基于机器学习的成纤维细胞生长因子受体激酶抑制剂虚拟筛选模型

目的:构建基于机器学习的高效成纤维细胞生长因子受体(FGFR)激酶抑制剂虚拟筛选模型。方法:收集公共数据集BindingDB中的FGFR激酶抑制剂;用RDkit计算分子描述符表征化合物分子用以数据输入;采用随机森林和支持向量机两种机器学习算法建立虚拟筛选模型,用准确率、精准率、召回率、受试者工作特征曲线下面积(AUC)四个指标对模型进行评价;使用随机森林模型对1 300万个化合物进行初步筛选;随后依次用Autodock Vina和Glide方法进一步筛选FGFR1激酶抑制剂;用分子动力学模拟对虚拟筛选得到的化合物进行分析。结果:构建的随机森林模型和支持向量机模型的准确率、精准率、召回率和AUC等评价指标有良好表现,随机森林模型的准确率和AUC分别可达0.878和0.952,随机森林模型可以用来作为FGFR激酶抑制剂的虚拟筛选模型。将随机森林模型用于大通量虚拟筛选获取高活性先导化合物,筛选所得3个最优化合物与FGFR1激酶的分子对接和分子动力学分析显示,在氢键、结合自由能、疏水作用与阳性药物AZD4547有较高相似性,FGFR1的LEU21、VAL29、ALA49三个残基是小分子药物保持稳定结合的重要残基。结论:本研究提供了一种基于机器学习的FGFR激酶抑制剂虚拟筛选模型,可以用于大规模小分子化合物库的高效筛选。

抗成纤维细胞生长因子及其受体信号通路药物在肿瘤治疗中应用的研究进展

成纤维细胞生长因子受体(FGFR)是一种受体酪氨酸激酶(RTK),与其配体成纤维细胞生长因子(FGF)相结合,激活下游的信号转导通路,参与调控细胞的正常生理活动。当FGFR基因发生扩增、突变或者融合等异常改变时,就会导致下游细胞信号通路的异常激活,促进细胞的增殖、迁移、侵袭及上皮-间质转化,进而促进肿瘤的发展。同时,FGFR在多种肿瘤中均呈高表达,因此FGF/FGFR可作为肿瘤治疗的重要靶点。根据药物作用机制,可以将抗FGFR信号通路药物分为两大类,分别为FGFR-酪氨酸激酶抑制剂(TKI)和阻断FGF/FGFR的单克隆抗体。目前,已有多种针对FGF/FGFR的靶向药物进入临床试验阶段,在肿瘤治疗中取得较好的临床效果,有的靶向药物获批用于临床肿瘤的治疗,为肿瘤的精准治疗带来了新的曙光。

成纤维细胞生长因子与其受体相互作用及其抑制剂的研究进展

成纤维细胞生长因子 (FGF)有许多重要的生理功能 ,并与肿瘤的形成有关 .为了弄清FGF与成纤维细胞生长因子受体 (FGFR)相互作用的机制 ,人们对FGF和FGFR的各个结合结构域进行了深入、细致的研究 ,定位了aFGF、bFGF的肝素结合区、bFGF的受体结合区、FGF受体的肝素结合区、配体结合区和FGF受体相互结合区 ,提出了两个FGF与FGFR相互作用的模型 ,在此基础上设计了FGF的核酸类、糖类和多肽类抑制剂 ,为寻找新一代抗癌药物打下了理论基础 .

体外压力刺激对大鼠“足三里”穴筋膜组织成纤维细胞合成释放基质金属蛋白酶1、基质金属蛋白酶抑制剂1、前列腺素E_2和胰岛素样生长因子1的影响

背景:腧穴筋膜结缔组织成纤维细胞是针推治疗操作过程中的主要受力组织细胞之一,细胞生物学行为的调整对腧穴发挥治疗作用的功能关系密切。目的:通过体外实验观察压力刺激对大鼠"足三里"穴筋膜组织成纤维细胞合成释放基质金属蛋白酶1、基质金属蛋白酶抑制剂1、前列腺素E2和胰岛素样生长因子1的影响。方法:体外培养大鼠"足三里"穴筋膜组织成纤维细胞,随机分为空白对照组和压力刺激组。压力刺激组对细胞实施50kPa压力刺激,每次加力2h,每8h1次,共6次;空白对照组不加压。检测细胞外培养液中基质金属蛋白酶1、基质金属蛋白酶抑制剂1、前列腺素E2和胰岛素样生长因子1含量的变化,并计算基质金属蛋白酶1与基质金属蛋白酶抑制剂1比值的变化。结果与结论:"足三里"穴筋膜组织成纤维细胞压力作用后,培养液中基质金属蛋白酶1、基质金属蛋白酶抑制剂1和前列腺素E2含量均增加(P<0.05或0.01),基质金属蛋白酶1与基质金属蛋白酶抑制剂1比值增大(P<0.05),胰岛素样生长因子1变化无显著性意义。结果证实,压力刺激对腧穴筋膜组织成纤维细胞基质金属蛋白酶1、基质金属蛋白酶抑制剂1和前列腺素E2合成释放的调节,以及对基质金属蛋白酶1与基质金属蛋白酶抑制剂1比值的提高,可能是腧穴接受针灸推拿治疗后发挥"疏经通脉"作用的细胞生物力学原理之一。

冻干重组碱性成纤维细胞生长因子无人血清白蛋白保护剂的研究

目的在冻干重组碱性成纤维细胞生长因子制剂中引入一种无人血清白蛋白保护剂。方法采用 3种药用辅料按一定比例配制保护剂。结果加入无人血清白蛋白保护剂的 3批供试品 ,成品各项检查均合格。生物效价在 (40± 2 )℃、(2 5± 2 )℃、2℃～ 8℃保存分别达 6、12、3 0个月。

成纤维细胞生长因子及其受体抑制剂的研究进展

成纤维细胞生长因子受体(FGFRs)是受体酪氨酸激酶(RTKs)超家族的一员,它可以与成纤维细胞生长因子(FGFs)结合,引发靶细胞的多种反应,同时参与许多生物过程,如细胞增殖、抗凋亡及血管生成等,发挥其生理功能。FGFRs分别在癌细胞和内皮细胞中参与肿瘤的发生和血管的生成,因此,FGFRs-靶向药物会产生直接或间接的抗癌作用。简单介绍了FGFs及FGFRs,重点对FGFR抑制剂的研究进展进行了综述。

10种中药成分对鸡胚成纤维细胞生长的影响

将鸡胚成纤维细胞 ( CEF)分别与当归多糖 ( CAPS)、黄芪多糖 ( APS)、板蓝根多糖 ( IRPS)、淫羊藿多糖 ( EPS)、蜂胶多糖 ( PPS)、淫羊藿黄酮 ( EF)、蜂胶黄酮 ( PF)、黄芪黄酮 ( AF)、黄芪皂甙 ( AS)和人参皂甙 ( GS)等 10种中药成分一起加入到 96孔细胞培养板中培养 ,分别在培养 2 4、36、4 8、6 0、72 h时用 MTT法测定中药成分对 CEF增殖的影响。结果表明 ,所有中药成分均能显著促进 CEF增殖 。

血清半胱氨酸蛋白酶抑制剂C和妊娠相关血浆蛋白A及成纤维细胞生长因子21在预测原发性高血压患者颈动脉粥样硬化中的价值

目的探讨血清半胱氨酸蛋白酶抑制剂C(Cys-C)、妊娠相关血浆蛋白A(PAPP-A)、成纤维细胞生长因子21(FGF-21)在预测原发性高血压(EH)患者颈动脉粥样硬化(CAS)中的价值。方法选取2015年1月至2017年12月于新疆维吾尔自治区人民医院全科医疗科就诊的EH患者200例,其中合并CAS患者80例(CAS组),单纯EH患者120例(EH组),另选择本院同期体检健康人员100名为健康对照组(HC组),比较3组研究对象血糖、尿素氮、血肌酐、血尿酸、总胆固醇、三酰甘油、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、Cys-C、PAPP-A、FGF-21水平及颈动脉内膜中层厚度(cIMT)的差异,应用多因素线性回归模型分析血清标志物与cIMT的相关性,应用受试者工作特征曲线评价血清Cys-C、PAPP-A及FGF-21水平在预测EH合并CAS中的效能。结果 CAS组的总胆固醇、三酰甘油、LDL-C、cIMT、Cys-C、PAPP-A和FGF-21水平均明显高于EH组和HC组(均P<0.05),EH组和CAS组的HDL-C均显著低于HC组(均P<0.05)。多因素线性回归分析显示,cIMT与血清总胆固醇、LDL-C、Cys-C、PAPP-A及FGF-21水平呈正相关,与HDL-C呈负相关(均P<0.05)。受试者工作特征曲线显示,Cys-C和FGF-21预测CAS的曲线下面积(AUC)较高(AUC=0.761、0.765),其次为PAPP-A和LDL-C(AUC=0.696、0.636),HDL-C和总胆固醇较低(AUC=0.624、0.609);应用Cys-C、PAPP-A和FGF-21联合诊断后诊断效能得到明显提高(AUC=0.857)。3种指标联合诊断CAS的敏感度高于单独应用Cys-C、PAPP-A和FGF-21(88.75%比80.00%、75.00%、81.25%)(均P<0.05),而诊断准确率无明显变化(均P>0.05)。结论血清Cys-C、PAPP-A及FGF-21水平与EH患者CAS间存在明显的相关性,联合检测Cys-C、PAPP-A及FGF-21对预测EH患者的CAS具有较高的诊断效能。

碱性成纤维细胞生长因子促进皮肤创伤愈合的动物实验研究

目的 观察碱性成纤维细胞生长因子 (bFGF)对动物皮肤创伤愈合的影响。方法 采用小鼠背部割伤无菌创面模型 ,将实验组bFGF溶液 ,对照组用生理盐水溶液分别 1次 /d滴于创面 ,伤后取创伤组织制成组织切片 ,观察病理学变化。结果 bFGF组创面明显缩小 ,毛细血管和成纤维细胞数显著多于对照组。

碱性成纤维细胞生长因子复合降解膜置入脊髓缺损局部对脊髓神经再生的作用

目的:探索碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)复合降解膜置入脊髓缺损局部抑制结缔组织增生,促进胶质细胞增殖和轴突再生,提高脊髓神经纤维的再生效果。方法:切除狗L1-2,L3-4脊髓节段,采用缝匠肌尾侧部桥接脊髓缺损局部包裹bFGF复合降解膜,术后不同时间采用行为学和形态学方法进行测试和观察。结果:膜内外结缔组织增生有明显差异。肌桥段内有再生的神经纤维,双下肢运动功能有所恢复,TarlovMotorscotol分级为2～4级。结论:bFGF复合降解膜抑制脊髓损伤局部结缔组织增生,提高神经纤维的再生效果。

活血化瘀方对乳腺增生病患者血管内皮生长因子及碱性成纤维细胞生长因子的影响

目的观察活血化瘀方对乳腺增生病患者血管内皮生长因子(VEGF)及碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)的影响和临床疗效。方法将88例乳腺增生病患者随机分为2组,治疗组60例予活血化瘀方,对照组28例予西医常规治疗。2组均治疗3个疗程,随访3个月。并选择同期健康者30例为正常对照组。采用酶联免疫法测定3组治疗前后血清VEGF及bFGF变化,统计临床疗效。结果治疗组总有效率91.67%,对照组总有效率89.29%,2组总有效率比较差异无统计学意义(P>0.05),疗效相当。2组治疗前VEGF及bFGF含量均高于正常对照组(P<0.05)。2组治疗后VEGF及bFGF含量均较本组治疗前明显降低(P<0.05),而组间比较差异无统计学意义(P>0.05)。2组治疗后VEGF含量与正常对照组相当(P>0.05),bFGF仍高于正常对照组(P>0.05)。结论 VEGF、bFGF在乳腺增生病中过度表达,提示血管生成是其发生发展的重要环节,活血化瘀方可降低患者血清中VEGF、bFGF含量,阻断血管生成,促使病灶消散、吸收,为治疗乳腺增生病的有效方药。

碱性成纤维细胞生长因子对糖尿病大鼠创面愈合的影响

目的研究重组牛碱性成纤维细胞生长因子(bFGF)对糖尿病大鼠皮肤溃疡促愈合的机制。方法采用雄性wistar大鼠,制备糖尿病模型,造成背部皮肤缺损,将bFGF溶液连续15天喷注于创面,透明膜描记记录伤后第5、10、152、0天创面面积。伤后第51、0、15、20天取创面组织,观察其病理变化,包括肉芽组织的生长和再上皮化情况。结果bFGF可以明显加速糖尿病大鼠皮肤溃疡的愈合速度,使创面面积显著减小(P<0.05).组织学检查:bFGF治疗组在创伤10天成纤维细胞生长活跃,数量明显增多,成纤维细胞与毛细血管肉芽数量明显多于对照组;创伤后15天,创面收缩与再上皮化明显,新生上皮向创面中心爬行较快。在bFGF作用组,MMP-9和Timp-1表达增强。结论bFGF对于糖尿病大鼠皮肤溃疡的愈合有明显的促进作用。bFGF可能通过促进皮肤细胞高表达MMP-9和Timp-1途径加快皮肤损伤的修复。

藻酸双酯钠协同酸性成纤维细胞生长因子促血管生成作用的研究

探讨藻酸双酯钠(PSS)在体内协同酸性成纤维细胞生长因子(aFGF)促缺血区微血管生成作用的可行性.结果表明,给药后第10天,髂动脉血管造影可见aFGF组及aFGF+PSS组血管密度较盐水组明显增加,PSS组血管密度未见明显增加;aFGF组及aFGF+PSS组肌组织间有大量均匀分布的微血管与盐水组比较差异显著(P<0.05).PSS组与盐水组比较无显著差异(P>0.05).aFGF+PSS组与aFGF组及PSS组均有显著差异(P<0.05).aFGF具有促缺血区微血管生成作用,PSS具有协同aFGF的促血管生成作用.

治疗胆管癌的新药:选择性成纤维细胞生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂Pemigatinib

pemigatinib是一种口服给药的选择性成纤维细胞生长因子受体(FGFR)酪氨酸激酶抑制剂,于2020年4月17日获美国食品药品监督管理局(FDA)批准,用于治疗FGFR2融合或重排的局部晚期或转移性胆管癌成年患者。pemigatinib的常见不良反应包括高磷血症、脱发、腹泻、疲劳等。本文主要对pemigatinib的作用机制、药物代谢动力学、临床研究、药物相互作用、不良反应和特殊人群用药等方面进行介绍,以期为临床用药提供一定的帮助与指导。

杀菌/通透性增加蛋白23-人酸性成纤维细胞生长因子融合蛋白在CHO细胞中的表达及活性鉴定

杀菌／通透性增加蛋白（BPI）是一种主要存在于中性粒细胞内的阳离子抗菌蛋白，具有杀菌、中和内毒素和抗真菌等作用，并且在发生生物学效应时，对机体不产生任何损害，在革兰阴性菌感染的治疗方面有很好的应用前景。研究表明，BPIN端片段BPI23（1～199氨基酸）具有完整BPI杀菌、中和内毒素等活性。人酸性成纤维细胞生长因子（haFGF）具有广泛的生物学活性。能促进伤口愈合，在治疗烧伤、机体缺血损伤、溃疡等方面具有极为广泛的应用前景、特别是在创伤修复方面，haFGF应用甚广，其活性部位主要集中在C端。