猪伪狂犬病病毒HeN1株全基因组测序及感染和毒力相关基因的变异特征分析

2011年以来我国多个省份免疫过Bartha-K61弱毒疫苗的猪场相继发生猪伪狂犬病（PRl疫情。为分析PR病毒（PRV）流行株的变异情况，本研究对其中一株PRVHeNl分离株进行了全基因组测序，并对PRV感染相关基因（gB、gC、gD和gH）和毒力相关基因（TK、PK、RR1、RR2、gE和gI）进行比较分析。结果显示，国内分离株之间的序列同源性很高（96．2％～100％），而与国外分离株的同源性较低（92．9％～99．7％）；国内分离株与国外分离株在感染和毒力相关基因编码上存在氨基酸突变和插入／缺失特征；并且序列分析表明部分插入／缺失与微卫星序列重复单元数量的变化相关。遗传进化分析表明，国内外分离株间具有显著的遗传差异，处于两个独立的遗传分支。此外，国内分离株相对于国外分离株在gC蛋白中存在7个连续氨基酸的插入（63AAASTPA69），该插入突变可以作为PRV国内外病毒株的分子特征。本研究为有效防制PR提供实验依据。