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大肠杆菌O157的志贺毒素基因克隆和测序
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作者 李睿 孙言凤 +1 位作者 王芳 熊燕 《中国酿造》 CAS 北大核心 2010年第9期65-67,共3页
将一株大肠杆菌O157PCR扩增stx2基因全长并克隆测序。该菌株stx2基因与GenBank数据库收录的stx2基因最高同源性为98%,在3个核苷酸位点存在基因突变。采用邻位相连法构建进化树,序列分析结果表明O157为stx2C基因亚型。了解大肠杆菌O157... 将一株大肠杆菌O157PCR扩增stx2基因全长并克隆测序。该菌株stx2基因与GenBank数据库收录的stx2基因最高同源性为98%,在3个核苷酸位点存在基因突变。采用邻位相连法构建进化树,序列分析结果表明O157为stx2C基因亚型。了解大肠杆菌O157的基因突变情况,并为开发大肠杆菌分子检测方法提供了参考。 展开更多
关键词 大肠杆菌O157 志贺毒素基因 基因克隆 测序
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非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的志贺毒素基因变种及黏附相关基因分析 被引量:4
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作者 赵爱兰 金东 +2 位作者 白向宁 徐建国 熊衍文 《疾病监测》 CAS 2012年第6期428-431,共4页
目的了解我国部分地区非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的志贺毒素基因变种及其黏附相关基因,为进一步研究致病机制提供依据。方法采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)方法对29株分离菌株的stx1、stx2基因全长扩增并测序,... 目的了解我国部分地区非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的志贺毒素基因变种及其黏附相关基因,为进一步研究致病机制提供依据。方法采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)方法对29株分离菌株的stx1、stx2基因全长扩增并测序,通过与GenBank中已公布的变种序列比对确定菌株stx1、stx2基因的变种类型。对位于LEE毒力岛上的eaeA、escF、escC、tir、espA、espB、espD基因及LEE以外其他黏附相关基因iha、toxB、efa1、sfpA、lpfAO157/OI-141、lpfAO157/OI-154、saa、lpfAO113、eibG进行PCR检测。结果 25株stx1阳性菌株中有13株携带stx1a原毒素,12株携带stx1c变种;10株stx2阳性菌株中,7株携带stx2d变种,1株为stx2a原毒素,1株携带stx2g变种,1株携带与stx2eA亚单位、stx2dB亚单位最接近的stx2变种。LEE岛上的7个基因检测结果均为阴性,黏附相关基因iha阳性率为89.7%(26/29),saa阳性菌株3株、eibG阳性菌株1株,其余6个黏附相关基因均为阴性。结论我国部分非O157 STEC菌株的志贺毒素基因以stx1c、stx2d变种为主,LEE毒力岛不存在,而黏附相关基因iha广泛存在于不同血清型的产志贺毒素大肠杆菌菌株中。 展开更多
关键词 非O157产志贺毒素大肠杆菌 志贺毒素基因变种 黏附基因
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聚合酶链反应扩增大肠杆菌志贺样毒素基因 被引量:1
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作者 王嘉福 冉雪琴 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 1999年第11期6-8,共3页
两对寡核苷酸引物通过聚合酶链反应扩增大肠杆菌志贺样毒素I(SLT I)和志贺样毒素Ⅱ(SLTⅡ)基因,在单一反应中,两对引物分别扩增出130bp(SLTⅠ)和346bp(SLT Ⅱ)的DNA 片段,扩增片段经地高辛标记... 两对寡核苷酸引物通过聚合酶链反应扩增大肠杆菌志贺样毒素I(SLT I)和志贺样毒素Ⅱ(SLTⅡ)基因,在单一反应中,两对引物分别扩增出130bp(SLTⅠ)和346bp(SLT Ⅱ)的DNA 片段,扩增片段经地高辛标记寡核苷酸探针Southern 印迹杂交分析,证实为SLT Ⅰ和SLT Ⅱ基因产物。同一扩增反应中应用SLTⅠ和SLTⅡ复合引物进行扩增,不同基因型志贺样毒素大肠杆菌从样品中鉴定出。869份牛、猪腹泻粪样DNA 样品通过PCR进行了测定,其中,3% 检出志贺样毒素大肠杆菌,与牛出血性腹泻、猪水肿病有关。 展开更多
关键词 大肠杆菌 志贺毒素基因 聚合酶链反应
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大肠杆菌志贺样毒素Ⅱ型基因的分子克隆 被引量:1
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作者 冉雪琴 吴拥军 王嘉福 《西南农业学报》 CSCD 2003年第3期86-89,共4页
本文克隆了含大肠杆菌志贺样毒素Ⅱ型基因的2 0kbSau3AI酶切片断,对插入片段进行了核苷酸序列测定,1298bp的核苷酸序列包含2个完整的开放读框,其中SLTIIA亚基基因编码区长957bp,编码319个氨基酸多肽,SLTIIB亚基基因编码区长267bp,编码8... 本文克隆了含大肠杆菌志贺样毒素Ⅱ型基因的2 0kbSau3AI酶切片断,对插入片段进行了核苷酸序列测定,1298bp的核苷酸序列包含2个完整的开放读框,其中SLTIIA亚基基因编码区长957bp,编码319个氨基酸多肽,SLTIIB亚基基因编码区长267bp,编码89个氨基酸多肽,与已知人源的SLTII基因核苷酸序列比较具有99%的同源性,与SLTI结构基因相比,A亚基同源序列为56 43%,B亚基为60 15%。 展开更多
关键词 犊牛 病原菌 大肠杆菌 志贺毒素Ⅱ型基因 基因克隆 序列分析
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猪水肿病志贺样毒素大肠杆菌的分离与鉴定 被引量:6
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作者 王红珍 艾虎 +2 位作者 吴拥军 冉雪琴 王嘉福 《西南农业学报》 CSCD 2004年第3期378-381,共4页
大肠杆菌产生的志贺样毒素Ⅱ型突变体(Shiga liketoxinvariant,SLTⅡv)是猪水肿病的主要致病因子。采用聚合酶链式反应,以特异的寡核苷酸片段为引物,从200份贵州省患水肿病猪粪样中检出19株菌株含有志贺样毒素Ⅱ型突变体基因,生化实验... 大肠杆菌产生的志贺样毒素Ⅱ型突变体(Shiga liketoxinvariant,SLTⅡv)是猪水肿病的主要致病因子。采用聚合酶链式反应,以特异的寡核苷酸片段为引物,从200份贵州省患水肿病猪粪样中检出19株菌株含有志贺样毒素Ⅱ型突变体基因,生化实验结果符合大肠埃希氏杆菌的特点。经鉴定,19株大肠杆菌分属于O8、O65、O82、O1394种血清型,其中O82占63%。研究结果证实,在贵州省猪水肿病中存在志贺样毒素基因。 展开更多
关键词 大肠杆菌 猪水肿病 志贺毒素Ⅱ型突变体基因
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志贺菌6种毒力基因的多重PCR检测 被引量:1
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作者 徐兰英 许汴利 马宏 《郑州大学学报(医学版)》 CAS 北大核心 2009年第6期1218-1221,共4页
目的:建立志贺菌6种毒力基因[志贺菌肠毒素1基因(set1)、志贺菌肠毒素2基因(sen)、侵袭性质粒抗原H基因(ipaH)、侵袭相关蛋白基因(ial)、志贺毒素1基因(stx1)及调控基因(virA)]的多重PCR鉴定方法,实现多基因的同时检测。方法:选择志贺菌... 目的:建立志贺菌6种毒力基因[志贺菌肠毒素1基因(set1)、志贺菌肠毒素2基因(sen)、侵袭性质粒抗原H基因(ipaH)、侵袭相关蛋白基因(ial)、志贺毒素1基因(stx1)及调控基因(virA)]的多重PCR鉴定方法,实现多基因的同时检测。方法:选择志贺菌的6种毒力基因作为靶基因,以A群和C群4株标准及B群和D群4株临床分离株为模型,应用降落PCR方法在1个反应管中同时进行扩增,根据扩增片段大小定性判断结果。通过样本倍比稀释检验多重PCR的灵敏性,并在NCBI网站上用BLAST检索各引物的特异性。另选取河南省2001年至2007年115株志贺菌进行多重PCR检测,以验证多重PCR的可行性。结果:多重PCR能同时检测上述6种毒力基因,与单基因PCR分别检测6种毒力基因相比具有相近的灵敏度与特异性。应用多重PCR方法检测115株志贺菌,除stx1外,其余5种毒力基因的阳性率均在85%以上。结论:多重PCR鉴定志贺菌毒力基因具有简便、快速的特点,适用于毒力基因鉴定和流行病学调查研究。 展开更多
关键词 志贺 多重PCR 志贺菌肠毒素1基因 志贺菌肠毒素2基因 侵袭性质粒抗原H基因 侵袭相关蛋白基因 志贺毒素1基因 调控基因
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天津地区志贺菌志贺肠毒素基因分布与脉冲场凝胶电泳分型研究
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作者 董杰 高新蕾 +1 位作者 陈锦英 刘广文 《环境与健康杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期111-114,共4页
目的了解天津地区志贺菌流行株的志贺肠毒素基因分布和PFGE分子分型情况。方法采用PCR方法检测天津地区2005—2007年分离的62株志贺菌编码志贺肠毒素的基因(set1As、et1Bs、en),并用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对菌株进行分子分型和聚类分析... 目的了解天津地区志贺菌流行株的志贺肠毒素基因分布和PFGE分子分型情况。方法采用PCR方法检测天津地区2005—2007年分离的62株志贺菌编码志贺肠毒素的基因(set1As、et1Bs、en),并用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对菌株进行分子分型和聚类分析。结果 62株志贺菌中福氏志贺菌占58.06%,其中福氏2b为福氏志贺菌的优势型别;宋内志贺菌占41.94%;福氏志贺菌的三种志贺肠毒素基因检出率均明显高于宋内志贺菌(P<0.05);受试菌株的基因组DNA经PFGE分型,福氏志贺菌可分为10种带型(FⅠ~FⅩ);宋内志贺菌可分为4种带型(SⅠ~SⅣ),其中SⅠ型占86.96%(20/23株)。结论天津地区流行的志贺菌株编码肠毒素基因set1As、et1B和sen在不同血清群中的分布有显著性差异;宋内志贺菌可能源于亲缘关系很近的克隆系(SⅠ型),福氏志贺菌PFGE分子分型呈现出明显的多态性。 展开更多
关键词 志贺 志贺毒素基因 脉冲场凝胶电泳 分子分型
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河南省新发传染病EHEC O157:H7监测研究 被引量:8
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作者 夏胜利 沈刚健 +2 位作者 靳会娟 马宏 张锦 《现代预防医学》 CAS 北大核心 2008年第23期4691-4694,共4页
[目的]了解河南省肠出血性大肠杆菌(EHEC)感染性腹泻的发病情况、宿主带菌状况、食品污染程度及志贺毒素(stx)基因型,为制订有效的防治对策提供依据。[方法]采集河南省监测点腹泻病人、家畜、家禽粪便,水和肉食品等标本分离EHEC菌株,应... [目的]了解河南省肠出血性大肠杆菌(EHEC)感染性腹泻的发病情况、宿主带菌状况、食品污染程度及志贺毒素(stx)基因型,为制订有效的防治对策提供依据。[方法]采集河南省监测点腹泻病人、家畜、家禽粪便,水和肉食品等标本分离EHEC菌株,应用分子生物学技术检测分析菌株rfbO157、rfbO111、hlyA、eaeA、stx2和stx1等毒力基因和突变基因。[结果](1)从腹泻病人、家畜、家禽、食品、水、蜣螂和苍蝇中均分离出EHEC菌株共275株,总分离率7.88%;其中O157︰H7菌株为232株(84.36%),携带stx2基因EHECO157︰H7菌株88株(37.93%);非O157︰H7菌株43株(15.64%)。(2)宿主动物中羊带菌率最高(6.96%),是河南省EHEC最主要宿主动物;多重PCR检测出8种不同毒力基因组合型,主要为rfbO157+、hlyA+、eaeA+、stx2+组合。stx2变种毒素GK探针检测出3种毒素变种杂交带型,其中stx2原毒素+stx2vha型占7.4%,stx2vha型的占72.2%,未知新杂交带型占20.4%。(3)EHECO157︰H7菌株可分为9个PFGE型,自羊、牛、鸡和蜣螂和腹泻病患者中分离的携带stx2vha菌株同属一个PFGE型。(4)144株不携带志贺毒素的O157菌株中发现O157︰H38、O157︰H42和O157︰Hund(未确定型)新菌株。[结论]河南省家禽、家畜中普遍携带EHECO157︰H7大肠杆菌,羊是最主要的宿主动物;EHECO157︰H7为我省优势菌型,其毒素基因型为stx2-eaeA-hlyA并以stx2vha亚型为主。EHEC在外环境中污染严重并可在人与人、动物与人之间传播,家畜、家禽携带stx2 EHECO157︰H7率的高低与EHEC人群感染发病呈相关关系。 展开更多
关键词 EHEC O157:H7 腹泻 志贺毒素基因 基因 多重PER PFGE
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Establishment and Application of a Real-time PCR Method for Detecting stx2 Gene in Shiga Toxin-producing Escherichia coli(STEC)
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作者 汪伟 张雪寒 +6 位作者 王润 何孔旺 温立斌 倪艳秀 周俊明 王小敏 李彬 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2014年第9期1473-1477,共5页
[Objective] This study aimed to establish a real-time PCR method for de- tecting stx2 gene in Shiga toxin-producing E. coli (STEC). [Method] According to the known STEC stx2 gene sequences published in GenBank, PCR ... [Objective] This study aimed to establish a real-time PCR method for de- tecting stx2 gene in Shiga toxin-producing E. coli (STEC). [Method] According to the known STEC stx2 gene sequences published in GenBank, PCR primers and probes were designed based on the conserved region to construct recombinant plasmid as a positive template, thus optimizing the reaction conditions and establishing the real- time PCR method. [Result] A standard curve was established based on the opti- mized real-time PCR system, indicting a good linear correlation between the initial template concentration and Ct value, with the correlation coefficient F^e of above 0.995. The established method had a good specificity, without non-specific amplifica- tion for 10 non-STEC intestinal bacterial strains; the detection limit of initial template was 1.0x102 copies/μI, indicating a high sensitivity; furthermore, the coefficients of variation within and among batches were lower than 1% and 5% respectively, sug- gesting a good repeatability. [Conclusion] In this study, a real-time PCR method was successfully established for detecting STEC stx2 gene, which provided technical means for rapid detection of STEC in samples. 展开更多
关键词 Shiga toxin-producing E. colr Shiga toxin 2 gene Real-time PCR
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Expression of Overlapping PCR-generated Shiga Toxin B Gene Fragment in E. Coli and Its Ascitic Polyclonal Antibody
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作者 Shan Gao Lin Kang Jinglin Wang 《Journal of Life Sciences》 2010年第1期26-31,共6页
The mature Shiga toxin B (StxB) gene was optimized and generated by overlapping PCR. Recombinant expression vector pQE40-DHFR/StxB was constructed when the gene was cloned into pQE fusion expression vector. Induced ... The mature Shiga toxin B (StxB) gene was optimized and generated by overlapping PCR. Recombinant expression vector pQE40-DHFR/StxB was constructed when the gene was cloned into pQE fusion expression vector. Induced by Isopropyl β-D-thiogalactoside (IPTG), the DHFR/StxB fusion protein was highly expressed to the level of 41.36% in E. coli MI5 cells. The 35 kDa fusion protein with a 6 His-tag was one-step purified from inclusion bodies using Ni-NTA affinity chromatography column under denaturing conditions, and was refolded by dialyzing with a decreasing urea gradient. Purified DHFR/StxB fusion protein was used to immunize Kunming mice for generating the ascitic polyclonal antibody against recombinant StxB protein by injecting sarcoma 180 cells and the titer ofascitic polyclonal antibody is up to 1: 1× 10^6 detected by the indirect enzyme linked immunosorbent assy (ELISA). Western immunoblotting analysis revealed that the ascitic polyclonal antibody against StxB had a specific affinity for a 70 kDa shiga toxin protein of Shigella dysenteriae type 1. It is a new simple and quick method to produce a large amount of ascitic polyclonal antibody. The antibody is used to develop immunological method for detecting shiga toxin. 展开更多
关键词 StxB subunit synthetic gene ascitic polyclonal antibody affinity purification.
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