上海人群抗原处理相关基因的分布及其与原发性IgA肾炎关联研究

采用PCR SSO和PCR RFLP技术对 6 0例经临床及肾穿刺证实的IgA肾炎 (IgAN )患者和 80例正常人的TAP、LMP2和DM等位基因频率进行了检测。结果显示在患者和正常人中各等位基因频率均无显著性差异 ,表明IgAN与抗原处理相关基因无关联。同时分析了经典Ⅱ类基因 (DR/DQ/DP )和抗原处理相关基因 (TAP/LMP2 /DM )之间可能存在的连锁不平衡 ,获得了扩展的HLAⅡ类单倍型 。

抗原处理相关运载体等位基因与I型糖尿病的关联研究

目的 :探讨抗原处理相关运载体 (transporterassociatedwithantigenprocessing ,TAP)等位基因与I型糖尿病 (DM1)的关联性。方法 :用聚合酶链反应 序列特异性寡核苷酸探针杂交技术 ,对 5 2例DM1患者及 6 1例正常对照人群进行TAP1、TAP2等位基因变异位点氨基酸表型频率分析。结果 :DM1患者TAP1333位Ile Ile、6 37位Asp Asp、TAP2 379位Val Val纯合子表型频率显著低于对照 (P <0 0 0 5 ) ,DM1患者TAP1333位Ile Val、6 37位Asp Gly、TAP2 379位Ile Val杂合子表型频率明显高于对照 (P <0 0 0 5 )。TAP基因的其它变异位点氨基酸表型频率在DM1患者与正常对照组之间的差异无显著性意义。结论 :TAP1333位Ile Ile、6 37位Asp Asp、TAP2 379位Val Val纯合子表型可能是DM1的保护基因。TAP1333位Ile Val、6 37位Asp Gly、TAP2 379位Ile

LMP7、TAP2基因多态性与云南汉族非小细胞肺癌的相关性

目的:探讨低相对分子量蛋白酶体7基因(LMP 7)及抗原处理相关转运体2基因(TAP 2)中的单核苷酸多态性(SNP)与云南汉族人群非小细胞肺癌的相关性。方法:选取云南汉族非小细胞肺癌患者467例作为病例组、同期健康正常人群488例作为对照组,采用Taq Man探针基因分型方法对TAP2基因的SNP位点rs241447及LMP7基因的SNP位点rs2071543进行基因分型,分析rs241447和rs2071543等位基因和基因型在病例组和对照组间的分布差异,分析这两个SNP位点在肺癌不同临床分期的中分布差异。结果:rs241447在对照组和病例组中基因型的分布频率比较,差异有统计学意义(P=0.015);在超显性遗传模式下,rs241447基因型C/C-T/T可能是云南汉族人群非小细胞肺癌的风险因素(OR=1.38,95%CI为1.07~1.78,P=0.014),rs2071543的等位基因和基因型在对照组和病例组中的分布频率比较差异无统计学意义(P>0.05)。结论:TAP2基因中的SNP位点rs241447可能与云南汉族人群非小细胞肺癌的易感性相关。

抗原处理相关转运体等位基因与HLA-B27检测呈阳性的强直性脊柱炎的相关研究

目的 探讨汉族人群抗原处理相关转运体 (transporter associated with antigen processing,TAP)等位基因与 HL A- B2 7及强直性脊柱炎 (ankylosing spondylitis,AS)的相关性。方法 用聚合酶链反应 -序列特异性寡核苷酸探针杂交技术 ,对 48例 AS患者 (B2 7+ )及 12 3名正常对照人群 (B2 7+ 2 7名、B2 7-96名 )进行 TAP1、TAP2等位基因分型及变异位点氨基酸表型频率分析。结果 汉族人群 TAP1表现型主要为 Ile/Ile和 Asp/Asp,而 TAP2则以 Val/Val、Ala/Thr和 Stop/Stop占优势。 TAP1和 TAP2至少各有4种等位基因型 ,分别为 TAP1*0 10 1、TAP1*0 2 0 1、TAP1*0 30 1、TAP1*0 40 1和 TAP2 *0 10 1、TAP2 *0 10 2、TAP2 *0 2 0 1、TAP2 *0 2 0 2。研究对象中有 9.9% (17/171) TAP1探针无法定型 ,15 .8% (2 7/171)TAP2无法定型 ,呈杂交空白。病例组与对照组间 TAP等位基因型分布无差异 (P>0 .0 5 )。AS(B2 7+ )患者TAP1333位纯合子 Val/Val表型频率显著低于正常对照 (B2 7+ ) (P<0 .0 5 )。正常对照 (B2 7+ ) TAP2 6 6 5位纯合子 Ala/Ala表型频率显著高于正常对照 (B2 7- ) (P<0 .0 5 ) ,而正常对照 (B2 7+ ) TAP2 6 6 5位杂合子Ala/Thr表型频率则显著低于正常对照 (B2 7- ) (P<0 .0 5 )。

上海人群中TAP、LMP和HLA-DM基因多态性研究

调查上海人群中抗原处理相关基因TAP、LMP和HLA-DM的分布情况,并探索这些基因与自身免疫病类风湿关节炎(RA)、IgA肾炎(IgAN)和多发性硬化症(MS)的可能关联。应用PCR-SSO或PCR-RFLP技术对80名无血缘关系的上海地区正常人及156名RA患者、60名IgAN患者和21名MS患者作了TAP1、TAP2、LMP2、HLA-DMA和HLA-DMB基因分型。并作了两位点连锁不平衡分析。在该群体中,(1)共观察到4个TAP1、6个TAP2、2个LMP2、4个HLA-DMA和4个HLA-DMB等位基因;(2)在TAP1B-TAP2A、TAP1B-LMP2H和TAP2D-DMA*0101存在连锁不平衡(Pc<0.05);(3)本人群中IgAN和MS的遗传易感性与抗原处理相关基因无关,而RA患者中DMB*0101基因频率降低(P<0.01),TAP1C和DMB*0104等位基因频率显著升高(P<0.01)。比较分析表明,上海人群中抗原处理相关基因多态性与国外其他人种中的报道相似,本人群中IgAN和MS与抗原处理相关基因不关联,而TAP1C和DMB*0104等位基因可能是RA的遗传易感基因。

抗原处理相关转运体基因1基因codon 637 Asp/Gly多态性与慢性乙型肝炎相关性研究

目的探讨抗原处理相关转运体基因1（transporter associated with antigen processing1，TAP1）codon637多态性与慢性乙型肝炎（chronichepatitisB，CHB）的关系。方法142例CHB患者（CHB组）和150例体检健康者（对照组），2组采用PCR-限制性片段长度多态性法对TAP1-codon637Asp／Gly单核苷酸多态性进行基因分型，以谷丙转氨酶（glutamic-pyruvictransaminase，GPT）、谷草转氨酶（glutamic-oxaloacetictransaminase，GOT）、总胆红素、γ-谷氨酰转肽酶、白蛋白、乙型肝炎E抗原、乙型肝炎病毒（hepatitisBvirus，HBV）-DNA及其病毒载量、外膜大蛋白、前s1抗原为检测指标。结果CHB组GPT[（72．7l±16．64）u／L]、GOT[（65．82±9．56）u／L]水平明显高于对照组[GPT为（31．07±10．25）u／L，GOT为（29．06±7．43）u／L3（P〈0．05）；CHB组TAPl-637位点Asp／Asp基因型分布频率（45．07％）低于对照组（68．67％），Asp／Gly、Gly／Gly基因型分布频率（47．18％、7．75％）高于对照组（28．00％、3．33％）（P〈0．05）；与Asp／Asp基因型患者相比，Asp／Gly和Gly／Gly基因型患者发生CHB的风险分别增加2．567倍（95％CI：1．563-4．216，P=0．000）和3．541倍（95％CI：1．176-10．660，P=0．018）；CHB组Gly等位基因频率为31．34％，对照组为17．33％，Gly等位基因可增加CHB患病风险（OR=2．671，95％CI：1．656-4．307，P=0．000）；TAP1—637位点Gly等位基因与HBV—DNA阳性率相关（OR=1．854，95％CI：1．049-3．277，P=0．032）；HBV—DNA病毒载量在104-107copies／mL时，Asp等位基因分布频率和Gly等位基因比较差异有统计学意义（P〈0．05）。结论TAP1—637位点Asp／Gly单核苷酸多态性与CHB患病风险相关，且等位基因Gly可能是HBV感染的易感基因。