基于扩增阻滞突变系统-聚合酶链式反应法的A1/A2牛奶鉴别试剂盒的开发及应用

目的基于扩增阻滞突变系统-聚合酶链式反应(amplification refractory mutation system polymerase chain reaction,ARMS-PCR)技术,开发A1A2牛奶鉴别试剂盒,并对市场上A2牛奶产品进行检测应用,实现对A2牛奶的鉴别检测。方法本研究先利用D-loop基因片段设计了牛内参基因引物探针组(标记FAM荧光)。随后,在β-酪蛋白基因突变位点分别设计了A1基因引物探针组和A2基因引物探针组(均标记VIC荧光)。基于ARMS-PCR技术构建了双通道ARMS-PCR反应体系与程序,进而成功开发了A1A2牛奶实时荧光ARMS-PCR试剂盒。为进一步验证试剂盒性能,将其应用于市场上A2牛奶的检测,并将检测结果与DNA测序法结果对比。结果本试剂盒特异性强,检测DNA灵敏度为0.1 ng/L;10份市售实际样品的应用检测结果与测序结果一致。结论本试剂盒特异性好,灵敏度高、准度度高,适用于A2牛奶的真实性鉴别。

基于突变阻滞扩增系统的实时荧光PCR技术检测幽门螺杆菌23S rRNA基因突变及其评价

目的探索突变阻滞扩增系统(ARMS)联合实时荧光PCR技术用于检测幽门螺杆菌23S rRNA基因突变的可行性。方法以幽门螺杆菌23S rRNA基因2143位点的两种基因型(野生型为AAA,突变型为AGA)质粒DNA为研究模型,设计ARMS引物同时对实时荧光PCR体系进行优化,对突变阻滞扩增系统联合实时荧光PCR技术的基因分型特异性进行评价。结果在与模板匹配的ARMS引物3'端附近故意引入错配碱基,降低该ARMS引物浓度和镁离子浓度,并采用两步PCR循环的反应程序,使ARMS引物的特异性增强,能够得到清晰的基因分型结果。结论这种基于突变阻滞扩增系统的实时荧光PCR技术,实验设计简便,特异性较好,并有望在此基础上发展成为适合临床应用的突变检测方法。

扩增阻滞突变系统快速检测H型高血压患者MTHFR C677T基因型的应用研究

目的通过扩增阻滞突变系统-聚合酶链反应(ARMS-PCR)检测H型高血压患者5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T基因型,以期建立一种低成本、简单快速的MTHFR C677T基因分型方法。方法基于湖南省H型高血压危险因素研究的大型流行病调查的人群基础,采用单纯随机方法,选取94例H型高血压患者作为研究对象。设计阻滞度递减的系列错配引物,采用ARMS-PCR对94例患者外周血样本的MTHFR C677T基因型进行鉴定,并抽取不同基因型进行测序验证。结果 ARMS-PCR产物电泳后条带清晰,易于判读MTHFR C677T基因型。94例H型高血压患者共检出CC基因型42例、CT基因型24例和TT基因型28例。ARMS-PCR与DNA测序结果一致。结论 ARMS-PCR经阻滞度递减的系列错配引物能有效对MTHFR C677T基因型进行鉴定,此法具有成本低、操作简单、用时短的优点。适用于各类基因的多态性分析。

优化的多重扩增阻滞突变系统-PCR对载脂蛋白E基因的简易分型

目的通过改进和优化多重扩增阻滞突变系统-PCR(multi-ARMS-PCR)条件,建立载脂蛋白E(ApoE)基因的简易分型方法。方法基于multi-ARMS-PCR的原理和特点,针对文献报道方法中存在的缺陷和错误,重新设计或改进引物。以外周血白细胞基因组DNA为模板,应用4个等位基因特异性寡核酸上游引物、1个通用下游引物和一对内参引物,分A,B两个管同步进行多重PCR反应。PCR扩增产物经过琼脂糖凝胶电泳分离-EB染色,根据电泳带型的差异,实现对ApoE 6种基因型的判定。结果新引物显著提高了扩增效率和反应特异性,排除了非特异条带的干扰,减少了ApoE基因分型的错判。结论采用优化后的multi-ARMS-PCR方法对ApoE基因型进行鉴定,具有操作简便、时间短、效率高、成本低的优点,值得推广。

北京协和医院病理科首先开展蝎形探针扩增阻滞突变系统检测石蜡切片基因突变

北京协和医院病理科在国内首次引入蝎形探针扩增阻滞突变系统（scorpions amplification refractory mutation system,Scorpions ARMS）进行石蜡切片基因突变检测,并证实该项新技术较之传统恶性肿瘤石蜡切片的基因突变检测具有高敏感性和特异性，可为非小细胞肺癌与结直肠癌检测提供可靠依据，为临床医师制定有效的治疗方案提供指导。

扩增阻滞突变系统用于ABO血型基因分型研究

目的建立一种快速、低成本的ABO血型基因分型方法。方法设计6对引物,建立扩增阻滞突变系统(ARMS),对30例中国汉族无关个体外周血样本的ABO基因型进行鉴定,并与血清学方法和直接测序结果进行比较。结果 ARMS技术检测30例样本结果同血清学方法、直接测序结果吻合率达到100%。结论该研究建立的ABO血型基因型鉴定方法可快速检测出28种ABO基因型,具有一定的临床应用价值。

环介导等温扩增技术在呼吸系统疾病中的应用

呼吸道感染和肿瘤,是威胁人类健康的主要疾病之一,其死亡率居高不下,而肺癌常与某些疾病共存或其影像学形态与某些疾病类似,故易误诊或漏诊。呼吸道疾病传统诊断方法慢、敏感度低下,亟待一种快速,敏感、准确的诊断方法面世。2000年Notomi等[1]首先发布环介导等温扩增技术,

多重突变特异性扩增系统检测葡萄糖-6-磷酸脱氢酶两种常见的基因点突变

目的建立多重突变特异性扩增系统(ARMS)检测我国葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因最常见的两种基因点突变,即G1388A和G1376T。方法对128例经限制性内切酶分析或DNA直接测序证实为G6PD基因G1388A或G1376T突变的样本,应用多重ARMS法,进行G6PD两种基因点突变分析。结果多重ARMS法一次即可同时检出G1388A和G1376T两种突变,未发现假阳性和假阴性。结论应用单管多重PCR法能快速检测出G6PD基因G1388A和G1376T突变,操作简便,结果准确,可应用于临床上G6PD两种基因点突变检测。

应用扩增阻碍突变系统检测骨髓增殖性疾病JA砬V617F基因突变的研究

目的探讨JAK2V617F基因突变在恶性血液病中的表达及临床意义。方法运用扩增阻碍突变系统对133例恶性血液病患者进行JAK2V617F基因突变检测分析。结果在133例样本中，60例BCR—ABL融合基因阴性的慢性骨髓增殖性疾病患者存在JAK2V617F基因突变（61．7％），其余血液病未发现该点突变，差异有统计学意义（P〈0．05）。其中真性红细胞增多症、特发性血小板增多症、原发性骨髓纤维化和嗜酸细胞增多症的阳性率分别为89．5％、53．6％、44．4％和25％。检测JAK2V617F基因突变的灵敏性为2％。结论JAK2V617F基因突变在BCR—ABL融合基因阴性的慢性骨髓增殖性疾病患者中广泛表达，尤其以真性红细胞增多症患者发生率最高。扩增阻碍突变系统检测JAK2V617F基因突变具有很好的特异性和灵敏度，可作为临床筛查的检测方法。

PowerPlex~ 16 HS系统直接扩增法检测常见检材的DNA

目的研究PowerPlex16 HS系统直接扩增法对血样、口腔拭子和烟蒂3种常见检材的有效性。方法采用PowerPlex16 HS系统对11份新鲜血样、10份口腔拭子和10份烟蒂样本进行直接扩增检测,对所得数据进行统计分析。结果新鲜血样和口腔拭子的完整遗传图谱检测成功率为100%,烟蒂样本的完整遗传图谱检测成功率为90%。结论 PowerPlex16 HS系统直接扩增法是一种适用于血样、口腔拭子和烟蒂3种常见检材的有效方法。

高通量红细胞血型基因分型的多重连接依赖的探针扩增技术在一例抗Di^a新生儿溶血病诊断中的应用

目的运用高通量红细胞血型基因的多重连接依赖的探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)辅助诊断一例罕见的由抗Di^a导致的严重核黄疸新生儿溶血病。方法运用传统的血型血清学方法对导致新生儿溶血病相关红细胞血型抗体进行鉴定,运用MLPA对患儿及其父母的超过40种红细胞血型抗原进行基因分型,对鉴定的抗体进行效价分析。结果血型血清学检测表明患儿体内含有针对某种低频抗原的抗体,MLPA基因分析结果提示母婴红细胞MNS血型系统及Diego血型系统抗原不匹配,可能存在抗N或抗Di^a,经进一步的血型血清学检测,证实母亲及患儿血清中存在抗Di^a,并且其母亲血清抗Di^a效价为1:32。结论抗Di^a可引起包括核黄疸在内的严重新生儿溶血病;高通量红细胞血型基因分型的MLPA技术能够协助并有效解决临床疑难样本稀有血型鉴定;针对国人的Di^a阳性的试剂红细胞应该常规应用于日常的抗体筛查工作中。

国产化细胞扩增系统及其配套工艺技术分析

国产化细胞扩增系统是自主开发的国产化生物制药用一次性生物反应器系统,设备基于模拟海浪的轻柔摇摆模式,整合多重自动化控制系统及一次性培养袋,为生物药制备中的细胞培养过程提供密闭系统下的一次性工艺解决方案。相较于传统设备,其生物安全等级更高,可有效地避免污染、降低成本并简化操作工艺,是生物制药设备的发展方向。重点对细胞扩增系统进行介绍,并结合配套工艺展示其在生物制药实际生产过程中的应用技术方案及效果。

多重连接依赖的探针扩增(MLPA)技术在广州地区RhD阴性献血者基因分型研究中的应用

目的采用新型Rh血型系统的MLPA检测试剂盒,对广州地区收集的200名RhD阴性献血者进行基因分型。方法采用传统的血型血清学方法,对RhD阴性献血者进行RhD表型鉴定。提取基因组DNA,采用MLPA检测试剂盒对收集的200名RhD阴性献血者进行RHD基因分型。对于不能明确分型的标本,进行RHD基因直接测序分析。结果在200名RhD阴性献血者中,采用MLPA方法对196名进行了明确的基因分型。其中,127名为RHD基因缺失(占63.5%);仅检测到包含RHD1227A突变的DEL等位基因有41例,其中38例包含杂合等位基因,其余3例包含纯合等位基因;仅检测到RHD(1-2)-CE(3-9)-D(10)等位基因的有23例,其中19例杂合,4例纯合;3例包含2种不同的RHD等位基因(1条为RHD(1-2)-CE(3-9)-D(10),另1条为RHD1227A);其余2例分别包含杂合的DFR-2(RHD-CE(4)-D)及弱D15型(RHD845A)等位基因。在其余4例直接测序分析的标本中,2例包含杂合的RHD711delC突变;1例1条等位基因为MLPA检测到的包含RHD1227A突变的DEL等位基因,另1条为包含711delC突变的RHD等位基因;其余1例的1条等位基因为MLPA检测到的RHD(1-2)-CE(3-9)-D(10),另1条为包含新突变的RHD等位基因(1154G>T,385Gly>Val)。结论 MLPA检测试剂盒是适用于中国人群的1种快速、有效的高通量基因分型方法,能够对中国人群常见的各种RHD基因型进行明确分型,适用于参比实验室相关疑难标本的基因分型检测。也可应用于中国人群常见的Del表型检测,使Del表型患者不必再输注RhD阴性血液,节约稀有的RhD阴性血液资源。

利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术联合T细胞斑点试验对泌尿系结核的诊断效果评价

目的探讨利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测技术(GeneXpert MTB/RIF)联合结核感染T细胞斑点试验(T⁃SPOT)对泌尿系结核(urinary tuberculosis,UTB)的诊断效能。方法选择2017年1月至2018年12月河南省胸科医院就诊临床疑似UTB的病人。分别采集样本进行抗酸涂片、液体培养、GeneXpert MTB/RIF和T⁃SPOT检测。使用χ2检验对不同检测方法的灵敏度进行比较。结果其中42例(47.1%)病人临床确诊为泌尿系结核。在泌尿系结核病例中,单项检测的阳性率最高的为T⁃SPOT,达到85.7%(36/42),但其在非泌尿系结核病例中的阳性率也最高,达到25.5%(12/47)。GeneXpert MTB/RIF和T⁃SPOT联合检测的特异度为100%;其联合检测灵敏度为89.4%,显著高于其他四项单独检测,分别为:抗酸涂片11.8%(χ2=57.225,P<0.001)、液体培养法42.8%(χ2=19.112,P<0.001)、GeneXpert MTB/RIF检测64.2%(χ2=7.823,P<0.01)和T⁃SPOT检测85.7%(χ2=2.573,P<0.05)。结论GeneXpert MTB/RIF和T⁃SPOT联合检测对于泌尿系结核的临床诊断有很好的临床应用价值,值得广泛推广应用。

多重连接探针扩增技术的研究进展及其应用

多重连接探针扩增技术（multiplex ligation-dependentprobe amplification,MLPA）是一种高通量、针对待测核酸中靶序列进行定性和定量分析的新技术。该技术仅需20ng/μlDNA,即可通过简单的杂合、连接、PCR扩增及电泳步骤,在同一反应管中对四十多个不同的靶基因进行检测和定量分析。这一技术最先于2002年由荷兰的Schouten等[1]报道。如今短短几年中,该技术已被欧洲、亚洲等几十个实验室采用。迄今为止,已有150多篇不同领域采用该技术方法的报道在重要刊物上发表。

多重连接探针扩增技术检测常见线粒体疾病

目的探讨多重连接探针扩增技术(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)用于常见线粒体疾病基因检测的可行性。方法收集2010年5月至2012年8月北京协和医院281例可疑线粒体异常病例,包括神经科存在神经系统损伤的患者233例及眼科疑诊Leber遗传性视神经病变的患者48例,运用MLPA法对常见线粒体疾病突变位点进行检测,并使用线粒体基因序列测定方法进行验证。结果 281例标本中共38例检测到线粒体基因突变,总检出率为13.5%。眼科48例标本中,3460G>A、11778G>A和14484T>C3种突变共检测到19例,检出率为39.6%;神经科233例标本中,3243A>G、8344A>G、8993T>G和大片段缺失共检测到19例,检出率为8.2%。除1例大片段缺失暂无PCR测序验证外,其余MLPA结果均经序列测定验证为相符。结论 MLPA法是一种可行的快速、准确、简便的基因诊断方法,可作为筛查常见线粒体疾病的检测工具,为临床诊断和治疗提供依据。

PowerPlex~16 HS系统直接扩增法检测肋软骨

目的检验PowerPlex16HS直接扩增系统对软骨的有效性。方法采用PowerPlex16HS复合扩增系统对10例腐败尸体的肋软骨进行直接扩增检验。结果所检验肋软骨都获得了完整遗传图谱,检测成功率为100%。结论 PowerPlex16HS系统直接扩增法能够应用于肋软骨的DNA分型检验。

RFC1基因动态突变相关多系统萎缩一例

患者男性,48岁,因行走不稳2年,加重伴言语笨拙、尿频1年,于2021年5月20日入院。患者入院前2年(2019年3月)无明显诱因出现行走不稳,直线行走不能,伴踩棉花感,此后症状呈进行性加重,伴右手笨拙,书写困难,当地医院头部MRI提示“腔隙性梗死”,予以阿司匹林100mg/d口服,未见明显好转。1年前(2020年5月)逐渐出现言语笨拙,语言含糊,无饮水呛咳、吞咽困难,伴尿频、尿急,久站后心慌、头晕,晕厥1次,伴性功能障碍,当地医院MRI检查显示脑干和小脑萎缩.