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基于异构图神经网络的微生物与疾病关联挖掘
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作者 时宇 吴舜尧 《青岛大学学报(自然科学版)》 CAS 2022年第4期8-13,共6页
微生物与疾病关联挖掘的工作大多未考虑微生物分类信息树等微生物背景信息,也未能充分利用微生物与疾病间的非线性关联,为此提出一种基于异构图神经网络的微生物与疾病关联挖掘方法。利用微生物分类信息树完善生物分子网络,输出异构生... 微生物与疾病关联挖掘的工作大多未考虑微生物分类信息树等微生物背景信息,也未能充分利用微生物与疾病间的非线性关联,为此提出一种基于异构图神经网络的微生物与疾病关联挖掘方法。利用微生物分类信息树完善生物分子网络,输出异构生物分子网络节点的低维向量并挖掘节点间关联。研究结果表明,与传统方法相比,引入微生物分类信息树的新方法具有更好的效果,AUC、AUPRC和F1-score分别达到0.901、0.552和0.557。 展开更多
关键词 图神经网络 微生物与疾病关联 微生物分类信息树
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