微RNA在乳腺癌糖酵解代谢中的研究进展

目的乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,其严重损害女性身心健康。乳腺癌细胞依赖糖酵解途径产生三磷酸腺苷供能,是乳腺癌进展的重要特征。微RNA(microRNA,miRNA)是由若干核苷酸组成的内源性单链非编码RNA,在乳腺癌细胞中异常表达,可通过调控细胞代谢途径影响乳腺癌的病理生理过程。研究表明,miRNA参与乳腺癌糖代谢过程,是乳腺癌能量代谢研究的热点之一。本文概述miRNA在乳腺癌糖酵解代谢中的研究进展,旨在深入了解乳腺癌的发病特征和糖酵解的作用机制,寻找新的治疗靶点,从而为乳腺癌治疗策略的制订提供理论依据。

微RNA与冠状动脉疾病研究的文献计量学评价

目的基于CiteSpace和VOSviewer探讨微RNA(miRNA)与冠状动脉疾病(CAD)研究的热点与趋势。方法通过检索WebofScience核心合集数据库和中国知网、万方数据知识服务平台、维普网,获取2010年1月至2023年6月有关miRNA与CAD研究的相关文献,利用CiteSpace6.2.R2、VOSviewer1.6.19绘制作者、关键词共现、突现、时间线图谱。结果共纳入英文文献1733条,中文文献748条。中国是最高产的国家,中山大学是领先的研究机构,王阶发表论文最多。冠心病、动脉粥样硬化是主要关键词。结论验证不同miRNA亚型对CAD的调控作用及其机制为主要热点,未来的研究将致力于促进miRNA在CAD早期诊断、治疗及预后中的临床应用。

鸽微RNA病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立

旨在建立鸽微RNA病毒(pigeon megrivirus,PiMeV)实时荧光定量RT-PCR检测方法。本研究根据GenBank中PiMeVs序列特征设计特异性检测引物,从信鸽粪便中检测到PiMeV阳性(命名为PiMeV-CHN001株),并对其3 C基因进行核苷酸同源性比较和遗传进化分析,明确其基因特征后,设计特异性实时荧光定量RT-PCR检测(RT-qPCR)引物组,建立检测PiMeV的RT-qPCR方法。结果显示:PiMeV-CHN001株3 C基因全长为591 bp,编码197个氨基酸,和其他2株野鸽源PiMeV(MeV-B1株和MeV-B2株)核苷酸相似性分别为89.5%和92.0%。建立的检测PiMeV的RT-qPCR方法的标准曲线Y轴截距为37.93,斜率为-3.335,相关系数为1.00,扩增效率为99.4%。特异性强,仅PiMeV出现特异性扩增信号和特异性峰值[Tm值为(81.69±0.22)℃],对鸽源禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)、鸽源禽I型副黏病毒(pigeon paramyxovirus type I,PPMV-1)、鸽输血传播病毒(pigeon torque teno virus,PTTV)、鸽腺病毒(pigeon adenovirus,PiAd)及鸽圆环病毒(pigeon circovirus,PiCV)检测均未见特异性扩增信号;敏感性优,最低检测限为54.0拷贝·μL^(-1);重复性好,批内和批间变异系数均低于1.5%。用建立的检测方法对42份信鸽粪便样品进行检测,发现2份阳性样品(阳性率为4.76%)。本研究首次证实我国大陆地区信鸽中存在PiMeV,丰富了PiMeV宿主谱信息;建立的RT-qPCR方法为后续开展PiMeV流行病学研究提供支撑。

三株新型鸭源微RNA病毒分离毒株的全基因组序列分析

分离新型鸭源微RNA病毒进行全基因组测序并进行遗传进化分析。对本实验室2021年不同来源的种鸭和肉鸭病料进行PCR检测,初步确定存在一种未知分类的新型微RNA病毒感染。取病死鸭病料组织处理后接种SPF鸡胚分离病毒,设计引物对分离到的病毒进行PCR检测,通过重叠PCR方法进行全基因组扩增测序。将分离病毒各蛋白氨基酸序列两两比对,同时选取GenBank数据库中微RNA病毒代表毒株序列绘制系统进化树,并对主要蛋白P1、2C、3D序列比对分析。结果显示:共分离到三株微RNA病毒,分别命名为21101株、21016株和21075株(GenBank登录号:OQ927377~OQ927379)。基因组长度分别为7445、7445和7447 bp,均包含一个编码2141个氨基酸的开放阅读框(ORF),可划分为P1、P2、P3三个部分,符合微RNA病毒序列特征。基于全基因组序列遗传进化分析发现,三株分离病毒与本实验室前期分离的Duck/FC22/China/2017(GenBank登录号:MN102111)毒株及上海兽医研究所分离的Duck/AH15/CHN/2015(GenBank登录号:MT681985)位于同一分支,与鸭甲型肝炎病毒(Duck hepatitis A virus,DHAV)遗传距离最近。分离的三株鸭源微RNA病毒进行全基因组测序及遗传进化分析发现,与目前已知的两株微RNA毒株为同一类新型鸭源微RNA病毒。

人工智能算法在癌症相关微RNA研究中的应用进展

微RNA(miRNA)是一类通过不完全碱基互补配对实现后转录调控作用的小分子非编码RNA,其往往在癌症患者的病灶和外周血中表达失调。近年来,基于人工智能算法如机器学习和深度学习的模型逐渐应用于miRNA生物信息学研究。与传统的生物信息学工具比较,基于人工智能算法的miRNA靶点预测工具准确度更高,并实现了miRNA亚细胞定位和亚细胞重分布的预测,进一步深化了科研人员对miRNA的认识。此外,人工智能算法在临床模型构建的应用也显著提升了miRNA生物标志物的挖掘效率。本文总结了近年来人工智能算法在miRNA靶点预测、亚细胞定位和生物标志物挖掘的应用,并探讨了机器学习和深度学习对癌症相关miRNA研究的潜在价值。

中药调节微RNA干预食管癌的机制研究进展

食管癌(EC)是常见的消化系统恶性肿瘤,预后极差。微RNA(miRNA)是肿瘤发生、发展的重要调控因子,可参与肿瘤细胞增殖、侵袭、转移和凋亡等恶性生物学行为。中药具有疗效确切、作用广泛、副作用小的特点,故本文以miRNA为切入点,系统阐述中药调节miRNA干预EC的作用机制。结果发现,姜黄素、款冬花多糖、白术多糖、麦冬皂苷B等中药有效成分和豆根管食通口服液可上调miRNA-532-3p(miR-532-3p)、miR-551b-3p、miR-99a、miR-34a、miR-199a-3p、miR-377等miRNA的表达,白杨素、藤梨根提取物等中药有效成分/部位和柴胡疏肝散合旋覆代赭汤、加味橘皮竹茹汤等中药复方可下调miR-199a-3p、miR-451、miR-21等miRNA的表达,从而调控信号通路(磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B等)、下游蛋白(锌指和同源框蛋白1等)或酶类(胸腺激酶1等)的表达,抑制EC细胞的增殖、侵袭和转移,诱导其凋亡,最终达到延缓EC进展的目的。

循环微RNA在卵巢癌中的研究进展

卵巢癌症状出现较晚,目前尚缺乏早期筛查及有效治疗方法,病死率居女性生殖道肿瘤首位。因此,全面了解卵巢癌进展的分子机制、识别新型生物标志物、发现新药的潜在靶点尤为重要。微RNA(miRNA)异常表达参与卵巢癌的发生发展。肿瘤细胞分泌的miRNA可在体液中检测出来,循环miRNA水平与临床疾病的发生发展密切相关,可用于预测卵巢癌的预后和疗效。未来明确循环miRNA在卵巢癌中的作用机制、发现新型肿瘤标志物,可以为疾病的治疗提供新思路。

微RNA对肝癌血管内皮细胞功能影响的研究进展

血管内皮细胞是内衬在血管内壁表面的单细胞层,活化后可增强肝癌细胞的增殖性和侵袭性,通过增殖、迁移等方式形成新的血管,促使肝癌的复发和转移。微RNA(miRNA)对血管内皮细胞功能具有重要的调节作用,其转录后可抑制或促进血管内皮细胞增殖,影响肝癌患者预后。miR-126、miR-155、miR-21、miR-221/222是常见的几种调控血管内皮细胞功能的miRNA,这些不同种类miRNA可通过不同机制对肝癌患者的血管内皮细胞功能产生影响,从而调控肝癌细胞的增殖和转移。因此,阐明不同种类miRNA调控血管内皮细胞功能的具体机制,将对肝癌的诊断、治疗和预后评估具有重要意义。

微RNA在免疫性血小板减少症中参与调节免疫细胞的研究进展

微RNA是一类具有基因表达和调控功能的非编码RNA,参与多种生理过程,其异常表达与免疫性血小板减少症的发生密切相关。微RNA主要通过调节适应性和特异性免疫细胞来调控基因表达,进而影响免疫性血小板减少症中的免疫应答反应。本文就微RNA通过调节单核细胞、巨噬细胞、调节性T细胞、辅助性T细胞17、B细胞、调节性B细胞的表达影响免疫性血小板减少症病情变化的研究现状和进展进行综述,以期为未来治疗该病提供新思路、新靶点。

尿液外泌体微RNA在膀胱癌诊疗中的研究进展

膀胱癌是泌尿系统常见的恶性肿瘤之一,早期诊断困难,且易复发及远处转移。外泌体可穿透膀胱基底膜并将微RNA(miRNA)运输到尿液中,miRNA包含肿瘤相关的生物学信息,在尿液中含量非常丰富,不易被降解。尿液外泌体来源的miRNA在膀胱癌诊断、治疗等方面均具有一定潜力,检测其表达水平可提高膀胱癌诊断的灵敏度和特异度,同时调节尿液外泌体miRNA水平还可改善膀胱癌患者对化疗药物的耐药性。因此,深入研究miRNA在膀胱癌进展中的作用机制可为临床膀胱癌患者的诊断及治疗提供新思路。

微RNA在糖尿病肾病中的研究进展

糖尿病肾病(DKD)作为糖尿病最常见的微血管并发症之一,已经成为导致终末期肾病的重要原因之一。微RNA(miRNA)是长度为19~25个碱基对的短链非编码RNA,其可与靶基因mRNA的3'非翻译区结合,参与下游信号分子的表观遗传调控。研究表明miRNA可与DKD的发生发展密切相关,本文就miRNA与DKD之间的关系及其研究进展作一综述,以期为DKD的预防、诊断、治疗提供参考。

“新四联”药物对射血分数保留慢性心力衰竭患者的心功能、血流动力学及微RNA水平的影响

目的探讨“新四联”药物对射血分数保留心力衰竭患者的心功能、血流动力学及微RNA(miRNA)水平的影响。方法回顾性选取2019年1月至2023年1月运城市中心医院心内科收治的射血分数保留慢性心力衰竭患者123例作为研究对象,按治疗方式的不同分为对照组(n=61)和观察组(n=62)。对照组在降压、降糖、抗心力衰竭、降脂等常规对症治疗基础上,行“金三角”[血管紧张素转化酶抑制剂(ACEI)/血管紧张素Ⅱ受体拮抗剂(ARB)+β受体阻滞剂+醛固酮受体拮抗剂(MRA)]治疗。观察组在常规治疗基础上予以“新四联”[血管紧张素受体脑啡肽酶抑制剂(ARNI)或ACEI/ARB+钠-葡萄糖协同转运蛋白2(SGLT2i)+β受体阻滞剂+MRA]药物治疗。比较两组治疗前、治疗后1个月的心功能指标[左心室射血分数(LVEF)、左心室收缩末期内径(LVESD)、左心室舒张末期内径(LVEDD)]和血流动力学指标[左前降支收缩期峰流速(SPV)、舒张期峰流速(DPV)、时间速度积分(TVI)]及外周血miRNA-499、miRNA-30a水平等指标差异。比较两组患者心血管病死率及再入院率。结果治疗后1个月,两组LVEF均高于治疗前,LVESD、LVEDD均低于治疗前,观察组的LVEF为(65.62±8.69)%,高于对照组[(54.25±8.64)%],LVESD、LVEDD分别为(55.36±7.62)、(40.31±6.56)mm,均低于对照组[(61.47±7.25)、(46.72±7.12)mm],差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗后1个月,两组SPV、DPV、TVI均高于治疗前,且观察组的SPV、DPV、TVI分别为(17.65±1.34)cm/s、(32.48±3.15)cm/s、(23.58±1.26)分,均高于对照组[(15.40±1.36)cm/s、(29.42±3.12)cm/s、(20.34±1.25)分],差异均有统计学意义(P<0.05)。治疗后1个月,两组miRNA-499、miRNA-30a水平均低于治疗前,且观察组治疗后1个月的miRNA-499、miRNA-30a分别为1.65±0.22、0.11±0.06,均低于对照组(1.89±0.29、0.14±0.06),差异均有统计学意义(P<0.05)。两组心血管病死率比较,差异无统计学意义(P>0.05);观察组患者的再入院率为4.84%,显著低于对照组(14.75%),差异有统计学意义(P<0.05)。结论“新四联”药物可改善射血分数保留心力衰竭的患者的心功能,调节冠状动脉血流动力学,降低miRNA-30a和miRNA-499水平,对机体康复有益。

脱氧核酶催化放大效应在微RNA传感中的研究与应用

微RNA(microRNAs,miRNAs)是一种与肿瘤等多种疾病的发生发展密切相关的短序列非编码RNA,其具有丰度低、序列同源性高和易降解等特点,因此,miRNAs的高灵敏、高特异检测面临巨大挑战。具有RNA切割活性的脱氧核酶是新兴的一类功能性单链DNA分子,此类酶能在金属离子的辅助下对核酸底物特异性切割,释放miRNA进行循环再利用,实现信号放大。目前,基于脱氧核酶催化放大检测miRNA的新方法研究是近年来科研人员的重点关注方向之一。本文根据脱氧核酶结合不同的生物传感新技术和新材料,对近年来发展出的基于脱氧核酶催化放大检测miRNAs的新方法进行分类与回顾,归纳为脱氧核酶DNA自组装、脱氧核酶偶联等温扩增以及脱氧核酶结合新型纳米材料的3类方向,并逐一阐述各个方向的基本原理及其在生物传感领域、医学检测方向的最新研究进展与应用实例,旨在为进一步的精准灵敏检测miRNAs新策略研究提供参考。

肠道菌群与微RNA互相作用在功能性肠病中的研究进展

功能性肠病作为临床常见病,其发病机制尚不明确。研究表明,肠道微生物与微RNA(miRNA)之间存在错综复杂的双向交流和串扰,其中miRNA靶向调控肠道细菌生长与平衡,肠道菌群也能调节miRNA的表达。基于此,该研究对肠道菌群与miRNA及二者相互作用进行概述,重点阐述这种互作机制对功能性肠病的影响,并进一步探讨二者双向交流在功能性肠病中所产生的诊断能力和治疗潜力。

微RNA在缺氧缺血性脑病中的调控作用研究进展

缺氧缺血性脑病(HIE)是一系列由围生期窒息引起的脑部缺氧等病理性损害,可遗留神经系统后遗症,甚至导致新生儿死亡。HIE发病机制复杂,涉及血流重新分配、脑血管自主调节功能障碍、脑组织废弃代谢物堆积等。目前关于HIE临床主要采用对症支持及康复训练治疗。微RNA(miRNA)在转录后调控中发挥重要作用,参与HIE的发生发展,有望成为诊断及监测HIE治疗反应的标志物。因此,深入研究miRNA在HIE中的调控作用,可以为疾病的治疗提供新思路。

微RNA生物学功能及其与卵巢癌相关性的研究进展

卵巢癌(ovarian carcinoma,OC)是女性常见三大原发恶性肿瘤之一,严重危害女性生殖健康。由于其隐匿性高、易耐药、易复发的特点,导致患者预后较差、病死率极高。微RNA(microRNA,miRNA)是一类小分子单链非编码RNA,主要通过特异性抑制翻译或降解靶mRNA,在转录后水平上发挥基因表达调控作用。多种miRNA已被证实在OC中异常表达,并在调控细胞迁移侵袭、耐药、血管生成以及肿瘤微环境等方面发挥核心作用。本文就miRNA生物学功能、miRNA在OC中的作用进行综述,以为OC的诊治、预后及干预靶点等提供参考。

中晚期宫颈癌放化疗敏感度与血清微RNA水平的相关性分析

目的研究中晚期宫颈癌放化疗敏感度与血清微RNA(miR)水平的相关性。方法纳入2020年1月至2022年3月南充市中心医院收治的112例中晚期宫颈癌患者为研究对象。患者均接受同步放化疗方案治疗,分析其放化疗敏感度,并据此分为高敏组(n=68)和低敏组(n=44)。采用实时荧光定量PCR法检测所有研究对象血清miR-136、miR-664、miR-206表达水平,并比较高敏组和低敏组患者血清miR-136、miR-664、miR-206相对表达量,通过受试者操作特征(ROC)曲线分析患者血清miR-136、miR-664、miR-206表达水平并评估其放化疗敏感度的价值。分析放化疗敏感度与临床病理特征间的关系,并探讨中晚期宫颈癌患者放化疗敏感度的影响因素。结果高敏组患者血清miR-136、miR-664表达水平均高于低敏组(P<0.05),miR-206表达水平低于低敏组(P<0.05)。ROC曲线结果显示,血清miR-136、miR-664、miR-206对中晚期宫颈癌患者放化疗敏感度均有一定的评估价值,其曲线下面积分别为0.834、0.910、0.855。高敏组与低敏组患者国际妇产科联盟(FIGO)分期差异有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归分析显示,miR-136、miR-664、miR-206、FIGO分期是中晚期宫颈癌患者放化疗敏感度的独立影响因素(P<0.05)。结论血清miR-136、miR-664、miR-206表达水平与宫颈癌同步放化疗敏感度相关,血清miR-136、miR-664表达下调和miR-206表达上调可能提示宫颈癌同步放化疗抵抗。

微RNA在颈椎后纵韧带骨化症中的作用和机制研究进展

颈椎后纵韧带骨化症(OPLL)是附着于椎体后缘的后纵韧带在多因素作用下发生异常增厚和骨化的现象,是常见的颈椎退行性疾病之一,可导致严重的感觉和运动功能障碍^([1])。目前,OPLL的发生机制尚不清楚,其早期诊断和治疗方式仍然有限。有文献^([1])报道,遗传与环境因素共同参与了OPLL的发生。

环状RNA-微RNA轴在甲状腺癌中的研究进展

环状RNA属于非编码RNA,近年来被发现在甲状腺癌中表达失调,其有望成为甲状腺癌的生物标志物。环状RNA-微RNA轴广泛参与甲状腺癌的发生发展过程。部分环状RNA可结合多种微RNA,而不同的环状RNA-微RNA轴存在共同的下游信号通路或分子靶标。这些环状RNA、信号通路及分子靶标可能在甲状腺癌的发生发展中发挥重要作用。本文就环状RNA-微RNA轴在甲状腺癌发生发展中的研究进展及临床应用前景进行综述。

基于加权基因共表达网络分析探索射血分数保留的心力衰竭中微RNA功能模块和分子调控网络

目的通过生物信息学方法探索射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)潜在的生物标志物和治疗靶点。方法使用NCBI-GEO数据库检索获得GSE53437高通量测序数据进行分析。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)获取与HFpEF密切相关的基因模块和核心微RNA(miRNA),利用miRNet数据库预测核心miRNA的靶向mRNA。应用R语言“clusterProfiler”程序包对靶基因进行KEGG通路和基因本体论(GO)富集分析。最后采用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络和miRNA-mRNA基因网络。结果在基因模块与疾病相关性分析中,棕色模块与HFpEF的相关系数(r)绝对值为0.37,P值为3e-4,具有最高的正相关性。各基因模块的基因显著性(GS)分布显示,棕色模块具有最高的GS值。模块内分析显示,棕色模块的模块相关性(MM)与GS之间密切相关(r=0.61,P值为7e-52)。以MM>0.85且GS>0.40为条件,共筛选出17个与HFpEF高度相关的核心miRNA。应用miRNet数据库预测到1578个靶向mRNA。GO注释分析结果显示,该组基因参与的生物学过程包括造血调控、T细胞激活和细胞组分大小调控等,涉及的细胞成分包括转录调控复合物、运输囊泡、早期内体等的构成,分子功能主要富集在DNA结合转录抑制因子活性/RNA聚合酶Ⅱ特异性、泛素蛋白连接酶结合和生长因子活性等方面。KEGG通路分析结果显示,该组基因主要富集于Hippo信号通路、ErbB信号通路、TNF-α信号通路、Ras信号通路等。miRNA-mRNA基因网络分析显示,miRNA-3188与UBA52、HDAC2、PSMF1和SUFU相互作用,miRNA-3909与HDAC2、PSMF1、SUFU和RELA相互作用,miRNA-762与PSMF1、SUFU和RELA相互作用,miRNA548b-3p与UBA52、HDAC2和PSMF1相互作用,miRNA-3198与UBA52、PSMF1、SUFU和RELA相互作用。结论本研究可能有助于阐释HFpEF的分子机制,为识别HFpEF的生物标志物及潜在治疗靶点奠定新的理论依据。