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抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点相关神经细胞类型及相互作用网络分析
1
作者
赵弘毅
丁伟健
+3 位作者
冯飞翔
宋文正
刘书齐
高蕾
《生物信息学》
2024年第2期124-133,共10页
基于抑郁症的全基因组关联分析研究(GWAS),对于获得的单核苷酸多态性位点(SNP)使用Haploreg软件进行基因注释,得到SNP注释的102个易感基因.。使用MAGMA软件对GWAS的汇总统计数据做基因水平的分析,获得了270个校正之后显著的基因,两者合...
基于抑郁症的全基因组关联分析研究(GWAS),对于获得的单核苷酸多态性位点(SNP)使用Haploreg软件进行基因注释,得到SNP注释的102个易感基因.。使用MAGMA软件对GWAS的汇总统计数据做基因水平的分析,获得了270个校正之后显著的基因,两者合并共得到320个抑郁症易感基因。通过药物数据库Drugbank获取133个抗抑郁药物靶点基因。使用EWCE包对抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点在三套脑组织单细胞测序数据中,分别进行神经细胞类型富集分析。结果发现大脑皮质的GABA神经元(抑制性神经元)和谷氨酸能神经元(兴奋性神经元)是抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点共同的神经元。这两种类型的神经细胞可能是抗抑郁药物与抑郁症易感基因相互作用的神经细胞,另外少突胶质前体细胞可能是抑郁症特有的易感神经细胞。使用Network Calculator软件构建网络并进行进行网络拓扑学参数分析。结果表明抑郁症易感基因与抗抑郁药物靶点组成了一个具有显著的相互连接的网络。本研究从单细胞层面揭示抑郁症的遗传机制,在网络层面为寻找新的抗抑郁药物靶点提供了一定的启示。
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关键词
单细胞测序
抑郁
症易感基因
抗抑郁
药物
靶
点
神经细胞
相互作用网络
原文传递
抑郁症中的免疫代谢调控异常与药物干预研究进展
被引量:
12
2
作者
郑啸
王广基
郝海平
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期19-25,共7页
针对单胺类神经递质失衡的经典抗抑郁治疗方案有着较大的局限性。近年来,临床和动物实验不断揭示炎症免疫机制与抑郁症的发生、发展密切相关。随着神经-免疫-代谢互动研究的深入,免疫代谢异常驱动的神经炎症反应和病变已成为抑郁病理机...
针对单胺类神经递质失衡的经典抗抑郁治疗方案有着较大的局限性。近年来,临床和动物实验不断揭示炎症免疫机制与抑郁症的发生、发展密切相关。随着神经-免疫-代谢互动研究的深入,免疫代谢异常驱动的神经炎症反应和病变已成为抑郁病理机制和药物干预研究的重要方向。本文在阐述抑郁症病理网络中免疫代谢失调环节的基础上,总结抗抑郁活性化合物免疫代谢调控的新作用,并探讨以上研究进展对于抗抑郁症药物研发策略和临床治疗的启示。
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关键词
抑郁
症
免疫代谢调控异常
中枢外周互动
抗抑郁靶点
原文传递
题名
抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点相关神经细胞类型及相互作用网络分析
1
作者
赵弘毅
丁伟健
冯飞翔
宋文正
刘书齐
高蕾
机构
山东第一医科大学(山东省医学科学院)生命科学学院生物信息系
出处
《生物信息学》
2024年第2期124-133,共10页
基金
山东省大学生创新创业训练计划项目(No.S202010439097)
山东省医药卫生科技发展计划项目(No.2019WS391)
山东省自然科学基金项目(No.ZR2020MC061)。
文摘
基于抑郁症的全基因组关联分析研究(GWAS),对于获得的单核苷酸多态性位点(SNP)使用Haploreg软件进行基因注释,得到SNP注释的102个易感基因.。使用MAGMA软件对GWAS的汇总统计数据做基因水平的分析,获得了270个校正之后显著的基因,两者合并共得到320个抑郁症易感基因。通过药物数据库Drugbank获取133个抗抑郁药物靶点基因。使用EWCE包对抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点在三套脑组织单细胞测序数据中,分别进行神经细胞类型富集分析。结果发现大脑皮质的GABA神经元(抑制性神经元)和谷氨酸能神经元(兴奋性神经元)是抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点共同的神经元。这两种类型的神经细胞可能是抗抑郁药物与抑郁症易感基因相互作用的神经细胞,另外少突胶质前体细胞可能是抑郁症特有的易感神经细胞。使用Network Calculator软件构建网络并进行进行网络拓扑学参数分析。结果表明抑郁症易感基因与抗抑郁药物靶点组成了一个具有显著的相互连接的网络。本研究从单细胞层面揭示抑郁症的遗传机制,在网络层面为寻找新的抗抑郁药物靶点提供了一定的启示。
关键词
单细胞测序
抑郁
症易感基因
抗抑郁
药物
靶
点
神经细胞
相互作用网络
Keywords
Single⁃cell RNA sequencing
Susceptibility genes of depressive disorder
Antidepressant drug targets
Neuronal cell
Interaction network
分类号
Q3 [生物学—遗传学]
R74 [医药卫生—神经病学与精神病学]
原文传递
题名
抑郁症中的免疫代谢调控异常与药物干预研究进展
被引量:
12
2
作者
郑啸
王广基
郝海平
机构
中国药科大学药物代谢动力学重点实验室
出处
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期19-25,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(81325025
81503142)
文摘
针对单胺类神经递质失衡的经典抗抑郁治疗方案有着较大的局限性。近年来,临床和动物实验不断揭示炎症免疫机制与抑郁症的发生、发展密切相关。随着神经-免疫-代谢互动研究的深入,免疫代谢异常驱动的神经炎症反应和病变已成为抑郁病理机制和药物干预研究的重要方向。本文在阐述抑郁症病理网络中免疫代谢失调环节的基础上,总结抗抑郁活性化合物免疫代谢调控的新作用,并探讨以上研究进展对于抗抑郁症药物研发策略和临床治疗的启示。
关键词
抑郁
症
免疫代谢调控异常
中枢外周互动
抗抑郁靶点
Keywords
major depressive disorder
immunometabolic dysregulation
brain-periphery crosstalk
antidepressant target
分类号
R943 [医药卫生—药剂学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点相关神经细胞类型及相互作用网络分析
赵弘毅
丁伟健
冯飞翔
宋文正
刘书齐
高蕾
《生物信息学》
2024
0
原文传递
2
抑郁症中的免疫代谢调控异常与药物干预研究进展
郑啸
王广基
郝海平
《药学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
12
原文传递
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参考文献
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