普通菜豆镰孢菌枯萎病抗性种质资源筛选及全基因组关联分析

普通菜豆镰孢菌枯萎病是严重制约菜豆(Phaseolus vulgaris)产量的主要病害之一。采用下胚轴双孔注射法对601份普通菜豆种质资源进行枯萎病抗性鉴定,共筛选出4份高抗材料。在此基础上,基于分布在全基因组上的3765456个单核苷酸多态性(SNP)标记,进行全基因组关联分析,以P<1×10^(–5)为阈值。结果检测到57个显著关联的SNP位点,分布于1、2、6、8和11号染色体上;共获得8个显著关联区域,其中位于1号染色体上的区域1包含SNP最多(48个),最显著SNP P值为2.18E–07。在8个显著关联区域中,共检测到186个基因,其中157个基因有注释信息,编码过氧化物酶、抗病蛋白、转录因子和蛋白激酶等。结合KEGG富集分析和序列同源性比对,鉴定出9个候选基因可能与抗性相关。