无创产前筛查扩展性检测临床研究进展

随着高通量测序技术的发展,获取孕妇外周血胎儿游离DNA进行胎儿染色体非整倍体评估的无创产前筛查(NIPT)技术已在国内外广泛应用。21、18、13-三体综合征是目前NIPT的主要检测目标,但已有许多学者提出了将NIPT技术用于性染色体、双胎妊娠,以及对染色体微缺失、微复制,单基因遗传病等其他范围扩展检测的可能性。

扩展性无创产前检测在胎儿染色体拷贝数变异筛查中的应用

目的探讨扩展性无创产前检测(NIPT-Plus)在胎儿染色体拷贝数变异(CNVs)筛查中的临床应用价值。方法选取2021年6月至2022年12月在西安新长安妇产医院行NIPT-Plus检测的2604例孕妇作为研究对象,NIPT-Plus检测结果为高风险的孕妇建议进行羊水穿刺,行染色体核型分析和染色体微阵列分析(CMA)进行结果验证,电话随访妊娠结局。结果2604例孕妇中NIPT-Plus检测提示25例CNVs高风险,阳性率为0.96%,18例孕妇选择侵入性产前诊断,其中12例CMA结果与NIPT-Plus结果相吻合,阳性预测值为66.67%(12/18),随访发现9例孕妇在遗传咨询后选择终止妊娠,1例孕妇早产后孩子夭折,2例孕妇选择继续妊娠。结论NIPT-Plus是一种高效的筛查技术,对胎儿染色体CNVs的检出具有一定的临床应用价值,但存在假阳性,仍需进一步产前诊断。

扩展性无创产前检测在胎儿染色体异常筛查中的应用

目的:分析扩展性无创产前检测(NIPT-plus)用于胎儿染色体异常筛查的效果。方法:选取符合无创产前检测指征的孕妇9 136例,其中6 110例接受无创产前检测(NIPT),3 026例接受NIPT-plus,共检出265例高风险孕妇,其中248例行介入性产前诊断(低深度全基因组测序和染色体微阵列分析)以进一步明确诊断。结果:NIPT对21-三体、18-三体、13-三体的阳性预测值分别为90.24%、82.14%、14.29%,对性染色体非整倍体(SCA)的阳性预测值为26.23%,对拷贝数变异(CNV)的阳性预测值为33.33%,总阳性预测值为50.86%;NIPT-plus对以上异常的阳性预测值分别为93.33%、83.33%、0.00%、38.46%、32.26%,总阳性预测值为53.42%;两种方法比较,差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论:NIPT-plus与NIPT筛查胎儿染色体异常的效能相近,其中对21-三体、18-三体的阳性预测值较高,具有较高的临床应用价值。

扩展性无创产前基因检测在产前诊断中的应用

目的探讨扩展性无创产前基因检测(NIPT-plus)在产前诊断中的应用价值。方法选取2020年4月至2021年12月在阜阳市人民医院就诊的159例NIPT-plus结果提示高风险的孕妇,所有孕妇均行羊膜腔穿刺术,同时进行染色体核型分析联合染色体微阵列分析(CMA)或染色体拷贝数变异(CNV)测序(CNV-seq)并进行随访,对所有孕妇的检测结果和妊娠结局进行汇总分析。结果159例NIPT-plus高风险孕妇中,21三体36例、18三体11例、13三体2例、性染色体数目异常58例、其他染色体数目异常30例、CNV 22例。159例孕妇羊水样本通过染色体核型分析联合CMA/CNV-seq检测共检出70例与NIPT-plus结果一致的异常样本和4例非NIPT-plus提示的其他异常。NITP-plus对21三体、18三体、13三体、性染色体数目异常、其他染色体数目异常、CNV的阳性预测值分别为75.0%(27/36)、72.7%(8/11)、0(0/2)、36.2%(21/58)、6.7%(2/30)和54.5%(12/22)。4例非NIPT-plus提示的其他异常的CNV片段大小均小于3 Mb,包括1例致病性变异、3例临床意义未明变异。结论NIPT-plus具有较高的准确度,对常见的染色体非整倍体异常和拷贝数变异具有一定的预测价值,同时建议NIPT-plus提示高风险的孕妇,运用染色体核型分析联合CMA或CNV-seq进行进一步的产前诊断,以确定胎儿是否存在染色体变异。

扩展性无创产前检测在胎儿染色体异常筛查中的应用价值

目的:分析扩展性无创产前检测(NIPT-plus)在胎儿染色体异常筛查中的应用价值。方法:选取2021年1月至2023年3月于该院行胎儿染色体疾病筛查的4473名孕妇为研究对象,均进行NIPT-plus检测,对NIPT-plus结果提示胎儿染色体异常且自愿进行羊水染色体核型分析的孕妇于超声引导下行羊膜腔穿刺,采用Kappa检验分析NIPT-plus结果与羊水染色体核型分析结果的一致性。结果:4473名孕妇中胎儿染色体异常88名,其中21-三体综合征(T21)17名、18-三体综合征(T18)6名、13-三体综合征(T13)1名、性染色体数目异常23名、染色体微缺失/微重复25名、其他常染色体数目异常16名。NIPT-plus检出88名胎儿染色体异常孕妇中67名自愿进行羊水染色体核型分析,共检出染色体异常37名,其中检出T21 9名、T18 3名、T13 0名,性染色体数目异常8名,染色体微缺失/微重复8名,其他常染色体数目异常9名。经Kappa一致性检验,NIPT-Plus检测T21的一致性很好(Kappa值=0.939),检测T18的一致性较好(Kappa值=0.849),检测性染色体数目异常、染色体微缺失/微重复、其他常染色体数目异常的一致性一般(Kappa值=0.458、0.539、0.584),检测T13的一致性较差(Kappa值=0.000)。结论:NIPT-Plus在T21、T18胎儿染色体异常筛查中均具有较高的应用价值。

扩展性无创产前检测在染色体微缺失微重复的临床应用价值

目的:探讨扩展性无创产前检测(NIPT-plus)在筛查胎儿染色体微缺失微重复综合征(MMS)的临床应用价值。方法:选取2020年1月至2023年6月温州市中心医院接受NIPT-plus检测的5027例孕妇作为研究对象。其中,54例NIPT-plus结果显示MMS高风险的孕妇被建议进行羊膜腔穿刺术,进行胎儿染色体微阵列分析(CMA)检测,并对妊娠结局进行随访,以分析MMS高风险孕妇的检测效能。结果:在5027例孕妇中,>35岁高龄孕妇占42.59%(2141/5027)。NIPT-plus检测结果显示54例MMS高风险,阳性率为1.07%,其中,>35岁孕妇占44.45%(24/54)。共有35例孕妇接受了侵入性产前诊断,其中14例确诊为MMS,阳性预测值为40%(14/35)。同时,发现2例CMA结果与NIPT-plus结果不符,随访发现7例孕妇在遗传咨询后选择终止妊娠。结论:NIPT-plus在筛查MMS高风险孕妇方面具有较高的阳性预测值。

扩展性无创产前检测应用于孕期产前筛查的临床效果分析

目的分析将扩展性无创产前检测(expanded non-invasive prenatal testing,NIPT plus)应用于孕期产前筛查的临床效果。方法回顾2018年9月至2019年12月在本中心自愿接受NIPT-plus检测的3700例孕妇的筛查结果、产前诊断以及妊娠结局。结果在3700例孕妇中,74例(2.0%)的结果为高风险,其中63例孕妇接受了侵入性产前诊断,确诊19例,阳性预测值为30.2%。NIPT-plus对于常见染色体三体的阳性预测值较高,对性染色体非整倍体和微缺失微重复的阳性预测值为中低水平。结论作为一种新的筛查技术,NIPT-plus较传统的方法具有更广阔的应用前景,可为临床医师和孕妇提供重要的参考。

扩展性无创产前检测在血清学筛查唐氏综合征高风险的临床效果分析

目的探讨扩展性无创产前检测(expanded noninvasive prenatal testing,NIPT-plus)在血清学筛查唐氏综合征高风险的临床应用效果。方法回顾性分析2018年9月至2019年12月因血清学筛查唐氏综合征高风险(≥1/270)于郑州大学第一附属医院遗传与产前诊断中心行NIPT-plus的1561例孕中期孕妇的筛查结果、产前诊断以及妊娠结局。结果行NIPT-plus筛查的1561例孕妇中,45例孕妇结果为NIPT-plus高风险,检出率为2.88%(45/1561)。40例高风险孕妇行侵入性产前诊断,确诊20例,阳性预测值为50.0%(20/40)。统计学分析提示,NIPT-plus对0-1/90组的21-三体、性染色体非整倍体和微缺失/重复综合征的检出率高,阳性预测值低于其他两组。结论NIPT-plus在血清学筛查唐氏综合征高风险孕妇不同组的检出率和阳性预测值存在差异。NIPT-plus能够缓解产前诊断压力,可作为孕妇血清学筛查唐氏综合征高风险的检测手段。

CNV-seq联合核型分析在扩展性NIPT结果异常孕妇产前诊断中的临床应用

目的 探索在扩展性非侵入性产前检测(NIPT-plus)筛查结果异常孕妇中应用拷贝数变异测序(CNV-seq)技术联合染色体核型分析进行产前诊断的临床价值。方法 收集2021年1月—2022年12月因NIPT-plus结果异常至阜阳市人民医院产前诊断中心自愿接受羊膜腔穿刺术并选择进行羊水核型联合CNV-seq检测的孕妇233例,统计病例产前诊断结果,并对所有病例进行随访。结果 233例羊水样本中检出86例核型异常,其中非整倍体66例、染色体结构异常9例、嵌合体13例,其中2例同时存在结构异常和嵌合。CNV-seq检出胎儿染色非整倍体同核型结果一致,12例嵌合体核型和CNV-seq均检出。1例平衡易位嵌合体CNV未检出,1例XO嵌合及1例T15嵌合核型未检出。2例性染色体相关的复杂嵌合异常,核型提示体内存在2种异常细胞系,孕妇家庭最终决定终止妊娠。CNV-seq技术在未检出非整倍体异常及嵌合体病例中检出致病及可能致病性拷贝数变异(pCNVs)13例,检出231处意义未明(VUS)的CNVs,共报告21处,占9.1%(21/231)。核型检出结构畸形病例中,有3例CNV-seq结果未见异常,孕妇及家属均决定继续妊娠;13例CNV-seq检出pCNVs的病例中,有11例核型未检出异常,占84.6%(11/13)。结论 CNV-seq技术联合核型分析在NIPT-plus结果异常孕妇中可提供更精确的产前诊断结果,但在选择前应仔细产前咨询,告知孕妇家属此技术的局限性。

1例无创产前检测提示13-三体综合征与21-三体综合征同时高风险胎儿的产前诊断

目的明确无创DNA产前检测发现1例13-三体综合征与21-三体综合征同时高风险的胎儿的遗传学病因。方法对一例普通无创产前检测提示13-三体综合征与21-三体综合征并存高风险的胎儿后续进行扩展性无创产前检测,羊水染色体微阵列检查与父母外周血染色体核型检查。结果普通无创DNA产前检测胎儿游离DNA浓度为19.5%,提示胎儿21号和13号染色体同时存在重复高风险;扩展性无创产前检测胎儿游离DNA浓度为18.5%,提示胎儿21号和13号染色体同时存在染色体片段重复;羊水染色体微阵列结果为arr[GRCh38]13q14.3q34(50646848-114342258)×363.7Mb,arr[GRCh38]21q11.2q21.3(13644166-26035771)×312.4Mb;胎儿父亲外周血染色体检查为46,XY,母亲为46,t(13,21)(q14.3,q11.2)。结论对于无创产前检测检出特殊结果的样本,扩展性无创产前检测能够提高测序数据量和优化算法,可为临床提供更多有用信息,但最终还需要通过产前诊断验证结果;家系追溯有助于明确遗传学病因,有利于后续遗传咨询。

扩展性无创产前检测21-三体综合征假阴性原因分析

目的探讨1例扩展性无创产前检测(expanded non-invasive prenatal testing,NIPT-PLUS)21-三体综合征假阴性的原因。方法对1例行扩展性无创产前检测结果为阴性,后期超声检测显示胎儿心脏发育异常的病例行羊水穿刺取羊水细胞进行QF-PCR、核型分析和拷贝数变异测序(copy number variation sequencing,CNV-Seq)检测;对引产后的胎盘进行多点取样,并用CNV-Seq进行拷贝数变异检测;分析胎盘嵌合导致假阴性原因及降低影响的相应措施。结果QF-PCR、羊水核型和CNV-Seq检测结果全部显示胎儿为21-三体综合征核型;胎盘检测结果显示脐带为21-三体综合征核型且离脐带越近的位置21-三体综合征核型占据比例越大。结论本例21-三体综合征假阴性为胎盘嵌合引起;扩展性无创产前检测低风险病例后续产检仍不可忽视,特别是超声检测结果需重点关注。

扩展性无创产前检测双胎之一22q11.2缺失综合征假阴性结果的原因分析

目的探讨1例扩展性无创产前检测(NIPT-plus)双胎之一22q11.2缺失综合征(22q11.2 DS)假阴性的原因。方法对1例NIPT-plus结果为阴性,后期因超声异常行羊水穿刺的辅助生殖双胎样本,获取胎儿细胞后行核型分析和拷贝数变异测序(CNV-seq)检测。收集并分析孕妇的临床信息及检测数据,探讨假阴性的原因。结果NIPT-plus的uniMap reads为11.77 Mb,胎儿游离DNA浓度为3.05%。羊水核型结果显示一胎为46,XY,另一胎儿为46,XX,均正常。CNV-Seq结果显示一胎正常,另一胎为缺失大小为2.58 Mb的22q11.2 DS。结论上述假阴性应是由较低的胎儿游离DNA浓度、孕妇较高的BMI、辅助生殖、双胎以及较小的缺失片断等综合因素共同引起。对于NIPT-plus低风险者的后续超声检查不可忽视。

测序深度对无创产前检测效能的影响分析

目的通过增加测序深度,评估扩展性无创产前检测(NIPT-plus)的临床适用性,为产前咨询提供参考依据。方法收集2018年8月—2020年12月在内蒙古妇幼保健院行NIPT的36730例及行NIPT-plus的4633例孕妇资料进行回顾性分析,孕妇年龄17~49岁,孕周12~37周,并对NIPT经产前诊断的77例假阳性及4例假阴性样本行NIPT-plus复检,测序深度增加3倍,对比分析NIPT和NIPT-plus与产前诊断结果的一致性。结果NIPT筛查复合三体(T21、T18、T13)的阳性预测值(PPV)显著高于NIPT-plus(71.11%vs 42.31%,P<0.05),性染色体非整倍体(SCAs)、罕见常染色体非整倍体(RCAs)和微缺失微重复综合征(MMS)的PPV与NIPT-plus均无显著性差异。77例NIPT假阳性样本行NIPT-plus后,6例(7.79%)转变为低风险,4例假阴性样本中1例由低风险转变为T15高风险,与产前诊断结果一致。结论NIPT-plus一定程度上可以降低NIPT的假阳性率、提高RCAs的检出率,降低出生缺陷的发生风险,因此,临床中进行遗传咨询时可根据孕妇的风险值合理选择。

10303例扩展性无创产前检测的结果分析

目的 评估扩展性无创产前检测(NIPT-plus)筛查胎儿染色体异常的临床效果。方法 回顾性收集2019年12月至2022年8月在杭州市妇产科医院进行NIPT-plus的10303例单活胎孕妇,对提示高风险的孕妇应用染色体核型分析和单核苷酸多态性微阵列(SNP array)验证,并追踪随访妊娠结局,分析其筛查效能。结果 10303例孕妇接受NIPT-plus检测,检出阳性标本196例,25例孕妇拒绝产前诊断,171例NIPT-plus高风险孕妇接受侵入性产前诊断,最终确诊阳性62例,阳性预测值为36.26%(62/171),其产前诊断结果显示NIPT-plus检测对胎儿21、18、13三体(T21、T18、T13)的阳性预测值(PPV)分别为80.00%(20/25)、33.33%(3/9)、25.00%(1/4),性染色体非整倍体(SCA)和染色体微缺失/微重复综合征(MMS)的PPV为49.12%(28/57)和31.58%(6/19)。结论 扩展性无创产前检测对胎儿常见染色体非整倍体异常、SCA、MMS的检出具有一定的临床应用价值,但存在假阳性,需进一步产前诊断。

NIPT-plus筛查染色体MMS的应用评价

目的探讨扩展性无创产前检测(NIPT-plus)在筛查染色体微缺失/重复综合征(MMS)上的应用。方法选取中山大学附属第一医院2018年1月至2020年12月3860例孕妇及2022年10例室间质评样本的NIPT和NIPT-plus检测结果,其中24例孕妇进行染色体微阵列分析(CMA)产前诊断。结果24例孕妇及10例质评样本NIPT-plus游离DNA浓度明显高于NIPT,总测序数据量提高了1.39~1.58倍,有效测序数据量提高了1.20~1.35倍;24例孕妇样本NIPT-plus提示1例18-三体,1例21-三体,2例MMS,NIPT提示1例18-三体,1例21-三体;10例质评样本NIPT-plus提示9例MMS且9号样本同时存在性染色体非整倍体(SCAs),NIPT仅提示1例SCAs。结论在本院系统检测范围内NIPT-plus能有效应用于MMS的筛查,减少出生缺陷。

产前诊断18p四体综合征一例

18p四体综合征(tetrasomy 18 syndrome)是一种罕见的染色体疾病,大约每18万活产婴儿中有1例出现。本病例经扩展性NIPT检测提示18号染色体非整倍体高风险(Z=4.75),经羊水细胞染色体核型分析和全基因组拷贝数变异(CNVs)分析后诊断为18p四体综合征。

NIPT-plus在产前筛查中的应用价值分析

目的 探讨扩展性无创产前基因检测(NIPT-plus)技术在产前筛查中的应用价值。方法 收集南方医科大学珠江医院及南方医科大学第七附属医院2018年1月-2021年6月的NIPT-plus数据,并对结果提示胎儿染色体异常高风险的孕妇行羊膜腔穿刺胎儿染色体检查进行验证,分析其检测的阳性预测值、阴性预测值,并随访胎儿的预后。结果共检测2191例孕妇,发现异常38例,阳性率为1.7%,其中染色体拷贝数变异6例。共31例行羊膜腔穿刺验证,其中18例NIPT-plus结果与羊膜腔穿刺结果相符,总的阳性预测值为58.1%、阴性预测值为100.0%。共5例染色体拷贝数变异进行产前诊断,其中3例产前诊断结果与NIPT-plus结果相符,阳性预测值为60.0%。结论 对有发生胎儿染色体异常风险的孕妇,将NIPT-plus用于产前初筛有一定的警示价值。

NIPT-plus在高龄孕妇产前筛查中的应用

目的 探讨拒绝产前诊断的高龄孕妇(年龄≥35岁)行扩展性无创产前基因检测技术(NIPT-plus)的可行性。方法 回顾性分析本中心行NIPT-plus的689名高龄孕妇的临床资料。以羊水产前诊断为金标准,验证NIPT-plus检测结果的一致性。结果 NIPT-plus检测中,共筛出24例高风险,包括21-三体、18-三体、性染色体异常各3例,微缺失微重复14例,其他染色体异常1例。21例高风险孕妇行羊水穿刺产前诊断,3例高风险孕妇拒绝羊穿(产前诊断率87.50%),确诊21-三体2例(阳性预测值100%)、18-三体1例(阳性预测值33.33%)、性染色体异常3例(阳性预测值100%)、微缺失微重复2例(阳性预测值16.67%)。结论 拒绝产前诊断的高龄孕妇可以行NIPT-plus筛查,以减少出生缺陷儿的发生。

NIPT-plus提示3pter-p25缺失综合征和Pallister-Killian综合征高风险胎儿1例的遗传学分析

目的探讨1例由扩展性无创产前检测(NIPT-plus)提示3pter-p25缺失综合征和Pallister-Killian综合征(PKS)高风险胎儿的遗传学病因。方法选取2023年6月27日于乌鲁木齐市妇幼保健院NIPT-plus检测提示3pter-p25缺失综合征和PKS高风险的1例胎儿为研究对象。采集孕妇相关临床资料,对胎儿羊水样本进行羊水染色体G显带核型分析与染色体微阵列分析(CMA),对其父母进行外周血染色体G显带核型分析,孕妇经遗传咨询后引产并对引产胎儿组织进行拷贝数变异测序(CNV-seq)。结果孕妇年龄为36岁,G3P1,因胎儿超声提示“胎儿双侧侧脑室对称、宽12 mm,未见明显胎儿透明隔腔,胎儿单脐动脉”就诊。CMA检测结果提示arr[GRCh37]3p26.3p26.1(61892_7439472)x1,12p13.33p12.2(173787_20064689)x3,缺失和重复片段大小分别为7.2 Mb和19.89 Mb,羊水的染色体核型分析结果为46,Xn,der(3)t(3;12)(p26;p12).arr;胎儿母亲的外周血染色体核型为46,XX,t(3;12)(p26;p12),胎儿父亲的外周血染色体核型正常。引产胎儿组织CNV-seq结果为seq[hg19]del(3)(p26.3p26.1)chr3:g.60000_7420000del,dup(12)(p13.33p12.2)chr12:g.60000_20020000dup,缺失和重复片段大小为7.36 Mb和19.96Mb,与CMA检测结果相符。结论该胎儿同时存在3p26.3p26.1微缺失及12p13.33p12.2微重复变异,根据其母亲染色体核型结果,推测胎儿的染色体变异源自母亲的不平衡配子。应用G显带核型分析与CMA检测技术可诊断胎儿染色体结构异常的类型及来源,从而明确胎儿的遗传学病因。

1例15q11.2-q13.1父源重复胎儿的产前诊断及遗传学分析

目的 对1例扩展性无创产前检测提示染色体拷贝数变异(CNV)的孕妇实施介入性产前诊断及遗传分析。方法 应用染色体微阵列分析(CMA)对胎儿进行CNV检测,应用甲基化特异性的多重连接依赖的探针扩增(MS-MLPA)对胎儿及其父母的染色体15q11-q13区域进行拷贝数分析和甲基化状态分析。结果 CMA检测结果显示胎儿染色体15q11.2-q13.1区域存在5.21Mb的片段重复;MS-MLPA检测结果显示胎儿染色体15q11-13区域存在大片段重复,且重复片段为父源,胎儿父母该区域不存在大片段缺失/重复或甲基化异常。结论 扩展性无创产前检测技术可对部分微缺失/微重复综合征进行产前筛查,当检出的微缺失/微重复包含印迹区域时,进一步使用MS-MLPA对甲基化进行检测、明确印迹区域缺失/重复的亲本来源是预测受检胎儿表型和构建完整家系图的重要依据,对于提供完善的遗传咨询非常重要。