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应用抑制消减杂交技术构建肝癌差异表达基因消减cDNA文库 被引量:13
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作者 李靖 韩本立 +5 位作者 黄桂君 钱桂生 徐晓霞 杨彤翰 梁平 陈杰 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期698-701,共4页
目的 构建肝癌及癌旁肝组织差异表达基因的消减cDNA文库。方法 采用新近建立的抑制消减杂交方法 ,以肝癌组织及癌旁肝组织作为对比材料 ,分离肝癌组织中差异表达基因的cDNA片段 ,将其与T载体进行T/A连接构建文库 ,将连接产物用电穿孔... 目的 构建肝癌及癌旁肝组织差异表达基因的消减cDNA文库。方法 采用新近建立的抑制消减杂交方法 ,以肝癌组织及癌旁肝组织作为对比材料 ,分离肝癌组织中差异表达基因的cDNA片段 ,将其与T载体进行T/A连接构建文库 ,将连接产物用电穿孔法转化大肠杆菌进行文库扩增后 ,随机挑取 1 0 0个白色克隆用菌落PCR进行鉴定。结果 扩增消减cDNA文库获得 30 0 0余个白色阳性克隆 ,随机挑取 1 0 0个白色克隆用PCR进行扩增 ,95%的克隆中均有 1 0 0~ 6 0 0bp的插入片段 ,这些片段可能是肝癌差异表达基因的cDNA片段。结论 用SSH法及T/A克隆技术成功构建了肝癌与癌旁肝组织差异表达基因消减cDNA文库 ,该消减cDNA文库的建立为进一步筛选、克隆肝癌差异表达的新基因奠定了基础。 展开更多
关键词 肝肿瘤 抑制杂交 基因文库 cdna
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cDNA文库的差异筛选与抑制性减数杂交相结合分离胡萝卜体细胞胚根发育相关基因 被引量:11
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作者 张雷 杨志攀 +2 位作者 刘一鸣 黄美娟 吴乃虎 《自然科学进展》 北大核心 2002年第3期261-265,共5页
应用cDNA文库差异筛选与抑制性减数杂交相结合的技术程序,并通过反向Northern分析进一步验证,成功地从解调控12 h的胡萝卜体细胞胚的cDNA文库中,分离到7个在解调控12h特异表达的基因.其中4个含有完整的编码框,分别编码木质葡聚糖内转糖... 应用cDNA文库差异筛选与抑制性减数杂交相结合的技术程序,并通过反向Northern分析进一步验证,成功地从解调控12 h的胡萝卜体细胞胚的cDNA文库中,分离到7个在解调控12h特异表达的基因.其中4个含有完整的编码框,分别编码木质葡聚糖内转糖基化酶、脂肪酸去饱和酶、一种poly(A)结合蛋白和一种酰基转移酶.另外3个是5'端部分缺失的cDNA基因片段,分别编码三磷酸甘油醛脱氢酶、一种糖蛋白和一种与单链RNA/DNA结合的蛋白.对其中部分基因的Northern分析结果显示,它们的表达量在蔗糖调控下的胡萝卜体细胞胚根发育的不同时期均有显著变化,说明它们都是与胚根发育相关的基因. 展开更多
关键词 cdna文库 胚根发育 胡萝卜体细胞胚 异筛选 抑制杂交 基因克隆 基因分离 基因表达
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重金属镉处理的水稻幼根cDNA抑制差减杂交文库的构建 被引量:3
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作者 张美 袁连玉 +2 位作者 刘勋成 郑枫 段俊 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期90-94,共5页
重金属污染是影响水稻生长和稻米品质的重要因素,其中又以镉(Cadmium,Cd)污染最为严重,然而目前对其分子机制以及解决措施却了解甚少。本研究以水稻品种日本晴为材料,采用0.5 mmol/L镉处理水稻幼根48 h,通过运用结合分子镜像选择(mirror... 重金属污染是影响水稻生长和稻米品质的重要因素,其中又以镉(Cadmium,Cd)污染最为严重,然而目前对其分子机制以及解决措施却了解甚少。本研究以水稻品种日本晴为材料,采用0.5 mmol/L镉处理水稻幼根48 h,通过运用结合分子镜像选择(mirror orientation selection,MOS)技术的抑制差减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)方法,构建cDNA抑制差减杂交文库,并进行microarray筛选,用于分离应答镉胁迫的差异表达基因。揭示水稻应对镉胁迫处理的分子机理,为水稻耐受镉胁迫基因的分离奠定了基础。 展开更多
关键词 抑制杂交 水稻
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应用抑制消减杂交技术构建哮喘病人嗜酸细胞差异表达基因消减cDNA文库 被引量:2
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作者 徐劲松 蔡绍曦 +3 位作者 邹飞 佟万成 万为人 赵海金 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期82-85,共4页
目的构建哮喘病人治疗前后嗜酸细胞差异表达基因的消减cDNA文库。方法采用新近建立的抑制消减杂交方法,哮喘治疗前后的嗜酸细胞为试验和对比材料,分离哮喘病人嗜酸细胞中差异表达基因的cDNA片段,将其与T载体进行T/A连接构建文库,将连... 目的构建哮喘病人治疗前后嗜酸细胞差异表达基因的消减cDNA文库。方法采用新近建立的抑制消减杂交方法,哮喘治疗前后的嗜酸细胞为试验和对比材料,分离哮喘病人嗜酸细胞中差异表达基因的cDNA片段,将其与T载体进行T/A连接构建文库,将连接产物用氯化钙转化法转化大肠杆菌进行文库扩增和蓝白斑筛选,随机挑取100个白色克隆用菌落.PCR进行鉴定。结果扩增消减cDNA文库获得3 000余个白色阳性克隆,随机挑取100个白色克隆用 PCR进行扩增,90%的克隆中均有200-600 bp的插入片段,这些片段可能是哮喘嗜酸细胞差异表达基因的cDNA片段。结论用SSH法及T/A克隆技术成功构建了哮喘病人治疗前后嗜酸细胞差异表达基因消减cDNA文库.该消减 cDNA文库的建立为进一步筛选、克隆哮喘病人嗜酸细胞差异表达的新基因奠定了基础。 展开更多
关键词 哮喘 嗜酸细胞 抑制杂交 基因文库
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细菌攻毒杂色鲍血淋巴细胞抑制性差减杂交文库构建及巨噬细胞表达蛋白cDNA的克隆与差异表达 被引量:4
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作者 任洪林 徐丹丹 +4 位作者 乔琨 蔡灵 黄伟滨 张鼐 王克坚 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1043-1050,共8页
以雌性杂色鲍为对象,以大肠杆菌、副溶血弧菌、溶壁微球菌、表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的混悬液做为攻毒菌,利用抑制性差减杂交(SSH)技术构建细菌攻毒的杂色鲍血淋巴细胞SSHcDNA文库。随机挑取生长菌落110个克隆子,进行菌液PCR鉴定,... 以雌性杂色鲍为对象,以大肠杆菌、副溶血弧菌、溶壁微球菌、表皮葡萄球菌、金黄色葡萄球菌的混悬液做为攻毒菌,利用抑制性差减杂交(SSH)技术构建细菌攻毒的杂色鲍血淋巴细胞SSHcDNA文库。随机挑取生长菌落110个克隆子,进行菌液PCR鉴定,计算文库重组率为98.18%,文库容量为1.37×106pfu。将重组子测序,经BLAST一致性搜索比对分析,有一重组片段含有穿孔素(Perforin)保守结构域,为巨噬细胞表达蛋白(MEP)类穿孔素部分cDNA序列,片段大小为1551bp,连续编码517个氨基酸残基,申请GenBank登录号为EU272049。经半定量PCR和荧光定量PCR差异显示分析,发现在细菌感染状态下MEP基因在血淋巴细胞中存在明显的上调表达现象。 展开更多
关键词 杂色鲍 血淋巴细胞 细菌 抑制杂交 巨噬细胞表达蛋白 类穿孔素 异表达分析
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应用抑制消减杂交技术构建哮喘病人嗜酸细胞差异表达基因消减cDNA文库 被引量:1
6
作者 徐劲松 蔡绍曦 +3 位作者 邹飞 佟万成 万为人 赵海金 《实用医学杂志》 CAS 2004年第8期857-860,共4页
目的 :构建哮喘病人治疗前后嗜酸细胞差异表达基因的消减cDNA文库。方法 :采用新近建立的抑制消减杂交方法 ,哮喘治疗前后的嗜酸细胞为试验和对比材料 ,分离哮喘病人嗜酸细胞中差异表达基因的cDNA片段 ,将其与T载体进行T/A连接构建文库 ... 目的 :构建哮喘病人治疗前后嗜酸细胞差异表达基因的消减cDNA文库。方法 :采用新近建立的抑制消减杂交方法 ,哮喘治疗前后的嗜酸细胞为试验和对比材料 ,分离哮喘病人嗜酸细胞中差异表达基因的cDNA片段 ,将其与T载体进行T/A连接构建文库 ,将连接产物用氯化钙转化法转化大肠杆菌进行文库扩增和蓝白斑筛选 ,随机挑取 10 0个白色克隆用菌落PCR进行鉴定。结果 :扩增消减cDNA文库获得 3 0 0余个白色阳性克隆 ,随机挑取10 0个白色克隆用PCR进行扩增 ,90 %的克隆中均有 2 0 0~ 60 0bp的插入片段 ,这些片段可能是哮喘嗜酸细胞差异表达基因的cDNA片段。结论 :用SSH法及T/A克隆技术成功构建了哮喘病人治疗前后嗜酸细胞差异表达基因消减cDNA文库 ,该消减cDNA文库的建立为进一步筛选。 展开更多
关键词 抑制杂交技术 哮喘 嗜酸细胞 异表达 基因消 eDNA文库 SSH
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应用抑制性差减杂交技术构建铁皮石斛差减cDNA文库的探讨 被引量:5
7
作者 魏小勇 《广州中医药大学学报》 CAS 2005年第4期320-322,326,共4页
[目的]探讨构建铁皮石斛抑制差减文库的方法,为克隆石斛碱生物合成相关功能基因奠定基础。[方法]采用抑制性差减杂交(SSH)技术,分别以4年生和1年生铁皮石斛叶片互补脱氧核糖核酸(cDNA)作为检测子(tester)与驱赶子(driver),将所获得差减c... [目的]探讨构建铁皮石斛抑制差减文库的方法,为克隆石斛碱生物合成相关功能基因奠定基础。[方法]采用抑制性差减杂交(SSH)技术,分别以4年生和1年生铁皮石斛叶片互补脱氧核糖核酸(cDNA)作为检测子(tester)与驱赶子(driver),将所获得差减cDNA片段克隆入质粒表达载体(PointTMXa-1T-Vector),转化大肠杆菌JM109,聚合酶链反应(PCR)扩增鉴定插入片段。[结果]成功地构建了与石斛碱生物合成相关的差减cDNA文库,获得的正、反向差减文库分别含560、220个重组子;插入片段的平均大小为550bp。[结论]所构建的差减cDNA文库适合进一步克隆分析石斛碱相关功能基因研究。 展开更多
关键词 石斛碱/生物合成 cdna文库 抑制杂交 铁皮石斛
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萘胁迫下水稻幼苗抑制差减杂交cDNA文库构建 被引量:1
8
作者 赵胡 《生物学杂志》 CAS CSCD 2008年第3期48-50,共3页
从200mg/№萘胁迫水稻幼苗根系中成功分离和纯化了高纯度的总RNA和mRNA,并以无萘处理为Driver,以200mg/Kg的幼苗为Tester,通过eDNA双链的合成及两次PCR扩增,富集到两组处理中差异表达的大小在200~800bp的eDNA序列,pGEMT的连接... 从200mg/№萘胁迫水稻幼苗根系中成功分离和纯化了高纯度的总RNA和mRNA,并以无萘处理为Driver,以200mg/Kg的幼苗为Tester,通过eDNA双链的合成及两次PCR扩增,富集到两组处理中差异表达的大小在200~800bp的eDNA序列,pGEMT的连接和蓝白斑筛选表明杂交文库滴度和重组率分别达到1.5×10^6pfu/mL和96%,共收集阳性克隆8000个,形成了抑制消减杂交的质粒cDNA文库。随机挑取酶切质粒的电泳分析表明,载体中均有插入片段。高效抑制消减杂交文库的建立为进一步分析基因的差异表达及分离萘胁迫下抗性基因奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 抑制抑制杂交 cdna文库
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森林革蜱半饱血雄蜱抑制消减杂交cDNA文库的构建及差异基因的分析
9
作者 刘琪 王伟琳 +4 位作者 孟庆峰 徐展 崔洁 刘新欣 王伟利 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期274-279,共6页
目的构建森林革蜱(Dermacentor silvarum)半饱血雄蜱抑制消减杂交cDNA文库,分析差异基因。方法以森林革蜱半饱血雄蜱为实验组(tester),未吸血雄蜱为对照组(driver),分别提取总RNA,SMARTER PCR合成双链cDNA,RsaⅠ酶切后连接接头并... 目的构建森林革蜱(Dermacentor silvarum)半饱血雄蜱抑制消减杂交cDNA文库,分析差异基因。方法以森林革蜱半饱血雄蜱为实验组(tester),未吸血雄蜱为对照组(driver),分别提取总RNA,SMARTER PCR合成双链cDNA,RsaⅠ酶切后连接接头并进行抑制消减杂交。巢式PCR扩增杂交产物,经柱纯化后连接至PMD-18T中,转化大肠埃希菌DH5α感受态细胞,进行蓝白斑筛选,并计算文库滴度和重组率。随机挑选阳性克隆,反向Northern杂交(Northern blotting)和RT-PCR法检测抑制消减杂交cDNA文库的消减效率。随机选取差异基因阳性克隆送测序,利用Blastn和Blastx对测序结果进行核酸种类同源性分析和蛋白种类同源性的比对和功能预测。结果电泳结果显示,森林革蜱半饱血雄蜱和未吸血雄蜱的ds cDNA均呈弥散拖影,大小在500bp以上,经RsaⅠ酶切后,大小在100~1000 bp;接头连接效率大于25%。巢式PCR结果显示,消减的ds cDNA呈聚集条带,大小在250~500 bp。构建的森林革蜱半饱血雄蜱抑制消减杂交cDNA文库的滴度为700 000 pfu/ml,重组率为88.5%(239/270)。反向Northern blotting检测结果显示,当以森林革蜱半饱血雄蜱单链cDNA为探针时,消减文库信号较强;以未吸血雄蜱单链cDNA为探针时,消减文库信号较弱。RT-PCR结果显示,随机选取的8个阳性克隆中,有5个在半饱血状态下表达上扬,抑制消减杂交cDNA文库消减效果较好。115个阳性克隆测序得到87个差异表达序列标签(ESTs),大小为200~800 bp。Blastn分析结果显示,87个序列中,与其他蜱基因有同源性的53个,同源性为70%~98%,与库蚊、甲虫和果蝇等其他昆虫基因有同源性的34个,同源性为32%~65%。Blastx预测结果显示,序列中片段表达的蛋白包括参与吸血和血液消化的不同酶类,主要功能为能量代谢、信号传导和转录调节等。结论建立了森林革蜱半饱血雄蜱抑制消减杂交cDNA文库,差异基因的功能预测与蜱的吸血和血液消化等有关。 展开更多
关键词 森林革蜱 抑制杂交 cdna文库 异基因
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应用抑制消减杂交技术构建结核分枝杆菌差异表达基因消减cDNA文库 被引量:4
10
作者 刘艳群 杜先智 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期61-65,共5页
目的:构建结核分枝杆菌H37Rv与H37Ra的差异表达基因消减文库,分离结核分枝杆菌差异表达cDNA片段。方法:利用抑制性消减杂交技术分析结核分枝杆菌强毒株H37Rv和弱毒株H37Ra的基因组mRNA的表达差异,并进行两轮消减杂交和两次PCR,将第二次... 目的:构建结核分枝杆菌H37Rv与H37Ra的差异表达基因消减文库,分离结核分枝杆菌差异表达cDNA片段。方法:利用抑制性消减杂交技术分析结核分枝杆菌强毒株H37Rv和弱毒株H37Ra的基因组mRNA的表达差异,并进行两轮消减杂交和两次PCR,将第二次PCR产物与pGEM-T载体相连,电击转化大肠杆菌E.coliDH5α进行文库扩增和蓝白斑筛选,RT-PCR鉴定差异表达文库。结果:以结核分枝杆菌强毒株H37Rv的cDNA为检测子的正相杂交和以弱毒株H37Ra的cDNA为检测子的反相杂交各自高表达或特异性表达的片段都得到选择性扩增,成功构建了差异表达cDNA文库A库和B库。所长出的菌落中90%为白色克隆,其中单一条带的克隆占75%和80%,片段大小集中在100~800bp之间。结论:利用SSH技术成功构建了结核分枝杆菌强毒株H37Rv和弱毒株H37Ra差异表达基因消减cDNA文库,该消减文库的建立为进一步筛选、克隆这两种菌株之间差异表达的新基因奠定了基础。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 抑制性消杂交 cdna文库
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用抑制差减杂交法分离和克隆梭梭幼苗受渗透胁迫诱导相关基因的cDNA片段 被引量:27
11
作者 郭新红 姜孝成 +3 位作者 潘晓玲 戴玉池 姜维明 陈良碧 《植物生理学报(0257-4829)》 CAS CSCD 2001年第5期401-406,共6页
以Hoagland溶液培养的梭梭幼苗 (H)为对照群体 ,甘露醇处理的梭梭幼苗 (M )为目标群体 ,进行抑制差减杂交。用经过HcDNA差减的McDNA构建了一个含有大约 4 0 0个独立克隆的差减文库 ;采用差减前的HcDNA和McDNA以及正向 /反向差减杂交后的... 以Hoagland溶液培养的梭梭幼苗 (H)为对照群体 ,甘露醇处理的梭梭幼苗 (M )为目标群体 ,进行抑制差减杂交。用经过HcDNA差减的McDNA构建了一个含有大约 4 0 0个独立克隆的差减文库 ;采用差减前的HcDNA和McDNA以及正向 /反向差减杂交后的cDNA为模板标记探针 ,对随机挑取的 10 0个重组质粒进行差示筛选 ,获得了 2 1个阳性候选克隆。从这些阳性候选克隆中随机挑取了 8个进行Northernblot分析 ,证实其中 3个候选克隆代表了在M中特异表达或表达增强的基因 ,序列分析和同源性比较表明它们与逆境胁迫有关 ;而另外 5个候选克隆无Northern杂交信号 。 展开更多
关键词 抑制杂交 梭梭幼苗 渗透胁迫 cdna文库 特异表达
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白粉病菌诱导的小麦抑制差减文库构建与杂交点阵膜制备 被引量:6
12
作者 骆蒙 孔秀英 +2 位作者 霍纳新 徐春晓 贾继增 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期49-53,共5页
以本实验室培育的抗白粉病品系“百农 32 17×Mardler”BC5F4为材料 ,构建了一个白粉病菌诱导的抑制差减杂交cDNA文库。建库过程质量分析表明 ,差减杂交效率较高 ,文库质量较好。文库滴度为 4 .2× 10 9cfu·ml-1;插入片段... 以本实验室培育的抗白粉病品系“百农 32 17×Mardler”BC5F4为材料 ,构建了一个白粉病菌诱导的抑制差减杂交cDNA文库。建库过程质量分析表明 ,差减杂交效率较高 ,文库质量较好。文库滴度为 4 .2× 10 9cfu·ml-1;插入片段平均为 30 0bp左右。挑取文库阳性克隆 96 0个 ,扩增插入片段 ,将其制备成高密度杂交点阵膜。通过探针杂交检测表明 ,本研究制备点阵膜的方法简便可靠 。 展开更多
关键词 小麦 白粉病 抑制杂交 高密度点阵膜 抗病机制 表达序列标签 抑制文库
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用抑制性差减杂交构建新疆Kaposi肉瘤差异表达基因文库 被引量:14
13
作者 李冬妹 杨磊 +6 位作者 仙玲玲 谭晓华 李锋 应康 普雄民 王小波 何玲 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期65-69,共5页
目的:分离卡波氏肉瘤(Kaposi's sarcoma,KS)差异表达基因,并建立相应的cDNA文库,为从分子水平揭示KS发病机制打下良好基础.方法:采集KS肉瘤及来源于同一患者的正常皮肤组织,抽提总RNA,逆转录酶合成dscDNA,经Rsa I酶切,与2种不同的... 目的:分离卡波氏肉瘤(Kaposi's sarcoma,KS)差异表达基因,并建立相应的cDNA文库,为从分子水平揭示KS发病机制打下良好基础.方法:采集KS肉瘤及来源于同一患者的正常皮肤组织,抽提总RNA,逆转录酶合成dscDNA,经Rsa I酶切,与2种不同的接头衔接,分别以正常组织和肿瘤组织作为tester和driver,进行双向抑制性差减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH),初步筛选KS肉瘤与正常皮肤差异表达基因,将差异基因PCR扩增,产物与pGEM-Teasy克隆载体连接,转化DH5α大肠杆菌,采用蓝白斑筛选,获得白色阳性克隆菌落,并煮沸破菌,PCR扩增出未知基因片段.结果:差减得到差异基因片段多位于200~500bp,成功构建了2个分别代表在KS肿瘤组织中表达上调和下调的基因文库.结论:经双向抑制性差减杂交获得了KS差异表达基因文库.抑制性差减杂交是一种快速、方便、有效的建立差异基因文库的方法. 展开更多
关键词 KAPOSI肉瘤 抑制杂交 异基因 基因克隆 异表达基因 基因文库 肉瘤 构建 皮肤组织 PCR扩增
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海蓬子盐胁迫初期抑制消减杂交cDNA文库的构建 被引量:9
14
作者 张大栋 马鸿翔 +4 位作者 吉晓佳 周春霖 王茂文 汤日圣 杨永华 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2006年第2期113-116,共4页
为提高缩叶肉质盐生植物海蓬子总RNA和mRNA的质量,将改良CTAB法与Tripure试剂盒方法相结合,从300mg海蓬子发芽后20d的幼苗中成功分离和纯化了高纯度的总RNA和mRNA。并以无NaCl处理为Driver,以200mmol/LNaCl处理24h、48h、72h的幼苗... 为提高缩叶肉质盐生植物海蓬子总RNA和mRNA的质量,将改良CTAB法与Tripure试剂盒方法相结合,从300mg海蓬子发芽后20d的幼苗中成功分离和纯化了高纯度的总RNA和mRNA。并以无NaCl处理为Driver,以200mmol/LNaCl处理24h、48h、72h的幼苗为Tester,通过cDNA双链的合成及两次PCR扩增,富集到两组处理中差异表达的大小在200~1300bp的cDNA序列,pGEM-T的连接和蓝白斑筛选表明杂交文库滴度和重组率分别达到2,6×10^7和96%,共收集阳性克隆12000个,形成了抑制消减杂交的质粒cDNA文库。随机挑取酶切质粒的电泳分析表明,载体中均有插入片段。两种RNA提取方法的结合有效提高了多汁多色素海蓬子RNA的质量,高效抑制消减杂交文库的建立为进一步分析基因的差异表达及分离抗盐基因奠定了基础。 展开更多
关键词 盐生植物海蓬子 抑制抑制杂交 cdna文库 RNA分离
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叶锈菌诱导的小麦叶片抑制差减杂交文库构建及其分析 被引量:13
15
作者 李星 于秀梅 +4 位作者 李亚宁 张立荣 刘大群 杨文香 张汀 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第12期4069-4076,共8页
【目的】研究叶锈菌诱导小麦叶片的基因表达情况,从分子水平阐明小麦的抗病机制。【方法】以小麦抗叶锈病近等基因系TcLr41为材料,利用抑制差减杂交技术,构建叶锈菌诱导的小麦叶片cDNA文库,随机挑取文库中的阳性克隆测序,并对测序结果... 【目的】研究叶锈菌诱导小麦叶片的基因表达情况,从分子水平阐明小麦的抗病机制。【方法】以小麦抗叶锈病近等基因系TcLr41为材料,利用抑制差减杂交技术,构建叶锈菌诱导的小麦叶片cDNA文库,随机挑取文库中的阳性克隆测序,并对测序结果进行功能注释和分类。【结果】成功构建了叶锈菌诱导的小麦叶片抑制差减杂交文库,共获得3 456个阳性克隆。挑取165个阳性克隆进行测序,获得160条高质量EST。对EST序列进行聚类后,共获得107条非重复序列(Unigene),与GenBank进行BLASTx和BLASTn同源比对,其中70条非重复序列与已知基因同源性很高,占全部非重复序列的65.4%。已知功能的EST涉及植物的能量代谢、信号转导、转录调控及抗病防卫等多方面。【结论】通过对功能已知的基因分析,推测促分裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinase)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(serine/threonine protein kinase)、GTP结合蛋白(GTP-binding protein)、钙网蛋白(calreticulin)、过氧化氢酶(catalase)、谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione-S-transferase)、多聚泛素基因(polyubiquitin)、锌指蛋白(zinc-finger protein)、肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase)、转脂蛋白(lipid transfer protein)、类甜蛋白(thaumatin-like)、几丁质酶(chitinase)等可能参与了小麦与叶锈菌的非亲和互作过程。 展开更多
关键词 小麦 叶锈菌 抑制杂交 表达序列标签
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条锈菌诱导的小麦抑制差减杂交文库构建及其表达序列标签研究 被引量:24
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作者 于秀梅 喻修道 +4 位作者 屈志鹏 韩青梅 郭军 黄丽丽 康振生 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期50-55,共6页
利用抑制差减杂交技术构建了条锈菌(Puccinia striiformis)诱导的小麦叶片cDNA文库。文库质量检测表明:差减杂交效率较高,质量较好。用DNAStar5.0对172条高质量的ESTs进行聚类,共获得120个contigs。对功能已知的contigs分类,能量和初级... 利用抑制差减杂交技术构建了条锈菌(Puccinia striiformis)诱导的小麦叶片cDNA文库。文库质量检测表明:差减杂交效率较高,质量较好。用DNAStar5.0对172条高质量的ESTs进行聚类,共获得120个contigs。对功能已知的contigs分类,能量和初级代谢类占32.5%,其中与光合作用相关的基因出现频率最高;参与膜及转运、抗病与防御的基因分别位于第二、三位;次生代谢、蛋白质合成加工和细胞结构建成的基因较少。通过分析抗病相关基因,初步推测HR和SAR可能为小麦抗条锈病过程中的2种抗性形式。最后利用RT-PCR对4条感兴趣基因进行分析,明确其在抗病过程中的表达模式。 展开更多
关键词 小麦 条锈菌 抑制杂交(SSH) 表达序列标签(ESTs) 反转录PCR(RT-PCR)
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应用抑制性消减杂交技术构建人肝癌组织特异表达cDNA文库 被引量:4
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作者 王顺启 冯占宁 +6 位作者 刘国红 王广良 程华 王同顺 倪虹 宋文芹 陈力 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期115-118,共4页
为克隆和筛选肝癌特异表达基因.应用抑制消减杂交技术对肝癌及癌旁组织进行消减杂交,产物PCR扩增后,进行克隆.共得到1820个克隆,1776个克隆有100~800 bp的插入片断,阳性率达98%,说明人肝癌组织特异表达cDNA消减文库构建成功,同时我们对... 为克隆和筛选肝癌特异表达基因.应用抑制消减杂交技术对肝癌及癌旁组织进行消减杂交,产物PCR扩增后,进行克隆.共得到1820个克隆,1776个克隆有100~800 bp的插入片断,阳性率达98%,说明人肝癌组织特异表达cDNA消减文库构建成功,同时我们对cDNA克隆进行测序,证明这些克隆的功能是和肝癌的发生高度相关的.抑制消减杂交是克隆特异表达基因的有效方法. 展开更多
关键词 抑制杂交 肝癌 基因文库 cdna克隆
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抑制性消减杂交构建奶牛乳房炎抗性相关cDNA文库 被引量:20
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作者 曹随忠 李宏滨 +2 位作者 王爱华 赵兴绪 杜立新 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期526-530,共5页
以经产荷斯坦奶牛外周血白细胞为材料,分离Poly(A)+ RNA,反转录合成单链及双链cDNA,经酶切成平均大小为400~600 bp的片段,将患乳房炎奶牛cDNA分成2组,分别与2种不同的接头连接,再与健康奶牛cDNA进行2次消减杂交和2次抑制性PCR扩增,将第... 以经产荷斯坦奶牛外周血白细胞为材料,分离Poly(A)+ RNA,反转录合成单链及双链cDNA,经酶切成平均大小为400~600 bp的片段,将患乳房炎奶牛cDNA分成2组,分别与2种不同的接头连接,再与健康奶牛cDNA进行2次消减杂交和2次抑制性PCR扩增,将第2次PCR产物与pGEM-T载体连接,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞进行文库扩增,构建了具有高消减效率的奶牛乳房炎抗性相关cDNA文库.文库扩增后得到610个白色阳性克隆,随机挑选克隆进行PCR鉴定,插入片段主要分布在250~750 bp 之间.文库的成功构建为进一步筛选、克隆与奶牛乳房炎抗性相关的基因奠定了基础,对研究奶牛乳房炎抗性的分子机制以及乳房炎的综合防制具有重要意义. 展开更多
关键词 奶牛乳房炎 cdna文库 抑制性消杂交 抗性 相关 构建 pGEM-T载体 荷斯坦奶牛 PCR扩增 PCR产物 感受态细胞 TOP10 PCR鉴定 接头连接 大肠杆菌 阳性克隆 综合防制 分子机制 白细胞 外周血 RNA 反转录 600 610 片段 酶切
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用抑制差减杂交法分离小麦幼苗水分胁迫诱导表达的cDNA 被引量:13
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作者 王转 贾晋平 景蕊莲 《生物技术通报》 CAS CSCD 2003年第5期36-39,共4页
小麦种子水培 ,幼苗长至一叶一心后 ,在 2 0℃生长箱中水培 4 8h作为对照组 (Driver) ,PEG 6 0 0 0水溶液胁迫培养 4 8h作为处理组 (Tester)。进行抑制差减杂交 ,构建包含 15 0 0个独立克隆的SSH文库。以正向和反向差减杂交后的cDNA为探... 小麦种子水培 ,幼苗长至一叶一心后 ,在 2 0℃生长箱中水培 4 8h作为对照组 (Driver) ,PEG 6 0 0 0水溶液胁迫培养 4 8h作为处理组 (Tester)。进行抑制差减杂交 ,构建包含 15 0 0个独立克隆的SSH文库。以正向和反向差减杂交后的cDNA为探针 ,筛选SSH文库 ,得到 181个阳性克隆 ,测序后获不重复EST 10 1个。 展开更多
关键词 杂交 小麦 幼苗 水分胁迫 诱导表达 cdna
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牦牛外周血单个核细胞抑制消减cDNA文库的构建及部分差异表达分子的克隆分析 被引量:3
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作者 何延华 景志忠 +5 位作者 陈国华 房永祥 蒙学莲 李小庆 段风云 王生富 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第8期631-636,共6页
为筛选牦牛外周血单核细胞(PBMC)差异性基因,以刀豆素A(ConA)和脂多糖(LPS)联合刺激的PBMC cDNA为实验组,未经诱导刺激的PBMC cDNA为驱动组,利用抑制性消减杂交技术(SSH)构建了丝裂原诱导刺激PBMC的消减文库并对其部分阳性克隆进行了ES... 为筛选牦牛外周血单核细胞(PBMC)差异性基因,以刀豆素A(ConA)和脂多糖(LPS)联合刺激的PBMC cDNA为实验组,未经诱导刺激的PBMC cDNA为驱动组,利用抑制性消减杂交技术(SSH)构建了丝裂原诱导刺激PBMC的消减文库并对其部分阳性克隆进行了EST序列分析。从消减文库中随机挑取16个阳性克隆,进行PCR鉴定,显示克隆的重组率大于93%,插入片段大小大部分集中在200bp~1000bp之间。随机挑取100个克隆进行测序及同源性分析,初步获得27条差异表达基因片段,其中24个为已知基因,3个为新ESTs序列;随机选择非重复的6个差异表达的序列设计引物,以半定量PCR方法验证其消减效率。结果显示,均从构建的消减文库中扩增到目的片段,其中5个为诱导性差异表达分子,1个为诱导特异性表达分子,说明该文库有较高的质量。本研究应用抑制消减杂交技术构建了牦牛PBMC的差异表达cDNA文库,并高通量克隆鉴定了相关功能基因片段,表明该技术手段有助于快速发现牦牛新功能基因。 展开更多
关键词 外周血单个核细胞(PBMC) 诱导刺激 抑制杂交 cdna文库
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