得到的正常核型猪群体(杂交 0号 )、丹系长白猪... 本研究用微卫星探针 (GT) 10 得到了 9个家猪品种的DNA指纹图。 1~ 9品种依次为 :1 3 /1 7罗伯逊易位纯合子猪群体、1 3 /1 7罗伯逊易位杂合子猪群体、1 3 /1 7罗伯逊易位杂合子猪互交所得到的正常核型猪群体(杂交 0号 )、丹系长白猪群体、加系双肌臀杜洛克猪群体、加系双肌臀大约克猪群体、加系双肌臀长白猪群体、丹系长白猪与 1 3 /1 7易位杂合子猪产生的杂交后备猪群体 (杂交 1号 )、杜洛克猪与 1 3 /1 7易位杂合子猪产生的杂交后备猪群体 (杂交 2号 )。根据指纹带型计算了每个群体的相似系数 (F)、平均等位基因频率 (Q)、最低平均杂合率 (H)和遗传距离指数 (D)。 9个品种的相似系数介于 0 .5 82~ 0 .91 1 ,根据各品种之间的遗传距离指数作出矩阵图 。 展开更多
关键词 DNA指纹技术 家猪 群体 遗传结构 罗伯逊易位 微卫星探针
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应用猪的微卫星DNA作探针制作牛、鸭和鹌鹑的DNA指纹图
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作者 樊宝良 孟安明 贾锋 《邯郸农业高等专科学校学报》 2000年第2期1-3,共3页
我们曾经得到了猪的8个不同位点的微卫星序列克隆。本文以猪的基因组中克隆得到的微卫星序列制作了牛、鸭和鹌鹑的DNA指纹图,结果证明来源于某一物种的微卫星序列可以应用于其他物种的DNA指纹图的制作。
关键词 微卫星DNA DNA指纹 探针 鹌鹑
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杜鹃基因组微卫星富集文库的构建 被引量:1
3
作者 王书珍 金卫斌 +5 位作者 项俊 郑永良 方元平 干建平 程华 杜航 《湖北农业科学》 2015年第3期627-630,637,共5页
利用FIASCO方法(Fast Isolation by AFLP Sequences COntaining repeats)构建杜鹃(Rhododendron simsii Planch.)的(AG)n微卫星富集文库。通过菌液PCR检测,从(AG)n微卫星富集文库的356个阳性菌落中筛选了233个进行测序分析。结果表明,20... 利用FIASCO方法(Fast Isolation by AFLP Sequences COntaining repeats)构建杜鹃(Rhododendron simsii Planch.)的(AG)n微卫星富集文库。通过菌液PCR检测,从(AG)n微卫星富集文库的356个阳性菌落中筛选了233个进行测序分析。结果表明,202个序列富含SSR位点,阳性比率达86.7%。去除杂峰、叠峰、信号弱的序列,最终筛选39个供后续引物开发使用,其中完美型SSR有22个,不完美型5个,混合型12个。磁珠富集法构建杜鹃基因组微卫星文库是一条高效可行的途径,为微卫星位点的分离、杜鹃种群遗传多样性和遗传结构的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 杜鹃(Rhododendron simsii Planch.) 微卫星 探针 富集文库
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藏羚羊(AAC)_n微卫星富集文库构建与引物筛选
4
作者 徐永涛 马建滨 +4 位作者 周智红 谭春敏 张湑泽 郭松长 都玉蓉 《青海师范大学学报(自然科学版)》 2014年第1期41-46,共6页
基于磁珠富集法,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AAC)8从藏羚羊(Tibetan antelope)基因组酶切的300—1000bp片段中筛选微卫星位点,纯化的富集片段连接到pCR@2.1载体和转化到Trans5α感受态细胞.随机挑取180个白斑克隆,PCR检测... 基于磁珠富集法,利用生物素标记的寡核苷酸探针(AAC)8从藏羚羊(Tibetan antelope)基因组酶切的300—1000bp片段中筛选微卫星位点,纯化的富集片段连接到pCR@2.1载体和转化到Trans5α感受态细胞.随机挑取180个白斑克隆,PCR检测到条带数大于或等于2的阳性克隆为56个,阳性率为31.1%.对阳性克隆测序,获得43条含微卫星座位的序列,微卫星重复次数在5~20次之间.舍弃不适宜设计引物的微卫星座位,试验设计并合成了20对微卫星引物;以3个样点(青海、新疆、西藏)的24个藏羚羊基因组为模板进行PCR扩增,获得8对可得到稳定扩增产物的微卫星引物,其中4对引物的扩增产物具有多态性,座位分别为AAC050、AAC056、AAC165和AAC477.上述引物可用于藏羚羊及近缘物种的遗传多样性、种群遗传结构等研究. 展开更多
关键词 藏羚羊 微卫星 富集文库 (AAC)8探针 引物筛选
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大仓鼠DNA指纹谱探针的筛选 被引量:2
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作者 宋铭晶 徐来祥 张知彬 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期287-292,共6页
采用一种简便提取高质量DNA的方法,从大仓鼠肝脏组织中提取其总DNA,分别以人工合成的微卫星核心序列(GTG)5和(CA)8做单一引物,进行特异引物PCR反应。电泳检测后回收15条特异性片段。与被标记过的大仓鼠基因组DNA反向杂交结果表明,15个... 采用一种简便提取高质量DNA的方法,从大仓鼠肝脏组织中提取其总DNA,分别以人工合成的微卫星核心序列(GTG)5和(CA)8做单一引物,进行特异引物PCR反应。电泳检测后回收15条特异性片段。与被标记过的大仓鼠基因组DNA反向杂交结果表明,15个片段中(GTG)5-8、(CA)8-1b和(CA)8-5b产生了较强的阳性信号。我们依据3个片段的测序结果设计适合DIG标记的探针,该探针得到的大仓鼠不同地理种群个体的指纹图谱有较高的个体特异性和种群多态性,而且与传统的来源于其它生物重复序列的探针如33.6和33.15形成的指纹图谱相比得到的变异适中,便于统计。 展开更多
关键词 大仓鼠 DNA指纹谱 探针 微卫星 反向杂交
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多位点DNA指纹技术在保加利亚普通田鼠中的应用探讨 被引量:1
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作者 陈炜 Leibenguth Friedrich 陈宏 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期101-104,共4页
In the paper, DNA fingerprinting patterns of common vole (Microtus arvalis) were detected with HindIII, HinfI and microsatellite probe (GTG) 5 .The results showed that legible DNA fingerprints were not produced with H... In the paper, DNA fingerprinting patterns of common vole (Microtus arvalis) were detected with HindIII, HinfI and microsatellite probe (GTG) 5 .The results showed that legible DNA fingerprints were not produced with HindIII and probe (GTG) 5, however HinfI and probe (GTG)5 produced abundantly informative DNA fingerprints. DNA fingerprints were individual-specific and represented higher polymorphism in number, intensity and distribution bands among individuals. The band-sharing rates (BSR) between individuals were determined by the DNA fingerprints. The average band numbers and average band-sharing rates in fragment length region (FLR) of >2.3 kb were 29.625±5.012 and 0.388±0.083 respectively. Correlative fingerprint-data with the population were calculated from average BSR. In this study, a technical basis is established for application of multilocus DNA fingerprinting in common vole. 展开更多
关键词 DNA指纹 普通田鼠 微卫星探针(gtg) 多态性
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家畜家禽DNA指纹图的研究进展(综述) 被引量:1
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作者 孟安明 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1993年第S1期32-38,共7页
多种小卫星探针和微卫星探针可以用来获得家畜家禽的 DNA 指纹图谱.象人的DNA 指纹图一样,畜禽的 DNA 指纹图也具有高度的变异性和稳定的遗传性.畜禽 DNA 指纹图已广泛地用于鉴定个体、测定品种(系)的遗传纯度和品种(系)间的遗传距离、... 多种小卫星探针和微卫星探针可以用来获得家畜家禽的 DNA 指纹图谱.象人的DNA 指纹图一样,畜禽的 DNA 指纹图也具有高度的变异性和稳定的遗传性.畜禽 DNA 指纹图已广泛地用于鉴定个体、测定品种(系)的遗传纯度和品种(系)间的遗传距离、监测育种及遗传操作效应、寻找重要数量性状位点的遗传标记、开发单位点高变异探针等方面. 展开更多
关键词 畜禽 卫星探针 微卫星探针 DNA 指纹图
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罗伯逊易位群体遗传结构的DNA指纹分析
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作者 杨建军 徐晓立 +1 位作者 许宗运 王小霞 《生物技术》 CAS CSCD 2002年第4期5-6,共2页
用微卫星探针 (GGAT) 4 得到了罗伯逊易位猪群体内共 9个家猪品种的DNA指纹图。 1~ 9品种依次为 :1 3/ 1 7罗伯逊易位纯合子猪群体、1 3/ 1 7罗伯逊易位杂合子猪群体、1 3/ 1 7罗伯逊易位杂合子猪互交所得到的正常核型猪群体 (杂交 0... 用微卫星探针 (GGAT) 4 得到了罗伯逊易位猪群体内共 9个家猪品种的DNA指纹图。 1~ 9品种依次为 :1 3/ 1 7罗伯逊易位纯合子猪群体、1 3/ 1 7罗伯逊易位杂合子猪群体、1 3/ 1 7罗伯逊易位杂合子猪互交所得到的正常核型猪群体 (杂交 0号 )、丹系长白猪群体、加系双肌臀杜洛克猪群体、加系双肌臀大约克猪群体、加系双肌臀长白猪群体、丹系长白猪与 1 3/ 1 7易位杂合子猪产生的杂交后备猪群体 (杂交 1号 )、杜洛克猪与 1 3/ 1 7易位杂合子猪产生的杂交后备猪群体 (杂交 2号 )。根据指纹带型计算了每个群体的相似系数 (F)、平均等位基因频率 (Q)、最底平均杂合率 (H)和遗传距离指数 (D)。 9个品种的相似系数介于 0 546~0 931 ,根据各品种之间的遗传距离指数作出矩阵图 。 展开更多
关键词 罗伯逊易位 DNA指纹 微卫星探针 遗传结构 品种
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两个绵羊品种多位点DNA指纹的研究
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作者 陈宏 房兴堂 Leibenguth F 《徐州师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2006年第1期1-5,共5页
利用3种限制性酶Hind Ⅲ,Hae Ⅲ,Hinf Ⅰ和3种微卫星及小卫星DNA探针(GTG)5,(TG)n,M13检测了2个绵羊品种基因组DNA的多样性。结果表明,具有个体特征的DNA指纹获得依赖于酶/探针的结合。Hae Ⅲ,Hinf Ⅰ和3种探针都可产生丰富... 利用3种限制性酶Hind Ⅲ,Hae Ⅲ,Hinf Ⅰ和3种微卫星及小卫星DNA探针(GTG)5,(TG)n,M13检测了2个绵羊品种基因组DNA的多样性。结果表明,具有个体特征的DNA指纹获得依赖于酶/探针的结合。Hae Ⅲ,Hinf Ⅰ和3种探针都可产生丰富的DNA指纹带谱。DNA指纹表现了高度的个体特异性和多样性,这种多样性表现在带纹的数目、强度和带纹的分布区域上。Hind Ⅲ与3种探针的结合都不能产生清晰的DNA指纹带谱。以特定片段长度区域统计丁带纹的相似率,在Hae Ⅲ/(TG)n 组合中,黑头绵羊的平均带纹相似率为0.34,欧洲盘羊为0.50.根据带纹相似率,估算了群体平均杂合度为0.83~O.90.用Hae Ⅲ/(TG)n 组合的指纹相似率,估算了两品种间的相似性指数(0.89)和遗传距离(0.29). 展开更多
关键词 DNA指纹 微卫星探针 卫星探针 多态性 绵羊
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Studies on microsatellite instability in p16 gene and expression of hMSH2 mRNA in human gastric cancer tissues 被引量:6
10
作者 Qin-XianZhang YiDing +1 位作者 Xiao-PingLe PengDu 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2003年第3期437-441,共5页
AIM: To detect the loss of heterozygosity (LOH) frequency of microsatellite sites D9s171, D9s1604 of p16 gene and expression of hMSH2 mRNA in various differentiated types of gastric cancer, adjacent cancer tissues and... AIM: To detect the loss of heterozygosity (LOH) frequency of microsatellite sites D9s171, D9s1604 of p16 gene and expression of hMSH2 mRNA in various differentiated types of gastric cancer, adjacent cancer tissues and normal gastric mucosa.METHODS: LOH was detected by polymerase chain reaction (PCR)-denaturing polyacrylamide gel electrophoresis-silver staining. The expression of hMSH2 mRNA was examined with in situ hybridization.RESULTS: The frequency rate of LOH was significantly higher in gastric cancers than that in adjacent cancer tissues (P=0.032). No significant difference was noted among various differentiated types and various clinical stages of gastric cancers. The significantly reduced expression of hMSH2mRNA positive signal cells exhibited in gastric cancers, in comparison with that in the adjacent cancer tissues and normal gastric mucosa, respectively (P=0.001). No significant difference was noted among various clinical stages of gastric cancers (P>0.05). The difference of positive signal cells in poorly differentiated cancers and those in well and moderately differentiated cancers were significant (P<0.001).CONCLUSION: The frequencies of LOH in two microsatellite sites, D9s171 and D9s1604, in p16 genome were associated with development of gastric cancer and no significant correlation was demonstrated between the LOH frequency and the cell differentiated types of tumor cells or clinical stages. There was a positive relationship between the expression of hMSH2 mRNA and the differentiated types of gastric cancer. 展开更多
关键词 胃癌 癌组织 微卫星稳定性 P16基因 HMSH2 基因探针
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渔业生物学
11
《南方水产科学》 CAS 2004年第8期11-19,共9页
040871固定时间和方法影响洋地黄毒苷配基标记的DNA探针在检测大西洋鲑骨骼肌中鳝库多虫的灵敏度=Durationandmethodoffixationaffectsthesensitivityofadigoxygenin-labelledDNAprobeindetectingKudoathyrsitesinAtlanticsalmonskeleta... 040871固定时间和方法影响洋地黄毒苷配基标记的DNA探针在检测大西洋鲑骨骼肌中鳝库多虫的灵敏度=Durationandmethodoffixationaffectsthesensitivityofadigoxygenin-labelledDNAprobeindetectingKudoathyrsitesinAtlanticsalmonskeletalmuscle[刊,英]/JonesSRM,GobB,Prosperi-PortaG//Aquac..-2003。 展开更多
关键词 渔业生物学 洋地黄毒苷配基 DNA探针 大西洋鲑 固定时间 敏度 骼肌 杜父鱼 微卫星标记 氨基酸序列
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小麦D染色体组祖先节节麦的白叶和坚韧的花序轴性状的基因遗传作图
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作者 邱敦莲(摘译) 《作物育种信息》 2006年第4期14-14,共1页
节节麦是普通小麦的二倍体D染色体组供体,是培育小麦新品种的有用基因的良好来源。Cox等(1990)将小麦与节节麦杂交,将节节麦基因导入小麦染色体组。利用节节麦中的微卫星探针对节节麦白叶和坚韧的花序轴基因进行作图。白叶表现型被... 节节麦是普通小麦的二倍体D染色体组供体,是培育小麦新品种的有用基因的良好来源。Cox等(1990)将小麦与节节麦杂交,将节节麦基因导入小麦染色体组。利用节节麦中的微卫星探针对节节麦白叶和坚韧的花序轴基因进行作图。白叶表现型被位于染色体2D6上的抑制因子W2^I所抑制。基因W2^I位于2DS的远端,与着丝粒无连锁。这说明W2^I位点离着丝点的距离在六倍体小麦的进化过程中一直保留下来,就象抑制基因位于节节麦和面包小麦上的同一位置一样。 展开更多
关键词 D染色体组 基因导入 普通小麦 遗传作图 节节麦 花序轴 祖先 小麦新品种 微卫星探针 六倍体小麦
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