微生物醌指纹法在环境微生物群体组成研究中的应用

微生物醌是能量代谢过程的电子传递体,不同的微生物含有不同种类和分子结构的醌。因此,环境样品中微生物醌的组成,即醌指纹可在一定程度上反映微生物的群体结构。本文简要介绍了微生物醌的分析方法,并利用醌指纹对活性污泥中的微生物群体组成进行了解析。

药品微生物实验室水系统分离37株微生物的鉴定及分析

目的针对目前国内微生物实验室试验用水的实际情况,探索试验用水微生物群落的组成及分布规律。方法参考国内外药典对纯化水微生物的检验方法,收集某实验室7个纯水使用点的纯化水,经薄膜过滤法处理,采用R2A琼脂培养基培养、分离和纯化,并进行革兰染色。分别运用基因型鉴定方法(16S rDNA序列分析、Riboprinter全自动微生物基因指纹鉴定系统),生化鉴定方法(Biolog自动微生物鉴定系统)对检出微生物进行鉴定,并对实验结果进行分析比较。结果本研究共培养获得37株细菌,主要为鞘氨醇单胞菌属和叶杆菌属等。16S rDNA序列分析能对37株微生物达到属或属水平以上的鉴定,Biolog自动微生物鉴定系统鉴定出13株微生物,Riboprinter全自动微生物基因指纹鉴定系统鉴定出17株微生物。结论16S rDNA序列分析适合对水系统中的微生物进行基于培养的群落分布分析,Riboprinter全自动微生物基因指纹鉴定系统更适用于同种/属细菌的分型及溯源分析。

跨学科视角下的流域磷源示踪技术:原理、实践与挑战

文章详细介绍了流域磷源示踪技术的种类和原理,包括化学特征示踪法、同位素示踪法、微生物指纹法和模型模拟法,并讨论了各方法的优势、局限性以及面临的挑战。尽管这些技术在理解磷循环的复杂性和动态特性方面各有优势,但其有效应用受限于技术方法的局限性、数据解释框架的多样性和比较难度、操作的高度复杂性以及对先进技术的依赖。该文强调了跨学科协作在推动技术创新、数据处理集成和成本效益平衡方面的重要性。通过结合化学、生物学、环境科学等学科的方法和理念,可以为磷源示踪技术的优化提供新视角,助力未来的研究和实践应用。

注射剂微生物污染的RiboPrinter~?微生物基因指纹系统鉴定及同源性分析

目的对注射剂的无菌检查阳性结果进行核糖体分型鉴定,并根据鉴定结果进行微生物污染的来源分析。方法采用RiboPrinter■微生物基因指纹系统对阳性菌A1和污染调查中采集菌株中的的16株葡萄球菌进行鉴定和同源性分析。结果 RiboPrinter■微生物基因指纹系统的鉴定结果与菌株的生化鉴定结果完全相同;A1的鉴定结果为科氏葡萄球菌,溯源自无菌检查实验的环境污染。结论基于核糖体分型原理的RiboPrinter■微生物基因指纹系统鉴定结果准确可靠,可用于鉴定及同源性分析污染的微生物。

分子生物学在食品微生物检测中的应用

食品安全是百姓关注的大问题,目前食品安全监测技术正在蓬勃发展,随着现代分子生物学技术的发展,对微生物学的研究也进入到分子、基因水平。病原微生物的检测也逐渐进入分子时代,本文介绍了应用于病原微生物检测的PCR技术、DNA指纹图谱等技术。

食源性金黄色葡萄球菌肠毒素基因型检测与分布研究

目的对食源性致病金黄色葡萄球菌肠毒素SEA^SEJ基因型分布状况进行调查,并探讨菌株分型与肠毒素基因型分布之间的关联性。方法采用PCR方法扩增金黄色葡萄球菌及肠毒素SEA^SEJ基因型核酸片段,应用全自动微生物基因指纹鉴定系统(Ribo Printer)对菌株进行分型和类聚状况分析。结果分离的24个待测菌株可分为6个亚型,各亚型均匀分布;待测10种肠毒素基因型中,SEI型、SEG型、SEA型和SEB型的出现频率较高,分别占54.2%、41.7%、37.5%和25.0%,同时表达两种以上肠毒素基因型的比率约50%,SEG型和SEI型肠毒素的表达分布具有协同性;金黄色葡萄球菌的溯源性特点与肠毒素分布规律一致。结论食源性金黄色葡萄球菌肠毒素呈现多基因型协同表达的特点,各菌株亚型与肠毒素基因型分布之间存在一定的关联性。

16S rDNA在乳酸菌菌种鉴定及聚类分析上的应用

近年来,微生态制剂日益受到市场关注。市售微生态食品以益生菌酸奶或乳酸饮料为主,其中活的乳酸菌含量及菌株特性是决定微生态制剂质量的关键。目前常用的菌种鉴定技术包括生理生化方法或PCR方法,前者工作量大周期长,后者需要专业人员操作,且难以区分死活细菌。本文选取了11种市售的乳酸菌产品,采用MC、MRL、TPY等乳酸菌专用培养基进行乳酸菌计数及菌种分离,进一步用荧光定量PCR方法验证了产品中常规培养法难以分离的双歧杆菌,在此基础上,采用Riboprinter基因指纹图谱分析仪,对分离自11种酸奶样品的16株乳酸菌菌进行了核酸水平的鉴定,建立了16S rDNA聚类分析分子图谱,方便并简化对微生态产品的质量进行"物证相符"的考证,初步分析了目前市场上市售酸奶所用菌种的种属相关性。

金黄色葡萄球菌分离株自动化核糖体分型的研究

运用自动化核糖体基因分型系统(Riboprinter),用EcoRI酶,对实验室分离的31株金黄色葡萄球菌进行分子分型研究。31株菌均被鉴定为金黄色葡萄球菌,并获得25种Riboprinter核糖体基因条带型。

枳壳细菌污染状况及溯源分析

目的:考察枳壳果实、药材、饮片的微生物污染水平,并对其污染细菌进行分离鉴定、溯源。方法:参考2020年版《中华人民共和国药典》通则1108《中药饮片微生物限度检查法》,对枳壳中的需氧菌总数、霉菌和酵母菌总数、耐热菌总数以及控制菌进行检查,采用PCR技术、RP技术对枳壳中检出的细菌进行菌株鉴定并通过BN软件溯源。结果:各阶段的微生物数量需氧菌总数及霉菌和酵母菌总数排序均为切片饮片、果实、麸炒饮片、药材。10批检出耐胆盐革兰氏阴性菌,但均未超过1×10^(4)cfu·g^(-1),未检出大肠埃希菌和沙门菌。共鉴定菌株50株,其中芽孢杆菌是该药材中的优势菌种,检出条件致病菌阪崎克罗诺肠杆菌、恶臭假单胞菌、肺炎克雷伯菌等。结论:为降低饮片中微生物负载,可尝试通过控制润药工艺参数如温度、水活度等方法防止微生物大量繁殖。果实到药材假单胞菌存在有同源性,而该类菌可能因为不耐热在饮片中并未分离到;阪崎克罗诺肠杆菌仅在饮片中存在,且占比高达50%,该菌可能是加工过程中由生产设备或环境或水体污染所致;另外,值得注意的是麸炒后的3批饮片中均存在条件致病菌肺炎克雷伯菌,应注意控制该类微生物污染,以保障枳壳质量安全。

金黄色葡萄球菌分型方法的建立及应用

目的建立食源性金黄色葡萄球菌的分型与溯源方法。方法以血浆凝固酶为目标基因,通过PCR方法对食源性金黄色葡萄球菌进行鉴定,同时借助全自动微生物基因指纹鉴定系统(RiboPrinter)对其进行分型和类聚状况分析。结果 PCR方法可特异性鉴定金黄色葡萄球菌,RiboPrinter方法可将金黄色葡萄球菌分为6个亚型,各亚型类聚状况平均分布。结论上述方法的建立可准确地将金黄色葡萄球菌进行鉴定和分型,分析类聚分布与同源性关系,为食源性致病菌的快速鉴定与分型溯源提供技术手段。