2019—2023年北京市怀柔区流感疫苗对住院严重急性呼吸道感染保护效果评价

目的 估算北京市怀柔区2019—2020和2022—2023年流行季流行性感冒(以下简称流感)疫苗对住院严重急性呼吸道感染(SARI)的保护效果(VE)。方法 利用怀柔区住院SARI监测数据,通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)进行流感病毒核酸检测。采用检测阴性的病例对照设计,计算流感核酸阳性组与阴性组SARI患者流感疫苗接种的比值比(OR)以及VE。结果 2019—2020和2022—2023年流行季流感疫苗对住院SARI的总VE为27.00%(95%CI:-77.83%~70.00%),其中2019—2020、2022—2023年流行季的VE分别为31.85%(95%CI:-108.10%~77.68%)、20.51%(95%CI:-291.49%~83.86%)。2019—2020年流行季对A(H3N2)亚型的VE为29.50%(95%CI:-115.47%~76.93%),2022—2023年流行季对甲型流感的VE为20.51%(95%CI:-291.49%~83.86%)。结论 怀柔区2019—2020和2022—2023年流行季流感疫苗接种未显示出有效预防流感住院的效果,后期需更严谨的大样本研究以进一步评估。

2019—2022年北京市通州区哨点医院儿内科严重急性呼吸道感染住院病例特征分析

目的分析2019—2022年北京市通州区儿内科严重急性呼吸道感染(SARI)住院病例的病原谱及流行特征,为疾病防控提供依据。方法选取2019年1月—2022年12月首都医科大学附属北京潞河医院收治的379例SARI住院患儿为研究对象,进行回顾性分析。采集患儿鼻咽拭子、呼吸道分泌物,应用多重实时荧光聚合酶链反应(qPCR)技术检测病原种类,分析其流行病学和临床特征。结果379例SARI患儿中,男性205例,女性174例;0~5岁196例,6~10岁129例,11~15岁54例;175例患儿检测到明确病原。175例SARI病例中,由病毒引起的SARI病例最常见的病原为呼吸道合胞病毒和副流感病毒;由细菌引起的SARI病例最常见的病原为肺炎支原体和肺炎链球菌。≤5岁患儿SARI主要由病毒引起,最常见病原体为呼吸道合胞体病毒;>5岁患儿SARI主要由细菌引起,最常见病原体为肺炎支原体。自2019年起北京市通州地区≤15岁儿童开始流行肺炎支原体病原菌。结论北京市通州区≤5岁儿童需重点关注呼吸道合胞病毒感染,>5岁儿童则需要重点防控肺炎支原体感染。不同年份流行毒株不同,需针对本地优势流行毒株制订治疗方案和防控措施。

2019—2021年安徽省合肥市某三甲医院住院的严重急性呼吸道感染患者的监测分析

目的分析2019—2021年在安徽省合肥市第二人民医院住院的严重急性呼吸道感染(SARI)患者的监测结果。方法筛查2019年1月—2021年12月安徽省合肥市第二人民医院住院部监测科室(呼吸内科、儿内科与重症监护科)SARI患者的资料,并采集患者鼻咽拭子、呼吸道分泌物,通过反转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测甲乙通用性流感病毒。结果2019—2021年,共监测SARI患者934例,占监测科室同期入院病例的12.04%;2019年、2020年和2021年,SARI患者分别占入院患者的10.62%、14.90%和11.40%。2020年,检测出的SARI患者占比较高。2019—2021年,SARI监测病例主要集中于冬春季节,以5岁以下儿童病例占比较大(54.82%),男女比例为1.66∶1。SARI的监测科室分别为儿内科(82.12%)、呼吸内科(17.77%)以及重症监护科(0.11%);2019—2021年采集的934份咽拭子标本经实验室检测,阳性标本39份,阳性率为4.17%,主要感染病毒类型为B型Victoria系[27例(69.23%)]。SARI与流感阳性感染患者中合并症最常见的为肺炎,SARI合并并发症的467例患者中,99.36%的患者转归为治愈或好转,不合并并发症的患者中,99.57%的患者转归为治愈或好转,差异无统计学意义(P=1.000)。SARI病例采样前最常用的药物为抗生素与神经氨酸酶抑制剂类抗病毒药物。SARI病例中,使用抗病毒药物的患者中有98.66%疾病转归为治愈或好转,而不使用抗病毒药物的患者中,99.53%的患者疾病转归为治愈或好转,差异无统计学意义(P=0.343)。结论2019—2021年,在安徽省合肥市第二人民医院住院的SARI病例多为男性、儿童、老人,冬春季为高发季节,流感阳性患者主要感染菌株均为FluB,且所有患者转归情况较好。

苏州地区5岁以下严重急性呼吸道感染(SARI)住院患儿的病毒病原学和临床特征分析

目的了解苏州地区5岁以下严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)住院患儿的病毒病原学构成、季节分布和临床特征,为苏州地区SARI病例的临床诊断治疗及防控提供线索和依据。方法对2011年3月至2012年2月期间在苏州大学附属儿童医院内科急诊病房及呼吸科病房住院治疗的5岁以下SARI病例采集鼻咽部分泌物进行实验室检测,同时收集患儿的既往病史及临床特征等相关信息。结果共纳入SARI病例746例,其中474例采集了鼻咽部分泌物。病毒阳性检出率为46.0%,其中流感病毒A型2.1%、B型11.0%、呼吸道合胞病毒(respiratory syncytial virus,RSV)26.6%、腺病毒3.2%、副流感病毒Ⅰ型2.7%、Ⅲ型4.0%,未检测到副流感Ⅱ型病毒。RSV全年均有流行,流感A、B型病毒则主要在冬、春季流行。男性患儿RSV阳性率高于女性患儿(P<0.05);流感病毒、RSV、腺病毒、副流感病毒在不同年龄段SARI患儿的阳性率差异皆有统计学意义(P<0.05)。病毒检测阳性患儿咳嗽、喘息及肺炎的发生率显著高于阴性患儿(P<0.05);RSV及副流感病毒在肺炎患儿中的检出率明显高于其他诊断(P<0.05)。纳入研究的SARI患儿平均住院天数7.38天,中位数为7天。SARI患儿在病程中接受糖皮质激素治疗与住院时间密切相关。结论苏州地区5岁以下SARI住院患儿病毒检出率最高的是RSV和流感病毒,病毒感染可能是加重SARI病例临床症状的原因之一;不同病毒感染所致疾病特征有所差异,流感病毒以上呼吸道感染和肺炎为主,RSV以毛细支气管肺炎为主。

2016年至2018年云南省住院严重急性呼吸道感染病例监测结果分析

目的探讨云南省住院严重急性呼吸道感染(SARI)病例流行病学、临床和流感病原学变化特征。方法对2016年1月至2018年12月云南省哨点医院监测到的SARI病例进行流行病学和临床特征调查,并采集咽拭子标本开展流感等呼吸道病毒检测。结果2016年1月至2018年12月,云南省哨点医院SARI病例占同期住院病例的1.20%(717/59917)。检出流感核酸阳性率为4.60%(33/717)。随机抽取的流感阴性SARI病例中,检出其他呼吸道病毒感染阳性率为23.81%(30/126),主要包括呼吸道合胞病毒、副流感病毒和偏肺病毒等。SARI病例主要来源于呼吸内科和儿内科,以青壮年和婴幼儿为主。流感确诊病例以青壮年儿童和老年人为主。并发症主要包括肺炎、呼吸衰竭和急性呼吸窘迫综合征等。SARI病例和确诊流感病例均主要集中于冬春季。SARI%和ILI%变化趋势相似。结论SARI监测作为流感样病例(ILI)监测的有效补充,建议加强呼吸道传染病防控知识的健康宣教,对重点人群推广接种流感疫苗,开展呼吸道多病原检测。

北京市东城区哨点医院住院严重急性呼吸道感染情况分析

目的监测北京市东城区哨点医院住院严重急性呼吸道感染(SARI)患者,了解本地区SARI发病规律。方法对住院SARI病例进行咽拭子检测,收集病例信息。结果共入选59例患者,其中病毒核酸检测阳性13例,均为甲型H3,病毒核酸阳性病例集中出现在10、11、12月。SARI病毒阳性和阴性组之间,年龄、性别、体温、症状和主要诊断均无显著性差异(P>0.05)。结论10、11、12月是甲型H3流感发生高峰季;病毒感染与年龄、性别、体温、症状和主要诊断无关。

郴州地区5岁以下住院儿童严重急性呼吸道感染病毒病原学研究

目的:通过对郴州地区2013-2014年5岁以下住院儿童严重急性呼吸道感染病毒病原学的病例对照研究,了解该地区的病毒流行病学特征,为临床诊治和疾病预防控制提供参考。方法:收集2013年7月-2014年6月因严重急性呼吸道感染住院患儿的鼻咽拭子489份,同时采集年龄、时间相匹配的无感染症状对照244份,采用real-time RT-PCR方法检测呼吸道合胞病毒(RSV)、鼻病毒(HRV)、偏肺病毒(HMPV)、A型流感病毒(IFV-A)、B型流感病毒(IFV-B)、C型流感病毒(IFV-C)、副流感病毒1~4型(PIV1~4)、腺病毒(ADV)、博卡病毒(HBoV)、肠道病毒(EV)及冠状病毒(HCoV-OC43、HCoV-NL63、HCoV-229E、HCoV-HKU1)。结果:489份病例组中有359份(73.41%)至少检测到1种病毒,RSV检出率最高,为27.61%,其次为ADV 9.82%、HRV 9.41%、IFV-A 8.38%、PIV2 7.15%,HMPV 5.32%,HPeV未检出。244份对照中有65份(26.64%)至少检测到1种病毒,PIV2、IFV-B、HKU1、PIV4、HPeV未检出,检出最高的为HRV 10.25%,病例组病毒总检出率比对照组检出率高,且差异有统计学意义。除HRV、冠状病毒、HBoV、IFV-C、PIV4、EV病例组与对照组检出率差异无统计学意义外,其他病毒病例组检出率比对照组明显高。各病毒主要检出年龄与季节都不同,病毒混合感染以RSV合并HRV感染为主。结论:RSV、ADV、IFV-A、IFV-B、HMPV、PIV1~3是郴州地区儿童SARTI的重要病原,以冬春季主要流行,12~35个月儿童易感,而HBoV、IFV-C、PIV4、EV、HRV和冠状病毒可能是重要的无症状潜伏感染病毒。

头孢曲松钠治疗急性严重呼吸感染临床效果评价

目的 评价头孢曲松钠在治疗急性严重呼吸感染方面的临床效果.方法 将在我院确诊为急性严重呼吸感染的患者191 例随机分为甲、乙、丙三组,甲组患者应用头孢曲松钠 进行治疗,乙组患者应用莫西沙星,丙组患者应用头孢他啶进行治疗,对三组患者的临床疗效进行对比分析.结果 在临床疗效方面甲组患者明显优于乙组与丙组,不良反应明显低于乙组与丙组,差异均存在统计学意义（p〈0.05）.结论 在严重呼吸感染的临床治疗中,头孢曲松钠具有更好的临床疗效,且不良反应发生率低,安全、有效,可作为急性严重呼吸感染的首选治疗药物.

511例5岁以下儿童严重急性呼吸道感染流感病毒检测结果分析

目的了解我院儿科5岁以下住院儿童严重急性呼吸道感染(SARI)的流感病毒分布情况及其流行特征。方法选取2014年1月至2016年6月我院儿科5岁以下住院患儿511例,取咽拭子进行流感病毒快速核酸检测并分析流感病毒的总检出率、病毒的不同型别以及不同年龄组患儿的检出情况等。结果流感病毒检测的阳性率为13.89%;均为甲型或乙型流感病毒;3岁~和4岁~组流感病毒检测阳性率较高;流感病毒检出时间主要集中于冬春季。结论流感病毒流行分布因年龄、季节的不同而不同。应加强学龄前尤其是3~5岁儿童在冬春季节呼吸道疾病监测和防治工作。

住院严重急性呼吸道感染监测项目病例定义修改的可行性探索

为提高严重急性呼吸道感染(SARI)的监测系统的敏感性和可操作性。选取湖北省荆州市4家重点监测医院的儿内科和呼吸内科开展现场调查,对住院患者的病历进行回顾,查询符合严重急性呼吸道感染(SARI)和急性呼吸道感染(ARI)病例定义的患者,了解在流感流行季节(12月份)和非流感流行季节(6月份)不同病例定义下的纳入的病例数,以及每周的入院病人的分布情况。病例定义可由SARI修改为ARI;从住院病例中随机抽取约1/4(22.4%)的样本量进行检测,即可得到与总体一致的阳性率;为操作便利,选择每周的周一和周二两天进行呼吸道标本的采样。可采用ARI病例定义对监测地区住院患者开展呼吸道传染病监测,对监测人群可采用随机抽样进行流感病毒的检测,从而提高监测工作的可实施性,并同时降低监测运行成本。

ARIMA模型在兰州市城关区医院儿科住院的严重急性呼吸道感染病例数预测中的应用

目的对兰州市城关区人民医院儿科收治的住院严重急性呼吸道感染病例进行自回归滑动平均混合(ARIMA)建模,判断模型的建模效果,并进行预测。方法选取兰州市城关区人民医院2010年1月至2016年6月儿科住院严重急性呼吸道感染病例数数据作为ARIMA模型的建模部分,2016年7～12月数据作为模型验证部分,比较模型的拟合和预测效果。结果 2010年1月至2016年6月在兰州市城关区人民医院儿科收治的住院严重急性呼吸道感染病例数有1、2月较低,6、7月较高的季节因素,ARIMA(1,1,2)×(2,1,0)_(12)模型拟合的效果较好,该模型在测试集上验证平均绝对百分比误差达到31.30,均方根误差达到11.49,将2016年7～12月数据作为验证集,验证结果相对误差为22.19%。结论所建立ARIMA(1,1,2)×(2,1,0)_(12)模型在测试集上拟合效果好,在验证集上预测精度高,我院儿科应用该模型在住院严重急性呼吸道感染病例数的预测和预警可达到较好的效果。

上海市崇明区16岁及以上人群严重急性呼吸道感染住院病例病原学监测分析

目的通过对上海市崇明区住院严重急性呼吸道感染病例的流感病毒监测,了解其病原学特点和季节性特点.方法：对严重急性呼吸道感染病例进行鼻咽拭子荧光定量 PCR 方法检测.结果：三星镇社区卫生服务中心核酸检测阳性率12.20%（5/41）,新河镇社区卫生服务中心核酸检测阳性率 24.39%（10/41）,均高于全市常规门急诊监测流感病毒阳性率;两监测点流感阳性呈明显的时间分布,且两监测点高阳性率月份相似;两监测点流感阳性总计男性7例,女性8例,阳性检出率分别为：15.91%,21.05%.不同性别住院SARI病例中的流感阳性病例比例差异无统计学意义（χ2=0.04,P =0.85）.结论：严重急性呼吸道感染住院病例监测是对常规发热门诊流感病毒监测进行补充,为流感防控工作和临床治疗提供科学依据.

2019-2022年北京市通州区严重急性呼吸道感染住院病例病原谱分析

目的分析2019—2022年北京市通州区哨点医院严重急性呼吸道感染(severe acute respiratory infection,SARI)住院病例的病原谱及流行特征,为科学防控提供参考。方法纳入2019年1月—2022年12月北京市通州区潞河医院SARI患者,采集患者鼻咽拭子或呼吸道分泌物,荧光定量法检测病原及其种类,分析其流行病学特征。结果共纳入SARI病例1124例,其中379例呼吸道病原体阳性,检出率为33.72%。细菌的检出率较高,以肺炎支原体、肺炎链球菌和嗜麦芽窄食单胞菌为主,检出率较高的病毒为甲型流感病毒、副流感病毒和呼吸道合胞病毒。不同年龄段病例数及病原检出率差异有统计学意义(χ^(2)=555,P=0.0001)。不同年份优势检出病原体不同,2019年肺炎支原体和甲型流感病毒的检出率较高,分别为27.27%(51/187)和17.65%(33/187);2020年副流感病毒、肺炎支原体和流感嗜血杆菌的检出率较高,分别为16.67%(10/60)、11.67%(7/60)和11.67%(7/60);2021年嗜麦芽窄食单胞菌和呼吸道合胞病毒的检出率较高,分别为24.39%(20/82)和19.51%(16/82);2022年嗜麦芽窄食单胞菌和副流感病毒的检出率较高,分别为20.00%(10/50)和12.00%(6/50)。结论北京市通州区SARI病例中细菌性病原体检出率较高,需要关注嗜麦芽窄食单胞菌和肺炎支原体的流行。此外,呼吸道合胞病毒、副流感病毒、甲型流感病毒的流行也不容忽视。不同年份检出的主要病原体不同,需要针对本区的实际情况制定防控措施。本研究为国家呼吸道多病原监测方案的实施提供了基础数据。

2015—2020年天津市严重急性呼吸道感染病例人呼吸道合胞病毒的流行特征分析

目的了解2015—2020年天津市严重急性呼吸道感染病例中人呼吸道合胞病毒的流行特征。方法研究资料来源于2015—2020年天津市哨点医院第三中心医院的SARI病例监测数据,有1597例SARI病例纳入研究。研究对象的临床标本进行了呼吸道多病原检测,并对HRSV阳性标本进行分型,分析不同年龄组、不同时段病例的HRSV检出率差异以及混合感染情况。结果共收集鼻咽拭子样本1597份,HRSV检出率为4.20%。67份HRSV阳性标本中单纯HRSV-A核酸阳性19份,单纯HRSV-B核酸阳性19份,HRSV-A和HRSV-B同时核酸检出阳性29份。不同年龄组HRSV检出率的差异具有统计学意义(P<0.05),5岁以下儿童HRSV检出率高于其他年龄组。2016至2020年,HRSV检出率呈现出逐年递增的趋势。SARI病例冬季HRSV检出率最高,为7.15%。HRSV与其他病毒检出混合阳性10例(14.93%),其中HRSV与甲型流感病毒检出混合阳性4例。结论天津市HRSV流行高峰为冬季,2016至2020年天津市HRSV感染率呈上升趋势,5岁以下儿童是HRSV感染的高发人群。

2018—2022年浙江省湖州市儿童严重急性呼吸道感染病例中呼吸道合胞病毒感染特征

【目的】了解浙江省湖州市严重急性呼吸道感染(SARI)住院病例中的儿童呼吸道合胞病毒(RSV)感染情况,探索RSV的流行特征及影响因素。【方法】收集湖州市第一人民医院2018—2022年符合SARI监测方案定义的新入院的<15周岁儿童的咽拭子标本进行呼吸道病毒核酸检测。应用SPSS 25.0和Excel 2016软件对数据进行统计分析。【结果】共对1 076份标本进行核酸检测,总体阳性率为11.2%,<5岁婴幼儿的阳性率较高(16.7%)。RSV感染呈季节分布,主要集中在秋冬季,12月份阳性率最高(22.3%)。共检出呼吸道混合感染23份,混合感染率2.13%,其中RSV相关的混合感染检出16份。logistic回归分析得出,季节与年龄是影响RSV感染的因素。【结论】2018—2022年湖州市SARI中RSV在不同年龄以及不同季节呈不同的流行特征,存在明显的差异,为日后RSV感染的预防提供了科学依据。

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型感染与视网膜血管阻塞之间不存在因果关系:来自两样本孟德尔随机化证据

目的孟德尔随机化(MR)分析严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染与视网膜血管阻塞的因果关系。方法采用欧洲人群全基因组关联研究(GWAS)的汇总统计数据,进行双样本MR分析。SARS-CoV-2感染的GWAS数据包含SARS-CoV-2普通感染、感染住院、重症感染者,分别为2597856、2095324、1086211例。视网膜血管阻塞数据来自FinnGen数据库,其中视网膜动脉阻塞、视网膜静脉阻塞(RVO)分别为203269、182945例。采用逆方差加权(IVW)、随机效应模型、加权中位数(WM)、MR-Egger、简单模式、加权模式分析SARS-CoV-2不同感染表型与视网膜血管阻塞之间的双向因果关系。采用Q统计量的P值判断分析各单核苷酸多态性(SNP)之间是否存在异质性;采用MR多态性残差和离群值(MR-Presso)法检测SNP异常值;采用MR-Egger截距测试检验SNP的水平多效性。结果MR分析IVW、随机效应模型、MR-Egger、WM、加权模式结果显示,SARS-CoV-2普通感染、感染住院、重症感染与视网膜血管阻塞无显著关联(P>0.05);视网膜血管阻塞与SARS-CoV-2不同感染表型无显著关联(P>0.05)。简单模式下,SARS-CoV-2重症感染与RVO存在关联(P<0.05);RVO与SARS-CoV-2普通感染存在关联(P<0.05)。IVW、MR-Egger未观察到不同暴露与结局存在异质性(P>0.05)。MR-Egger无水平多效性证据(P>0.05);MR-Presso未发现离群的SNP。结论本研究结果不支持SARS-CoV-2感染与视网膜血管阻塞发生存在因果关系。

2021—2022年度成都市某哨点医院住院重症急性呼吸道感染患者监测结果分析

目的了解四川成都市某哨点医院住院重症急性呼吸道病毒感染(SARI)患者的病原谱,为流感阴性患者的诊断处理提供依据。方法对2021年1月至2022年12月收集到的成都市某哨点医院SARI病例咽拭子标本,使用多重荧光PCR的方法进行多种呼吸道病原的检测。采用χ^(2)检验进行组间率的比较(SPSS 26.0软件),检验水准为α=0.05。结果采集到的608例SARI患者标本中,共检出呼吸道病原体阳性的患者300例,总阳性率为49.34%。其中流感嗜血杆菌阳性155例(阳性率为25.49%),腺病毒阳性58例(9.54%),乙型流感病毒阳性45例(7.40%),甲型流感病毒阳性32例(5.30%);混合感染72例(11.84%)。流感病毒集中于秋冬季节,呼吸道合胞病毒主要集中在春季。不同年龄组的感染阳性率比较,差异有统计意义(P<0.001),5~17岁病例病原体检出阳性率最高(80.23%),其次是5岁以下病例(59.17%)等。结论成都市SARI病例的主要病原体为流感嗜血杆菌、流感病毒、腺病毒等。感染不同病原出现不同月份高峰,要做好对18周岁以下年龄组SARI患者的病原监测。SARI病例的多种呼吸道病原体检测,不但能够为医院治疗未知病因呼吸道感染患者带来帮助,而且对SARI的防治与管理有着重要的公共卫生作用。

2023年上海市病毒性急性呼吸道感染监测结果分析

目的分析2023年上海市病毒性急性呼吸道感染的病原学特征和流行特点,为相关呼吸道疾病防控和风险评估提供科学依据。方法基于2023年上海市急性呼吸道感染多病原监测工作,对哨点医院报送的临床监测标本进行呼吸道病原体多重PCR检测,结合标本信息对检出病例进行病原学与流行病学分析。结果2023年度上海市病毒性急性呼吸道感染监测标本中病毒性病原体阳性检出率为21.17%(984/4648),其中ILI病例标本的检出率为33.53%(504/1503),严重急性呼吸道感染病例标本检出率为15.62%(480/3145)。甲型流感病毒(Flu A)的检出率最高(13.7%,637/4648),其他病原体包括人偏肺病毒(HMPV)、人鼻病毒/肠道病毒(HRV/HEV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒(PIV)、腺病毒(ADV)、乙型流感病毒(Flu B)和人博卡病毒(HBoV)均有检出。从时间分布看,HRV/HEV和RSV在第二季度检出率最高,均为2.27%(28/1236),PIV在第三季度检出率最高,为2.49%(35/1405),HMPV则主要在第三季度与第四季度流行,其检出率分别为2.63%(37/1405)和2.35%(32/1360)。结论Flu A为上海市市2023年度急性呼吸道感染监测病例中的主要呼吸道病原体,HMPV检出率仅次于Flu A,HRV/HEV、RSV、PIV等其他各类呼吸道病毒在不同季度均有检出且存在叠加流行,各种呼吸道病毒在不同感染人群和不同时间的流行情况存在差异。

2020-2021年河南省漯河市严重急性呼吸道感染病例呼吸道合胞病毒基因特征分析

目的 了解2020-2021年河南省漯河市严重急性呼吸道感染(SARI)病例中的人呼吸道合胞病毒(HRSV)基因特征。方法 采集2020年4月至2021年3月漯河市中心医院因SARI住院的病例标本,用荧光定量PCR法进行HRSV病毒核酸检测,对检测阳性标本使用RT-PCR法进行HRSV G基因第二高变区扩增,使用CExpress以及MEGA7.0软件进行序列编辑、进化树构建和基因特征分析。结果 共采集SARI咽拭子标本170份,其中HRSV核酸检测阳性标本15份(8.8%)。对阳性标本进行靶基因扩增后获得12条序列,经分析全部为HRSVB亚型的BA9基因型。8条序列与来自欧洲的BA9基因型序列汇成一簇,处于进化树顶端;4条序列与来自国内和澳洲的BA9基因型序列汇成一簇。与参考株相比,12条序列在重复插入的60个碱基区及aa164-176区域出现突变,同时存在253NITT糖基化位点的增加和276 NSTQ糖基化位点的缺失。结论 HRSV B亚型是2020-2021年河南省漯河市SARI病例中流行的亚型,BA9基因型为流行基因型,与流行株相比变异较大,应对BA9基因型HRSV进行持续深入的监测,为科学防控SARI提供依据。

湖州市严重急性呼吸道感染儿童病例中人偏肺病毒的流性特征分析

目的为了解湖州市严重急性呼吸道感染(SARI)儿童住院病例中人偏肺病毒(hMPV)的流行特征。方法收集2021年1月-2022年12月湖州市第一人民医院SARI儿童住院病例的咽拭子标本,采用多重荧光PCR的方法进行hMPV及其他常见呼吸道病毒检测。hMPV阳性样品进一步对其F基因进行测序已确定其基因型别。结果共收集629例SARI儿童住院病例标本,病毒检出阳性率为20.03%(126/629)。其中呼吸道合胞病毒RSV检出阳性率最高,为9.38%(59/629),人偏肺病毒hMPV检出阳性率为2.07%(13/629)。hMPV感染在各年龄组儿童均有发现,其中>1岁~3岁组检出阳性率最高。hMPV的检出高峰主要集中在冬季和春季。基于F基因的系统进化分析显示湖州地区流行的hMPV包括A、B2个基因型,其中B1基因亚型4例,B2基因亚型2例,A2c基因亚型4例,未检出A1基因亚型。结论湖州地区hMPV感染呈季节性流行,存在A2c基因亚型、B1基因亚型和B2基因亚型共流行。