微卫星DNA标记技术及其在遗传多样性研究中的应用

微卫星 DNA的高突变率、中性、共显性及其在真核基因组中的普遍性 ,使其成为居群遗传学研究、种质资源鉴定、亲缘关系分析和图谱构建的优越的分子标记。本研究系统介绍了微卫星 DNA在结构和功能上的特点 ,并对微卫星 DNA标记技术应用的遗传学机理和一般方法进行了扼要的阐述。另外 ,本研究还探讨了微卫星 DNA标记技术在遗传多样性研究中的应用现状 。

微卫星DNA标记技术及其在猪近交系遗传检测中的应用前景

首先对家畜核基因组中DNA微卫星标记作了简要的介绍 ,包括微卫星标记的定义、结构、分布、组成、保守性、优点及丰富的多态性等。其次主要介绍微卫星DNA标记技术在猪近交系遗传检测方面的应用。微卫星标记出现以前 ,只能通过公式来简单的计算近交系数 ,现在通过微卫星标记技术结合PCR(聚合酶链式反应 )技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,可以计算出近交系猪的等位基因频率 ,进一步得到它的多态信息含量。从而可以从分子水平上真正验证近交系猪的基因纯合度及同基因性 ,在转基因研究。

微卫星DNA标记技术及其在海洋生物遗传学中的应用

DNA简单重复序列从1974年在海洋生物中被发现,到1989年“微卫星”术语开始使用这段时间是这种新型分子标记技术的发展阶段。伴随着PCR技术的发明、成熟与拓展,微卫星DNA以其多态性高、随机分布、共显性遗传、重复性好等特点在生物学的个体及系统发育方面得到很广泛的应用。本文从微卫星DNA的发展简史开始,较详细地介绍了它的原理、方法及策略,然后概括了在海洋动、植物的遗传学中,微卫星DNA在遗传多样性分析、遗传图谱构建、基因鉴定和标记以及系谱认证等领域的研究,展望了其在海洋生物分子育种、基因克隆、生物保护等方面的应用前景。

微卫星DNA标记技术及其在鱼类中的应用

微卫星存在于几乎所有真核生物的基因组中,且呈随机均匀分布;在染色体上,除着丝粒及端粒区域外,其它区域均有广泛分布。微卫星能参与遗传物质结构的改变、基因调控及细胞分化等过程,有自身特异结合蛋白,能直接编码蛋白质。通过PCR扩增并使用凝胶电泳分离可产生大量含有微卫星DNA片断。微卫星DNA标记技术可应用于分析鱼类物种遗传多样性、分析群体的遗传结构、建立遗传图谱和基因定位、鱼类种质资源的保护、建立微卫星DNA指纹库、亲子鉴定和血缘关系分析以及种群生态学研究。

微卫星DNA标记技术及其在昆虫学上的应用

综述微卫星DNA标记技术在昆虫特定基因定位、种群遗传结构及分化、近缘物种的区分、昆虫生态特性的系统进化以及微卫星基因图谱的绘制等领域中的应用。

微卫星DNA标记技术及其在植物研究中的应用

微卫星DNA(或简单重复序列,simplesequencerepeats,SSR)是继RFLP、RAPD等分子标记后出现的第二代分子标记技术。随着分子生物学的发展,微卫星标记技术在植物基因组中的应用越来越广泛。由于SSR具有多态性高,呈共显性遗传,遵守孟德尔式分离,在数量上没有生物学的限制,实验操作简单,对样品质量要求不高等特点,因此被广泛用于植物遗传图谱的构建、基因定位、构建指纹图谱、遗传多样性及物种进化与亲缘关系的研究等方面。

微卫星DNA标记技术及其在昆虫学上的应用

微卫星DNA标记作为一种多态性和稳定性高、重复性好、呈共显性的分子遗传标记技术,目前已被广泛应用于昆虫学的研究中。本文介绍了微卫星DNA标记的基本原理和特点,并综述了近年来该技术在昆虫种群遗传结构及分化、生物学特性与习性、遗传图谱的构建、基因定位以及系统发生等领域中的应用。

微卫星DNA标记技术及其应用

微卫星DNA是高等真核生物基因组中种类多、分布广、具有高度的多态性和杂合度的分子标记,由于其具有多态性检出率高、信息含量大、共显性标记、实验操作简单、结果稳定可靠等优点,已经成为种群遗传学研究中被广泛应用的分子遗传标记.微卫星DNA标记技术在动物亲缘关系的鉴定、特定基因定位、群体遗传结构的分析、物种的进化和系统发生以及遗传基因连锁图谱的构建等方面已得到了广泛的应用.因此,就微卫星DNA遗传标记的原理、特点及应用等方面进行综述.

微卫星DNA标记技术在养猪业中的应用

1微卫星DNA的结构 微卫星DNA又称短串联重复或简单重复序列,由侧翼序列和重复串联的核心序列2部分组成,核心序列长度一般为1～6个碱基,首尾相连组成重复串联序列[1],其中最常见的是2个碱基的双核苷酸重复,即（TG）n和（CA）n,每个微卫星DNA的核心序列结构相同,

微卫星DNA标记技术成为近年来研究的一个热点

微卫星DNA标记在理论和实践上，都具有重要意义。目前微卫星标记在种群结构分析、物种遗传多样性的鉴定、遗传图谱的构建中均有广泛的应用。专家分析认为，在海洋生物，尤其是经济海产动植物分子遗传学理论与应用综合的研究领域中，微卫星DNA分子标志研究技术成为近年来研究的一个热点，值得大家关注．

DNA分子标记技术在口腔微生物研究中的应用

传统的微生物培养及鉴定方法,很难全面反映口腔微生物群落的状态及其与宿主之间的关系。近年来,随着分子生物学的发展,某些DNA分子标记技术被广泛应用于口腔微生物领域,为发现新菌种、相关口腔疾病发病机制的探讨及临床病例的快速诊断等方面开辟了新的途径。本文主要对相关DNA分子标记技术的基本原理及在口腔微生物领域的应用现状进行综述,比较各种方法的优势与不足,以期为不同的研究方向提供经验。

微卫星DNA标记技术对试验用虎皮猫群体遗传结构的分析

用筛选优化出的24个具有丰富多态性的微卫星位点对华北制药厂的34只虎皮猫基因组DNA进行PCR扩增,对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳和STR扫描,运用popgene3.2软件对试验用虎皮猫群体进行群体遗传结构分析。结果显示,虎皮猫群体平均观测等位基因数为4.083 3,平均有效等位基因数为2.632 3,平均有效杂合度为0.610 8,平均香隆指数为1.078 6。结果表明,微卫星DNA标记技术适于猫群体遗传结构分析;该试验用虎皮猫群体符合封闭群的遗传特性。

微卫星DNA标记技术检测ENU致C57BL/6J小鼠基因突变

目的建立微卫星DNA标记技术检测基因突变的方法。方法对C57BL/6J近交系小鼠腹腔注射乙基亚硝基脲(ENU)溶液后,分析其外观和精子畸形状况,应用41个在不同品系小鼠间表现多态性的微卫星位点,通过STR扫描技术检测ENU诱变后不同组织的微卫星多态性。结果个别ENU诱变小鼠背部出现白斑;精子畸形率在80%左右,显著高于对照组(P<0.01);有4个微卫星位点在不同组织表现出多态性。结论微卫星DNA标记技术可检测到基因突变,初步建立了微卫星DNA检测ENU致C57BL/6J小鼠基因突变的方法。

微卫星DNA分子标记技术及其在动物学研究中的应用

笔者阐述了微卫星DNA的结构及其多态性分析原理和微卫星标记DNA技术的实践方法,并简要介绍了近年来微卫星DNA分子标记技术在遗传多样性、遗传图谱构建和QTL定位、群体遗传结构分析和杂交优势预测以及疾病与疾病诊断研究等方面的应用。

微卫星DNA分子标记技术及其在茶树研究中的应用

本文阐述了微卫星DNA的结构及其多态性分析原理和微卫星标记DNA技术的实践方法,并简要介绍了近年来微卫星DNA分子标记技术在茶树遗传多样性、亲缘关系、种质鉴定、遗传图谱构建、目的基因的定位等方面的应用。

东北春播区糜子核心种质的荧光微卫星标记鉴定

优异种质资源是糜子新品种选育和产业发展的基础。本研究以190份东北春播区糜子核心种质为材料,利用前期构建的SSR标记在5'端标注荧光,进行PCR扩增和毛细管电泳。根据毛细管电泳检测的片段有无采用“0/1”表示,利用ID Analysis4.0进行区分,使用PopGene、PowerMarker、MEGA、Structure、NTSYS进行遗传多样性分析。试验结果表明,3个荧光SSR标记组合(RYW3+RYW6+RYW28)可区分190份材料,共检测出等位变异73个,平均为24.3333;有效等位基因数(Ne)为5.4728(RYW3)~15.8922(RYW6),平均为9.6496;检出Shannon多样性指数(I)为2.0851(RYW3)~2.9457(RYW6),平均为2.4896;观测杂合度(Ho)为0.7529(RYW6)~0.9574(RYW28),平均为0.8876;期望观测杂合度(He)为0.8194(RYW3)~0.9398(RYW6),平均为0.8765;Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.8173(RYW3)~0.9371(RYW6),平均为0.8741;多态性信息含量(PIC)为0.8656(RYW3)~0.9722(RYW6),平均为0.9198。基于UPGMA将190份资源划分为3个群组。基于Structure的遗传结构分析(K=3)将糜子核心种质分为3个类群,来源于东北地区的4个基因库(黑龙江、吉林、辽宁和内蒙古的一部分)。基于主成分分析将材料分为4个类群,与地理来源一致。利用在线二维码技术(https://cli.im/)构建了190份东北糜子核心种质的DNA分子身份证。

微卫星标记技术及其在家禽遗传育种中的应用

1标记的技术原理 微卫星DNA分布在整个基因组不同位置上,由于重复次数或重复程度不完全,而形成每个座位的多态性.SSR所揭示的多态微卫星DNA标记一般不直接用作探针,由于每类微卫星两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,因此可根据两端序列设计一对特异引物,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增每个位点的微卫星序列,经聚丙烯酰胺凝胶电泳,检测其多态性.其多态信息含量高达0.7以上.……

利用FIASCO技术进行波纹巴非蛤微卫星DNA标记分离与筛选的研究

为揭示波纹巴非蛤种质遗传特性、开发种质库,利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了其基因组微卫星标记的分离与筛选研究。基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接,用生物素标记的(CA)15或(AAG)7探针与其杂交,然后用磁珠富集、洗脱获得单链目的片段,经PCR扩增后形成双链,最后进行克隆转化,构建微卫星富集文库。挑选克隆用探针引物(CA)15或(AAG)7和载体引物进行PCR筛选,测序得到含有微卫星DNA的序列,根据序列设计和合成微卫星引物,进行引物适用性分析,并分析了湛江群体的遗传结构。结果表明:8对微卫星引物在湛江群体共检测到108个等位基因,每个位点等位基因数为5～19,期望杂合度为0.666～0.926,观测杂合度为0.400～0.882,4个位点(Pun4,Pun5,Pun6,Pun7)显著偏离哈迪-温伯格平衡(P<0.00625);PIC介于0.62～0.92,所有位点均属于高度多态位点(PIC>0.5)。说明FIASCO技术适合于波纹巴非蛤微卫星标记的分离与筛选,筛选得到的8个微卫星位点能用于波纹巴非蛤遗传多样性分析及野生群体与养殖群体的群体结构分析。