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不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究
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作者 陈海霞 蔡超 +7 位作者 刘静仪 张治国 原梅 贾俊楠 孙照刚 黄海荣 高基民 李卫民 《结核病与胸部肿瘤》 2017年第3期173-178,共6页
目的在规范化的结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)可变数目串联重复序列(variablenumberoftandemrepeats,VNTR)基因分型的基础上,构建我国31个省(自治区、直辖市)VNTR数据库,每个省优化一套VNTR位点组合,为我国... 目的在规范化的结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)可变数目串联重复序列(variablenumberoftandemrepeats,VNTR)基因分型的基础上,构建我国31个省(自治区、直辖市)VNTR数据库,每个省优化一套VNTR位点组合,为我国结核病预防控制策略的制定提供科学依据。方法对2007—2008年全国结核病耐药性基线调查的4116株MTBl5位点VNTR(15-VNTR)基因分型。汉高指数(Hunter-GastonIndex,HGI)分析每个位点的分辨率。依据谱系流行特征,以分辨率高和稳定性强为原则,为各省设计一套VNTR优化组合(12.VNTR、10.VNTR、8-VNTR和5-VNTR),采用HGI和成簇率进行评价。结果完成了涵盖率为96.36%(3966/4116)MTB完整15-VNTR图谱。发现QUB11b、MIRU26等7个高分辨率位点;QUB26、MIRU16、Mtub21、QUB11b在部分地区遗传稳定性差。内蒙古自治区、重庆市、黑龙江省的最优组合为10.VNTR,其他各省的最佳组合为8-VNTR。结论VNTR数据库的建立将推动全国范围MTB传染源的追踪;各省优化VNTR组合的推出有助于当地结核病疫情的监测和群体遗传学的研究。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 可变数目串联重复序列 基因分型 分辨 成簇率
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电子玻璃纤维纱线集束性评价方法与标准 被引量:1
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作者 李博 唐予远 +2 位作者 陈洋 郑天勇 杨开道 《国际纺织导报》 2022年第3期1-5,19,共6页
采用激光显微镜观察电子玻璃纤维纱线的横截面纤维形态,并结合Image-Pro Plus(IPP)软件获取纤维横截面图中纤维的各项参数和纱线横截面外轮廓,提出将纤维成团数量、纤维成簇率、纤维填充率和纤维的理论相对平均距离作为电子玻纤纱纤维... 采用激光显微镜观察电子玻璃纤维纱线的横截面纤维形态,并结合Image-Pro Plus(IPP)软件获取纤维横截面图中纤维的各项参数和纱线横截面外轮廓,提出将纤维成团数量、纤维成簇率、纤维填充率和纤维的理论相对平均距离作为电子玻纤纱纤维集束性评价指标。对5种不同批次的玻纤纱试样的纤维集束性进行综合评价,并以评价结果作为参考,提出电子玻纤纱集束性的评价方法和标准,该标准将集束性评价结果分为3个等级。该评价结果与采用激光显微镜观察纱线横截面图像所得结果基本一致,从而证实了评价方法的可行性。 展开更多
关键词 电子玻纤纱 集束性 纤维团量 纤维成簇率 纤维填充
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新疆南疆地区116株结核分枝杆菌基因分型研究
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作者 朱婷婷 王乐 +5 位作者 阿依努尔·莫合买提 祖丽卡提阿衣·阿布都拉 王明哲 古丽娜·巴德尔汗 王森路 刘万里 《中国热带医学》 CAS 北大核心 2024年第7期826-832,共7页
目的探讨新疆维吾尔自治区南疆地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)分子流行病学特点,分析MTB菌株成簇的影响因素,为新疆南疆地区结核病防治提供科学依据。方法随机抽取2018年和2020—2022年新疆南疆地区耐药监测点的结... 目的探讨新疆维吾尔自治区南疆地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)分子流行病学特点,分析MTB菌株成簇的影响因素,为新疆南疆地区结核病防治提供科学依据。方法随机抽取2018年和2020—2022年新疆南疆地区耐药监测点的结核分枝杆菌,提取菌株DNA,采用24位点可变串联重复序列分型方法对菌株进行基因分型,对结核分枝杆菌进行位点多样性及分辨力检测,分析新疆南疆地区菌株的成簇率并比较其传播差异。结果116株结核分枝杆菌分90个基因型,其中独立基因型76种,其余的菌株成14簇,每簇2~7株,共40株,成簇率34.48%,传播率22.41%。分辨指数最高的为QUB-11b位点,分辨力指数为0.801;分辨指数最低的位点是MIRU2,分辨力指数为0。北京基因型在新疆南疆地区结核分枝杆菌中占44.83%(52/116)。菌株是否成簇与是否异烟肼耐药、利福平耐药差异有统计学意义(χ^(2)=6.798,P=0.009;χ^(2)=15.544,P<0.001)。结论新疆南疆地区结核分枝杆菌基因型呈高度多态性,但北京基因型仍是优势菌株,新疆南疆地区结核分枝杆菌的成簇率较高,这提示近期传播在新疆南疆地区结核病的流行中占有一定比例。新疆南疆地区北京基因型相对于非北京基因型、利福平耐药菌株相对于非利福平耐药菌株、乙胺丁醇耐药菌株相对于非乙胺丁醇耐药菌株更容易成簇。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 可变串联重复序列 基因分型 成簇率
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不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究 被引量:4
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作者 陈海霞 蔡超 +7 位作者 刘静仪 张治国 原梅 贾俊楠 孙照刚 黄海荣 高基民 李卫民 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第6期794-799,共6页
目的 在规范化的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeats,VNTR)基因分型的基础上,构建我国31个省(自治区、直辖市)VNTR数据库,每个省优化一套VNTR位点组合,... 目的 在规范化的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeats,VNTR)基因分型的基础上,构建我国31个省(自治区、直辖市)VNTR数据库,每个省优化一套VNTR位点组合,为我国结核病预防控制策略的制定提供科学依据。方法 对2007-2008年全国结核病耐药性基线调查的4 116株MTB15位点VNTR(15-VNTR)基因分型。汉高指数(Hunter-Gaston Index,HGI)分析每个位点的分辨率。依据谱系流行特征,以分辨率高和稳定性强为原则,为各省设计一套VNTR优化组合(12-VNTR、10-VNTR、8-VNTR和5-VNTR),采用HGI和成簇率进行评价。结果 完成了涵盖率为96.36%(3 966/4 116)MTB完整15-VNTR图谱。发现QUB11b、MIRU26等7个高分辨率位点;QUB26、MIRU16、Mtub21、QUB11b在部分地区遗传稳定性差。内蒙古自治区、重庆市、黑龙江省的最优组合为10-VNTR,其他各省的最佳组合为8-VNTR。结论 VNTR数据库的建立将推动全国范围MTB传染源的追踪;各省优化VNTR组合的推出有助于当地结核病疫情的监测和群体遗传学的研究。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 可变数目串联重复序列 基因分型 分辨 成簇率
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贵州省结核分枝杆菌临床分离株MIRU-VNTR位点基因分型研究 被引量:11
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作者 孙荣 毕雅坤 +4 位作者 欧维正 王燕 秦万 蒙俊 陈峥宏 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第1期29-33,共5页
目的了解贵州省结核分枝杆菌临床分离株的数目可变串联重复序列(MIRU-VNTR)基因多态性及近期传播情况。方法收集2014年贵州省结核分枝杆菌临床分离株185株(耐多药菌株57株,全敏感菌株97株),采用MIRU-VNTR 12个位点分析法进行PCR检测,应... 目的了解贵州省结核分枝杆菌临床分离株的数目可变串联重复序列(MIRU-VNTR)基因多态性及近期传播情况。方法收集2014年贵州省结核分枝杆菌临床分离株185株(耐多药菌株57株,全敏感菌株97株),采用MIRU-VNTR 12个位点分析法进行PCR检测,应用NTsys2.10软件对全部基因型数字化结果进行非加权组平均法(UPGMA)聚类分析。结果 185株结核分枝杆菌临床分离株分为5个基因群(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ),呈现156个基因型,其中135个为独特基因型,其余50株为16簇,最大簇包含10株菌,最小簇包含2株菌,成簇率为27.03%,近期感染最小估计为18.37%,I群结核分枝杆菌为147株,占79.46%,为优势菌群,在MIRU 12个位点中,26、31位点多态性较高(h>0.60),4、10、23、27、39、40位点呈中等程度的多态性(0.3≤h≤0.60),2、16、20、24位点多态性较低(h<0.30)。结论贵州省结核分枝杆菌具有基因多态性,其主要的流行群为I群,MIRU26和MIRU31呈高等程度多态性,MIRU2、MIRU20和MIRU24、MIRU27呈低等程度多态性。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 基因分型 成簇率 耐药性 数目可变串联重复序列
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宜昌市耐药结核分枝杆菌MIRU-VNTR分子特征及耐药基因突变分析 被引量:4
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作者 纪律 刘晓俊 +2 位作者 余云芳 余枫华 周攀 《预防医学》 2021年第2期149-152,共4页
目的了解湖北省宜昌市结核分枝杆菌耐药基因位点突变、分布重复单位及可变数目串联重复序列(MIRU-VNTR)分子特征,为耐药结核病防治提供依据。方法选取2019年1—6月宜昌市所有结核病定点医院检测的涂阳标本和涂阴培阳标本。采用基因芯片... 目的了解湖北省宜昌市结核分枝杆菌耐药基因位点突变、分布重复单位及可变数目串联重复序列(MIRU-VNTR)分子特征,为耐药结核病防治提供依据。方法选取2019年1—6月宜昌市所有结核病定点医院检测的涂阳标本和涂阴培阳标本。采用基因芯片法检测利福平耐药相关ropB基因及异烟肼耐药相关katG和inhA基因,分析位点的突变情况;采用24位点的MIRU-VNTR对耐药菌株进行分型。结果共收集到结核分枝杆菌367株,总耐药58株,总耐药率为15.80%。单耐利福平10株,耐药率为2.72%;单耐异烟肼25株,耐药率为6.81%;耐多药23株,耐药率为6.27%。33株ropB基因突变中531(C→T)突变类型最多,突变13株,突变率为39.39%;复治患者的ropB基因突变率为28.26%,高于初治患者的6.23%(P<0.05)。28株katG基因突变中315(G→C)突变最多,突变26株,突变率为54.17%;18株inhA-15(C→T)突变,突变率为37.50%;inhA和katG联合突变率为4.17%。复治患者的inhA和katG基因突变率为28.26%,高于初治患者的10.90%(P<0.05)。MIRU-VNTR检测结果呈明显遗传多样性,h值最小的是MIRU02和MIRU24,均为0.017,最大的Mtub21为0.774。基因型呈明显多态性,共有49个基因型,15株菌株形成6个簇,近期传播率为15.52%,成簇率为25.86%。结论宜昌市结核分枝杆菌总耐药率和耐多药率较低,耐药结核病呈现低流行,复治患者耐药基因突变率和成簇率较高。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 耐药基因 位点突变 分子分型 成簇率
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The effect of neighbor distance of magnetic nanoparticle clusters on magnetic resonance relaxation properties 被引量:1
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作者 Dan Wang Bingbing Lin +4 位作者 Taipeng Shen Jun Wu Chunchao Xia Bin Song Hua Ai 《Science Bulletin》 SCIE EI CAS CSCD 2016年第13期1023-1030,共8页
Superparamagnetic iron oxide (SPIO) nanoparticle clusters are one unique form which can enhance magnetic relaxivity and improve the magnetic resonance imaging contrast at the same iron concentration, comparing to si... Superparamagnetic iron oxide (SPIO) nanoparticle clusters are one unique form which can enhance magnetic relaxivity and improve the magnetic resonance imaging contrast at the same iron concentration, comparing to single SPIO nanoparticles. Controlling of cluster size and other structural parameters have drawn great interests in this field to further improve their magnetic properties. In this study, we investigated how the interparticle distance (also known as neighbor distance) of SP10 nanocrystals within clusters affect their magnetic relaxation behaviors. To adjust the neighbor distance, different amount of cholesterol (CHO) was chosen as model spacers embedded into SPIO nanocluster systems with the help of amphiphilic diblock copolymer poly(ethylene glyco)-polyester. Small- angle X-ray scattering was applied to quantify the neighbor distance of SPIO clusters. The results demonstrated that the averaged SPIO nanocrystal neighbor distance of nan- oclusters increased with higher amount of added CHO. Moreover, these SPIO nanocrystal clusters had the promi- nent magnetic relaxation properties. Simultaneously, con- trolling of SPIO nanocrystal neighbor distance can regulate the saturation magnetization (Ms) and magnetic resonance (MR) T2 relaxation of the aggregation, and ultimately obtain better MR contrast effects with decreased neighbor distance. 展开更多
关键词 Iron oxide nanoparticle CLUSTERS Neighbor distance Magnetic properties T2relaxation
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