应用cDNA微矩阵基因芯片筛选运动性心肌肥大相关基因的初步研究

目的 :应用cDNAchip(cDNA芯片或微矩阵基因芯片 )技术筛选运动性心肌肥大相关基因。方法 :摘取运动组和对照组小鼠心脏 ,按一步法抽提总RNA并纯化mRNA ,将 2 30 4个点包括10 3个阴性及对照基因和 2 2 0 1条小鼠靶基因的PCR扩增产物 ,按微矩阵 (12× 12点× 16亚矩阵 ,点间距离 375 μm)点制于硅烷化玻片上 ,制备成cDNA芯片。将等量抽提纯化的运动组和对照组小鼠心肌组织mRNA ,分别与掺入的荧光分子Cy3和Cy5经逆转录合成cDNA荧光探针 ,混合后再与cD NA芯片杂交 ,通过芯片扫描仪对荧光信号图像进行扫描 ,经计算机分析比较运动组和安静对照组心肌组织中基因表达谱的变化。结果 :在 2 2 0 1条待研究基因中 ,两组小鼠心肌组织间存在差异表达的基因。具有显著表达差异的基因有 71条 ,其中上调基因有 37条 ,下调基因有 34条。结果显示 :cDNA芯片技术筛选运动性心肌肥大相关基因具有高通量、高敏度、高效率、大规模和并行性等优点。

微矩阵基因芯片筛选喉鳞癌相关基因的研究

目的 :应用基因微矩阵方法筛选喉鳞癌相关基因。方法 :按一步法抽提喉鳞癌和对照喉正常组织的总 RNA并纯化m RNA;将 40 96种人类基因 PCR产物用 Cartesian Pixsys75 0 0点样仪按微矩阵排列点样于化学涂层的载玻片上 ,制成基因芯片 ;将等量的对照组织和喉鳞癌组织 m RNA分别逆转录合成荧光分子掺入的 c DNA一链做探针 ,混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用 Scan Array30 0 0扫描仪扫描芯片荧光信号图像 ,计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因。结果 :在 40 96种基因中 ,喉鳞状细胞癌与喉正常组织间存在差异表达的基因。所检测的 4例临床标本中 ,2例共有的差异表达基因2 11～ 35 6条 (5 .15 %～ 8.87% ) ,3例共有的差异表达基因 36条 (0 .88% )。结论 :基因微矩阵芯片在筛选喉肿瘤发生相关基因的改变具有快速、高通量、高敏度等特点。

cDNA微矩阵筛选卵巢癌相关基因的研究

背景与目的:导致卵巢癌发生、发展的分子机制目前还不完全清楚,有研究者认为癌发生可能是许多基因表达水平的改变导致细胞内出现一系列分子变化的结果。本研究的目的是应用cDNA微矩阵方法对正常人卵巢组织及卵巢癌组织基因表达的差异性进行比较研究,筛选卵巢癌的相关基因。方法:将512个人癌基因和抑癌基因的cDNA用点样仪点在特制玻片上,制成表达谱芯片;分别提取人正常卵巢组织及卵巢癌组织的mRNA,通过逆转录PCR方法,将Cy3和Cy5两种荧光分别标记到两种组织的cDNA,制备成cDNA探针,并与表达谱芯片进行杂交及扫描,通过计算机应用ImaGene3.0软件分析和处理数据。结果:对正常卵巢组织和卵巢癌组织的癌基因和抑癌基因表达谱分析,在3例或3例以上组织有共表达差异性的基因有38个,其中在卵巢癌组织中下调的基因有23个,上调的基因有15个。结论:应用cDNA微矩阵技术研究卵巢癌的基因表达谱,初步筛选出了肿瘤相关基因。

应用基因微矩阵芯片筛选胰腺癌的相关基因

目的应用基因微矩阵芯片筛选胰腺癌的相关基因。方法按一步法提取胰腺正常组织及胰腺癌组织总RNA,以包含4096个DNA的基因微矩阵芯片对正常胰腺组织及胰腺癌基因表达谱进行分析。结果胰腺癌与正常胰腺组织中表达差别有显著意义的基因共有949条,其中胰腺癌下调基因468条,上调基因381条,按其功能分类共有15类。结论基因微矩阵芯片可有效筛选出胰腺癌的相关基因;胰腺癌的发生发展由多个类型的基因参与调控,而非单一因素所致。

cDNA微矩阵分离胃癌组织差异表达cDNA序列研究

背景与目的:许多研究表明,一些与胃癌相关的基因未被识别。本研究拟分离和鉴定胃癌差异表达cDNA序列,进一步克隆胃癌相关基因。方法:采用包含4892条cDNA序列的微阵列分析癌旁正常胃粘膜和胃癌组织表达谱的差异,利用生物信息学分析差异表达cDNA序列,RT-PCR(reversetranscriptionpolymerasechainreaction)验证cDNA微阵列结果。结果:癌旁正常胃粘膜和胃癌组织相比,二倍以上的差异表达cDNA序列33个,其中在胃癌中表达上调18个,表达下调15个。生物信息学分析表明,MDSCBC11克隆为代表新基因的cDNA序列且位于1p35-36,RT-PCR证实其在43%(13/30)胃癌中存在表达下调。结论:通过分析癌旁正常胃粘膜和胃癌组织表达谱的变化,发现一些与胃癌相关的新的cDNA序列,为进一步寻找和克隆胃癌新的相关基因提供重要研究线索。

用cDNA微矩阵研究肝纤维化基因表达的变化

目的 筛选在肝纤维化过程中发生异常表达的基因。方法 建立四氯化碳诱导肝纤维化大鼠模型 ;选取正常和造模大鼠肝脏各 1只进行cDNA微矩阵 (microarray)研究 ;从cDNA微矩阵研究结果中选取一个在造模大鼠肝脏中表达明显异常的基因 (smurf 2 ) ,用半定量RT PCR检测此基因在不同实验阶段 (第 1、2、4、8周 )两组大鼠中的表达变化。结果 通过cDNA微矩阵发现在肝纤维化过程中 ,smurf 2、PTAFR、CYP2D6、FGG等许多和炎症、代谢有关的基因表达均上调。通过半定量RT PCR研究发现经四氯化碳处理第 1周时smurf 2基因在造模大鼠肝脏中表达与正常大鼠表达无明显变化 ,第 2周时表达下调 ,第 4周时表达明显上调 ,第 8周时该基因表达又趋于下降。结论 smurf 2基因转录水平的变化 ,影响smad TGFβ信号传导的调控 ,可能参与了四氯化碳诱导大鼠肝纤维化的形成过程。

生物微矩阵(芯片)方法检测100例幽门螺杆菌抗体的临床分析

目的生物微矩阵芯片技术检测患者血清中幽门螺杆菌(Hp)毒素相关蛋白(CagA)、空泡毒素(Va-cA)及尿素酶抗体(Ure),快速提供胃十二指肠疾病诊断的依据。方法对100例胃病患者留取血清,用生物微矩阵芯片方法检测。结果 CagA阳性为55%,VacA阳性为29%,Ure阳性为16%。结论芯片法在幽门螺杆菌感染的诊断、筛查和防治中具有重要意义。

脑胶质瘤差异表达基因的微矩阵研究

目的 用生物芯片筛选胶质母细胞瘤相关基因。方法 采用一种由包括胶质瘤cDNA文库构建的14 000个基因片段的生物芯片来杂交筛选胶质母细胞瘤的基因并分析其表达谱的变化。结果 经过杂交筛选并与正常脑组织比较，94个基因差异表达超过3倍，298个基因片段超过2倍。一些胶质瘤中上调基因在正常脑组织中几乎没有表达。几个与胶质瘤发生发展相关的新基因被证实。结论 生物芯片结合相关的cDNA文库对大规模快速筛选胶质瘤及其他肿瘤的治疗靶基因具有实际意义。

基于斑点免疫金渗滤法的蛋白微矩阵

目的 :开发一种低成本、简单易用的基于免疫金渗滤法的蛋白微矩阵用于平行检测分析血清中多种靶分子 .方法 :用点样仪将人IgG和多种抗原点到硝酸素纤维膜上 ,经小牛血清白蛋白封闭后垫以高分子吸水材料 ,随后滴加血清样本 ,免疫金显色 ,CCD阅读仪分析相对灰度值 ,并与ELISA法的检测结果进行对比 .结果 :微矩阵的IgG检测范围在 1～5 0ng之间 ;按照 4 0 0份阴性血清相对灰度值的均数加上 3倍标准差制定临界值 .在 186份随机血清试验中 ,与ELISA试剂盒比较 ,检测结果无显著性差异 ,总体灵敏度和特异度均大于90 % .结论 :蛋白微矩阵与ELISA方法相比 ,检测效果相当 ,且具有操作步骤简单 ,易于使用 ,检测成本低 ,耗时少的优点 ,适合于在临床检验上的应用 .

卵巢癌基因表达谱的cDNA微矩阵研究

目的:探讨cDNA微矩阵(基因芯片)研究卵巢癌基因表达谱及分析部分差异表达基因功能的可行性。方法:采用4 097个靶基因点BiostarH-40s表达谱基因芯片,检测5例卵巢浆液性腺癌及5例正常卵巢组织(cy3-dUTP标记正常卵巢组织的RNA,用cy5-dUTP标记卵巢癌组织的RNA)的基因表达谱。结果:两组病例卵巢癌基因表达谱中,4例以上差异表达基因163个,其中基因表达增高(上调趋势)66个,基因表达降低(下调趋势)97个。明确基因功能分类的差异表达基因37个,其中原癌基因和抑癌基因类基因3个,细胞周期蛋白类基因1个,细胞骨架及运动蛋白类基因6个,DNA结合、转录和转录因子类基因1个,细胞受体类基因2个,免疫相关蛋白类基因5个,代谢类基因7个,蛋白翻译合成类基因2个,发育相关基因3个,其他类基因7个。结论:应用cDNA微矩阵研究卵巢癌基因表达谱,发现差异表达基因及其基因功能分类。

应用微矩阵表达谱基因芯片筛选食管癌新的相关基因

[目的]应用微矩阵表达谱基因芯片筛选食管癌新的相关基因。[方法]微矩阵表达谱基因芯片(14114种基因)筛选3例食管癌及其对照癌旁组织的差异表达基因,用Northern印迹证实,用末端终止法测序,将测序结果在GenBank数据库进行同源性检索。[结果]检测的3例临床标本中,共有的差异表达基因31条,上调基因10条,下调基因21条,其序列与Genbank数据库比较,从中筛选出2条无明显同源的人类已知基因或片段,即新基因,并列出其序列。[结论]微矩阵表达谱基因芯片可应用于筛选食管癌新的相关基因,其具备高通量、特异性好、快速的特点;食管癌和对照癌旁组织间存在2条新的差异表达基因。

DNA微矩阵芯片检测沙利度胺对HepG2细胞基因表达谱的影响

目的 从整个细胞基因组表达变化的角度 ,研究沙利度胺 (Tha)对基因表达谱的影响 ,揭示发育毒性药物的致畸机制。方法 用载有 8192条基因的DNA微矩阵芯片 ,检测在 11.6μmol·L- 1的Tha作用4 2h后 ,HepG2细胞基因表达谱的变化。结果有 19条基因的表达有明显变化 ,其中 17条基因表达下调 ,2条基因表达上调。下调基因中有多条为转录调控和胚胎发育相关基因 ,上调的基因中有DNA修复相关基因和线粒体功能相关的基因。结论 Tha能影响若干基因转录和胚胎发育基因的表达 ,可能与其发育毒性机制相关 。

抗体微矩阵玻片经硅酸钠处理后对红细胞血型抗体吸附能力的研究

目的探讨经硅酸钠修饰后用作抗体微矩阵载体的玻璃基片对血型抗体的吸附能力。方法用硅酸钠溶液在玻片上形成一层膜,再酸化以形成硅酸,然后用红细胞血型抗体包被后,以可与其发生特异性抗原抗体免疫反应的对应红细胞作反应指示剂,检测经硅酸钠处理后的玻片对血型抗体的吸附能力,以及血型抗体的免疫活性。结果红细胞血型抗体可以牢固的结合在硅酸钠处理过的玻片上,并且可以与其对应的红细胞抗原发生免疫学反应。结论经硅酸钠处理的玻片对血型抗体有很高的结合效力,同时抗体仍保持很高的免疫活性,因而可充当蛋白质抗体微矩阵基片。

移动优先:从融矩阵到微矩阵

随着移动互联网的快速发展,移动优先日渐成为媒体共识,以客户端为主打的移动版上线升级。融合传播就是主流媒体的互联网化,而"移动化则是互联网应用发展的必然趋势"。从目前来看,移动传播发展条件成熟,并且走向个性化定制服务。

呼吸道疾病生物微矩阵在呼吸道感染中的临床应用

目的:观察呼吸道疾病生物微矩阵(蛋白芯片)检验项目在筛查呼吸道感染原中的临床诊断价值。方法:应用我国生产的生物芯片分析系统及其呼吸道感染配套试剂盒和相应的胶体金检测项目试剂盒,对我院2011年6月～2012年6月呼吸道感染儿童305例和成人95例进行筛查。结果:305例儿童中流感病毒抗体(INV-IgG),呼吸道合胞病毒抗体(RSV-IgG),腺病毒抗体(ADV-IgG),肺炎支原抗体(MP-IgG),肺炎支原体抗体(MP-IgM),肺炎衣原体抗体(CP-IgG)和肺炎衣原体抗体(CP-IgM)的筛查阳性率分别为41%、19.3%、5.2%、27.9%、43%、11.1%和9.5%;95例成人的阳性率分别为10.5%、6.3%、0%、15.8%、16.8%、31.6%和33.7%。结论:呼吸道疾病生物微矩阵(蛋白芯片)用于呼吸道病原体的检测,虽然具有简便、快速和同步高通量检测等优点,但仍有内含项目指标均为IgG抗体、对急性呼吸道感染筛查阳性率不高、不利于早期诊断、项目内涵指标少、漏诊率高、需静脉采血等缺点。

04099 微矩阵将医学技术与生物技术结合起来

对德语国家中的1400家生物技术和医学技术公司进行的调查已表明，公司合作最有潜力的领域是：微矩阵及生物芯片（81％），生物传感器（79％）和药物输送技术（64％）。该调查也发现医学技术公司更可能设法与生物技术公司合作；有47％的医学技术公司找生物技术公司合作，而生物技术公司却对与制药公司合作更有兴趣（43％）。医学技术公司的工程师与生物技术公司的自然科学家之间的交流困难被认为是突出的问题。

单核苷酸多态性DNA微矩阵分析有利于评估激素治疗的利弊

Objective To determine what percentage of women can be given individu alized co unseling based on genetic information, as single nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with risks and benefits of estrogen therapy and hormone therapy such as thrombosis, myocardial infarction, breast cancer, and bone protection. D esign Cross-sectional study. Setting Academic research institution. Patient(s) A consecutive series of 2,507 perimenopausal and postmenopausal women. Intervent ion(s) Peripheral venous puncture and multiplex polymerase chain reaction on a m icroarray system. Main outcome measure(s) Analysis of 22 SNPs of 17 genes: AGTMe t235Thr, APOECys112Arg, APOEArg158-Cys, COMTVal158Met, CYP17-34T >C, CYP191558 C >T, CYP19Arg264Cys, CYP1A16235T >C, CYP1A1Ile462Val, CYP1B1Leu432Val, CYP1B1A -sn453Ser, HSD17B1-27A >C, ER-αIVS-401T >C, prothrombin20210G >A, factor V Leiden, eNOS-786T >C, eNOSGlu298Asp, MRSer810L eu, MTHFR677C >T, PAI 15G >4G, SRD5A2Val89Leu, and VDRb >B. Result(s) Among the women in the study, 66%had at least two homozygous mutant SNPs of interest. A t hrombophilic disposition was found in 9.9%of women, and 23%of women had at lea st two SNPs associated with an increased risk of breast cancer (COMT, CYP17, CYP 19, CYP1A1, and CYP1B1). The SNPs predisposing women to cardiovascular pathologi es (e.g., APOE, AGT, eNOS, and PAI 1) were found in 12.3%of women. Carriage of SNPs predisposing to early postmenopausal bone loss and osteoporosis (ER-αand VDR) were found in 26.7%of women. Conclusion( s) These data suggest that the as sessment of SNPs associated with risks and benefits of estrogen/hormone therapy may be a new means to individualize counseling about and prescription of estroge n/hormone therapy in up to 66%of women.

应用微矩阵表达谱基因芯片检测食管癌的基因改变

目的 应用微矩阵表达谱基因芯片研究食管癌的基因变化。方法 按一步法抽提三例食管癌及其对照癌旁组织的总RNA ,分别逆转录成荧光分子掺入的探针 ,混合后杂交基因芯片(1 4 1 1 4种基因 )。经严格洗片后用扫描仪扫描芯片荧光信号图像 ,计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因。结果 在所检测的 3例临床标本中 ,共有的差异表达基因 31条 ,上调基因 1 0条 ,下调基因 2 1条 ,有多类基因 ,有与信号转导有关、与细胞周期调控有关、与癌基因同源的基因等等。

应用基因微矩阵芯片筛选前列腺癌的相关基因

目的 应用基因微矩阵芯片筛选前列腺癌的相关基因。 方法 按一步法提取前列腺癌及正常前列腺组织总RNA ,并纯化mRNA ,以包含 4 0 96个cDNA的基因微矩阵芯片对前列腺癌及正常前列腺基因表达谱进行分析。 结果 前列腺癌及正常前列腺组织中表达差别有显著性意义的基因共 3 4 1条 ,其中前列腺癌下调基因 12 8条 ,上调基因 2 13条 ;表达差别有极显著性意义的基因有15条 ,其中显著下调基因 6条 ,显著上调基因 9条。 结论 基因微矩阵芯片可有效筛查出前列腺癌的相关基因 ;前列腺癌发生发展由多种类型的基因参与调控 。