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基于EST数据库的葡萄成花途径的预测及分析 被引量:6
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作者 刘丹 慕茜 +4 位作者 李晓鹏 刘更森 李玉 张彦苹 房经贵 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期26-34,共9页
以拟南芥成花途径相关基因序列为探针,对葡萄EST数据库进行同源检索筛选,获得相应的同源EST序列,并以葡萄不同发育时期的不同器官cDNA为模板,通过半定量RT-PCR反应研究了葡萄成花途径相关基因的存在与表达情况,对葡萄成花途径的进行了... 以拟南芥成花途径相关基因序列为探针,对葡萄EST数据库进行同源检索筛选,获得相应的同源EST序列,并以葡萄不同发育时期的不同器官cDNA为模板,通过半定量RT-PCR反应研究了葡萄成花途径相关基因的存在与表达情况,对葡萄成花途径的进行了分析与判断。研究发现,葡萄成花途径中的基因在不同器官中的不同时期的时空表达存在强弱的差异。 展开更多
关键词 葡萄 EST 成花途径 基因
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油茶花发育转录组测序及相关基因表达分析 被引量:14
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作者 胡玉玲 姚小华 +2 位作者 任华东 王开良 林萍 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第9期36-43,共8页
通过对油茶成花过程的转录组测序及其成花相关基因的表达分析,结果表明:转录组测序总共获得28 448 847个reads,5 742 023 480 bp数据量,GC含量为46.52%;拼接成大于200 bp以上的Unigenes有94 476条,N50长度为806 bp,其中1 kbp以上的Unige... 通过对油茶成花过程的转录组测序及其成花相关基因的表达分析,结果表明:转录组测序总共获得28 448 847个reads,5 742 023 480 bp数据量,GC含量为46.52%;拼接成大于200 bp以上的Unigenes有94 476条,N50长度为806 bp,其中1 kbp以上的Unigenes共12 643条,占Unigene总数的13.38%;Unigenes在各数据库中功能注释数目,在COG中有9 095条,在GO中有27 201条,在KEGG中有6 431条,在Swissprot中有24 534条,在TrEMBL中有36 393条,在Nr中有36 400条,在Nt中有30 858条;茎尖中FLC,FCA和FT基因表达量较AP1,AP2和PI基因低,FT基因(ID:Unigene60063)是油茶成花的关键基因,PI基因(ID:Unigene56059)与雄蕊发育关系紧密。 展开更多
关键词 油茶 转录组 高通量测序 成花基因 成花途径
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Molecular Cloning and Characterization of a DFR from Developing Seeds of Blue-grained Wheat in Anthocyanin Biosynthetic Pathway 被引量:8
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作者 杨国华 赵学强 +4 位作者 李滨 刘建中 郑琪 童依平 李振声 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2003年第11期1329-1338,共10页
Blue-grained wheat derived from the hybrid Triticum aestivum L. X Thinopyrum ponticum (Podp.) Barkworth et D. R. Dewey (Agropyron elongatum (Host) P. Beauv., 2n=70). The molecular biological mechanism of the biosynthe... Blue-grained wheat derived from the hybrid Triticum aestivum L. X Thinopyrum ponticum (Podp.) Barkworth et D. R. Dewey (Agropyron elongatum (Host) P. Beauv., 2n=70). The molecular biological mechanism of the biosynthetic pathway of blue pigments in the blue grain remains unclear yet. Dihydroflavonol 4-reductase (DFR) is one of the key enzymes controlling flavonoid synthesis in anthocyanin biosynthetic pathway, and may directly participate in the formation of blue pigment in the aleurone layer of blue-grained wheat. Here we cloned a DFR cDNA (TaDFR) from the developing seeds of blue-grained wheat, and four DFR genomic DNAs from Th. ponticum (ThpDFR.t), blue-grained wheat (TaDFR.bg), white-grained offspring of light blue-grained wheat (TaDFR.wg) and Chinese Spring (2n=42) (TaDFR.csg), respectively. TaDFR cDNA encodes a 354 amino-acids polypeptide with high identity to DFR from Hordeum vulgare L. (94%), Oryza sativa L. (83%), Zea mays L.(84%). The result of cluster analysis showed that TaDFR cDNA nucleotide sequence has 100% identity with that of TaDFR.csg. The four DFR genomic DNAs have extraordinary high homology and each has three introns. The differences of the four DFR genomic DNAs mainly exist in introns. Southern blotting analysis showed that there are at least 3-5 DFR copies in wheat, the copy numbers in different color grain wheats are not significantly different. The hybridization band patterns were the same, but different from that of Th. ponticum. DFR in blue-grained wheat belongs to a DFR superfamily. Northern blotting analysis indicated that the DFR expressed in the developing seeds of both blue- and white-grained wheat at 15 d after flowering (DAF), the mRNA levels of DFR reached the highest at 18 DAF, then declined quickly and disappeared at 33 DAF But the expression levels in blue-grained seeds were higher than that in white grain at the same seed developing stages. DFR transcripts accumulated in young leaves, and leaf sheaths of blue- and white-grained wheat and Th ponticum, but not detected in roots from different color wheats and developing seeds of Th. ponticum. Results indicated that there may exist some regulatory gene(s) which can increase the expression of DFR in the aleurone layer of blue-grained wheat, and thus resulting in the formation of blue pigments. 展开更多
关键词 blue-grained wheat anthocyanin biosynthetic pathway dihydroflavonol 4-reductase (DFR) rapid amplification of cDNA ends (RACE) Thinopyrum ponticum (2n=70)
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FLC调控植物成花的分子机制研究新进展 被引量:4
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作者 张长生 魏滔 +3 位作者 周玉萍 范甜 吕天晓 田长恩() 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期651-663,共13页
FLC是植物成花关键抑制因子,主要通过结合到其下游2个关键的成花促进基因(FT和SOC1)启动子上而抑制二者的表达。此外,还可以与其它调控因子结合调控开花。然而,关于FLC在成花调控中的具体分子机制仍需深入研究。该文主要结合8条成花调... FLC是植物成花关键抑制因子,主要通过结合到其下游2个关键的成花促进基因(FT和SOC1)启动子上而抑制二者的表达。此外,还可以与其它调控因子结合调控开花。然而,关于FLC在成花调控中的具体分子机制仍需深入研究。该文主要结合8条成花调控遗传途径,梳理近年来与FLC相关的新进展,并展望了未来的研究方向。 展开更多
关键词 FLC 成花调控途径 开花时间
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仁用杏花芽3个发育时期数字基因表达谱分析 被引量:3
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作者 宋猜 乌云塔娜 +2 位作者 李慧 许靖诗 刘汝卿 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1559-1568,共10页
以仁用杏‘优一’为试材,运用转录组、数字基因表达谱技术,研究了仁用杏花芽萌动期前后相关基因的表达规律。结果发现,仁用杏花芽在花芽萌动期前后进行着各种旺盛的生物合成和代谢活动,且4个开花调控途径(光周期途径、春化途径、自主途... 以仁用杏‘优一’为试材,运用转录组、数字基因表达谱技术,研究了仁用杏花芽萌动期前后相关基因的表达规律。结果发现,仁用杏花芽在花芽萌动期前后进行着各种旺盛的生物合成和代谢活动,且4个开花调控途径(光周期途径、春化途径、自主途径、GA调控途径)均已启动,光周期途径在花芽萌动时发挥重要作用,涉及到了74条基因,其中有38条差异基因上调表达,29条下调表达;GA途径在花芽萌动期对花芽的生长发育调控表现为抑制作用,涉及到了60条基因,其中有13条差异基因上调,9条差异基因下调;其他两条途径于花芽萌动前作用,其中春化途径涉及到了23个基因,其中有4条差异基因上调,15条差异基因下调;自主途径涉及到了24条基因,其中有3条差异基因上调,11条差异基因下调。本研究通过数字基因表达谱分析,初步了解仁用杏花芽萌动前后的网络途径,为后期对仁用杏花芽相关开花基因的研究、探明仁用杏早花的分子机理及通过分子育种方法培育仁用杏晚花品种提供坚实的理论依据。 展开更多
关键词 仁用杏 花芽 转录组 数字基因表达谱 成花调控途径
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