香港牡蛎感染才女虫后外套膜与鳃的转录组测序及差异表达基因分析

为探明香港牡蛎应对才女虫感染的免疫应答机制,利用Illumina技术,比较才女虫感染前后的香港牡蛎外套膜和鳃的转录组,注释牡蛎感染才女虫后产生的差异表达基因,并验证免疫代谢应答的相关基因,共获得74.85 GB纯净数据,其中:感染的外套膜有6 923个差异表达基因,上调基因3 770个,下调基因3 153个;感染的鳃有7 410个差异表达基因,上调基因3646个,下调基因3764个;受感染与健康牡蛎外套膜和鳃差异组分别有4398和4780个基因注释到GO分类上;外套膜和鳃转录组分别有3 851和4 367个差异表达基因注释在KEGG数据库中,大多数富集到的通路与机体的免疫相关。挑选5个差异表达基因进行荧光定量验证,包括热休克蛋白70(HSP70)、42同系物(CDC42)、细胞色素P450(CYP450)等在内的免疫代谢相关基因,结果表明,所挑选差异基因的表达趋势与高通分量测序结果基本一致,可通过加强体内多种免疫代谢基因协同作用来抵抗才女虫感染。