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微小核糖核酸与心血管疾病关系的研究进展 被引量:1
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作者 李莹 宋春莉 +2 位作者 刘斌 蔡丹 留志贤 《中国实验诊断学》 2015年第2期341-343,共3页
微小核糖核酸(microRNA,miRNA)为非编码RNA(ncRNA),它长度约22个核苷酸序列,与特定信使在相应的位点结合,通过改变信使RNA的稳定性来调节翻译过程,发挥调控作用,是一种重要的调控因子。多个研究发现miRNA作为ncRNA物种一个非常重要... 微小核糖核酸(microRNA,miRNA)为非编码RNA(ncRNA),它长度约22个核苷酸序列,与特定信使在相应的位点结合,通过改变信使RNA的稳定性来调节翻译过程,发挥调控作用,是一种重要的调控因子。多个研究发现miRNA作为ncRNA物种一个非常重要的部分[1],其存在鼠、线虫、果蝇等多个物种中,迄今为止估计人类miRNA序列编码约有1000个, 展开更多
关键词 微小核糖核酸 心血管疾病 信使RNA 核苷酸序列 MIRNA RNA序列 调控作用 调控因子
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永久性心房颤动患者心房组织相关微小核糖核酸调控网络研究
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作者 高杰 周建 +4 位作者 顾松 刘岩 安向光 张希涛 苏丕雄 《心肺血管病杂志》 2016年第6期431-435,共5页
目的:寻找永久性心房颤动(p AF)发病相关的关键微小核糖核酸(miRNA)及其调控靶基因。方法:表达谱芯片比较pAF患者(n=7)和窦性心律健康成人(n=4)的左心房组织的转录组,miRNA芯片筛选pAF相关差异表达miRNA,进行靶基因预测,与表达谱芯片的... 目的:寻找永久性心房颤动(p AF)发病相关的关键微小核糖核酸(miRNA)及其调控靶基因。方法:表达谱芯片比较pAF患者(n=7)和窦性心律健康成人(n=4)的左心房组织的转录组,miRNA芯片筛选pAF相关差异表达miRNA,进行靶基因预测,与表达谱芯片的筛选结果进行负相关分析后的基因集合进行显著性功能分析(GO-Analysis),得到显著性、低误判率、靶向性的功能以及对应的靶基因;利用miRNA与靶基因之间的靶向调控关系,构建差异miRNA与分析后得到的显著性GO所属交集靶基因的调控网络(miRNA-Gene-Network),得到网络中起核心调控作用的miRNA和被miRNA调控的关键靶基因;采用qRT-PCR方法检验另一组pAF患者(n=5)和窦性心律健康成人(n=4)的左心房组织标本,验证所寻找的miRNA和被调控的关键靶基因。结果:26个差异表达的miRNA(16个上调、10个下调)和610个靶基因有显著性改变(fold change>2,P<0.05),与miRNAs芯片预测靶基因负相关后建立miRNA-靶基因调节网络发现与pAF显著相关的20个miRNA和107个靶基因,相关度最高的是miR-144、miR-1284、miR-1827、miR-1、miR-3613-3p及miR-101;其调控的重要靶基因包括PTEN、TAOK1、RUNX1及TPM3等,参与心房电生理改变、成纤维细胞及胎儿基因表达等心房重构机制。qRT-PCR验证结果提示,这些主要的miRNA和靶基因与pAF发生密切相关。结论:通过表达谱基因芯片与miRNA芯片联合分析pAF左心房组织标本,构建miRNA-靶基因调控网络,是发现pAF相关关键miRNA及其调控靶基因一种方法。 展开更多
关键词 永久性心房颤动 微小核糖核酸 信使核糖核酸 靶基因 网络调控
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基于微小核糖核酸-信使核糖核酸网络探讨重复经颅磁刺激治疗缺血性脑卒中的分子机制
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作者 陈建敏 李菁 +2 位作者 黄华垚 陈振强 陈清法 《中华物理医学与康复杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期593-600,共8页
目的基于微小核糖核酸(miRNA)-信使核糖核酸(mRNA)调控网络探讨重复经颅磁刺激(rTMS)促进缺血性脑卒中(IS)神经修复的潜在分子机制。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载rTMS干预7 d后的IS大鼠皮质miRNA表达谱。使用R软件分析差异miRNAs... 目的基于微小核糖核酸(miRNA)-信使核糖核酸(mRNA)调控网络探讨重复经颅磁刺激(rTMS)促进缺血性脑卒中(IS)神经修复的潜在分子机制。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载rTMS干预7 d后的IS大鼠皮质miRNA表达谱。使用R软件分析差异miRNAs,通过在线数据库预测其对应的下游mRNAs,构建miRNA-mRNA调控网络,筛选关键miRNAs。对靶基因进行功能富集分析,构建靶基因所编码的蛋白质相互作用网络,识别网络中的核心mRNAs。选取无特定病原体动物(SPF)级雄性Sprague-Dawley大鼠24只,按随机数字表法随机分为假手术组、模型组和磁刺激组,每组8只大鼠。模型组和磁刺激组制备IS大鼠模型,仅磁刺激组接受连续7 d的rTMS干预,其余2组不进行干预。采用改良神经功能评分(mNSS)于造模前和造模成功1 d、3 d、7 d后评价3组大鼠的神经功能缺损程度;于造模成功8 d后深度麻醉大鼠,取脑组织行苏木精-伊红和尼氏染色观察组织缺失情况和神经元形态,利用实时荧光定量聚合酶链反应验证差异基因在3组大鼠缺血侧皮质中的表达趋势。结果共筛选出167个差异miRNAs和预测到25个mRNAs。富集分析表明,这些基因与细胞迁移的正向调节、神经营养因子受体信号通路的正向调节等生物学过程有关,涉及腺苷酸激活蛋白激酶、神经营养因子通路、大鼠肉瘤等信号通路。通过构建miRNA-mRNA调控网络,识别出miR-206-3p、miR-378a-3p、miR-107-3p、miR-92a-3p和miR-29b-3p共5个关键miRNAs;通过蛋白互作网络分析筛选出4个核心mRNAs,分别为整合素亚基β1、水通道蛋白4、脑源性神经生长因子(BDNF)、溶质载体家族2成员4。造模成功7 d后,磁刺激组的mNSS评分显著低于模型组同时间点(P<0.05)。与模型组相比,磁刺激大鼠右侧皮质的miR-206-3p表达明显降低(P<0.05),BDNF表达则显著增高(P<0.05)。结论miR-206-3p-BDNF调控网络和相关作用途径在rTMS促进IS大鼠神经修复过程中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 缺血性脑卒中 生物信息学 重复经颅磁刺激 基因表达综合数据库数据库 微小核糖核酸-信使核糖核酸调控网络
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上调微小mRNA-564对非小细胞肺癌A549细胞生物学行为的影响研究
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作者 王艳春 李昶 《河北医药》 CAS 2021年第14期2114-2117,共4页
目的探究微小信使核糖核酸564(miR 564)对非小细胞肺癌A549细胞生物学行为的影响。方法将非小细胞肺癌A549细胞分为空白组、下调组、上调组,空白组不做任何处理,通过细胞转染建立稳定转染的下调组、上调组。MTT检测细胞增殖能力,使用流... 目的探究微小信使核糖核酸564(miR 564)对非小细胞肺癌A549细胞生物学行为的影响。方法将非小细胞肺癌A549细胞分为空白组、下调组、上调组,空白组不做任何处理,通过细胞转染建立稳定转染的下调组、上调组。MTT检测细胞增殖能力,使用流式细胞仪检测细胞凋亡、周期分布情况,Transwell小室检测细胞侵袭,细胞划痕实验检测细胞迁移。Westernblot法检测细胞周期蛋白D1(CyclinD1)、p21重组蛋白(P21)、Toll样受体蛋白(TLR 4)、髓样分化因子(MyD88)、人核因子κB抑制蛋白α(IκBα)蛋白表达。结果上调组24、48、72 h,细胞增值率低于下调组,差异有统计学意义(P<0.05);上调组细胞凋亡率高于下调组,差异有统计学意义(P<0.05)。上调组侵袭细胞数、迁移细胞数,TLR-4、MyD88、IκBα表达均低于下调组,差异均有统计学意义(P<0.05)。上调组细胞处于G1期的比例高于下调组,差异有统计学意义(P<0.05)。上调组CyclinD1低于下调组,P21高于下调组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论上调微小mRNA 564经调控TLR 4、MyD88、IκBα蛋白的表达,抑制增殖、侵袭、迁移,促进凋亡,经调控CyclinD1、P21蛋白表达阻滞细胞周期分布。 展开更多
关键词 微小信使核糖核酸564 非小细胞肺癌 A549细胞生物学行为
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基于微小核糖核酸-信使核糖核酸调控网络的骨关节炎病变的相关分子机制研究
5
作者 程晓平 郑文伟 倪国新 《中华物理医学与康复杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期306-311,共6页
目的基于miRNA-mRNA调控网络进行生物信息学分析,探讨骨关节炎病变的相关分子机制。方法从GEO数据库下载人血清样本miRNA表达数据集,通过R语言limma包获取差异表达miRNA,采用miRwalk 2.0版数据库预测其对应靶基因(mRNA),并构建miRNA-mRN... 目的基于miRNA-mRNA调控网络进行生物信息学分析,探讨骨关节炎病变的相关分子机制。方法从GEO数据库下载人血清样本miRNA表达数据集,通过R语言limma包获取差异表达miRNA,采用miRwalk 2.0版数据库预测其对应靶基因(mRNA),并构建miRNA-mRNA调控网络。对靶基因进行功能GO分析和KEGG信号通路分析,构建靶基因所编码的蛋白质相互作用网络(PPI),从中筛选出骨关节炎病变的核心基因。结果共筛选出7个差异表达的miRNA(表达均为下调)和900个mRNA,这些基因主要涉及蛋白结合、DNA结合、转录等生理过程,参与Cell cycle、p53、Neurotrophin、PI3K-Akt等信号通路。蛋白相互作用分析表明MAPK1、TP53、MAPK14、CCND1、EP300、POLR2E、POLR2F、ABL1、RAC1、SKIV2L2为该调控网络的核心靶基因。结论OA的发生和发展涉及多个的miRNA、靶基因和作用途径,而通过构建骨关节炎相关miRNA-mRNA调控网络,可为找出骨关节炎病的分子机制和今后临床上诊疗提供新的思路。 展开更多
关键词 骨关节炎 微小核糖核酸 信使核糖核酸 调控网络
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肝癌组织中环氧化酶-2表达与微小转移的关系研究 被引量:1
6
作者 邓洪宇 《临床和实验医学杂志》 2007年第10期22-23,共2页
目的探讨肝癌组织中环氧化酶-2(Cyclooxygenase-2,Cox-2)的表达与肝癌微小转移之间的关系。方法应用免疫组织化学生物素化过氧化物酶复合物(SABC)法,检测44例原发性肝癌手术切除肝癌组织中Cox-2表达;应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检... 目的探讨肝癌组织中环氧化酶-2(Cyclooxygenase-2,Cox-2)的表达与肝癌微小转移之间的关系。方法应用免疫组织化学生物素化过氧化物酶复合物(SABC)法,检测44例原发性肝癌手术切除肝癌组织中Cox-2表达;应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测原发性肝癌患者外周血中AFP-mRNA。结果肝癌组织中Cox-2表达阳性率为41.6%(18/44),外周血甲胎蛋白信使核糖核酸(AFP-mRNA)阳性率25%(11/44),其中Cox-2表达阳性者中,AFP-mRNA阳性者为9例,占50%(9/18),而Cox-2表达阴性者中,AFP-mRNA阳性者为2例,占7.7%(2/26),两者有显著性差异。结论肝癌组织中Cox-2表达与肝癌微小转移有相关性。 展开更多
关键词 原发性肝癌 环氧化酶-2 微小转移甲胎蛋白信使核糖核酸
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微小膜壳绦虫感染对ICR小鼠小肠干细胞相关基因mRNA表达的影响 被引量:1
7
作者 杨汉蕾 赵敬 +4 位作者 张科 鄢宇航 门万琪 皮焕婷 牟荣 《贵州医科大学学报》 CAS 2021年第3期256-262,共7页
目的探讨微小膜壳绦虫(H.nana)感染对美国癌症研究所(ICR)小鼠小肠中干细胞相关基因信使核糖核酸(mRNA)表达的影响。方法取野生小鼠小肠内获取的H.nana虫体于显微镜下观察其形态,同时利用保守引物,采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增细胞... 目的探讨微小膜壳绦虫(H.nana)感染对美国癌症研究所(ICR)小鼠小肠中干细胞相关基因信使核糖核酸(mRNA)表达的影响。方法取野生小鼠小肠内获取的H.nana虫体于显微镜下观察其形态,同时利用保守引物,采用聚合酶链式反应(PCR)技术扩增细胞色素C氧化酶亚基I基因(COX 1)部分序列(PCOX 1),并与GenBank中记录的H.nana的COX 1参考株核苷酸序列进行同源性比对分析;60只ICR雌鼠随机均分为实验组(灌胃H.nana虫卵500个)和对照组(灌胃等量生理盐水),灌胃处理后1~10 d分别取2组小鼠距离回盲部6~8 cm处小肠肠段,观察2组小鼠小肠组织内虫体检获情况,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测2组小鼠小肠组织内G蛋白偶联受体5基因(Lgr 5)、多梳复合蛋白基因(Bmi 1)、武藏RNA结合蛋白基因(Msi 1)及淋巴细胞抗原6复合物基因(Ly 6 a)的mRNA相对表达量。结果野生小鼠体内获取的虫体符合H.nana的形态学特征,PCOX 1基因与GenBank中记录的H.nana的COX 1参考株核苷酸序列同源性为99%;qRT-PCR结果显示H.nana发育的似囊尾蚴阶段Lgr 5和Bmi 1表达上调、Ly 6 a表达下调(P<0.05或P<0.01),成虫阶段Lgr 5和Bmi 1表达下调、Ly 6 a上调(P<0.05或P<0.01),Msi 1在虫体发育的似囊尾蚴阶段和成虫阶段表达均下调(P<0.05)。结论H.nana感染可明显影响ICR小鼠Lgr 5、Bmi 1、Msi 1及Ly 6 a基因的mRNA水平,基因表达差异主要分2个阶段,分别对应H.nana虫体发育的似囊尾蚴阶段和成虫阶段。 展开更多
关键词 微小膜壳绦虫 小鼠 小肠 干细胞标志物 信使核糖核酸 实时荧光定量聚合酶链式反应
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食管癌患者行根治性切除术后血清miR-216a和Bcl-2 mRNA表达水平及与预后的相关性研究 被引量:5
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作者 贾东辉 杜宇 +1 位作者 黄飞 郝艳坤 《现代检验医学杂志》 CAS 2022年第2期93-99,共7页
目的 检测食管癌(esophageal cancer)患者行根治性切除术后血清中微小核糖核酸 -216a(micro RNA-216a,miR-216a),B 淋巴细胞瘤 -2(B-cell lymphoma-2, Bcl-2)信使核糖核酸(mRNA)表达水平,探讨二者与患者预后情况的关系。方法 选取 2012 ... 目的 检测食管癌(esophageal cancer)患者行根治性切除术后血清中微小核糖核酸 -216a(micro RNA-216a,miR-216a),B 淋巴细胞瘤 -2(B-cell lymphoma-2, Bcl-2)信使核糖核酸(mRNA)表达水平,探讨二者与患者预后情况的关系。方法 选取 2012 年 10 月~ 2016 年 5 月于保定市第二医院胸外科接受根治性切除术的食管癌患者 152 例作为观察组,选取同期入院体检的健康人 85 例作为对照组。根据 5 年随访结果将观察组患者分为生存组 49 例和死亡组103 例。采用实时荧光定量 PCR 法检测观察组术前和术后、对照组体检时血清 miR-216a 和 Bcl-2 mRNA 表达水平;分析食管癌患者术后血清 miR-216a 和 Bcl-2 mRNA 表达水平与临床病理特征的关系;比较生存组与死亡组术后血清 miR-216a 和 Bcl-2 mRNA 表达水平;采用 Kaplan-Meier 生存曲线分析食管癌患者术后血清 miR-216a,Bcl-2 mRNA 表达水平与患者 5 年总生存率的关系;COX 回归分析食管癌患者术后预后不良的危险因素;受试者工作特征(ROC)曲线分析术后血清 mi R-216a 和 Bcl-2 mRNA 表达水平对食管癌患者术后预后不良的预测价值。结果 与对照组相比,观察组术前和术后血清 miR-216a(2.05±0.42,1.36±0.30 vs 1.01±0.19)和 Bcl-2 mRNA(1.54±0.33,0.99±0.21 vs 0.68±0.15)表达水平显著升高,差异均有统计学意义(F=304.585,353.080,均 P =0.000),观察组术前血清 miR-216a 和 Bcl-2 mRNA 表达水平显著高于术后,差异有统计学意义(t=16.482,17.336,均 P =0.000);食管癌患者术后血清 miR-216a 和 Bcl-2 mRNA 表达水平与患者 TNM 分期、有无淋巴结转移有关,差异均有统计学意义(t=4.622 ~ 10.944,均 P=0.000);死亡组术后血清 miR-216a(1.50±0.34 )和 Bcl-2 mRNA(1.09±0.25)表达水平高于生存组(1.06±0.21,0.77±0.16),差异均有统计学意义(t=8.326,8.190,均 P =0.000);miR-216a 低表达组患者 5 年总生存率(50.63%)显著高于 miR-216a 高表达组(12.33%),Bcl-2 mRNA 低表达组患者 5 年总生存率(45.45%)显著高于 Bcl-2 mRNA高表达组(18.67%),差异均有统计学意义(χ^(2)=25.483,12.481,均 P=0.000);COX 多因素回归分析结果显示,TNM 分期 III ~ IV 期、有淋巴结转移、miR-216a 和 Bcl-2 mRNA 高表达均为影响食管癌患者术后预后不良的独立危险因素(P=0.000 ~ 0.024);血清 miR-216a,Bcl-2 mRNA 表达水平联合预测食管癌患者术后预后不良的曲线下面积 0.936明显高于二者单独预测的 0.864 和 0.837(Z=2.077,2.723,P=0.038,0.006)。结论 食管癌患者血清 miR-216a 和 Bcl-2 mRNA 表达上调,且术后低于术前,表明与患者术后预后密切相关,二者联合检测对食管癌患者术后预后不良有一定的预测价值。 展开更多
关键词 食管癌 微小RNA-216a B淋巴细胞瘤-2信使核糖核酸
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与儿童哮喘发病相关的关键miRNA、mRNA筛选 被引量:2
9
作者 邓坤 易蔚 +3 位作者 赖海艳 龙娟 任梦瑶 李伟伟 《山东医药》 CAS 2021年第24期59-63,共5页
目的筛选与儿童哮喘发病相关的关键微小核糖核酸(miRNA)、信使核糖核酸(mRNA)。方法从高通量基因表达数据库(GEO)数据库获取哮喘儿童miRNA芯片数据集GSE25230,利用GEO2R筛选出差异表达miRNA;对差异表达miRNA进行转录因子预测、下游靶基... 目的筛选与儿童哮喘发病相关的关键微小核糖核酸(miRNA)、信使核糖核酸(mRNA)。方法从高通量基因表达数据库(GEO)数据库获取哮喘儿童miRNA芯片数据集GSE25230,利用GEO2R筛选出差异表达miRNA;对差异表达miRNA进行转录因子预测、下游靶基因预测;利用GEO数据库获取哮喘儿童mRNA芯片数据集GSE63142,同时使用GEO2R筛选出差异表达mRNA,并对差异表达mRNA进行KEGG、GO功能富集分析;将差异表达miRNA预测靶基因与差异表达mRNA取交集获得目标基因,最后构建哮喘儿童发病潜在miRNA-mRNA调控网络,进一步筛选出关键miRNA、mRNA。结果共筛选出34个上调miRNA与35个下调miRNA,其转录因子主要有EGR1、SP1、SP4、RREB1、TFAP4。共筛选出68个上调差异表达mRNA与48个下调差异表达mRNA,KEGG富集结果显示差异表达mRNA主要涉及白介素17信号通路、神经活性配体—受体相互作用、趋化因子信号通路、肾素—血管紧张素系统等;GO功能富集分析显示,差异表达mRNA功能主要富集在细胞外基质、丝裂原激活蛋白激酶、细胞外间隙以及胞外区等生物学过程中。哮喘儿童发病潜在miRNA-mRNA网络Degree值排名前3的关键miRNA分别为hsa-miR-30c-5p、hsa-miR-181a-5p、hsa-miR-335-5p,关键mRNA分别为CXCL2、KIT、MUC5B。结论筛选出与儿童哮喘发病相关的关键miRNA分别是hsa-miR-30c-5p、hsa-miR-181a-5p、hsa-miR-335-5p,关键mRNA分别是CXCL2、KIT、MUC5B。 展开更多
关键词 哮喘 微小核糖核酸 信使核糖核酸 转录因子 基因本体功能 京都基因与基因组百科全书通路
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心律失常相关microRNA的研究进展 被引量:1
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作者 毛海燕 廉姜芳 《医学综述》 2013年第4期659-661,共3页
心脏性猝死是目前威胁人类的主要疾病之一,其病因很多,主要由恶性心律失常引起。由于不能确切认识心律失常的发生机制,目前尚无有效方法预防和治疗心脏性猝死。近年来,发现microRNA(miRNA)在心脏生理病理过程中发挥重要的调控作用,尤其... 心脏性猝死是目前威胁人类的主要疾病之一,其病因很多,主要由恶性心律失常引起。由于不能确切认识心律失常的发生机制,目前尚无有效方法预防和治疗心脏性猝死。近年来,发现microRNA(miRNA)在心脏生理病理过程中发挥重要的调控作用,尤其与心律失常的发生、发展密切相关。该文就miRNA在心律失常发生、发展中的作用予以综述。 展开更多
关键词 微小RNA 心律失常 信使核糖核酸
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异种肝移植手术前后移植肝差异表达基因的筛选及验证 被引量:2
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作者 李霄 纪洪辰 +3 位作者 潘登科 周亮 窦科峰 陶开山 《实用器官移植电子杂志》 2018年第5期349-354,共6页
目的探讨异种移植手术前后移植肝内差异表达基因的变化,并且进行筛选及验证。方法以α-1, 3-半乳糖苷转移酶基因敲除(GTKO)小型猪为供体、藏酋猴为受体,完成4例异种脾窝辅助性肝移植手术。于供肝修整时切取适量术前标本,于移植肝开放血... 目的探讨异种移植手术前后移植肝内差异表达基因的变化,并且进行筛选及验证。方法以α-1, 3-半乳糖苷转移酶基因敲除(GTKO)小型猪为供体、藏酋猴为受体,完成4例异种脾窝辅助性肝移植手术。于供肝修整时切取适量术前标本,于移植肝开放血流后48小时以肝穿刺活检获得术后标本。对手术前后的移植肝标本进行miRNAs和mRNAs的高通量芯片分析,筛选出关键的差异表达miRNAs和m RNAs,并进行实时定量PCR及Western Blot实验验证。结果与术前相比,有165个miRNAs在术后出现差异表达,其中上调分子112个,下调分子53个。筛选并验证mi-23b等12个出现显著差异表达的miRNAs,除miR-150和miR-126-3p外,其他miRNAs的表达变化情况与miRNAs芯片结果基本相符。与术前相比,有2 035个mRNAs在术后出现显著差异表达,其中922个表达上调、1 113个表达下调,筛选IGFBP6、CDK2AP1、TNFAIP6、FⅦ、NKG2D等5个生物学功能与肝脏移植密切相关的差异表达基因进行m RNA和蛋白水平验证。除NKG2D外,其他4个基因的蛋白水平表达变化与mRNA水平变化基本一致(均P <0.05),但CDK2AP1的蛋白变化幅度较小,差异无统计学差异(P=0.073)。结论异种肝移植术后移植肝的miRNAs和mRNAs表达出现较大变化,这些差异表达基因可能与免疫损伤及凝血功能障碍有关。 展开更多
关键词 异种移植 肝脏移植 小型猪 藏酋猴 微小核糖核酸 信使RNA
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急性髓系白血病患者血清miR-182-5p和HOXA9 mRNA表达及与复发的关系 被引量:3
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作者 沈宏宇 何川 +1 位作者 余娟 唐亚丽 《疑难病杂志》 CAS 2022年第1期7-11,23,共6页
目的探讨急性髓系白血病(AML)患者血清微小RNA-182-5p(miR-182-5p)和同源盒基因A9(HOXA9)信使核糖核酸(mRNA)的表达水平,并分析二者与AML治疗后复发的关系。方法选取2018年4月—2020年3月四川大学华西医院血液内科收治的AML患者110例作... 目的探讨急性髓系白血病(AML)患者血清微小RNA-182-5p(miR-182-5p)和同源盒基因A9(HOXA9)信使核糖核酸(mRNA)的表达水平,并分析二者与AML治疗后复发的关系。方法选取2018年4月—2020年3月四川大学华西医院血液内科收治的AML患者110例作为研究对象,根据患者治疗后1年内是否复发,分为AML缓解组(75例,治疗后1年内未复发)和AML复发组(35例,治疗后1年内复发)。另选取同期在医院体检健康者50例作为健康对照组。收集受试者实验室指标,实时荧光定量PCR法检测血清miR-182-5p和HOXA9 mRNA表达水平,分析血清miR-182-5p、HOXA9 mRNA表达水平及其相关性,AML患者复发的影响因素及血清miR-182-5p和HOXA9 mRNA表达水平对AML复发的预测价值。结果健康对照组、AML缓解组、AML复发组初诊时WBC水平、骨髓原始细胞比例依次升高,Hb、PLT水平依次降低(F/P=139.273/0.000、150.277/0.000、136.994/0.000、179.436/0.000);健康对照组、AML缓解组、AML复发组血清miR-182-5p、HOXA9 mRNA表达水平依次升高(F/P=254.519/0.000、129.910/0.000);血清miR-182-5p与HOXA9 mRNA表达水平呈正相关(r/P=0.519/0.000);血清miR-182-5p、HOXA9 mRNA表达水平高是影响AML患者复发的危险因素[OR(95%CI)=2.453(1.939~3.103)、2.341(1.524~3.596),P=0.000];血清miR-182-5p、HOXA9 mRNA预测AML复发的曲线下面积(AUC)为0.741、0.836,二者联合检测预测AML复发的AUC为0.861,优于单独预测者(Z/P=2.919/0.004、1.682/0.046)。结论血清miR-182-5p和HOXA9 mRNA可能通过高表达参与AML复发的进程,二者对AML复发的诊断可能有重要意义。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 微小RNA-182-5p 同源盒基因A9信使核糖核酸 复发
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长链非编码RNA在移植免疫中的研究进展 被引量:2
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作者 杨佩军 李霄 窦科峰 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期91-96,共6页
长链非编码核糖核酸(lnc RNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,它具有广泛的组织表达谱。研究发现,lnc RNA在许多生物学活动中都发挥重要作用,它的异常表达与个体发育和疾病之间存在联系。移植后免疫排斥反应是目前移植工作中最困扰... 长链非编码核糖核酸(lnc RNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,它具有广泛的组织表达谱。研究发现,lnc RNA在许多生物学活动中都发挥重要作用,它的异常表达与个体发育和疾病之间存在联系。移植后免疫排斥反应是目前移植工作中最困扰研究者的问题之一,近些年来lnc RNA与免疫系统各组成部分之间的相关性逐渐有文献报道,但目前对移植免疫与lnc RNA之间的关系研究甚少。本文就近年来lnc RNA在免疫系统,特别是移植免疫中的研究进展作一简述,为移植免疫相关研究提供参考。 展开更多
关键词 长链非编码核糖核酸(lncRNA) 微小核糖核酸(miRNA) 信使核糖核酸(mRNA) 器官移植 移植免疫 固有免疫 适应性免疫 自身免疫性疾病
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系统性红斑狼疮患者血中微小RNA和mRNA表达情况及相互作用的生物信息学分析 被引量:3
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作者 徐双艳 朱芸 +3 位作者 胡瑚 刘秀红 谭琳燕 梁作辉 《中国临床药理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第14期1867-1869,共3页
目的对系统性红斑狼疮(SLE)血中的微小核糖核酸(miRNA)和信使RNA(mRNA)相关的基因表达谱进行综合的生物信息学分析。方法拟定检索策略,从数据库中下载与SLE相关的基因表达谱,通过软件/数据库进行差异基因筛选、miRNA靶基因预测、miRNA... 目的对系统性红斑狼疮(SLE)血中的微小核糖核酸(miRNA)和信使RNA(mRNA)相关的基因表达谱进行综合的生物信息学分析。方法拟定检索策略,从数据库中下载与SLE相关的基因表达谱,通过软件/数据库进行差异基因筛选、miRNA靶基因预测、miRNA靶基因与mRNA取交集基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集、蛋白-蛋白互作网络和miRNA-mRNA互作网络。结果共纳入3个数据集,miRNA靶基因与mRNA有720个交集基因,且这些基因富集到CXC趋化因子活性、B细胞分化等重要的功能,以及经典的Wnt、Toll样受体等通路;分析得出蛋白-蛋白和miRNA-mRNA相互作用网络。结论miRNA可能通过直接靶向作用调控靶基因,进而影响SLE患者体内多种基因及信号通路的网络调控,从而参与SLE疾病的发生和发展。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮 微小核糖核酸 信使RNA 生物信息学分析
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微小RNA在急性肾损伤中的作用
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作者 冯新园 乔晞 《中华肾病研究电子杂志》 2022年第2期94-98,共5页
急性肾损伤(AKI)是多种原因引起肾功能短期快速下降所导致的临床综合征,患病率及死亡率高,深入研究AKI的调控机制对于改善其预后非常重要。微小RNA(miRNA)是内源性的短链非编码RNA,可通过影响靶mRNA的转录后活性来调控细胞的增殖、分化... 急性肾损伤(AKI)是多种原因引起肾功能短期快速下降所导致的临床综合征,患病率及死亡率高,深入研究AKI的调控机制对于改善其预后非常重要。微小RNA(miRNA)是内源性的短链非编码RNA,可通过影响靶mRNA的转录后活性来调控细胞的增殖、分化、代谢和凋亡等生物学功能。现已发现,miRNAs在各种人类疾病中发挥着重要作用。一些miRNAs通过促进炎症、凋亡和纤维化而在AKI中具有致病作用,而另一些miRNAs则具有抗炎、抗凋亡、抗纤维化和促血管生成的肾脏保护作用。所以,miRNAs不仅是AKI的新型生物标志物,还有望成为潜在的治疗靶点。本文综述了miRNA在AKI中的作用研究进展。 展开更多
关键词 急性肾损伤 微小核糖核酸 信使核糖核酸
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长链非编码RNA在矽肺纤维化发病机制中的作用研究
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作者 姚佳慧 楼建林 《中华劳动卫生职业病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期715-720,共6页
矽肺是一种由于长期吸入大量游离晶体二氧化硅所引起的进行性肺纤维化疾病,严重威胁相关劳动作业人员的健康,造成严重的疾病负担。矽肺的发病机制较为复杂且不明确,长链非编码RNA(lncRNA)在矽肺发病机制中起到重要作用。本文对矽肺发病... 矽肺是一种由于长期吸入大量游离晶体二氧化硅所引起的进行性肺纤维化疾病,严重威胁相关劳动作业人员的健康,造成严重的疾病负担。矽肺的发病机制较为复杂且不明确,长链非编码RNA(lncRNA)在矽肺发病机制中起到重要作用。本文对矽肺发病和疾病进展过程中lncRNA的作用机制进行综述,以期提高对该疾病的认识,为矽肺的防治提供思路。 展开更多
关键词 矽肺 长链非编码核糖核酸 肺纤维化 微小核糖核酸 信号通路 信使核糖核酸转录
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胆囊结石的高通量测序及生物信息学分析 被引量:1
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作者 杨斌 王强 刘斌 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期777-777,共1页
了解胆囊结石的发病机制及其重要意义.一、材料与方法1.一般资料:收集昆明医科大学第一附属医院10例胆结石患者和10例非结石患者的胆囊黏膜,用Illumina HiSeq 2500测序仪行高通量测序.2.数据分析:对比分析微小核糖核酸(miRNA)和信使核... 了解胆囊结石的发病机制及其重要意义.一、材料与方法1.一般资料:收集昆明医科大学第一附属医院10例胆结石患者和10例非结石患者的胆囊黏膜,用Illumina HiSeq 2500测序仪行高通量测序.2.数据分析:对比分析微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA)两者之间表达差异的基因并构建胆囊结石差异miRNA和mRNA表达谱及调控网络. 展开更多
关键词 胆囊结石 高通量 生物信息 测序 学分 信使核糖核酸 微小核糖核酸 miRNA
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支气管肺发育不良中新型miRNA-TF-mRNA共调控网络的鉴定
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作者 胡诤贇 史建伟 +3 位作者 张丽斐 姚倩倩 沈慧慧 朱连海 《国际呼吸杂志》 2022年第19期1474-1480,共7页
目的筛选与新生儿支气管肺发育不良(BPD)发病相关的关键转录因子(TF)、微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA), 并构建了调控网络。方法从高通量基因表达数据库GEO获取mRNA芯片数据集GSE108756, 筛选出的差异表达基因(DEGs)进行京都... 目的筛选与新生儿支气管肺发育不良(BPD)发病相关的关键转录因子(TF)、微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA), 并构建了调控网络。方法从高通量基因表达数据库GEO获取mRNA芯片数据集GSE108756, 筛选出的差异表达基因(DEGs)进行京都基因和基因百科全书(KEGG)、基因本体注释(GO)功能富集分析;参照HumanTFDB数据库获取与DEGs对应的TF后利用cytoHubba插件筛选出degree值前10的Hub TF;通过hTFtarget数据库找出Hub TF中7个TF所对应的靶基因;在GSE108756中获取7个TF及其靶基因所对应的探针表达量后做相关性分析, 筛选出最终纳入研究的6个Hub TF及所对应的正相关TF-mRNA关系队;利用Targetscan Human数据库获取靶向调控6个Hub TF的miRNAs, 并与miRNA芯片数据集GSE166762差异miRNAs取交集后匹配出负向调节的miRNA-TF关系队, 最后构建BPD患儿潜在miRNA-TF-mRNA调控网络, 进一步筛选出关键miRNA、mRNA。结果共筛选出201个差异表达基因, KEGG富集结果主要涉及B细胞受体信号通路、造血系统、原发免疫缺陷等作用, GO功能富集分析主要富集在B细胞增殖活化及免疫应答调节细胞表面受体等生物学过程中。与Hub TF(EBF1、TCF4、JUN、BCL11A、SPIB、E2F1)表达谱强关联的正相关下游靶基因有159个, 负相关的上游miRNA有120个。BPD患儿发病潜在的关键miRNA-TF-mRNA网络包括has-miR-217-TCF4-Pou2AF1、has-miR-150-5p-E2F1-ADM。结论本研究构建了新生儿BPD的miRNA-TF-mRNA共调控网络, 从转录调控的崭新视角为揭示BPD发病机制奠定理论基础。 展开更多
关键词 支气管肺发育不良 微小核糖核酸 转录因子 信使核糖核酸 基因调控网络
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