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土壤微生物网络复杂性预测黄土高原造林恢复生态系统多功能性
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作者 董政宏 张君红 +6 位作者 何佳 王健宇 李玉玉 冀泳標 刘凯茜 王振刚 陈文青 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2544-2560,共17页
人类活动导致黄土高原土地退化和生物多样性丧失,进而降低了生态系统功能。人工造林是该区域退化土地恢复的重要措施。现有的生态修复研究通常侧重于微生物群落物种多样性的恢复对单一生态系统功能的影响,而忽略了微生物间存在的相互作... 人类活动导致黄土高原土地退化和生物多样性丧失,进而降低了生态系统功能。人工造林是该区域退化土地恢复的重要措施。现有的生态修复研究通常侧重于微生物群落物种多样性的恢复对单一生态系统功能的影响,而忽略了微生物间存在的相互作用与生态系统多功能性(Ecosystem multifunctionality,EMF)的关系。为探究造林恢复过程中土壤微生物多样性和网络复杂性与EMF的关系,本研究采用时空代换法(space-time substitution method),沿50年造林恢复时间序列,分析了黄土高原地区造林恢复对土壤微生物群落多样性、土壤微生物网络复杂性以及与土壤养分循环相关的10个生态系统功能指标的影响,明确了土壤微生物群落特征与EMF的关系。结果表明,随造林恢复时间序列的增加,土壤微生物群落的综合多样性、网络复杂性和EMF均呈现出显著增加后下降的趋势(P<0.05),其中土壤微生物综合多样性和网络复杂性在第8年达到最高值,EMF在第20年达到最大值。在未控制土壤环境因素时,细菌和古菌多样性与EMF无显著相关性,真菌多样性与EMF呈显著正相关(P<0.001);土壤微生物群落的综合多样性和网络复杂性均与EMF显著正相关(P<0.001),其中土壤微生物网络复杂性对EMF的解释度更高。通过偏回归分析(Partial least squares regression,PLSR)控制土壤因子影响后发现,尽管土壤微生物的综合多样性和网络复杂性对EMF的解释度(P<0.001)均降低,但土壤微生物网络复杂性对EMF的解释度仍高于微生物综合多样性。结构方程模型(Structural Equation Model,SEM)进一步分析表明,土壤微生物多样性通过土壤微生物网络复杂性对造林修复地的EMF产生间接影响。综上所述,相较于土壤微生物综合多样性,微生物网络复杂性能够更好地预测EMF。而且,土壤微生物综合多样性主要通过促进网络复杂性间接正向影响EMF。本研究揭示了造林恢复生态系统中微生物群落特征与EMF的关系,为退化修复生态系统功能恢复提供了新的微生物调控机制解析。 展开更多
关键词 造林恢复 微生物多样 网络分析 网络复杂 生态系统多功能
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基于共现网络的关键微生物对秸秆还田土壤小麦产量的影响 被引量:3
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作者 邱丽丽 李丹丹 +1 位作者 张佳宝 赵炳梓 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期491-502,共12页
秸秆施用对作物产量影响效应不一致的机理尚不清楚,可能与秸秆施用诱导的土壤关键微生物群落组成及其丰度变化对产量影响的机理挖掘不够深入有关。选择红壤和黄褐土进行小麦盆栽实验,设置不同秸秆施用水平(S0、S10、S30,分别为0、10、30... 秸秆施用对作物产量影响效应不一致的机理尚不清楚,可能与秸秆施用诱导的土壤关键微生物群落组成及其丰度变化对产量影响的机理挖掘不够深入有关。选择红壤和黄褐土进行小麦盆栽实验,设置不同秸秆施用水平(S0、S10、S30,分别为0、10、30 g·kg^(-1)土),基于细菌-真菌共现网络评估微生物生态集群、酶活性、化学性质对秸秆施用下小麦产量的影响。结果表明,施用秸秆显著提升了两种土壤的速效养分、可溶性有机碳、微生物生物量碳含量及土壤酶(淀粉酶、转化酶、多酚氧化酶、脲酶、酸性磷酸酶、脱氢酶)活性,但红壤上小麦产量随着秸秆施用量增加显著增加,而黄褐土上则随着秸秆施用量增加而显著降低。与S0相比,红壤中S10和S30处理的籽粒重和地上部生物量分别提升33%~44%和73%~85%,黄褐土中则分别降低22%~25%和55%。共现网络中两个关键生态集群的丰度、酶活性、土壤化学性质的共同正效应影响了红壤小麦产量变化,而关键生态集群丰度对黄褐土小麦产量变化有更大的正效应。秸秆施用显著增加了红壤中与小麦产量正相关的Aspergillus丰度,显著降低了黄褐土中与小麦产量正相关的Bacillus、Burkholderia、Basidiobolus丰度。综上,秸秆施用后红壤中关键有益微生物丰度增加、酶活性增强、化学性质改善叠加作用使小麦产量提升;而黄褐土上小麦产量降低主要与关键有益微生物丰度降低有关,其效应超过化学性质和酶活性的改善。以上结果暗示关键微生物丰度的改变对秸秆还田土壤上作物产量变异有重要影响。 展开更多
关键词 秸秆还田 细菌-真菌网络 关键微生物 酶活 小麦产量
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基于共现分析的煤矿灾害知识图谱与关联性研究
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作者 蒋幸 赵春梅 +3 位作者 江成玉 张毅 蔡春林 夏勋鹏 《煤》 2024年第8期21-24,46,共5页
为探究煤矿灾害的研究动态与灾害之间的关联性,文章采用CiteSpace构建煤矿灾害知识图谱,以CNKI数据库中1996—2022年间已发表的7 379篇论文为数据样本,通过共现分析法的原理构建煤矿灾害共现矩阵,并引入Jaccard指数与Salton指数对煤矿... 为探究煤矿灾害的研究动态与灾害之间的关联性,文章采用CiteSpace构建煤矿灾害知识图谱,以CNKI数据库中1996—2022年间已发表的7 379篇论文为数据样本,通过共现分析法的原理构建煤矿灾害共现矩阵,并引入Jaccard指数与Salton指数对煤矿灾害关联性进行分析。研究表明:随着煤矿灾害研究的深入,煤矿事故死亡人数显著下降。煤与瓦斯突出、瓦斯爆炸和煤层自燃等是主要的煤矿灾害类型,爆炸超压、孔隙结构、煤尘爆炸等是当前的热点关键词。瓦斯爆炸-煤尘爆炸、瓦斯燃烧-外因火灾和煤尘燃烧-煤尘爆炸等之间的关联性较强,Jaccard指数与Salton指数均能较好地反映出煤矿灾害之间的关联性,可以定量表征煤矿灾害关联性。 展开更多
关键词 煤矿灾害 CITESPACE 知识图谱 关联 分析
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土壤微生物多样性通过共现网络复杂性表征高寒草甸生态系统多功能性 被引量:17
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作者 张君红 王健宇 +4 位作者 孟泽昕 何佳 董政宏 刘凯茜 陈文青 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期2542-2558,共17页
土壤微生物多样性在生态系统功能的维持方面发挥着至关重要的作用,但是土壤生物多样性与生态系统功能(Biodiversity-ecosystem function, BEF)关系仍存在争议。以往的研究多基于简单多样性指标(如物种数、香浓多样性指数等)对BEF关系进... 土壤微生物多样性在生态系统功能的维持方面发挥着至关重要的作用,但是土壤生物多样性与生态系统功能(Biodiversity-ecosystem function, BEF)关系仍存在争议。以往的研究多基于简单多样性指标(如物种数、香浓多样性指数等)对BEF关系进行探究,忽略了物种间复杂的相互作用在BEF关系中的重要性。以青藏高原米拉山高寒草甸为研究对象,使用Illumina MiSeq高通量测序技术测定了6个海拔高度(3755 m、3994 m、4225 m、4534 m、4900 m、5120 m)土壤细菌和真菌群落特征,分析了简单微生物多样性指标(物种数)和共现网络复杂性与生态系统多功能性(Ecosystem multifunctionality, EMF)的关系,以期进一步揭示微生物多样性与EMF的关系。共现网络分析表明,表征土壤细菌和真菌网络复杂性的节点(Node)和边(Link)沿海拔高度的升高显著下降(P<0.05)。土壤细菌和真菌的多样性和网络复杂性均沿海拔的升高显著下降(P<0.05),而且网络复杂性比相应的多样性下降明显。在未控制环境因素时,真菌和细菌的多样性和网络复杂性均与EMF显著正相关(P<0.05);其中真菌和细菌网络复杂性对EMF的解释度高于相应多样性对EMF的解释度。通过偏回归分析(Partial least squares regression, PLSR)控制年降水、年均温、黏粒含量、盐基离子和酸性离子等气候及土壤环境因子影响后,土壤细菌和真菌物种多样性与EMF的显著正相关关系变为不相关(P>0.05),而网络复杂性与EMF的显著正相关关系(P<0.05)仍然存在。利用方差分解分析(Variance partition analysis, VPA)将环境因子纳入对EMF的影响后发现,土壤微生物网络复杂性和环境因子对EMF变化的解释度可达80%,高于土壤微生物多样性与环境因子对EMF变化的解释度。结构方程模型(Structural equation model, SEM)分析进一步显示,土壤细菌多样性和真菌多样性通过促进对应共现网络的复杂性,间接对EMF产生正向影响。综上所述,相较于简单的多样性指标,土壤微生物网络复杂性对EMF具有更好的解释度和预测性,微生物多样性主要通过促进网络复杂性间接正向影响EMF。研究结果扩展了BEF关系的研究,证明微生物物种多样性主要通过促进对应的网络复杂性维持EMF。 展开更多
关键词 环境因子 海拔 微生物多样 微生物网络 网络复杂 生态系统多功能
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酿酒酵母对浓香型白酒酒醅微生物群落结构及功能的影响 被引量:1
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作者 马世源 李子健 +3 位作者 罗惠波 孙跃鹏 李津 黄丹 《中国食品学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第2期71-82,共12页
通过分析酿酒酵母对浓香型白酒酒醅微生物组成及挥发性代谢物的影响,探究其对酒醅微生物生态网络、挥发性代谢物以及微生物群落代谢功能的作用。将1株分离自浓香型白酒酒醅的酿酒酵母(Y1)扰动酒醅固态发酵过程,采用高通量测序技术和顶... 通过分析酿酒酵母对浓香型白酒酒醅微生物组成及挥发性代谢物的影响,探究其对酒醅微生物生态网络、挥发性代谢物以及微生物群落代谢功能的作用。将1株分离自浓香型白酒酒醅的酿酒酵母(Y1)扰动酒醅固态发酵过程,采用高通量测序技术和顶空固相微萃取质谱联用技术分析微生物群落构成和挥发性代谢物组成,利用随机森林学习算法计算能够表征试验组与空白组间差异的生物标志物,基于共现性网络模型分析试验组与空白组的微生物生态网络差异,采用PLS-DA和斯皮尔曼相关性分别分析其挥发性风味物质差异、差异代谢物与生物标志物的相关性,最后通过PICRUST2功能预测以及通路富集分析微生物群落潜在功能的改变。结果表明,5种细菌和15种真菌可以作为表征酿酒酵母扰动酒醅中微生物组成的生物标志物,并且提高了微生物生态网络的复杂性;挥发性代谢物的组成发生了改变,共有18种差异代谢物,部分挥发性代谢物的含量得到提高,绝大多数生物标志物与差异代谢呈显著相关。此外,酿酒酵母的扰动效应导致微生物群落出现180个上调基因,46个下调基因,这些基因大多数与物质的代谢有关。这些结果为酿酒酵母在白酒发酵中的应用及优化酒醅发酵过程提供了试验依据。 展开更多
关键词 酒醅 酿酒酵母 网络 生物扰动 挥发代谢物 功能预测
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苯醚甲环唑拌种对小麦根际微生物群落的影响
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作者 冯超红 李丽娟 +8 位作者 张姣姣 王俊美 李亚红 刘露露 韩自行 石瑞杰 万鑫茹 徐飞 宋玉立 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期163-171,共9页
小麦茎基腐病是我国北方小麦主产区的重大病害,对小麦安全生产造成严重威胁。化学农药的使用是最直接有效的防治方法,在植物病害防治中发挥重要作用。苯醚甲环唑是一种具有较高安全性的三唑类杀菌剂。本课题前期明确了苯醚甲环唑拌种对... 小麦茎基腐病是我国北方小麦主产区的重大病害,对小麦安全生产造成严重威胁。化学农药的使用是最直接有效的防治方法,在植物病害防治中发挥重要作用。苯醚甲环唑是一种具有较高安全性的三唑类杀菌剂。本课题前期明确了苯醚甲环唑拌种对小麦茎基腐病有一定的防治效果,且促生增产,但其对小麦根际微生物的影响尚不清楚。本文研究了苯醚甲环唑拌种对茎基腐病田中小麦根际土壤微生物的影响,结果表明,苯醚甲环唑拌种处理对小麦分蘖期,拔节期和灌浆期根际微生物的alpha和beta多样性均无显著影响,但使分蘖期镰孢属的相对丰度显著降低。微生物共现网络分析表明,苯醚甲环唑拌种处理提高了细菌网络的复杂性,降低了真菌网络复杂性,使植株根际微生物网络更接近健康植株根际的特征。该研究从根际微生物的角度为苯醚甲环唑防治小麦茎基腐病的机制研究及对土壤微生物的安全性评价提供理论依据。 展开更多
关键词 小麦茎基腐病 苯醚甲环唑 根际微生物 镰孢属 网络
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全量化收集粪污厌氧发酵失稳过程中微生物群落动态变化及生态集群组装模式
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作者 吁安 龙云 +4 位作者 陈莎莎 桂伦 吴强建 陈柳萌 龚贵金 《江西农业学报》 CAS 2024年第4期83-92,共10页
通过高通量测序技术分析了全量化粪污厌氧发酵在稳定、抑制和崩溃3个阶段的微生物菌群动态变化情况,结合微生物互作网络构建,识别互作网络中关键生态集群及组装模式,以期为全量化粪污沼气工程稳定运行提供理论依据和数据支撑。结果表明:... 通过高通量测序技术分析了全量化粪污厌氧发酵在稳定、抑制和崩溃3个阶段的微生物菌群动态变化情况,结合微生物互作网络构建,识别互作网络中关键生态集群及组装模式,以期为全量化粪污沼气工程稳定运行提供理论依据和数据支撑。结果表明:(1)在细菌门水平上,厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)为优势菌门,在各样品中相对丰度合计占比为96.0%。(2)在细菌属水平上,相对丰度较高的菌属为瘤胃梭菌属(Ruminiclostridium)、狭义梭菌属类群I(Clostridium_sensu_stricto_1)等。(3)在古菌属水平上,甲烷短杆菌属(Methanobrevibacter)、甲烷球形菌属(Methanosphaera)和甲烷袋状菌属(Methanoculleus)为优势菌属,在各样品中相对丰度合计占比为96.5%。(4)微生物互作网络分析揭示,全量化粪污厌氧发酵过程中的功能集群主要划分为3个模块(模块1~模块3),微生物群落在厌氧发酵受到抑制时会产生应激性调整;在产气稳定期,模块1占据主导地位,厌氧发酵系统的水解酸化菌与产甲烷菌间的协同良好,无明显的小分子挥发酸累积现象,可稳定水解产酸;在产气崩溃期,模块2、模块3的相对丰度大幅提升,并占据了模块1的生态位;微生物通过增加乙酸、丙酸等挥发性有机酸氧化菌的相对丰度和嗜酸产甲烷能力,缓解小分子挥发酸和氨氮的胁迫。 展开更多
关键词 厌氧发酵 全量化收集粪污 微生物群落 互作网络 生态集群
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秸秆与有机无机肥配施对潮土关键微生物及小麦产量的影响
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作者 郭伟 周云鹏 +4 位作者 陈美淇 李丹丹 王青霞 周谈坛 赵炳梓 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1134-1146,共13页
秸秆与化肥和鸡粪配施改变了土壤微生物群落结构及微生物间的相互作用关系,但这种变化与小麦产量间的关系尚不清楚。依托7年长期定位试验,选取5个施肥处理:不施化肥+秸秆离田(N0S0)、不施化肥+秸秆还田(N0S)、常规施化肥+秸秆离田(NS0)... 秸秆与化肥和鸡粪配施改变了土壤微生物群落结构及微生物间的相互作用关系,但这种变化与小麦产量间的关系尚不清楚。依托7年长期定位试验,选取5个施肥处理:不施化肥+秸秆离田(N0S0)、不施化肥+秸秆还田(N0S)、常规施化肥+秸秆离田(NS0)、常规施化肥+秸秆还田(NS)和施化肥+秸秆还田+鸡粪替代20%氮肥(NSM),研究不同施肥方式对细菌-真菌共现网络中微生物组成的影响,以及关键微生物与小麦产量间的相关关系。结果表明,与N0S0处理相比,NS0、NS和NSM处理的小麦籽粒产量分别提升539.20%、611.56%和676.56%,而N0S处理无显著变化。细菌和真菌群落组成均可分成显著不同的3组,分别为N0S0+N0S、NS0以及NS+NSM,即微生物群落组成在是否施用化肥之间显著不同;相同施用化肥情况下,在是否有施用有机物料之间显著不同。将重要性由高到低排序,导致不同处理细菌群落结构变化的主要土壤理化性质是有效磷(AP)、电导率(EC)、微生物生物量氮(MBN)、土壤有机碳(SOC)、易氧化有机碳(ROC)和颗粒有机碳(POC),导致不同处理真菌群落结构变化的主要土壤理化性质是EC、MBN、ROC、POC、AP和SOC。细菌-真菌共现网络中,两个关键模块(模块1和模块4)与小麦产量变化显著相关。NS+NSM处理提升了模块4中与小麦产量正相关的类诺卡氏菌属(Nocardioides)、纤维单胞菌属(Cellulomonas)、Pir4_lineage、金孢子菌属(Chrysosporium)、无茎真菌属(Acaulium)和裂壳菌属(Schizothecium)等有益菌的相对丰度,它们可降解纤维素和木质素、促进养分转化和循环或抑制病原菌生长;并显著降低了模块1中与小麦产量负相关的葡萄穗霉属(Stachybotrys)、无色穗孢属(Achroiostachys)和Fusicolla的相对丰度,它们为不利于土壤健康和作物生长的植物病原真菌。因此,化肥配施秸秆及化肥配施秸秆和鸡粪利于关键有益微生物增加及病原真菌减少,关键微生物的功能和相对丰度对小麦产量具有影响。 展开更多
关键词 秸秆还田 有机肥 细菌-真菌网络 关键微生物 小麦产量
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高寒草甸土壤细菌群落多样性和共现性网络对牦牛觅食强度的响应
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作者 孟令旭 贾彩玲 +2 位作者 许春雪 张潇文 呼和 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期9-18,共10页
牦牛觅食行为是影响青藏高原高寒草甸生态系统的重要因素之一,主要通过采食、践踏和粪便沉积影响土壤生态系统。土壤细菌群落作为土壤生态系统中的重要组成部分,在物质循环和能量流动等方面发挥着关键作用。本文通过在高寒草甸对牦牛进... 牦牛觅食行为是影响青藏高原高寒草甸生态系统的重要因素之一,主要通过采食、践踏和粪便沉积影响土壤生态系统。土壤细菌群落作为土壤生态系统中的重要组成部分,在物质循环和能量流动等方面发挥着关键作用。本文通过在高寒草甸对牦牛进行长期自由放牧处理,分析了不同觅食强度下的细菌群落组成及其共现性网络的变化,揭示了土壤细菌群落对牦牛觅食行为的响应特征。结果表明,细菌群落的优势菌门是变形菌门(Proteobacteria)(30.66%~33.38%)和放线菌门(Actinobacteria)(25.04%~28.99%),牦牛觅食显著增加了疣微菌门(Verrucomicrobia)(2.46~5.10%)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)(1.91%~2.68%)的相对丰度。牦牛觅食行为主要通过改变土壤pH值显著影响土壤细菌群落beta多样性,共现性网络复杂度随着觅食强度增加而增加,疣微菌门相对丰度的增加显著降低了细菌群落beta多样性和网络复杂度。牦牛觅食行为能够改善细菌群落稳定性,表明适当的觅食强度能够改善脆弱的高寒草甸生态系统。 展开更多
关键词 牦牛觅食 高寒草甸草原 土壤细菌 网络 土壤理化
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基于作者—关键词—引文多重共现的超网络知识关联研究 被引量:15
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作者 郭秋萍 梁梦丽 +1 位作者 刘秀丽 华康民 《情报理论与实践》 CSSCI 北大核心 2016年第7期20-26,共7页
[目的/意义]科技文献之间各式各样的关联关系形成错综复杂的网络,其结构具有多层性、多重性和嵌套性,可以采用超网络描述和揭示。[方法/过程]构建基于作者—关键词—引文3个子网的多重共现超网络模型,来揭示多层、多重、嵌套的异质共现... [目的/意义]科技文献之间各式各样的关联关系形成错综复杂的网络,其结构具有多层性、多重性和嵌套性,可以采用超网络描述和揭示。[方法/过程]构建基于作者—关键词—引文3个子网的多重共现超网络模型,来揭示多层、多重、嵌套的异质共现关系,并以图书馆、情报与文献学学科领域的"知识服务"主题为例进行实证分析。[结果/结论]该模型能够揭示科技文献网络同质节点的同质关联关系和异质节点的异质关联关系,为揭示科技文献间的隐性关联提供新的研究方法和范式。 展开更多
关键词 知识关联 多重 网络
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微生物群落对河流底泥中锑含量变化的响应 被引量:2
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作者 阳涅 孙晓旭 +3 位作者 孔天乐 孙蔚旻 陈泉源 高品 《生态环境学报》 CSCD 北大核心 2023年第3期609-618,共10页
锑(Sb)矿的开采会造成周边水环境发生Sb污染,对周边生态环境和人体健康造成潜在风险。微生物是河流中Sb污染物生物地球化学循环的主要驱动力之一,通过氧化/还原过程调控Sb的价态转化过程,从而改变Sb的毒性和流动性。以贵州独山县Sb污染... 锑(Sb)矿的开采会造成周边水环境发生Sb污染,对周边生态环境和人体健康造成潜在风险。微生物是河流中Sb污染物生物地球化学循环的主要驱动力之一,通过氧化/还原过程调控Sb的价态转化过程,从而改变Sb的毒性和流动性。以贵州独山县Sb污染河流底泥为研究对象,利用地球化学参数分析、高通量测序和统计分析等方法,研究Sb污染河流底泥中Sb的浓度分布规律及其对河流底泥微生物群落的选择性影响。结果表明,随着与Sb冶炼厂排水口距离的增加,河流底泥中Sb浓度逐渐降低,这可能是微生物还原产生的Sb(III)在厌氧环境下易与铁锰化合物结合形成沉淀所导致的。基于随机森林分析发现,Sb是塑造河流底泥微生物群落结构的主要因素,河流底泥微生物多样性随Sb浓度的降低而呈现逐渐增加的变化趋势。通过LEfSe差异分析可知,Sb是河流底泥微生物群落结构组成演变的关键驱动因子,在不同Sb污染环境下富集了差异微生物。结合共现网络分析,发现栖泥沼杆菌属Paludibacter和糖发酵菌属Saccharofermentans是Sb污染河流底泥中的核心微生物,其相对丰度与Sbtot、Sb(III)浓度呈显著正相关,表明这些关键微生物对Sb生物地球化学循环发挥重要作用,尤其对调控Sb的还原过程具有重要潜力。 展开更多
关键词 河流底泥 微生物群落 关键微生物 网络分析 锑还原菌
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桉树多代连栽引起的土壤细菌群落结构及共现性网络特征变化 被引量:5
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作者 许宇星 王志超 +1 位作者 竹万宽 杜阿朋 《桉树科技》 2022年第3期1-8,共8页
随着桉树人工林在中国的快速发展,不合理经营措施导致的林地土壤肥力质量下降问题受到种植农户、科研群体和社会大众的高度关注。本研究应用IlluminaMiseq PE300测序平台及共现性网络分析方法,对不同连栽代次桉树人工林土壤细菌网络特... 随着桉树人工林在中国的快速发展,不合理经营措施导致的林地土壤肥力质量下降问题受到种植农户、科研群体和社会大众的高度关注。本研究应用IlluminaMiseq PE300测序平台及共现性网络分析方法,对不同连栽代次桉树人工林土壤细菌网络特征、群落多样性及群落结构组成及其环境驱动因子展开研究。结果表明:尽管多代连栽模式对不同代次林分土壤细菌Alpha多样性未产生显著影响(除细菌丰富度),但集约化经营引起细菌群落结构的显著变化,细菌共现性网络的复杂性和凝聚性均随代次增加明显下降,多代连栽模式引起Acidobacteria丰度显著增加,而Actinobacteria和Patescibacteria的丰度显著下降。土壤硝态氮、有机质含量和容重作为关键环境因子驱动土壤细菌群落结构的演变过程。 展开更多
关键词 连栽代次 网络 土壤细菌 微生物群落结构及多样
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基于下一代测序分析3种不同保鲜处理的香椿在贮藏期间微生物多样性变化 被引量:2
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作者 林少华 陈存坤 +5 位作者 张慧杰 罗红霞 王丽琼 崔梦娇 许文涛 邓毛程 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2019年第14期42-50,共9页
香椿营养丰富,风味独特,深受消费者的喜爱,但容易腐烂变质,难以满足市场的需求。为了更好地提高其货架期,本研究以刚刚采摘的香椿嫩芽为试材,采用下一代测序技术比较不同保鲜方法下微生物的群落组成和多样性。结果表明,聚氯乙烯(polyvin... 香椿营养丰富,风味独特,深受消费者的喜爱,但容易腐烂变质,难以满足市场的需求。为了更好地提高其货架期,本研究以刚刚采摘的香椿嫩芽为试材,采用下一代测序技术比较不同保鲜方法下微生物的群落组成和多样性。结果表明,聚氯乙烯(polyvinyl chloride,PVC)保鲜膜结合紫外照射(ultraviolet irradiation,ZW)处理的香椿较聚氯乙烯保鲜膜、聚氯乙烯保鲜膜结合1-甲基环丙烯(1-methylcyclopropene,1-MCP)、聚氯乙烯保鲜膜结合乙烯吸附剂(ethylene absorbent,EA)处理的香椿的OTUs(Operational Taxonomic Units)和多样性均有所下降,保持优势的细菌门和真菌门分别为蓝菌门(Cyanobacteria)和子囊菌门(Ascomycota)。主成分分析表明,PVC+ZW处理组的微生物群落相似性更高,群落的稳定性更好。共现网络分析发现,紫外照射提高了不同菌群之间的负相关性。 展开更多
关键词 香椿 下一代测序 微生物多样 主成分分析 网络分析
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基于共现分析和关联规则的概念股共现网络研究 被引量:1
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作者 施国良 段秋宇 王春宝 《管理现代化》 CSSCI 北大核心 2020年第2期16-20,共5页
为全面地把握概念股的热点及关联性,降低投资风险,基于股票共现构建概念股共现网络,对概念股进行了热点概念发现、共现分析与关联规则挖掘,实证检验概念股之间的关联性强度。结果表明:概念股中股票共现现象普遍存在,短期热点概念股是热... 为全面地把握概念股的热点及关联性,降低投资风险,基于股票共现构建概念股共现网络,对概念股进行了热点概念发现、共现分析与关联规则挖掘,实证检验概念股之间的关联性强度。结果表明:概念股中股票共现现象普遍存在,短期热点概念股是热点事件的反映,长期热点概念股是投资策略驱动的结果;热点概念股与相关联的概念股因股票共现而表现出趋同效应,通过共现分析和关联规则相结合,精确计量了概念股关联性的强度和方向。 展开更多
关键词 概念股 股票市场 分析 关联规则 社会网络
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科尔沁沙地樟子松人工林土壤真菌共现网络及其与土壤因子的关系
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作者 刘明慧 柳叶 +5 位作者 任悦 高广磊 丁国栋 张英 赵珮杉 刘轩 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第23期9912-9924,共13页
为揭示科尔沁沙地樟子松(Pinus sylvestris var.mongolica)人工林土壤真菌间相互作用,以不同林龄(中龄、近熟和成熟)、不同土层(0—10和10—20 cm)樟子松人工林土壤为研究对象,以未造林地为对照样地,采用分子生态网络分析法,基于随机矩... 为揭示科尔沁沙地樟子松(Pinus sylvestris var.mongolica)人工林土壤真菌间相互作用,以不同林龄(中龄、近熟和成熟)、不同土层(0—10和10—20 cm)樟子松人工林土壤为研究对象,以未造林地为对照样地,采用分子生态网络分析法,基于随机矩阵理比较分析樟子松人工林土壤真菌网络特征及其影响因素。研究结果表明:(1)中龄林到近熟林阶段,科尔沁沙地樟子松人工林土壤真菌网络平均连通度增大,平均路径长减小,网络愈加复杂,而近熟林到成熟林阶段则相反,网络愈加简单;不同土层间,10—20 cm土层土壤真菌平均路径长度小于0—10 cm土层,平均连通度和聚类系数大于0—10 cm土层,10—20 cm较0—10 cm土壤真菌间相互联系更为密切;与樟子松人工林相比,未造林地土壤真菌网络中的平均连通度略低于近熟林,平均路径长低于樟子松人工林,未造林地土壤真菌群落更不稳定。(2)中龄、近熟和成熟樟子松人工林土壤真菌关键菌种分别为Guehomyces sp.、Oidiodendron sp.和Pseudeurotium sp.,未造林地关键菌种为Alphamyces sp.。在0—10 cm土层樟子松人工林和未造林地土壤关键菌种为红菇属真菌(Russula sp.),在10—20 cm土层土壤关键菌种为Guehomyces sp.。(3)樟子松人工林土壤真菌网络组成与土壤含水量显著相关,土壤全氮与土壤真菌网络呈显著负相关(P<0.05),土壤pH值和速效磷与土壤真菌网络呈显著正相关(P<0.05)。在樟子松人工林中,近熟林土壤真菌群落更复杂;随土壤深度增加,土壤真菌群落联系愈加紧密;种植樟子松后土壤真菌群落更复杂。土壤真菌关键菌种组成在不同林龄和土层间均存在差异,土壤真菌网络组成受土壤含水量影响,中介中心性前50的操作分类单元(OTU)主要受土壤全氮、pH和速效磷等理化性质影响。研究结果有助于深入理解科尔沁沙地樟子松人工林土壤真菌群落结构,并为科尔沁沙地樟子松人工林可持续经营提供理论依据和科技支撑。 展开更多
关键词 樟子松 土壤微生物 网络 林龄 土层 科尔沁沙地
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生物共现网络原理及其在淡水生态系统评估中的应用 被引量:3
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作者 万凌琳 陈芷凡 +4 位作者 郭佳 佟立辉 任丽娟 韩博平 吴庆龙 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1765-1787,I0001,I0002,共25页
快速有效的生物监测指标对于评估、保护、管理和恢复淡水生态系统至关重要.传统评估方法主要利用指示生物或类群的出现率和多度信息,但是忽略了水体环境中“生物”与“生物”,以及“生物”与“环境”间相互作用的复杂关系,而这些相互作... 快速有效的生物监测指标对于评估、保护、管理和恢复淡水生态系统至关重要.传统评估方法主要利用指示生物或类群的出现率和多度信息,但是忽略了水体环境中“生物”与“生物”,以及“生物”与“环境”间相互作用的复杂关系,而这些相互作用对淡水生态系统的生物多样性、生态系统服务功能以及生态系统对环境变化的响应有着深刻影响.生物共现网络是群落水平物种互作的结构模型,通过物种在群落出现及丰度数据,描述了物种间潜在的相互作用、群落的基本结构,反映群落在生态系统的功能和结构特性.生物共现网络展示了淡水生态系统中所有生物体之间潜在的相互作用关系,其拓扑结构特性可与特定的生态系统状态相关联,能够揭示生态系统的组织规律及其功能,可作为早期的、灵敏的生物指标,是一种很有应用前景的评估淡水生态系统状态和稳定性的工具. 展开更多
关键词 网络 生物群落 淡水生态系统 生态监测与评估
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盐碱土壤冬枣根际微生物多样性分析 被引量:3
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作者 朱家瑞 李新岗 +1 位作者 石国朝 杨桂燕 《经济林研究》 北大核心 2022年第3期36-45,64,共11页
【目的】研究不同土壤盐分条件下冬枣根际土壤微生物多样性、群落结构及其潜在功能,为盐碱条件下多年生果树栽培提供指导,同时为果树与微生物及环境之间互作的研究提供数据支撑。【方法】选取陕西省大荔县土壤盐分条件不同的冬枣园,采... 【目的】研究不同土壤盐分条件下冬枣根际土壤微生物多样性、群落结构及其潜在功能,为盐碱条件下多年生果树栽培提供指导,同时为果树与微生物及环境之间互作的研究提供数据支撑。【方法】选取陕西省大荔县土壤盐分条件不同的冬枣园,采集结果树根部周围土壤样品,测定其理化性质,并利用16S和ITS扩增子测序技术,对根际土壤样品中的细菌及真菌进行高通量测序。【结果】盐碱条件下,冬枣根际土壤中的优势细菌门分别为变形菌门Proteobacteria、酸杆菌门Acidobacteriota、放线菌门Actinobacteriota和厚壁菌门Firmicutes,其优势真菌门分别为子囊菌门Ascomycota、被孢霉门Mortierellomycota、担子菌门Basidiomycota和壶菌门Chytridiomycota。盐分的增加会导致微生物多样性和丰度均降低,使其群落组成更加相似;过高的盐分会降低细菌中类芽孢杆菌属Paenibacillus、链霉菌属Streptomyces等功能细菌的丰度,减少真菌中外生菌根和丛枝菌根,进而减弱微生物的代谢功能性。但是,高盐条件下子囊菌门和嗜盐单胞菌属Halomonas、Colidextribacter属、Pelagibius属等耐盐微生物均具较高的丰度。共现性网络分析结果表明,在应对盐分胁迫时,相比于细菌,真菌尤其是子囊菌门为维持微生物群落的稳定性而贡献得更多。【结论】土壤盐分是影响冬枣根际微生物群落组成及微生物之间共生关系的关键因素。冬枣根际的嗜盐单胞菌属等耐盐微生物或可成为盐碱条件下冬枣栽培及盐碱土壤改良的可利用资源。 展开更多
关键词 冬枣 土壤盐分 根际微生物 微生物多样 微生物网络
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我国组织二元性热点领域研究综述及可视化分析——基于共词分析和共现网络图谱 被引量:4
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作者 刘辉 张向群 《科技与管理》 2018年第1期70-76,共7页
以2006—2017年(截止2017. 6. 20)中国知网(CNKI)刊载的文章为研究基础,采用描述性统计分析、共现网络图谱及共词分析法对293篇与组织二元性主题高度相关的文献进行全面梳理。从宏观角度,展示了组织二元性相关研究的发文数量及趋势、主... 以2006—2017年(截止2017. 6. 20)中国知网(CNKI)刊载的文章为研究基础,采用描述性统计分析、共现网络图谱及共词分析法对293篇与组织二元性主题高度相关的文献进行全面梳理。从宏观角度,展示了组织二元性相关研究的发文数量及趋势、主要研究机构及发文作者;通过Ucinet 6. 0、Bib Excel和Spss等软件对高频关键词矩阵做社会网络分析、聚类和多维尺度分析,直观展现了我国组织二元性的研究现状,探究出组织二元性研究的热点集中在组织二元性概念界定、实现路径、适用领域、应用结果 4方面。 展开更多
关键词 组织二元 文献综述 词分析 网络图谱
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MEDLINE数据库中主要主题词与全部主题词的共现网络无标度性与小世界特性的检验分析 被引量:3
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作者 高雯珺 崔雷 《中华医学图书情报杂志》 CAS 2015年第10期65-71,共7页
以MEDLINE数据库所收录的药理学主题文献集合为例,分别构建全部主题词和主要主题词共现网络,分析了两种网络节点的点度中心度、接近中心度、中介中心度等3种中心性指标。然后根据节点的度分布,检验了两种网络节点度分布的无标度性,比较... 以MEDLINE数据库所收录的药理学主题文献集合为例,分别构建全部主题词和主要主题词共现网络,分析了两种网络节点的点度中心度、接近中心度、中介中心度等3种中心性指标。然后根据节点的度分布,检验了两种网络节点度分布的无标度性,比较分析了两种词共现网络的整体属性(平均距离和聚集系数)以检验其小世界效应。结果发现,这两种词共现网络都具有无标度特性和小世界效应,由全部主题词构建的共现网络适用于网络属性分析,由主要主题词构建的网络适用于学科主题内容分析。 展开更多
关键词 网络 社会网络分析 中心 无标度 小世界效应
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基于文献计量的近30年国内外土壤微生物研究分析 被引量:31
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作者 陈香 李卫民 刘勤 《土壤学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期1458-1470,共13页
为了解国内外土壤微生物的最新研究热点和发展趋势,借助Web of Science中SCI-EXPANDED数据库,利用VOSviewer、CiteSpace可视化分析软件等工具,对1990—2018年间发表的关于土壤微生物研究文献的国家、研究机构、期刊来源、主要研究内容... 为了解国内外土壤微生物的最新研究热点和发展趋势,借助Web of Science中SCI-EXPANDED数据库,利用VOSviewer、CiteSpace可视化分析软件等工具,对1990—2018年间发表的关于土壤微生物研究文献的国家、研究机构、期刊来源、主要研究内容及关注热点进行计量分析。结果表明,该领域的中国发文量呈快速增长趋势,但总被引频次较低;美国的发文量、总被引频次均位于首位。中国科学院是重要的研究机构,其发文量、总被引频次均位于第一,但篇均被引频次较低。主要的期刊来源有Applied and Environmental Microbiology、Soil Biology&Biochemistry等。国内关键词共现网络形成较晚,但发展速度较快,表现出同国外研究热点趋同的发展趋势。国内外研究热点主要集中于土壤微生物参与土壤有机质分解、碳氮养分循环、对污染土壤的微生物降解和修复作用、环境条件变化对土壤微生物群落结构多样性的影响、植物-微生物相互作用机理等。本文对了解土壤微生物研究领域的发展态势具有一定参考价值。 展开更多
关键词 土壤微生物 文献计量学 Web of Science 关键词网络 数据可视化分析
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