2019-2021年广东省严重急性呼吸道感染病例中鼻病毒流行情况及其分子分型研究

分析广东省人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)的流行情况和型别分布情况。选取了2019年1月至2021年12月收集的1959份SARI病例的咽拭子标本,采用呼吸道多病原检测和巢式PCR的方法进行HRV的检测和分型,使用SPSS 26.0软件分析HRV的流行分布,使用MEGA11等软件对HRV进行分型和亲缘关系的研究。共收集1959例严重急性呼吸道感染病例(Severe acute respiratory infection,SARI),其中男性为1205例,女性为754例。婴幼儿组阳性检出率最高,随着年龄的增长,鼻病毒的阳性检出率会下降。2020年鼻病毒阳性率仅在6月份有一个高峰期,2021年鼻病毒阳性率在4月份和10月份有两个高峰期。人鼻病毒合并其他病毒检出的病例有25例,检出率为12.31%,与人副流感病毒和人冠状病毒的合并检出最为常见。203份鼻病毒阳性样本共获得114条VP4/VP2序列,分型鉴定结果显示HRV-A型68株,HRV-B型8株,HRV-C型27株,HRV-A和HRV-C是广东省HRV流行的主要型别。婴幼儿是HRV感染的高发人群,HRV-A1和HRV-C15是广东省HRV感染的优势基因型。另外,学校开学导致的学生聚集现象是鼻病毒检出率上升的重要原因之一。

北京地区急性呼吸道感染病例中副流感病毒感染的流行特征研究

目的了解北京地区急性呼吸道感染病例中副流感病毒感染现况,探索其流行特征。方法选择2011 2014年期间就诊于哨点医院的急性呼吸道感染病例,采集其咽拭子、深咳痰液等呼吸道样本,采用多重实时荧光PCR法检测副流感病毒1型、2型、3型、4型及其他常见呼吸道病毒,包括腺病毒、偏肺病毒、冠状病毒、流感病毒、呼吸道合胞病毒、鼻病毒、博卡病毒、肠道病毒,检测结果采用SPSS 17.0软件进行统计分析。结果 3978例病例中共检测到217例副流感病毒阳性病例,阳性检出率为5.46%;其他呼吸道病毒检测阳性率最高为流感病毒,为12.27%（488/3978）;副流感病毒中3型阳性检出率最高,为2.21%,2型阳性检出率最低,为0.83%;5岁以下儿童组阳性检出率最高,为7.75%,其次为60岁以上老龄组,6-15岁青年组阳性检出率最低;2011 2013年副流感病毒1型、3型阳性检出率呈逐年下降趋势,2014年有所升高;副流感病毒2型阳性检出率在2011年和2013年间明显高于2012年和2014年,呈隔年流行态势;4年中副流感病毒4型呈散发;6 8月副流感病毒的阳性检出率明显高于其他月份;急性上呼吸道感染与急性下呼吸道感染病例中副流感病毒阳性率差异无统计学意义。结论 2011 2014年北京地区副流感病毒感染主要为3型和1型;婴幼儿是副流感病毒感染的主要人群。不同年份、月份副流感病毒流行强度及流行型别差异有统计学意义。

上海市崇明区16岁及以上人群严重急性呼吸道感染住院病例病原学监测分析

目的通过对上海市崇明区住院严重急性呼吸道感染病例的流感病毒监测,了解其病原学特点和季节性特点.方法：对严重急性呼吸道感染病例进行鼻咽拭子荧光定量 PCR 方法检测.结果：三星镇社区卫生服务中心核酸检测阳性率12.20%（5/41）,新河镇社区卫生服务中心核酸检测阳性率 24.39%（10/41）,均高于全市常规门急诊监测流感病毒阳性率;两监测点流感阳性呈明显的时间分布,且两监测点高阳性率月份相似;两监测点流感阳性总计男性7例,女性8例,阳性检出率分别为：15.91%,21.05%.不同性别住院SARI病例中的流感阳性病例比例差异无统计学意义（χ2=0.04,P =0.85）.结论：严重急性呼吸道感染住院病例监测是对常规发热门诊流感病毒监测进行补充,为流感防控工作和临床治疗提供科学依据.

儿童呼吸道感染标本人偏肺病毒的分子检测与分型

目的 了解儿科门诊流感样病例和住院严重急性呼吸道感染病例中人偏肺病毒（hMPV）感染状况、病毒基因特征.方法 选取2011-2013年杭州地区哨点医院,儿科呼吸道门诊、住院病例共2 593例,流感样病例采集咽拭子1 676份,住院重急性呼吸道感染病例采集气管吸取物917份.用实时荧光RT-PCR方法检测hMPV核酸,阳性样本用RT-PCR方法对hMPV融合蛋白（F）基因片段扩增、序列与基因分型.实验结果作描述性统计和样本率的卡方检验.结果 门诊检出率6.62％（111/1 676）,住院检出率6.32（58/917）,检出率差异无统计学意义（x2=0.086,P=0.769）.门诊与住院hMPV性别检出率差异无统计学意义.＜1岁组住院患儿检出率（6.33％,43/679）高于门诊（2.79％,19/681）,差异有统计学意义（x2=9.808,P=0.002）.hMPV阳性患儿平均年龄门诊（31.33±18.50月）＞住院（10.41±8.28月）.冬季门诊检出率13.56％（59/435）高于住院8.06％（20/248）,差异有统计学意义（x2=4.669,P=0.031）.hMPV共感染检出率住院（31.04％,19/58）高于门诊（18.01％,20/111）,差异有统计学意义（x2 =4.663,P=0.031）.门诊和住院hMPV均以A2亚型最多,不同基因型的临床特征不明显.结论 门诊与住院hMPV感染率无差异,hMPV阳性患儿平均年龄门诊大于住院,冬季hMPV检出率门诊高于住院,门诊与住院hMPV共感染主要病原不同,研究期间门诊与住院基因型均以A2为主.

广东省揭阳市2015年-2019年流感病毒核酸检测结果分析

目的了解揭阳市流感病毒流行规律和病原特征,为揭阳市流感防治工作提供科学依据和技术支撑。方法采集国家级流感监测哨点医院的流感样病例(influenza like illness,ILI)和住院严重急性呼吸道感染病例(severe acute respiratory infection,SARI)的咽拭子标本,用实时荧光定量RT-PCR方法进行核酸检测。结果共检测ILI标本5 545份,阳性723份,阳性率为13.04%;高峰出现在冬春季和夏季;15岁~24岁年龄组的核酸检测阳性率最高;检测样本中男、女阳性率比例为1.24∶1。共检测SARI标本683份,阳性100份,阳性率为14.64%;高峰出现在冬夏季;15岁~24岁年龄组的核酸检测阳性率最高;检测样本中男、女阳性率比例为1.08∶1。结论揭阳市流感流行形势比较严峻,流感阳性率较高;流行型别多样,不同年份流感优势毒株交替出现;各年龄组的阳性率有差异。