基于高通量多组学数据分析ESYT3在乳腺癌中的表达及临床意义

目的基于高通量数据库分析扩展突触结合蛋白3(ESYT3)在乳腺癌中的表达及临床意义。方法使用TCGA数据库和基因表达数据库(GEO)的门户网站(c Bio Portal和Oncomine)以及癌症多组学和临床数据库Linked Omics分析ESYT3在乳腺癌中的变化及其与临床预后的关系;分别采用Kaplan-Meier法分析ESYT3变异与乳腺癌患者生存之间的关系,非参数检验分析正常乳腺组织和浸润性乳腺癌组织中ESYT3的表达差异,Spearman非参数检验分析浸润性乳腺癌中ESYT3 m RNA水平与临床各指标的相关性以及基因拷贝数变化和甲基化水平对m RNA表达的影响。结果 c Bio Portal分析结果显示1 098例浸润性乳腺癌患者中,122例发生了ESYT3 m RNA的改变(包括突变、拷贝数变化和m RNA水平上调),其中,ESYT3 m RNA水平上调超过默认阈值(EXP≥2)的占10%,且不利于患者预后(P<0.05);Oncomine分析结果显示,浸润性乳腺癌组织中ESYT3m RNA水平明显高于癌旁组织(P<0.01);Linked Omics分析结果显示,浸润性乳腺癌中ESYT3 m RNA水平分别受雌激素受体、孕激素受体、PAM50分型、组织学类型、年龄以及肿瘤纯度的影响(P<0.01);ESYT3 m RNA水平与其基因拷贝数呈正相关(P<0.01),而与其DNA甲基化呈负相关(P<0.01)。结论 ESYT3拷贝数增加和低甲基化促进其表达,且ESYT3高表达不利于乳腺癌患者预后,可作为预后的候选标志物。

ESYT3和FNDC1在肺腺癌中的表达及其与肿瘤进展关系

目的检测肺腺癌患者癌组织中扩展突触结合蛋白3(ESYT3)和Ⅲ型纤连蛋白结构域包含蛋白1(FNDC1)的表达,并分析两者与肿瘤进展的关系。方法纳入2019-06-01-2022-06-01河南省胸科医院收治的137例肺腺癌患者病理组织标本。患者男96例,女41例;年龄43~76岁,平均年龄(65.87±8.14)岁。应用免疫组织化学染色法检测癌组织、癌旁组织(距离癌组织≥3 cm)ESYT3和FNDC1蛋白的阳性表达,分析其与临床病理特征的关系。随访截至2023-10-01,比较不同进展状态患者癌组织ESYT3和FNDC1阳性表达情况。采用χ^(2)检验分析ESYT3和FNDC1阳性表达与肺腺癌临床病理特征的关系,采用多因素Cox比例风险回归模型分析肺腺癌进展的影响因素,绘制Kaplan-Meier曲线分析癌组织ESYT3和FNDC1蛋白表达与肺腺癌进展的关系。结果肺腺癌组织和癌旁组织中,ESYT3阳性表达率分别为33.58%(46/137)和56.20%(77/137),FNDC1阳性表达率分别为43.07%(59/137)和21.90%(30/137),差异均有统计学意义,χ^(2)值分别为14.177和13.995,均P<0.001。有吸烟史、TNMⅢ期、有淋巴结转移、未/低分化、胸膜侵袭患者,癌组织ESYT3阳性表达率分别低于无吸烟史(χ^(2)=7.344,P=0.007)、TNMⅠ/Ⅱ期(χ^(2)=7.766,P=0.005)、无淋巴结转移(χ^(2)=7.161,P=0.007)、中/高分化(χ^(2)=6.742,P=0.009)、无胸膜侵袭(χ^(2)=8.408,P=0.004)患者,癌组织FNDC1阳性表达率分别高于无吸烟史(χ^(2)=9.352,P=0.002)、TNMⅠ/Ⅱ期(χ^(2)=6.691,P=0.010)、无淋巴结转移(χ^(2)=4.258,P=0.039)、中/高分化(χ^(2)=7.421,P=0.006)、无胸膜侵袭(χ^(2)=7.738,P=0.005)患者。随访时间16~52个月,中位随访时间37(18,48)个月,124例患者进展率50.81%(63/124)。多因素Cox比例风险回归模型分析显示,吸烟史(HR=3.254,95%CI:1.339~7.908)、TNMⅢ期(HR=2.125,95%CI:1.279~3.531)、未/低分化(HR=2.032,95%CI:1.230~3.356)、癌组织FNDC1表达(HR=2.980,95%CI:1.570~5.657)是肺腺癌进展的危险因素,癌组织ESYT3表达(HR=0.961,95%CI:0.940~0.983)是其保护因素。癌组织ESYT3蛋白表达阳性和阴性患者的无进展生存时间(PFS)分别为51(95%CI:41.594~60.406)和43(95%CI:35.335~50.665)个月,差异有统计学意义,χ^(2)=6.294,P=0.012;癌组织FNDC1蛋白表达阳性和阴性患者PFS分别为39(95%CI:32.350~45.650)和48(95%CI:44.760~51.240)个月,差异有统计学意义,χ^(2)=8.075,P=0.004。结论肺腺癌中ESYT3低表达,FNDC1高表达,两者与吸烟史、TNM分期、淋巴结转移、组织分化程度及胸膜侵袭相关,且是肺腺癌进展的影响因素。