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德南牛全基因组变异解析和功能基因挖掘
被引量:
1
1
作者
赵家豪
刘贤
+6 位作者
张子敬
赵昭
杜蕾
吕世杰
雷初朝
王二耀
黄永震
《中国牛业科学》
2024年第3期1-6,共6页
[目的]研究德南牛的群体遗传结构和解析影响其重要性状的关键基因。[方法]通过主成分分析、群体进化树分析、群体遗传结构分析等方法,研究德南牛的遗传结构和与其他品种的亲缘关系;同时,利用全基因组SNP数据,计算德南牛与德国黄牛、南...
[目的]研究德南牛的群体遗传结构和解析影响其重要性状的关键基因。[方法]通过主成分分析、群体进化树分析、群体遗传结构分析等方法,研究德南牛的遗传结构和与其他品种的亲缘关系;同时,利用全基因组SNP数据,计算德南牛与德国黄牛、南阳牛群体固定指数(Fst)和核苷酸多样性比值(πratio)、复合似然比(CLR)、XP-EHH等多种选择信号指标,以筛选出德南牛基因组上受到选择的信号,鉴定出重要的候选基因。[结果]德南牛具有欧洲普通牛(0.789)、东亚牛(0.176)、中国瘤牛(0.035)的混合血统。在θπ和CLR方法中鉴定出93个共有基因,使用FST和XP-EHH方法鉴定出17个共有基因。进行富集以及基因功能注释后,发现这些基因可能与生殖性能(TUBB3、NSD2、GRM1、ERBB4)、生长性状(RFX3、FGFR3、GABRB1、PDE4D)、环境适应性(PGR、GRIA4)和免疫系统反应(P2RY12、P2RY13、GPR87、P2RY14、GPR171)有关。[结论]本项研究发现德南牛血统受德国黄牛影响较多,且挖掘了德南牛基因组内可能具有经济意义的性状相关的选择特征,为德南牛种群的选育提高提供理论支撑。
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关键词
德南牛
选择信号
遗传结构分析
候选基因
下载PDF
职称材料
德南牛屠宰性能与肉品质测定分析
2
作者
盛家顺
王雪琦
+6 位作者
王婷婷
李文涛
孙宇
付彤
高腾云
王建钦
张天留
《中国畜禽种业》
2024年第10期67-78,共12页
该文通过研究德南牛的屠宰性能和肉品质性状,深入挖掘并评价德南牛的肉用特征,为德南牛育种目标提供参考。该试验选取4头德南牛,经强度育肥180 d后屠宰,年龄在18月龄,对其屠宰性能、胴体指数、肉品质进行测定和分析。结果表明:与2004年...
该文通过研究德南牛的屠宰性能和肉品质性状,深入挖掘并评价德南牛的肉用特征,为德南牛育种目标提供参考。该试验选取4头德南牛,经强度育肥180 d后屠宰,年龄在18月龄,对其屠宰性能、胴体指数、肉品质进行测定和分析。结果表明:与2004年同月龄的德南牛相比,屠宰率降低了1.63%,而净肉率提升了1.96%。在屠宰率和净肉率方面,与南阳牛相比,德南牛分别提升了7.83%和5.08%。在肉品质方面,德南牛眼肌面积和背最长肌的粗蛋白质含量分别达到123.50 cm2和21.72%,相较于南阳牛分别提升了21.7%和13.9%。在氨基酸、微量元素和脂肪酸组成及含量高低存在差异,其中,呈味氨基酸和微量元素中铁、锌含量高于晋南牛和平凉红牛。德南牛肉中主要脂肪酸组分是C16:0、C18:0和C18:1n9c,占到77.5%;功能性脂肪酸中以亚油酸为主,占到9.39%,其次为丙氨酸、二十二碳六烯酸,有利于人类健康。可见,经过持续的改良和选育,德南牛肉质风味浓厚、营养丰富,肉用性能提高明显,但是与肉用专门化品种相比还存在差距,需要持续进行核心群选育,以加快新品种培育进展。
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关键词
德南牛
屠宰性能
胴体性状
肉品质性状
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职称材料
德南牛体尺体重相关性及主成分分析
被引量:
6
3
作者
赵昭
赵家豪
+4 位作者
刘贤
茹宝瑞
雷初朝
陈宏
黄永震
《中国牛业科学》
2022年第5期22-25,共4页
[目的]为了研究德南牛生长发育状况。[方法]采用SPSS23.0软件对河南省南阳市某德南牛某养殖场中的321头德南牛成年母牛,体尺指标进行相关性分析,选择5个生长性状进行相关性和主成分分析。[结果]德南牛体高、体斜长、胸围、管围、十字部...
[目的]为了研究德南牛生长发育状况。[方法]采用SPSS23.0软件对河南省南阳市某德南牛某养殖场中的321头德南牛成年母牛,体尺指标进行相关性分析,选择5个生长性状进行相关性和主成分分析。[结果]德南牛体高、体斜长、胸围、管围、十字部高、具有极显著相关(P<0.01);从主成分的特征向量和贡献率来看,主成分1反映了德南牛的整体外貌结构信息,第2主成分反映了尻部特征。本研究为阐明德南牛的体型外貌特征和选育思路提供了依据。
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关键词
德南牛
体尺
体重
主成分分析
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职称材料
题名
德南牛全基因组变异解析和功能基因挖掘
被引量:
1
1
作者
赵家豪
刘贤
张子敬
赵昭
杜蕾
吕世杰
雷初朝
王二耀
黄永震
机构
西北农林科技大学动物科技学院
河南省畜牧技术推广总站
河南省农业科学院畜牧研究所
南阳市雅民农牧有限公司
出处
《中国牛业科学》
2024年第3期1-6,共6页
基金
科技创新2030—重大项目(2023ZD040480206)
2022年河南省中央引导地方科技发展资金项目(Z20221343039)
+1 种基金
河南省重大科技专项(221100110200)
国家现代农业产业技术体系(CARS-37)资助。
文摘
[目的]研究德南牛的群体遗传结构和解析影响其重要性状的关键基因。[方法]通过主成分分析、群体进化树分析、群体遗传结构分析等方法,研究德南牛的遗传结构和与其他品种的亲缘关系;同时,利用全基因组SNP数据,计算德南牛与德国黄牛、南阳牛群体固定指数(Fst)和核苷酸多样性比值(πratio)、复合似然比(CLR)、XP-EHH等多种选择信号指标,以筛选出德南牛基因组上受到选择的信号,鉴定出重要的候选基因。[结果]德南牛具有欧洲普通牛(0.789)、东亚牛(0.176)、中国瘤牛(0.035)的混合血统。在θπ和CLR方法中鉴定出93个共有基因,使用FST和XP-EHH方法鉴定出17个共有基因。进行富集以及基因功能注释后,发现这些基因可能与生殖性能(TUBB3、NSD2、GRM1、ERBB4)、生长性状(RFX3、FGFR3、GABRB1、PDE4D)、环境适应性(PGR、GRIA4)和免疫系统反应(P2RY12、P2RY13、GPR87、P2RY14、GPR171)有关。[结论]本项研究发现德南牛血统受德国黄牛影响较多,且挖掘了德南牛基因组内可能具有经济意义的性状相关的选择特征,为德南牛种群的选育提高提供理论支撑。
关键词
德南牛
选择信号
遗传结构分析
候选基因
Keywords
Denan cattle
selection signal
genetic structure analysis
candidate genes
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
德南牛屠宰性能与肉品质测定分析
2
作者
盛家顺
王雪琦
王婷婷
李文涛
孙宇
付彤
高腾云
王建钦
张天留
机构
河南农业大学动物科技学院
河南省南阳黄牛科技中心
出处
《中国畜禽种业》
2024年第10期67-78,共12页
基金
中国博士后科学基金面上资助项目(2023M741059)
河南省科技攻关(242102111002)。
文摘
该文通过研究德南牛的屠宰性能和肉品质性状,深入挖掘并评价德南牛的肉用特征,为德南牛育种目标提供参考。该试验选取4头德南牛,经强度育肥180 d后屠宰,年龄在18月龄,对其屠宰性能、胴体指数、肉品质进行测定和分析。结果表明:与2004年同月龄的德南牛相比,屠宰率降低了1.63%,而净肉率提升了1.96%。在屠宰率和净肉率方面,与南阳牛相比,德南牛分别提升了7.83%和5.08%。在肉品质方面,德南牛眼肌面积和背最长肌的粗蛋白质含量分别达到123.50 cm2和21.72%,相较于南阳牛分别提升了21.7%和13.9%。在氨基酸、微量元素和脂肪酸组成及含量高低存在差异,其中,呈味氨基酸和微量元素中铁、锌含量高于晋南牛和平凉红牛。德南牛肉中主要脂肪酸组分是C16:0、C18:0和C18:1n9c,占到77.5%;功能性脂肪酸中以亚油酸为主,占到9.39%,其次为丙氨酸、二十二碳六烯酸,有利于人类健康。可见,经过持续的改良和选育,德南牛肉质风味浓厚、营养丰富,肉用性能提高明显,但是与肉用专门化品种相比还存在差距,需要持续进行核心群选育,以加快新品种培育进展。
关键词
德南牛
屠宰性能
胴体性状
肉品质性状
Keywords
Denan cattle
Slaughter performance
Carcass trait
Meat quality trait
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
德南牛体尺体重相关性及主成分分析
被引量:
6
3
作者
赵昭
赵家豪
刘贤
茹宝瑞
雷初朝
陈宏
黄永震
机构
南阳市雅民农牧有限公司
西北农林科技大学动物科技学院
河南省畜牧总站
出处
《中国牛业科学》
2022年第5期22-25,共4页
基金
国家现代农业产业技术体系项目(CARS-37)
河南省肉牛产业技术体系项目(S2013-08)
+1 种基金
河南省科技攻关项目(222102110069)
河南省农业科学院自主创新专项基金项目(2022C45)。
文摘
[目的]为了研究德南牛生长发育状况。[方法]采用SPSS23.0软件对河南省南阳市某德南牛某养殖场中的321头德南牛成年母牛,体尺指标进行相关性分析,选择5个生长性状进行相关性和主成分分析。[结果]德南牛体高、体斜长、胸围、管围、十字部高、具有极显著相关(P<0.01);从主成分的特征向量和贡献率来看,主成分1反映了德南牛的整体外貌结构信息,第2主成分反映了尻部特征。本研究为阐明德南牛的体型外貌特征和选育思路提供了依据。
关键词
德南牛
体尺
体重
主成分分析
Keywords
Denan cattle
body size
body weight
principal component analysis
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
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被引量
操作
1
德南牛全基因组变异解析和功能基因挖掘
赵家豪
刘贤
张子敬
赵昭
杜蕾
吕世杰
雷初朝
王二耀
黄永震
《中国牛业科学》
2024
1
下载PDF
职称材料
2
德南牛屠宰性能与肉品质测定分析
盛家顺
王雪琦
王婷婷
李文涛
孙宇
付彤
高腾云
王建钦
张天留
《中国畜禽种业》
2024
0
下载PDF
职称材料
3
德南牛体尺体重相关性及主成分分析
赵昭
赵家豪
刘贤
茹宝瑞
雷初朝
陈宏
黄永震
《中国牛业科学》
2022
6
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职称材料
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