基于计算机模拟探讨六味地黄丸治疗骨关节炎的多成分-多靶点作用

目的:探讨六味地黄丸治疗骨关节炎的多成分-多靶点作用。方法:以六味地黄丸所含的183个化合物和与骨关节炎相关的13个靶点蛋白质为研究对象,利用描述符计算、主成分分析、分子对接等计算机模拟方法,分析六味地黄丸所含化合物的物理化学性质及其作用的靶点,并据此构建六味地黄丸多成分-多靶点作用网络。结果:六味地黄丸所含化合物具有多样的物理化学性质,这些化合物与治疗骨关节炎药物分子、类药分子具有相似的化学空间。六味地黄丸多成分-多靶点网络模型中每个化合物的平均靶点数为2.24,平均每个靶点与5个化合物相关联。结论:六味地黄丸治疗骨关节炎具有多成分、多靶点作用的特点,可能在治疗骨关节炎方面具有良好的应用前景。

经典Wnt信号通路中β-catenin在细胞核内外分布的调控机制及潜在治疗靶点的研究进展

经典Wnt信号通路在肿瘤细胞的增殖分化中发挥重要作用,该信号通路中的核心蛋白分子β-catenin介导信号从细胞质传递到细胞核,并在核内参与组成转录复合体,激活下游靶基因转录。β-catenin进入细胞核内是其激活下游转录因子的重要前提,其出入细胞核的方式尚未完全解析。β-catenin入核方式主要为利用经典入核途径关键蛋白直接入核及通过“分子伴侣”协助入核,而出核方式主要为依赖染色体维持区域1(chromosome maintenance region 1,CRM1)的出核途径。细胞膜上的钙黏蛋白、细胞质内的降解复合体相关蛋白及细胞核内的转录复合体相关蛋白等均可导致β-catenin滞留,从而影响其在细胞核内外的分布。在不改变细胞内β-catenin总量的情况下,通过减少β-catenin入核及核内滞留作用、增加其出核及核外滞留作用,从而阻断Wnt/β-catenin信号通路,也是治疗经典Wnt信号通路相关疾病的有效途径。本文总结近年来关于β-catenin在细胞核内外分布状态的调控机制,为进一步研究治疗经典Wnt信号通路相关疾病提供潜在靶点及新思路。

缺氧诱导因子-1α:很有潜力的肿瘤治疗靶点

缺氧诱导因子-1α(hypoxia-inducible factor-1α,HIF-1α)是在缺氧条件下广泛存在于人类和哺乳动物细胞内的一种核转录因子,对维持体内氧稳态起重要的调节作用。缺氧是实体肿瘤内部的常见现象,缺氧应激引起HIF-1α的聚集、活化,活化的HIF-1α通过与相应的靶基因序列结合调控多种缺氧反应基因的表达,以维持肿瘤细胞的自身氧稳态及能量代谢平衡,在肿瘤的发生发展中起着极为重要的作用。目前,对HIF-1α的研究已经成为肿瘤学研究中一个令人关注的领域,相关研究成果进一步加深了科学工作者对HIF-1α在肿瘤生物学进程中的作用及其信号通路调控的认识,为寻求肿瘤治疗的新靶点提供了重要科学依据和新思路。

基于网络药理学探讨独活-桑寄生治疗骨质疏松症的活性成分及生物学基础

目的运用网络药理学探究独活-桑寄生治疗骨质疏松症的活性成分,并通过筛选分析阐述独活-桑寄生治疗骨质疏松症的生物学基础。方法中药独活、桑寄生的活性成分及靶标通过中药数据库TCMSP、BATMAN检索出,骨质疏松症的预测靶点通过疾病靶点数据库GeneCards检索出,将药物和疾病靶点进行映射,利用网络可视化软件Cytoscape3.6.0整理并筛选出核心成分及有效靶点,再将有效靶点通过OmicShare云平台进行GO富集分析、David6.8数据库进行KEGG通路富集分析。结果独活和桑寄生活性成分根据筛选条件得到核心成分共3个,分别为槲皮素、蛇床子素和补骨脂素;核心靶点24个,包括PTGS2、PTGS1、ESR1、ADRB2等;获得2509条GO生物过程,包括对含氧化合物的反应、对有机物的反应、细胞对化学刺激的反应等;193条分子功能,包括对酶结合、同一蛋白结合、信号受体结合等;113条细胞组成,包括膜筏、膜微区、膜区等;获得KEGG信号通路12条,肿瘤坏死因子信号通路、低氧诱导因子-1信号通路、PI3K-Akt信号通路等为治疗骨质疏松症关键通路。结论独活和桑寄生配伍的多成分、多靶点、多通路通过抗炎和抗氧化的作用,从而治疗骨质疏松症,为中药复方治疗疾病的作用机制提供科学依据。

基于网络药理学的石菖蒲治疗注意缺陷多动障碍作用靶点及信号通路研究

目的采用网络药理学方法筛选石菖蒲治疗注意缺陷多动障碍(ADHD)的作用靶点及相关信号通路,进一步明确其作用机制。方法通过中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)、TCMDatabase@Taiwan数据库检索石菖蒲化学成分并筛选作用靶点,从DisGeNET、ADHDgene、TTD及DrugBank数据库检索与ADHD相关的疾病靶点,利用Cytoscape3.2.1软件构建化合物-靶点网络,并筛选核心网络,进一步进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果共筛选出石菖蒲治疗ADHD的化合物65个,与之相对应的作用靶点25个。共涉及信号通路238条,按其生物功能富集分为7组,分别为腺苷酸环化酶-G蛋白偶联受体信号通路、磷脂酶C-G蛋白偶联受体信号通路、单胺类神经递质转运、腺苷酸环化酶活性的调节、胺类物质转运的调控、平滑肌收缩功能及血管活性调节。结论本研究初步验证了石菖蒲治疗ADHD的药理学作用机制,为进一步从细胞生物学层面验证其作用机制奠定了基础。

基于气相色谱-质谱联用技术及网络药理学的黑老虎根挥发油活性成分研究

目的为黑老虎根的开发利用提供参考。方法采用气相色谱-质谱联用(GC-MS)法对黑老虎根挥发油的化学成分进行定性分析;在此基础上,运用网络药理学方法,预测和筛选出活性成分的作用靶点及其涉及的信号通路,构建成分-靶点网络及靶点相互作用网络,并进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集,以及疾病分析,阐述黑老虎根挥发油成分对疾病的作用机制。结果筛选出黑老虎根挥发油中相对含量大于1%的化合物共17种,均符合类药五原则。其中15种经网络药理学分析,共30个主要作用靶点,包括PTGS1,PTGS2,GABRA1,GABRA2,GABRA6,CHRM1,CHRM3,SLC6A2等;20个主要相关通路,其中,精神调节相关的通路包括神经活性配体-受体相互作用通路、逆行神经信号通路、尼古丁上瘾通路、吗啡上瘾通路γ-氨基丁酸通路、5-羟色胺突触通路等,炎症相关的通路包括NF-κB通路、胆碱能抗炎通路等。CO功能富集分析获得主要生物过程(BP)8条,细胞组分(CC)7个,分子功能(MF)4条。疾病分析中相关性排名前20的疾病主要为精神类疾病,以及2型糖尿病、感染、炎症等。结论本研究中建立的基于GC-MS技术与网络药理学的研究方法,可为黑老虎根挥发油有效成分鉴定及解析其药理活性提供参考,为深入研究黑老虎的药效物质和作用机制奠定基础。

基于网络药理学探讨半夏-麻黄的潜在有效成分及药理机制

目的:采用网络药理学方法探讨“半夏-麻黄”的有效成分及作用机制。方法:本研究利用TCMSP、UniProt、BATMAN、CTD数据库检索“半夏-麻黄”的化学成分、靶点、疾病,采用Cytoscape绘制半夏麻黄丸化合物-靶点、靶点-疾病网络图。结果:共获得25种候选化合物,筛选出285个靶蛋白,涉及32类疾病。结论:本研究系统地预测了半夏麻黄丸在癌症、心血管疾病、神经系统、消化系统等疾病上不同的治疗价值,为麻黄半夏丸的临床应用与研究提供了思路。

基于网络药理学探讨白术-枳实药对治疗慢性传输型便秘的作用机制

目的:探讨白术-枳实药对治疗慢性传输型便秘(STC)的作用机制。方法:借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索中药白术、枳实的化学成分和作用靶点,通过Uni Prot、HCBI和Pub Med等数据库查询靶点对应的基因,进而运用Cytoscape 3.2.1软件构建化合物-靶点(基因)网络、蛋白相互作用核心网络(PPICN)筛选出核心靶点,最后通过DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析研究其作用机制。结果:共筛选出了26个活性化合物,其中化合物-靶点(基因)网络包含21个活性化合物和相应靶点142个,核心靶点涉及前列腺素内过氧化物合酶1(PTGS1)、PTGS2等。PPICN包含302个蛋白,关键蛋白涉及融合基因NTRK1、帕金森基因PARK2、抑癌基因TP53等。GO功能富集分析得到GO条目741个(P<0.05),其中生物过程条目457个、分子功能条目131个、与细胞组成相关的条目153个。KEGG通路富集筛选得到106条信号通路(P<0.05),涉及EB病毒感染通路、病毒致癌作用通路、丝裂原活化蛋白激酶通路等。结论:白术-枳实药对通过多靶点、多通路来治疗STC,这为进一步深入探讨其作用的物质基础以及作用机制提供了参考。

基于网络药理学探讨黄芪-当归药对治疗膝骨关节炎的作用机制研究

目的利用网络药理学的方法,建立黄芪-当归药对的"活性成分-作用靶点-通路"的网络图,对作用靶点的基因功能和通路进行富集分析,探讨黄芪-当归药对治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制。方法通过检索中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)、台湾中医药资料库获得黄芪-当归药对的主要活性成分,采用SwissTargetPrediction预测活性成分的潜在靶点,同时利用OMIM、TTD、DiGSeE 3个疾病靶点数据进行比对,获得膝骨关节炎的核心作用靶点。借助STRING在线数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析。借助David数据库对作用靶点的GO(Gene ontology)注释和KEGG通路进行富集分析。最后通过Cytoscape 3.7.1构建黄芪-当归药对的"活性成分-作用靶点-通路"网络图,探究黄芪-当归药对治疗膝骨关节炎可能的靶点及作用机制。结果黄芪-当归共14个核心活性成分、61个重要作用靶点与其治疗膝骨关节炎密切相关。主要涉及黄芪-当归的核心化合物有槲皮素(quercetin)、刺芒柄花素(formononetin)、华良姜素(Jaranol)、β-谷甾醇(β-sitosterol)、山柰酚(kaempferol)、7-O-甲基异丙醇胺(7-O-methylisomucronulatol)、Inermine、异鼠李素(isorhamnetin)等;PPI网络图显示靠前的核心靶标有肿瘤蛋白p53(TP53),丝裂原活化蛋白激酶(MAPK),血管内皮生长因子A(VEGFA)、前列腺素内过氧化物合酶(PTGS),CJun氨基端激酶(JUN)、表皮细胞生长因子(EGF)、CC趋化因子配体2(CCL2)等;GO注释分析结果表明黄芪-当归活性成分具有促进细胞增殖,提高蛋白质结合活性、酶激活反应的作用;KEGG结果表明黄芪-当归药对发挥主要作用可能与PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、肿瘤坏死因子(TNF signaling pathway)、MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、血管内皮生长因子(VEGF signaling pathway)等信号通路有关。结论黄芪-当归药对可以通过多种途径,多种信号通路作用于多种靶点发挥其药物功效,有效治疗和延缓膝骨关节炎的病变进程,后期可以充分利用网络药理学的研究思路,有效预测与分析药物的潜在作用机制,为疾病的治疗提供新思路。

基于网络药理学探讨“紫菀-款冬”药理作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨"紫菀-款冬"作用机制。方法:利用TCMSP、UniProt、CTD数据库检索"紫菀-款冬"的化学成分、靶点、疾病,并利用DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析及基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析,采用cytoscape绘图。结果:共获得35个备选化合物,筛选出186个靶蛋白,涉及34类疾病。GO富集分析其生物过程与代谢、凋亡最为密切。KEGG分析最具显著性的通路是癌症通路。结论:通过系统地探讨"紫菀-款冬"候选成分所对应的靶点及作用机制,为今后的临床研究提供了思路。

基于网络药理学的白芍-甘草药对治疗膝骨关节炎的作用机制研究

目的利用网络药理学的方法,建立白芍-甘草药对的"活性成分-作用靶点-通路"的网络图,探讨白芍-甘草药对治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制。方法通过检索中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)获得白芍-甘草药对的主要活性成分,采用Swiss Target Prediction预测活性成分的潜在靶点,同时利用Gene Cards、OMIM、TTD等数据库进行比对,获取膝骨关节炎的核心作用靶点。借助STRING在线数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析。借助David数据库对作用靶点进行GO(Gene ontology)注释和KEGG通路富集分析。最后通过Cytoscape3.7.1构建白芍-甘草药对的"活性成分-靶点-通路"网络图,探究其治疗膝骨关节炎的作用机制。结果白芍-甘草共11个核心活性成分、65个重要作用靶点与膝骨关节炎的治疗密切相关。主要涉及核心成分有山奈酚(kaempferol)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、槲皮素(quercetin)、芍药苷(paeoniflorin)、白桦脂酸(Mairin)、刺芒柄花素(formononetin)、华良姜素(Jaranol)、甘草查而酮A(licochalcone a)、Inermine、甘草酚(Glycyrol)等;PPI网络图显示靠前的核心靶标有丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、肿瘤蛋白p53(TP53)、基质金属蛋白酶(MMP)、CJun氨基端激酶(JUN)、血管内皮生长因子(VEGFA)、前列腺素内过氧化物合酶(PTGS)、表皮细胞生长因子(EGF)等;GO注释分析结果表明白芍-甘草药对可以促进细胞增殖,提高蛋白质活性、酶激活反应;KEGG结果表明白芍-甘草药对可能主要通过癌症通路(Pathways in cancer)、肿瘤坏死因子(TNF signaling pathway)、MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、PI3K-Akt信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)等信号通路发挥作用的。结论白芍-甘草药对可以通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗膝骨关节炎的作用,为中药的后期研发与成分探究提供实验依据。

柴胡-白芍异病同治分子机制的网络药理学分析

目的应用网络药理学方法筛选柴胡-白芍药对治疗多种疾病的活性成分、作用靶点及通路,探讨其异病同治的分子机制。方法应用中药系统药理学数据库(TCMSP)和UniProt数据库筛选出柴胡-白芍药对的活性成分及对应靶点;采用Cytoscape 3.6.0软件构建柴胡-白芍药对的活性成分-靶点网络;运用STRING平台构建靶蛋白相互作用(PPI)网络;借助生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点进行GO生物过程富集和KEGG信号通路分析。结果柴胡-白芍药对中20种活性成分作用于193个潜在靶点;参与正向调节转录因子的活性、负调控细胞生物学过程、细胞复合蛋白介导的蛋白质复合物组装等7个主要GO生物过程;涉及免疫、细胞信号转导、癌症、神经、传染病等67条信号通路。结论预测了柴胡-白芍药对在胃肠炎症、神经系统、癌症等多种疾病上的治疗作用及其药效物质基础和分子机制,阐释了柴胡-白芍药对异病同治的分子基础。

淫羊藿-五味子药对治疗非酒精性脂肪肝机制的网络药理学研究

目的:基于网络药理学探讨淫羊藿-五味子药对治疗非酒精性脂肪肝的作用靶点及机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)获取淫羊藿和五味子的化学成分和靶点,并构建成分-靶点网络,其中化学成分的筛选条件为口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18。通过GenCards和OMIM数据库筛选出淫羊藿-五味子治疗非酒精性脂肪肝的潜在作用靶点。利用Cytoscape软件构建疾病-成分-靶点之间网络图,进一步进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:共筛选出药效成分31个,药物与疾病作用交集靶点69个,涉及109条通路,显示“淫羊藿-五味子”可能通过作用于IL6、AKT1、CXCL8等关键靶点,主要参与转录正调控DNA模板、免疫应答、细胞对肿瘤坏死因子的反应等生物学过程,从而调节AGE-RAGE、NAFLD等通路,达到治疗作用。结论:通过中药网络药理学,初步探讨出“淫羊藿-五味子”治疗非酒精性脂肪肝的作用机制,为下一步实验验证提供基础。

基于网络药理学和分子对接探讨人参-红景天治疗心肌缺血/再灌注损伤的作用机制

目的采用网络药理学方法、分子对接技术及实验研究,探究人参-红景天治疗心肌缺血/再灌注损伤(myocardial ischemia-reperfusion injury,MIRI)的作用靶点及机制。方法通过TCMSP数据库及文献补充筛选人参-红景天的有效活性成分及靶点,检索GENECARDS、DISGENET、DRUGBANK数据库得到MIRI靶点,使用STRING数据库构造功能蛋白相互作用网络(PPI),筛出核心靶点;并选择DAVID数据库进行基因本体功能分析(GO)和KEGG信号通路富集分析;最后借助分子对接技术及实验研究进行初步验证。结果获得人参-红景天有效活性成分43种,潜在靶点348个,并发现IL-6、TNF-α、VEGFA等靶点与MIRI密切相关,主要涉及TNF、PI3K-Akt、HIF-1等信号通路。分子对接结果显示,豆甾醇、人参皂苷rh2及红景天苷与IL-6、TNF-α、Caspase-3等靶点均有较好的结合作用且匹配度高,其中结合性最好的是Caspase-3与人参皂苷rh2,实验研究结果显示,人参-红景天可改善MIRI后心肌组织坏死,减轻心肌细胞水肿及血管充血情况,并降低MIRI大鼠中TNF-α及IL-6的表达水平。结论人参-红景天可能通过豆甾醇、人参皂苷rh2及红景天苷来调控IL-6、TNF-α、Caspase-3等多个靶点,抑制炎症及氧化应激反应,减轻心肌细胞损伤,发挥对MIRI的治疗作用。

基于GC-MS与网络药理学对毛菊苣籽挥发油抗AD作用机制的研究

目的研究毛菊苣籽挥发油抗阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)的作用机制。方法采用水蒸馏法提取毛菊苣籽中的挥发油成分,并使用气相色谱-质谱联用(GC-MS)技术分析其成分,将主要化合物在SwissTarget、STITCH、ChemMapper数据库中进行靶点查找,汇总得到化合物靶点。利用OMIM、TTD、GeneCards数据库获得AD相关靶点,与化合物靶点进行对比筛选得出相关潜在靶点,采用Cytoscape软件构建“化合物-疾病靶点”网络;基于DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果毛菊苣籽挥发油通过GC-MS分析共得到64个成分,按照其含量得到28个主要成分,共查找出185个化合物靶点;以阿尔茨海默病为关键词共找到279个疾病靶点,筛选得出12个相关成分和36个疾病-化合物共有靶点。GO生物功能分析共得到24条富集结果,主要涉及单元结、化学突触传递、酶的结合等;KEGG通路富集得到15条代谢通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、血清素能突触、钙质信号传导通路和PI3K-Akt信号通路等。结论根据网络药理学方法得出毛菊苣籽挥发油通过多活性成分、多靶点、多途径发挥对AD治疗作用。

基于网络药理学的党参-当归药对治疗间质性肺疾病的作用机制探讨

目的运用网络药理学方法预测党参-当归药对治疗间质性肺疾病(ILD)的潜在靶点和信号通路,进而探讨其治疗ILD的分子基础和作用机制。方法从中药系统药理学分析平台(TCMSP)获得党参-当归药对所含活性成分相关靶点,并基于uniprot数据库对靶点信息进行基因名的标准化;通过OMIM和Drugbank数据库收集ILD相关靶点,采用Cytoscape软件建立“党参-当归药对-化合物-靶点-ILD”网络模型;借助STRING平台分析药物-疾病靶点蛋白相互作用并进行网络构建;对靶点进行基因功能(GO)分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果“党参-当归药对-化合物-靶点-ILD”网络包含16个化合物和81个靶点,关键靶点涉及蛋白激酶B1(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)等;靶点基因功能倾向于调控细胞因子受体、增强核受体活性、激活细胞转录因子、调节细胞生物信号转导等;关键的KEGG通路包括白细胞介素-17(IL-17)信号通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路等。结论党参-当归药对可通过抗炎、调控细胞凋亡、调节氧化应激与免疫等过程发挥多靶点、多通路的治疗ILD作用。

PI3K/AKT/mTOR信号通路在三阴乳腺癌靶向治疗中的研究进展

三阴乳腺癌(TNBC)为乳腺癌重要亚型,因其三阴性特点导致分子靶向治疗效果较差,临床多采用新辅助化疗治疗TNBC,但疗效一般,预后差。磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B/哺乳动物雷帕霉素靶点(PI3K/AKT/mTOR)信号通路及解聚素-金属蛋白酶17(ADAM17)在多种肿瘤中都出现异常激活状态,是抗肿瘤的重要靶点。本文结合近年来相关文献,对PI3K/AKT/mTOR信号通路及ADAM17在肿瘤发生中的作用机制、相关靶点及TNBC靶向治疗中的研究进行汇总与分析,以期为多靶点联合治疗TNBC提供新思路。

基于网络药理学研究黄芪-白术治疗新冠肺炎的作用机制

目的采用网络药理学的方法探讨黄芪-白术治疗新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)的作用机制。方法利用TCMSP数据库对黄芪-白术活性成分和作用靶点进行查找与筛选,获得黄芪-白术的有效活性成分和作用靶点,用Cytoscape 3.7.2软件绘制黄芪-白术的有效活性成分-作用靶点网络;利用GeneCards数据库获取新冠肺炎作用靶点,利用Venny 2.1.0在线工具,获得黄芪-白术与新冠肺炎共同作用靶点(即是黄芪-白术治疗新冠肺炎的作用靶点);利用String数据库构建和分析共同作用靶点互作网络;最后利用R软件对共同作用靶点进行GO和KEGG富集分析。结果通过对黄芪-白术活性成分、作用靶点查找与筛选,获得黄芪-白术有槲皮素、山奈酚、蛇床子素、毛蕊异黄酮等19个有效活性成分,作用靶点189个,并绘制出黄芪-白术的有效活性成分-作用靶点网络图;用GeneCards数据库获取新冠肺炎作用靶点259个,经过Venny 2.1.0在线工具分析,获取41个黄芪-白术与新冠肺炎共同作用靶点;GO和KEGG富集分析提示:黄芪-白术参与细胞因子受体结合、细胞因子活性、受体配体活性、磷酸酶结合等生物学过程,可能通过调控IL-17、P53、HIF-1、B细胞、T细胞等信号通路而起到治疗新冠肺炎的作用。结论黄芪-白术主要是通过抗炎、抗氧化及调节免疫而达到治疗新冠肺炎目的。

基于网络药理学探讨仙茅-淫羊藿药对治疗卵巢储备功能减退的作用机制

目的:基于网络药理学探讨仙茅-淫羊藿药对治疗卵巢储备功能减退(DOR)的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘仙茅、淫羊藿的活性成分,采用UniProt数据库校正靶点的基因名称,通过人类基因注释数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)及疾病相关的基因与突变位点数据库(Dis GeNET)得到DOR的疾病靶点,并与仙茅-淫羊藿药对的作用靶点取交集,得到其治疗DOR的有效靶点。将上述靶点输入STRING 11.0数据库进行蛋白-蛋白交互(PPI)网络预测,最后利用Metascape进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析,揭示仙茅-淫羊藿药对治疗DOR的潜在信号通路。结果:共筛选出仙茅-淫羊藿药对29个活性成分和128个DOR疾病靶点。通过PPI网络分析,仙茅-淫羊藿药对治疗DOR可能与AKT1、IL-6、TP53、VEGFA、CASP3等蛋白有关。GO和KEGG分析结果显示,仙茅-淫羊藿药对治疗DOR的靶点富集于癌症途径、晚期糖基化产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路、细胞凋亡通路、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、核因子-κB(NF-κB)信号通路等。结论:PI3K-AKT信号通路、细胞凋亡、HIF-1信号通路、NF-κB信号通路可能是仙茅-淫羊藿药对调整DOR患者卵泡发育情况的主要通路。

基于网络药理学探讨三棱-莪术药对治疗肝癌的作用机制

目的:采用网络药理学方法筛选三棱-莪术药对治疗肝癌的作用靶点以及相关信号通路,明确治疗肝癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出三棱、莪术的有效药物成分及作用靶点,构建有效成分-靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。从OMIM、DrugBank、TTD数据库检索与肝癌相关的疾病靶点,并通过R语言软件分析获得三棱-莪术成分与肝癌的交集靶点。应用Cytoscape 3.2.1软件绘制成分-靶点网络,并运用DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选出三棱-莪术药对与肝癌的相对应作用靶点共31个。共涉及与肝癌相关的GO分析125条,主要包括分子功能、生物过程、细胞组分3个方面。KEGG通路82条,主要从一氧化氮生物合成过程的正调控、细胞对脂多糖的反应、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等多处通路治疗肝癌。结论:本研究初步验证了三棱-莪术药对通过肿瘤坏死因子信号通路、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、类固醇激素介导的信号通路等治疗肝癌。本研究表明三棱-莪术药对具有多成分、多靶点的特点,其作用机制多样,对进一步研究肝癌的治疗提供了参考。