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题名盐胁迫条件下苦马豆幼苗根差异表达基因及功能注释
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作者
王玉祥
贾广云
李道丰
张博
王涛
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机构
新疆农业大学草地资源与生态重点实验室
中国农业大学农业生物技术国家重点实验室
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出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期325-330,共6页
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基金
新疆维吾尔自治区高技术研究发展计划(200711101)
国家十一五科技支撑子项目(2008BADB3B06-02)
国家高技术研究863发展计划(2009AA10Z108)资助
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文摘
苦马豆(Swainsona salsula Taubert)是新疆重要的耐盐抗旱豆科植物,通过染色体压片技术确定供试材料为二倍体,采用截形苜蓿(Medicago truncatula)基因组芯片(61278个探针),对苦马豆幼苗根部在未经盐处理和在180 mM NaCl溶液中处理24 h后的表达水平进行了分析,找出控制盐胁迫的关键基因,为耐盐基因的筛选提供依据。结果表明:有4057个基因在不同处理条件下存在表达差异,其中155个上调基因和105个下调基因;利用Gene Ontology注释对差异表达的基因从分子功能、细胞组件、生物学过程3个水平进行功能分类,搜索NCBI数据库,在截形苜蓿和拟南芥(Arabidopsis thaliana)中找到有高相似性功能已知的部分基因,表明差异表达的基因涉及逆境胁迫、信号转导、电子传递、蛋白代谢等多个方面,这些基因是植物根部盐胁迫相关基因。
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关键词
苦马豆
耐盐
截形苜蓿基因组芯片
功能注释
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Keywords
Swainsonine
Salt-tolerance
Medicago genome microarray
Annotation
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分类号
Q344.1
[生物学—遗传学]
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