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急性冷应激大鼠肝脏中novel-miR-133-5p生物学功能预测
被引量:
1
1
作者
臧树成
郭文晋
+5 位作者
甄莉
连帅
王立鹏
袁建彬
李文杰
杨焕民
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期1585-1591,共7页
本研究旨在检测6种novelmicroRNA(novel-miR-1-5P,novelmiR-6-3P,novel-miR-9-3P,novel-miR-25-5p,no-vel-miR-133-5P和novel-miR-287-3p)在急性冷刺激大鼠肝脏中的表达情况,并对novel-miR-133-5P的生物学功能进行分析,预测了no...
本研究旨在检测6种novelmicroRNA(novel-miR-1-5P,novelmiR-6-3P,novel-miR-9-3P,novel-miR-25-5p,no-vel-miR-133-5P和novel-miR-287-3p)在急性冷刺激大鼠肝脏中的表达情况,并对novel-miR-133-5P的生物学功能进行分析,预测了novel-miR-133-5P在冷应激大鼠肝脏内的功能。前期冷应激大鼠血清高通量测序试验的结果中发现这6种差异表达的novelmicroRNA。本试验采用了30只12周龄SPF级Wistar雄性大鼠,体质量(350±10)g,将大鼠放置人工气候室预饲7d,预饲温度为(24.0±0.1)℃。随机分成急性冷应激组(CSS)和常温对照组(NTS),对CSS急性冷刺激12h后,冷刺激温度为(4.0±0.1)℃。采取肝脏提取总RNA,应用qRTPCR方法检测6种novelmicroRNA在急性冷刺激大鼠肝脏的表达情况。结果显示,6种novelmicroRNA在急性冷刺激大鼠肝脏均有表达,除novel-miR-9-3P外,其余的都显著升高,novel-miR-133-5P升高的最为明显(P〈0.01)。对novel-miR-1335P进行生物学信息分析发现,novel-miR-133-5P的靶基因有2048个,其中bcl9与wntll肿瘤的发生、增殖和迁移有关;同时wnt11也对正常细胞的增殖、分化和凋亡也有重要影响;Smarcall是一种DNA结合蛋白,可以修复因损伤而停止复制的DNA。结果表明,在大鼠血清中存在的6种novel microRNA同样存在于冷应激大鼠肝脏中,在冷应激状态下novel-miR-133-5P的异常上调可能会对机体的生长发育、免疫调节和遗传等方面有重要的影响。
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关键词
急性冷应激大鼠
肝脏
NOVEL
MICRORNA
靶基因
生物信息学
原文传递
题名
急性冷应激大鼠肝脏中novel-miR-133-5p生物学功能预测
被引量:
1
1
作者
臧树成
郭文晋
甄莉
连帅
王立鹏
袁建彬
李文杰
杨焕民
机构
黑龙江八一农垦大学动物科技学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第8期1585-1591,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(31372398)
教育部博士点导师基金资助项目(20132305110004)
“十三五”国家重点研发计划资助项目(2016YFD501210)
文摘
本研究旨在检测6种novelmicroRNA(novel-miR-1-5P,novelmiR-6-3P,novel-miR-9-3P,novel-miR-25-5p,no-vel-miR-133-5P和novel-miR-287-3p)在急性冷刺激大鼠肝脏中的表达情况,并对novel-miR-133-5P的生物学功能进行分析,预测了novel-miR-133-5P在冷应激大鼠肝脏内的功能。前期冷应激大鼠血清高通量测序试验的结果中发现这6种差异表达的novelmicroRNA。本试验采用了30只12周龄SPF级Wistar雄性大鼠,体质量(350±10)g,将大鼠放置人工气候室预饲7d,预饲温度为(24.0±0.1)℃。随机分成急性冷应激组(CSS)和常温对照组(NTS),对CSS急性冷刺激12h后,冷刺激温度为(4.0±0.1)℃。采取肝脏提取总RNA,应用qRTPCR方法检测6种novelmicroRNA在急性冷刺激大鼠肝脏的表达情况。结果显示,6种novelmicroRNA在急性冷刺激大鼠肝脏均有表达,除novel-miR-9-3P外,其余的都显著升高,novel-miR-133-5P升高的最为明显(P〈0.01)。对novel-miR-1335P进行生物学信息分析发现,novel-miR-133-5P的靶基因有2048个,其中bcl9与wntll肿瘤的发生、增殖和迁移有关;同时wnt11也对正常细胞的增殖、分化和凋亡也有重要影响;Smarcall是一种DNA结合蛋白,可以修复因损伤而停止复制的DNA。结果表明,在大鼠血清中存在的6种novel microRNA同样存在于冷应激大鼠肝脏中,在冷应激状态下novel-miR-133-5P的异常上调可能会对机体的生长发育、免疫调节和遗传等方面有重要的影响。
关键词
急性冷应激大鼠
肝脏
NOVEL
MICRORNA
靶基因
生物信息学
Keywords
acute
cold stress rat
liver
novel microRNA
target gene
bioinformatics analysis
分类号
S852.2 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
急性冷应激大鼠肝脏中novel-miR-133-5p生物学功能预测
臧树成
郭文晋
甄莉
连帅
王立鹏
袁建彬
李文杰
杨焕民
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
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