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扩增片段长度多态性技术对淋球菌的基因分型 被引量:1
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作者 季明春 钱莉 +2 位作者 陈红菊 严华 申厚凤 《南通医学院学报》 2003年第2期149-150,152,共3页
目的 :评价扩增片段长度多态性技术 ( AFL P)分析对淋球菌分离株进行基因分型的能力。方法 :2 6株淋球菌分离株基因以 Eco RI和 Mes I酶切及 AFL P分析。结果 :同一地区的淋球菌分离株之间存在相当大的 DNA多态性。结论 :AFL P是鉴别淋... 目的 :评价扩增片段长度多态性技术 ( AFL P)分析对淋球菌分离株进行基因分型的能力。方法 :2 6株淋球菌分离株基因以 Eco RI和 Mes I酶切及 AFL P分析。结果 :同一地区的淋球菌分离株之间存在相当大的 DNA多态性。结论 :AFL P是鉴别淋球菌临床分离株有用而敏感的分子技术 ,有助于了解菌株来源。 展开更多
关键词 淋球菌 基因分型 扩增片段多态性技术 AFLP
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扩增片段长度多态性技术在动物遗传多样性研究中的应用 被引量:2
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作者 郝琦蕾 姜晋国 《杭州师范学院学报(自然科学版)》 CAS 2004年第1期73-76,共4页
扩增片段长度多态性(AFLP)是一种有效的分子遗传标记方法,具有快速、经济、简便、模板需要量少、重复性高、结果可靠等优点。目前AFLP在动物方面的应用还不是很多,处于初级阶段,主要用于鉴定分类关系、种群遗传多样性分析、遗传连锁图... 扩增片段长度多态性(AFLP)是一种有效的分子遗传标记方法,具有快速、经济、简便、模板需要量少、重复性高、结果可靠等优点。目前AFLP在动物方面的应用还不是很多,处于初级阶段,主要用于鉴定分类关系、种群遗传多样性分析、遗传连锁图谱构建等方面。 展开更多
关键词 片段长度多态性技术 动物遗传多样性 分子遗传标记 内切酶
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山东产丹参遗传多样性的扩增片段长度多态性指纹分析 被引量:21
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作者 郝岗平 孙立彦 +2 位作者 史仁玖 高允生 王健美 《时珍国医国药》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期51-53,共3页
目的研究山东产丹参的遗传多样性,初步探讨扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术在丹参道地性鉴别上的应用。方法采用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对山东产15个丹参样本进行DNA多态性分析。结果利用4对引物组合构建了15个丹参样本的DN... 目的研究山东产丹参的遗传多样性,初步探讨扩增片段长度多态性(AFLP)分子标记技术在丹参道地性鉴别上的应用。方法采用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对山东产15个丹参样本进行DNA多态性分析。结果利用4对引物组合构建了15个丹参样本的DNA指纹图谱,通过相似性和聚类结果分析,丹参和白花丹参样本的遗传相似性较低,聚类结果也划分为两大类群,证明它们之间的亲缘关系较远,分化明显。临沂地区的野生和栽培丹参样本聚在一类,且栽培品种和野生品种之间具有一定的遗传差异。结论山东产丹参具有一定的遗传多样性,AFLP技术可用于丹参道地性鉴别。 展开更多
关键词 山东产丹参 遗传多样性 片段长度多态性技术
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酿造大麦品种鉴定技术的研究——啤酒大麦、麦芽品种特性及酿造技术研讨会材料之五 被引量:7
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作者 谷方红 张五九 +1 位作者 冯景章 林智平 《啤酒科技》 2003年第11期27-29,共3页
本研究将扩增性片段多态性技术应用于酿造大麦品种鉴定中,对不同的酶切效果进行了比较,并对20对引物组合进行了筛选,其中3对引物的多态性较强。通过2—3对引物即可区分11个酿造型大麦品种。
关键词 品种鉴定 片段多态性技术 DNA指纹技术 啤酒大麦
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中国葡萄酒产区酒酒球菌种质资源遗传多样性分析 被引量:2
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作者 金刚 王华 +1 位作者 张昂 李华 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2015年第17期134-139,共6页
为了解我国葡萄酒产区酒酒球菌种质资源遗传多样性,对22株筛选自我国不同葡萄酒产区的乳酸细菌进行了种特异性聚合酶链式反应(species-specific polymerase chain reaction,PCR)分析、16S r RNA序列分析和扩增片段长度多态性分析(amplif... 为了解我国葡萄酒产区酒酒球菌种质资源遗传多样性,对22株筛选自我国不同葡萄酒产区的乳酸细菌进行了种特异性聚合酶链式反应(species-specific polymerase chain reaction,PCR)分析、16S r RNA序列分析和扩增片段长度多态性分析(amplified fragment length polymorphism,AFLP)基因分型。种特异性PCR和16S r RNA序列分析表明22株分离株为酒酒球菌(Oenococcus oeni)。建立了O.oeni基于HindⅢ和MseⅠ为内切酶的AFLP分析体系,对16对引物组合进行了筛选,结果表明HT-MA、HT-MT、HT-MC、HG-MA、HG-MT、HC-MT为O.oeni AFLP分析的最佳引物组合,且实验重复性在98%以上。对O.oeni的AFLP分析结果显示:22株O.oeni分为3个簇群,且簇群间遗传相似性系数较小。所以,以HindⅢ和MseⅠ为内切酶的AFLP技术是研究O.oeni基因分型的有效方法,我国葡萄酒产区的O.oeni具有丰富的遗传多样性,O.oeni菌株间的遗传相似性系数不仅仅与其生态地理分布有关,可能还与其所处的微生态和其他因素有关。 展开更多
关键词 酒酒球菌 种特异性PCR 16S rRNA序列分析 片段长度多态性分析技术
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Discussion on AFLP Molecular Markers in Piper methysticum and Pepper 被引量:2
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作者 施江 辛莉 +1 位作者 杨彦 郑学勤 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2007年第3期5-10,19,共7页
The aim of the research was to discuss the genetic relationships between Piper methysticum, Pepper and other wild species in Pepper genus. DNA was extracted from leaves which belonged to 28 germplasms including 6 mate... The aim of the research was to discuss the genetic relationships between Piper methysticum, Pepper and other wild species in Pepper genus. DNA was extracted from leaves which belonged to 28 germplasms including 6 materials of P. methysticum, 21 maerials of cultivated and wild Pepper, 1 material of Peperomia pellucida belonged to different genus. Premiers with good band-type and high polymorphism and resolution were selected from 64 pairs of primers for AFLP amplification and the clustering analysis was conducted with MVSP3.13f software. 191 bands were amplified by 4 pairs of premiers, 189 of which had polymorphism, being 98.6%. 28 germplasms were classified into 6 different groups at the genetic similarity coefficient of 0.52 by silver staining AFLP, in which 6 materials of Piper methysticum were clustered into a single group, indicating that P. methysticum belonged to Pepper family of Pepper genus but were distantly related to the others. The research provided the basis for selecting rootstocks for P. methysticum graft, molecular identification of P. methysticum and the fingerprint construction of P. methysticum. 展开更多
关键词 Piper methysticum PEPPER Amplified fragment length polymorphism
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“东海1号”大黄鱼选育F_4代遗传多样性的AFLP分析 被引量:1
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作者 侯红红 苗亮 +2 位作者 李明云 穆方申 徐玉敏 《宁波大学学报(理工版)》 CAS 2018年第4期31-35,共5页
应用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对以岱衢洋野生大黄鱼为亲本、通过群体选育方法获得的"东海1号"大黄鱼选育系F4代进行了遗传多样性分析.结果显示:16对AFLP选择性扩增引物组合在选育F4代的20尾个体中共扩增出736个位点,其... 应用扩增片段长度多态性(AFLP)技术对以岱衢洋野生大黄鱼为亲本、通过群体选育方法获得的"东海1号"大黄鱼选育系F4代进行了遗传多样性分析.结果显示:16对AFLP选择性扩增引物组合在选育F4代的20尾个体中共扩增出736个位点,其中多态位点292个,多态率为39.67%;各引物对的Nei’s遗传多样性指数范围为0.090 4~0.203 7,平均值为0.139 9;Shannon多样性范围为0.132 0~0.304 7,平均值为0.209 9;其遗传多样性水平与原始亲本群体相当.表明若群体选育方法得当,多代选育后仍能维持较好的遗传多样性水平. 展开更多
关键词 大黄鱼 片段长度多态性(AFLP)技术 遗传多样性
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干旱胁迫下甘蓝型油菜全基因组DNA甲基化分析
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作者 王建平 张书芬 +7 位作者 朱家成 何俊平 曹金华 文雁成 胡坤 赵磊 王东国 蔡东芳 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期585-593,共9页
为实现油菜抗旱稳产,了解甘蓝型油菜DNA甲基化及其在干旱胁迫应答过程中可能起到的作用,分别以抗旱和干旱敏感油菜品系为材料,利用扩增片段单核苷酸多态性和甲基化检测技术(AFSM)对其在干旱和复水处理下的叶和根组织进行全基因组DNA甲... 为实现油菜抗旱稳产,了解甘蓝型油菜DNA甲基化及其在干旱胁迫应答过程中可能起到的作用,分别以抗旱和干旱敏感油菜品系为材料,利用扩增片段单核苷酸多态性和甲基化检测技术(AFSM)对其在干旱和复水处理下的叶和根组织进行全基因组DNA甲基化分析。结果发现:两个材料在三个处理条件下共鉴定到22 157个甲基化位点,以5mCCGG全甲基化位点为主,主要发生在基因的编码区,其次是启动子区。干旱胁迫诱导油菜全基因组DNA甲基化水平的变化,不同材料组织之间存在差异。干旱胁迫诱导叶组织整体甲基化水平升高,根组织差异不明显;复水处理导致叶组织整体甲基化水平下降,根组织的甲基化水平在两个材料间存在差异。差异甲基化位点的基因主要参与光合作用,类囊体、核糖体、质体和核膜等细胞组成,转运及转运蛋白活性等分子生物学功能。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 干旱胁迫 DNA甲基化 AFSM(片段单核苷酸多态性和甲基化检测技术)
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岱衢洋与官井洋大黄鱼养殖群体遗传多样性的AFLP分析 被引量:3
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作者 娄剑锋 雷世勇 +1 位作者 竺俊全 吴雄飞 《海洋科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期361-366,共6页
应用扩增片段长度多态性技术(AFLP),比较研究了岱衢洋大黄鱼养殖群体和官井洋大黄鱼养殖群体的遗传多样性。9对选择性引物组合,在2个群体的40个个体中共扩增出381个位点,其中多态位点为288个。2个养殖群体的多态位点比例、Nei′s基因多... 应用扩增片段长度多态性技术(AFLP),比较研究了岱衢洋大黄鱼养殖群体和官井洋大黄鱼养殖群体的遗传多样性。9对选择性引物组合,在2个群体的40个个体中共扩增出381个位点,其中多态位点为288个。2个养殖群体的多态位点比例、Nei′s基因多样性指数、Shannon多样性指数分别为65.01%和57.50%,0.162 3和0.1175,0.254 7和0.185 6,显示岱衢洋大黄鱼F2代养殖群体的遗传多样性高于官井洋大黄鱼繁育多代养殖群体的遗传多样性。UPGMA聚类分析图显示2个群体各自聚成一支。遗传分化系数Gst及AMOVA分析表明,2个群体的遗传变异主要来源于群体内个体间,但群体间已有一定程度的遗传分化。 展开更多
关键词 大黄鱼 片段长度多态性技术(AFLP) 养殖群体 遗传多样性
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出口特产果品京东板栗遗传多样性fAFLP分析
10
作者 赵优 李家侨 张娜 《中国口岸科学技术》 2023年第10期79-84,共6页
本文采用荧光标记扩增片段长度多态性技术(fluorescent amplified fragment length polymorphism,fAFLP)对燕山地区出口特产果品京东板栗的10个群体269个样本进行遗传多样性分析。结果显示,共扩增位点383个,位点大小在70~500 bp范围内,... 本文采用荧光标记扩增片段长度多态性技术(fluorescent amplified fragment length polymorphism,fAFLP)对燕山地区出口特产果品京东板栗的10个群体269个样本进行遗传多样性分析。结果显示,共扩增位点383个,位点大小在70~500 bp范围内,其中多态性位点为314个,多态性比例为81.89%;10个群体观测等位基因数、有效等位基因数、Nei’s多样性指数、Shannon信息指数平均值分别为1.4573±0.0905、1.3101±0.0611、0.1702±0.0297和0.2514±0.0487;10个地理群体遗传距离在0.0454~0.1563之间,相似系数在0.8234~0.9786之间,UPGMA聚类得出京东板栗亲缘关系图谱。研究我国主要出口京东板栗群体的遗传结构,以期为合理评估和保护其种质资源、开展遗传育种以及提升产品品质维护板栗国际市场声誉提供基础资料。 展开更多
关键词 京东板栗 荧光标记片段长度多态性技术 遗传多样性 聚类分析
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采用FAFLP对屠宰场鸡胴体分离的空肠弯曲菌的分子分型和溯源分析 被引量:2
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作者 胡冬梅 王明忠 +5 位作者 曲萍 孙雨 董浩 赵柏林 王晓英 孙爱萍 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期94-98,共5页
目的对中国部分省份屠宰场鸡胴体分离的空肠弯曲菌进行分子分型和溯源分析。方法采用荧光标记扩增片段长度多态性技术(FAFLP),对72株空肠弯曲菌分离株进行分子分型,选用HindⅢ和HhaⅠ限制性内切酶进行双酶切,电泳结果经Gene Marker V1.8... 目的对中国部分省份屠宰场鸡胴体分离的空肠弯曲菌进行分子分型和溯源分析。方法采用荧光标记扩增片段长度多态性技术(FAFLP),对72株空肠弯曲菌分离株进行分子分型,选用HindⅢ和HhaⅠ限制性内切酶进行双酶切,电泳结果经Gene Marker V1.80处理后,导入Bio Numerics软件进行聚类分析,所得结果收入溯源分析数据库。结果 72株空肠弯曲菌分离株共产生241条多态性片段,多数在80~100条;72株菌共产生72种带型,分辨率为100%;以70%相似度为界,可以分为11个群,群间最低相似度为56.9%,群内最高相似度为94.9%。以80%相似度为界,可将A群分为5个亚群,B群分为15个亚群,多个亚群所包含菌株显示有完全地域同源性。结论 FAFLP方法分辨率高,聚类分析显示有一定同源性,适用于空肠弯曲菌的分子分型和溯源分析。 展开更多
关键词 荧光标记片段长度多态性技术 空肠弯曲菌 屠宰场 鸡胴体分子分型和溯源
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基于cDNA-AFLP检测不明RNA病毒方法学研究
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作者 崔海洋 王永全 +1 位作者 吉彦莉 靳博 《公共卫生与预防医学》 2019年第2期101-103,共3页
目的建立cDNA扩增限制片段长度多态性技术(cDNA-AFLP)方法,提高少发或新发病病原体检测灵敏度,为应对可能发生的突发公共卫生事件提供技术储备。方法参考相关文献,分3部分建立cDNA-AFLP方法,包括:标本前处理;两步RT-PCR制备cDNA;cDNA多... 目的建立cDNA扩增限制片段长度多态性技术(cDNA-AFLP)方法,提高少发或新发病病原体检测灵敏度,为应对可能发生的突发公共卫生事件提供技术储备。方法参考相关文献,分3部分建立cDNA-AFLP方法,包括:标本前处理;两步RT-PCR制备cDNA;cDNA多态长度片段扩增。以Real-time PCR方法为金标准,评价cDNA-AFLP检测乙型流感病毒和EV71的灵敏度与特异度。结果 7件Real-time PCR检测乙型流感病毒阳性标本,2件经cDNA-AFLP检测阳性,灵敏度为28.57%,特异度为100.00%。7件Real-time PCR检测EV71阳性标本,3件经cDNA-AFLP检测阳性,cDNA-AFLP灵敏度为42.86%,特异度为100.00%。结论 cDNA-AFLP能有效检测不明RNA病毒,其灵敏度受标本内病毒载量影响,对CT值小于25的标本检出率较高。该方法不需要特异引物,不需要新投入大型仪器设备,覆盖病原体类别广,成本低,应该成为常规传染病监测项目的必要补充。 展开更多
关键词 cDNA限制片段长度多态性技术(cDNA-AFLP) 传染病监测 灵敏度 特异度
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