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扩展青霉erg4的生物信息学、亚细胞定位及表达分析
1
作者
韩占红
宗元元
+3 位作者
张学梅
王斌
PRUSKY Dov
毕阳
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期60-70,共11页
麦角甾醇是真菌细胞质膜的特有组分,在真菌生长发育中具有重要作用。erg4是参与麦角甾醇生物合成最后一步反应的基因,但扩展青霉中该基因的功能未知。本文通过RT-PCR方法克隆了扩展青霉3个erg4(erg4A、erg4B和erg4C)基因的CDS全长,对基...
麦角甾醇是真菌细胞质膜的特有组分,在真菌生长发育中具有重要作用。erg4是参与麦角甾醇生物合成最后一步反应的基因,但扩展青霉中该基因的功能未知。本文通过RT-PCR方法克隆了扩展青霉3个erg4(erg4A、erg4B和erg4C)基因的CDS全长,对基因结构、编码蛋白的跨膜螺旋和亲疏水性进行了生物信息学分析,通过融合绿色荧光蛋白定位的方法进行了亚细胞定位,测定了3个基因在不同生长发育阶段、不同培养基状态以及黑暗和蓝光条件下的表达差异。扩展青霉erg4A、eerg4B和erg4C的CDS全长分别为1476 bp、1491 bp和1596 bp,分别编码491、496和531个氨基酸;编码蛋白均属于跨膜蛋白,且表现出疏水性。绿色荧光蛋白与内质网红色荧光探针染色共定位结果显示,Erg4A、Erg4B和Erg4C均定位于内质网。erg4A、erg4B和erg4C在孢子阶段、孢子萌发阶段及成熟菌丝阶段的表达水平存在显著差异,其中,erg4A在3个阶段的表达量无明显变化,而erg4B和erg4C的表达量均显著上调,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4A在CY液体和固体培养条件下的表达量无显著变化,erg4B和erg4C在CY液体培养条件下的表达量显著高于固体培养,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4A和erg4B在蓝光条件下的表达量显著高于黑暗条件,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4C对蓝光条件不敏感。扩展青霉Erg4A、Erg4B和Erg4C均定位于内质网,erg4A、erg4B和erg4C在不同生长发育阶段、固体和液体以及黑暗与蓝光培养条件下的表达存在较大差异,其中,以erg4B的响应最为活跃。
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关键词
扩展青霉erg4
生物信息学分析
亚细胞定位
表达差异
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职称材料
题名
扩展青霉erg4的生物信息学、亚细胞定位及表达分析
1
作者
韩占红
宗元元
张学梅
王斌
PRUSKY Dov
毕阳
机构
甘肃农业大学食品科学与工程学院
Department of Postharvest Science of Fresh Produce
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第12期60-70,共11页
基金
国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目(31861143046)。
文摘
麦角甾醇是真菌细胞质膜的特有组分,在真菌生长发育中具有重要作用。erg4是参与麦角甾醇生物合成最后一步反应的基因,但扩展青霉中该基因的功能未知。本文通过RT-PCR方法克隆了扩展青霉3个erg4(erg4A、erg4B和erg4C)基因的CDS全长,对基因结构、编码蛋白的跨膜螺旋和亲疏水性进行了生物信息学分析,通过融合绿色荧光蛋白定位的方法进行了亚细胞定位,测定了3个基因在不同生长发育阶段、不同培养基状态以及黑暗和蓝光条件下的表达差异。扩展青霉erg4A、eerg4B和erg4C的CDS全长分别为1476 bp、1491 bp和1596 bp,分别编码491、496和531个氨基酸;编码蛋白均属于跨膜蛋白,且表现出疏水性。绿色荧光蛋白与内质网红色荧光探针染色共定位结果显示,Erg4A、Erg4B和Erg4C均定位于内质网。erg4A、erg4B和erg4C在孢子阶段、孢子萌发阶段及成熟菌丝阶段的表达水平存在显著差异,其中,erg4A在3个阶段的表达量无明显变化,而erg4B和erg4C的表达量均显著上调,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4A在CY液体和固体培养条件下的表达量无显著变化,erg4B和erg4C在CY液体培养条件下的表达量显著高于固体培养,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4A和erg4B在蓝光条件下的表达量显著高于黑暗条件,以erg4B的上调幅度最为明显。erg4C对蓝光条件不敏感。扩展青霉Erg4A、Erg4B和Erg4C均定位于内质网,erg4A、erg4B和erg4C在不同生长发育阶段、固体和液体以及黑暗与蓝光培养条件下的表达存在较大差异,其中,以erg4B的响应最为活跃。
关键词
扩展青霉erg4
生物信息学分析
亚细胞定位
表达差异
Keywords
Penicillium expansum
erg
4
bioinformatics analysis
subcellular localization
expression differences
分类号
S432.44 [农业科学—植物病理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
扩展青霉erg4的生物信息学、亚细胞定位及表达分析
韩占红
宗元元
张学梅
王斌
PRUSKY Dov
毕阳
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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