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低温胁迫下鹅掌楸抗寒性相关基因的差异表达分析
被引量:
8
1
作者
陆畅
李斌
郑勇奇
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期25-31,共7页
对4℃和-30℃低温条件下引种自安徽大别山的1株鹅掌楸〔Liriodendron chinense(Hemsl.)Sarg.〕植株顶芽总RNA进行了数字基因表达谱构建和差异表达基因筛选,并对筛选出的抗寒性相关基因进行了实时荧光定量PCR分析。结果表明:获得的总...
对4℃和-30℃低温条件下引种自安徽大别山的1株鹅掌楸〔Liriodendron chinense(Hemsl.)Sarg.〕植株顶芽总RNA进行了数字基因表达谱构建和差异表达基因筛选,并对筛选出的抗寒性相关基因进行了实时荧光定量PCR分析。结果表明:获得的总RNA样品质量符合实验要求。数字基因表达谱分析结果表明:每个样品的质量控制后序列的总长度均在0.5 Gbp以上,碱基错误率为0.01%,Q20值超过99%,Q30值为96.99%~97.23%,GC含量为44.97%~47.06%,并且每个样品比对成功的序列条数占质量控制后序列总数的百分率均在90%以上。差异表达基因筛选结果显示:共发现9个与鹅掌楸抗寒性有关的差异表达基因,分别为HSP、MYB、NAC、AP2、Zinc finger、WRKY、FAD、Phospholipase和β-amylase基因。实时荧光定量PCR分析结果表明这9个基因共有3种表达模式,其中,HSP和FAD基因的相对表达量均随着温度的降低而减少,表现为基因下调表达;AP2、NAC和Zinc finger基因的相对表达量随着温度的降低而增多,表现为基因上调表达;而β-amylase、WRKY、Phospholipase和MYB基因的相对表达量则表现为4℃时增加、-30℃时减少。从基因的相对表达量来看,最大相对表达量超过5的基因有NAC和WRKY,介于2~5之间的基因有AP2、Zinc finger、β-amylase和MYB,低于2的基因有Phospholipase、HSP和FAD。结果显示NAC和WRKY基因可能在鹅掌楸的抗寒过程中起主要作用。
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关键词
鹅掌楸
低温胁迫
抗寒
性
相关
基因
数字
基因
表达谱
差异表达
基因
相对表达量
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职称材料
香蕉寒害研究现状及展望
被引量:
17
2
作者
王安邦
金志强
+4 位作者
刘菊华
贾彩红
张建斌
苗红霞
徐碧玉
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期28-33,共6页
我国绝大部分香蕉种植区域属于香蕉非最适宜种植区,容易受到冬春寒流的侵袭而造成重大经济损失。寒害已成为制约我国香蕉产业健康发展的主要灾害之一。对香蕉寒害症状和类型、香蕉抗寒生理生化研究、防寒措施、抗寒相关基因的挖掘等方...
我国绝大部分香蕉种植区域属于香蕉非最适宜种植区,容易受到冬春寒流的侵袭而造成重大经济损失。寒害已成为制约我国香蕉产业健康发展的主要灾害之一。对香蕉寒害症状和类型、香蕉抗寒生理生化研究、防寒措施、抗寒相关基因的挖掘等方面进行了综述,简述了香蕉寒害研究存在的问题和发展现状,以期对香蕉寒害的基础研究及生产应用提供参考。
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关键词
香蕉
寒害
防寒措施
抗寒相关基因
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职称材料
题名
低温胁迫下鹅掌楸抗寒性相关基因的差异表达分析
被引量:
8
1
作者
陆畅
李斌
郑勇奇
机构
国家林木遗传育种重点实验室中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室
出处
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期25-31,共7页
基金
"十二五"国家科技支撑计划项目(2013BAD01B06)
文摘
对4℃和-30℃低温条件下引种自安徽大别山的1株鹅掌楸〔Liriodendron chinense(Hemsl.)Sarg.〕植株顶芽总RNA进行了数字基因表达谱构建和差异表达基因筛选,并对筛选出的抗寒性相关基因进行了实时荧光定量PCR分析。结果表明:获得的总RNA样品质量符合实验要求。数字基因表达谱分析结果表明:每个样品的质量控制后序列的总长度均在0.5 Gbp以上,碱基错误率为0.01%,Q20值超过99%,Q30值为96.99%~97.23%,GC含量为44.97%~47.06%,并且每个样品比对成功的序列条数占质量控制后序列总数的百分率均在90%以上。差异表达基因筛选结果显示:共发现9个与鹅掌楸抗寒性有关的差异表达基因,分别为HSP、MYB、NAC、AP2、Zinc finger、WRKY、FAD、Phospholipase和β-amylase基因。实时荧光定量PCR分析结果表明这9个基因共有3种表达模式,其中,HSP和FAD基因的相对表达量均随着温度的降低而减少,表现为基因下调表达;AP2、NAC和Zinc finger基因的相对表达量随着温度的降低而增多,表现为基因上调表达;而β-amylase、WRKY、Phospholipase和MYB基因的相对表达量则表现为4℃时增加、-30℃时减少。从基因的相对表达量来看,最大相对表达量超过5的基因有NAC和WRKY,介于2~5之间的基因有AP2、Zinc finger、β-amylase和MYB,低于2的基因有Phospholipase、HSP和FAD。结果显示NAC和WRKY基因可能在鹅掌楸的抗寒过程中起主要作用。
关键词
鹅掌楸
低温胁迫
抗寒
性
相关
基因
数字
基因
表达谱
差异表达
基因
相对表达量
Keywords
Liriodendron chinense (Hemsl.) Sarg.
low temperature stress
cold resistance related gene
digital gene expression profile
differential expression gene
relative expression
分类号
Q948.112.2 [生物学—植物学]
Q946-33 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
香蕉寒害研究现状及展望
被引量:
17
2
作者
王安邦
金志强
刘菊华
贾彩红
张建斌
苗红霞
徐碧玉
机构
中国热带农业科学院海口实验站香蕉研究所
中国热带农业科学院热带生物技术研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第8期28-33,共6页
基金
国家现代香蕉产业技术体系(CARS-32)
“十二五”农村领域国家科技计划课题(2011AA10020605)
文摘
我国绝大部分香蕉种植区域属于香蕉非最适宜种植区,容易受到冬春寒流的侵袭而造成重大经济损失。寒害已成为制约我国香蕉产业健康发展的主要灾害之一。对香蕉寒害症状和类型、香蕉抗寒生理生化研究、防寒措施、抗寒相关基因的挖掘等方面进行了综述,简述了香蕉寒害研究存在的问题和发展现状,以期对香蕉寒害的基础研究及生产应用提供参考。
关键词
香蕉
寒害
防寒措施
抗寒相关基因
Keywords
Banana
Chilling stress
Chilling-resistant measures
Chilling-resistant related genes
分类号
S668.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
低温胁迫下鹅掌楸抗寒性相关基因的差异表达分析
陆畅
李斌
郑勇奇
《植物资源与环境学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
8
下载PDF
职称材料
2
香蕉寒害研究现状及展望
王安邦
金志强
刘菊华
贾彩红
张建斌
苗红霞
徐碧玉
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
17
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职称材料
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