微生物基因检测技术在鄂尔多斯盆地神府南气田勘探中的应用

针对鄂尔多斯盆地构造复杂,储层分布差异大,气藏富集规律不明等问题,本文采用微生物基因检测技术的荧光定量PCR法测量研究区样品中油气指示基因的丰度,同时利用高通量基因测序法检测样品中的烃类微生物种群类型,分析认为,本区主要有东北部、西部、南部三个烃类异常带,展布特征与沉积认识吻合,且西部、南部有亲缘关系,东北部与二者无亲缘关系,可能与致密气、煤层气不同层系烃的逸散有关。实钻表明,本技术对于鄂尔多斯盆地致密气和煤层气混源区的含油气性评价方面具有较好的适用性,为油气有利区带筛选提供参考依据。

微生物基因组研究进展

本文综述了微生物全基因组测序的基本方法,数据收集和组装,序列缺口的填充、全基因组序列注释。同时对微生物基因组的研究现状和重大意义也作了简单概述。

微生物基因组上药物作用靶位的识别

在基因组时代 ,开发抗微生物的新药离不开基因组研究 ,基因组测序和生物信息学的迅猛发展使得微生物基因组上药物作用靶位的识别成为可能 ,并将使得细菌、真菌和寄生虫等对抗生素的耐药性成为过去。

晋西北酸粥发酵过程中微生物基因组DNA提取方法的比较

为了找到一种简单高效的晋西北酸粥发酵过程中微生物基因组DNA提取方法,本文采取对提取的微生物基因组DNA进行浓度测定的方法,比较了溶菌酶-SDS-蛋白酶K法、改良CTAB法和改良CTAB-溶菌酶法三种方法的提取效果。结果表明:溶菌酶-SDS-蛋白酶K法效果最好,可以获得质量较高的微生物基因组DNA,DNA浓度为1657.53 ng/μL;改良CTAB-溶菌酶法比溶菌酶-SDS-蛋白酶K法效果差,DNA浓度为1308.08 ng/μL;改良CTAB法对微生物基因组DNA的提取效果比溶菌酶-SDS-蛋白酶K法更差,DNA浓度为1098.36 ng/μL。以提取到的微生物基因组总DNA为模板,进行16S r DNA基因的PCR扩增,在回收产物中目的条带清晰,表明提取到的微生物基因组DNA含量高、结构完整。整体实验结果表明,溶菌酶-SDS-蛋白酶K法对于提取晋西北酸粥发酵过程中微生物基因组DNA效果最好。

微生物基因组的生物信息学研究平台的建立

随着人类基因组计划及其它测序工作顺利进行,人们已经得到了大量的基因序列。如何阐明这些序列的功能和意义,是功能基因组学的主要任务。生物信息学和比较基因组学为加速这一进程提供了有利的工具。该研究建立了对已经完成全基因组测序和部分测序的25种细菌的基因组的生物信息学研究平台,提供了WEB形式的服务(http://202.116.74.108)。25种细菌的全基因组蛋白质序列可以在NCBI的ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geabank/genomes/bacteria下载。该系统可以按照基因序列号、功能和种属名查询基因序列,根据美国国家信息中心(NCBI)的功能代码表对每个基因进行了自动和手工分类,并可查询分类情况,在此基础上建立了几种亲缘关系相近的种属的同源基因相互注释功能的应用。

用微生物基因组开发对付感染性疾病的新措施

综述微生物基因组研究对于深化认识微生物之间关系的作用以及利用微生物基因组开发抗感染性疾病的主要手段和进展,其中重点是利用生物信息学手段、基因芯片、噬菌体表面展示系统筛选新的抗微生物药物作用靶点。

中国微生物基因组研究

ISBN：9787030357236定价：190开本：16装帧：平装页码：692初版时间：2012-10-1专业分类：微生物学读者对象：《中国微生物基因组研究》内容属微生物学科前沿领域,可供从事医学、农业、工业、环境、生态、动物医学、植物病原微生物研究的研究人员、教师和研究生参考。

环境微生物基因组学的生态学管窥

自然界约99%的微生物不能通过传统的分离筛选途径进行培养(即未培养微生物),为获得新的基因资源,更全面地认识微生物多样性和微生物在自然环境和生物圈中的重要作用,近年来随着分子生物学的快速发展及其在微生物研究中的广泛运用,以环境中未培养微生物为研究对象的新兴学科——环境微生物基因组学成为国内外学者的研究热点。本文介绍了环境微生物基因组学的分析研究策略及生态作用:从环境样品中直接提取所有微生物的总DNA,采用适宜的载体克隆到宿主细胞中构建宏基因组文库,再筛选新的活性物质或基因;从生态学角度分析微生物不可培养的原因,可利用环境微生物基因组技术进行土壤污染修复、畜禽养殖除臭、鉴定新物种以及确定特定生态环境体系中未培养微生物种群与群落的结构组成及物种的进化模式。

基于微生物基因组序列开发疫苗的研究进展与分析

疫苗的问世,使得许多危害人类健康的疾病得到了控制,对全世界人类预防和治疗疾病方面发挥了不可磨灭的作用,而一些特殊的病原体所引起的人类疾病的危害性是极大的,但采用传统的方法根本无法制备其安全有效的疫苗。直到20世纪末,微生物全基因组测序、生物信息学分析、蛋白质组学和DNA芯片技术的发展为疫苗研究领域带来了前所未有的变革。基于微生物基因组序列开发疫苗的新方法应运而生,为采用传统方法无法取得成功的疫苗的制备带来了光明。本文从基于微生物基因组序列开发疫苗的可行性、原理、实验方法以及应用等方面进行了综述。

农业微生物基因工程研究现状与前景

阐述了基因工程在微生物固氮、微生物农药、微生物酶制剂及农业生态环境污染治理等主要领域的研究现状,提出了农业微生物基因工程今后发展的重点和研究方向.

微生物基因组与抗微生物药物的发展

微生物基因组及后基因组研究是继人类基因组计划后生命科学领域启动的又一巨大工程。其主要研究内容为阐明微生物基因的核苷酸序列,并在此基础上认识微生物基因组的生物学功能。对微生物基因组及后基因组的研究,有助于阐明病原微生物的耐药机制,为发现和研制新的抗微生物药物提供广阔的发展前景。

基于分布式信源编码的微生物基因组序列压缩算法

提出一种基于分布式信源编码的微生物基因组序列压缩算法,用于改进微生物基因组序列压缩效率不高的现状.首先将微生物基因组序列映射为两条二进制序列并映射为两幅二值图像以便使用更多的信源相关性.然后构建分布式信源编码来同时传输两个二值图像.同时,为保证边信息传输的高效,优化Context加权方法被用于边信息压缩.实验结果表明,与现有微生物基因组序列压缩算法相比较,该算法能获得更高的压缩效率,并且保持较合理的运算复杂度.

微生物基因组与药靶研究

微生物基因组研究及其相关的技术平台发展迅速,为发现新的药靶和研制新型抗微生物药物提供了有利条件.除了毒力因子、保守基因外,其他一些分子也可成为潜在的药靶.基因功能研究为发现潜在的药靶提供了可能,也是药靶研究中的主要难点之一.现在已有了对候选药靶进行识别和有效性评估的系统,但还有待于进一步完善.

合成、重构和改造微生物基因组

合成生物学是生物科学领域住21世纪刚刚出现的一个新的分支学科，作为一门新兴的交叉学科，与传统生物学通过解剖生命体以研究其内在构造的办法不同，合成生物学的研究方向是从最基本的要素开始一步步建立零部件。与基因工程把一个物种的基因延续、改变并转移至另一物种的作法不同，合成生物学的目的在于建立人工生物体系，让它们像电路一样运行。

微生物基因组在生物质能源中的应用

生物质能源是一种可再生的绿色能源,介绍了生物质能源利用的现状及在生物质能源中微生物所起的作用,并指出微生物基因组及其相关技术在生物质能源发展中发挥的重要作用。