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香蕉中抗病基因相似序列的克隆与分析
1
作者
阮小蕾
李华平
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期273-276,共4页
根据植物抗病基因编码氨基酸序列的核苷酸结合区(nucleotide binding site,NBS)和富含亮氨酸重复区(1eucine-rich repeat,LRR)等保守区域的特点,设计PCR简并引物,从香蕉华农7号中克隆得到1个1139bp的DNA片段。BLAST分析发现,...
根据植物抗病基因编码氨基酸序列的核苷酸结合区(nucleotide binding site,NBS)和富含亮氨酸重复区(1eucine-rich repeat,LRR)等保守区域的特点,设计PCR简并引物,从香蕉华农7号中克隆得到1个1139bp的DNA片段。BLAST分析发现,其编码的氨基酸序列与多种植物来源的NBS-LRR类抗病蛋白及抗病蛋白同源物的相似性为40%~50%,并具有NBS-LRR类抗性基因所拥有的保守结构域:P-环、激酶2a、激酶3a和疏水结构域等区段。该抗病基因相似片段可作为分子标记来筛选香蕉的抗病基因。
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关键词
香蕉
抗病基因相似序列
克隆
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职称材料
柑橘黄龙病侵染相关抗病基因同源序列的克隆鉴定与表达分析
被引量:
1
2
作者
刘婷婷
殷幼平
+3 位作者
林亚玉
贤家旭
陈世伟
王中康
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期23-28,共6页
[目的]从黄龙病耐病寄主植物cDNA中筛选抗病基因相关序列并对其进行表达分析研究。[方法]根据已克隆的植物抗性基因表达产物NBS-LRR保守区域设计简并引物,以耐HLB的柑橘属柚cDNA为模板扩增RGAs,并进行实时荧光定量PCR。[结果]通过RFLP...
[目的]从黄龙病耐病寄主植物cDNA中筛选抗病基因相关序列并对其进行表达分析研究。[方法]根据已克隆的植物抗性基因表达产物NBS-LRR保守区域设计简并引物,以耐HLB的柑橘属柚cDNA为模板扩增RGAs,并进行实时荧光定量PCR。[结果]通过RFLP分析及克隆测序共得到5个NBS类抗病基因相似序列(RGAs)片段,在GenBank上登录号为HM777043~HM777047。通过Clustalx、DNAMAN等软件分析5个RGAs及其推导的氨基酸的相似性,结果显示它们均含有典型NBS-LRR类抗性基因所具有的保守区域:P-loop、Kinase-2a、GL-PLAL,其与已克隆的烟草N、亚麻L6、拟南芥RPS2、RPS5、RPP8、RPM1等抗病基因在保守区域氨基酸水平上的相似性为19.71%~42.86%。根据得到的序列设计特异性引物,对5个RGAs在HLB侵染过程中的表达进行定量PCR,结果显示嫁接病芽接穗后的8次连续采样中5个RGA的表达受到不同程度的调控。[结论]表明5个RGAs可能与黄龙病的侵染有关。
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关键词
柚cDNA
抗病基因相似序列
定量PCR
表达分析
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职称材料
题名
香蕉中抗病基因相似序列的克隆与分析
1
作者
阮小蕾
李华平
机构
华南农业大学植物病毒研究室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期273-276,共4页
基金
国家自然科学基金(30671358)
公益性行业(农业)科研专项(nyhyzx07-029)资助
文摘
根据植物抗病基因编码氨基酸序列的核苷酸结合区(nucleotide binding site,NBS)和富含亮氨酸重复区(1eucine-rich repeat,LRR)等保守区域的特点,设计PCR简并引物,从香蕉华农7号中克隆得到1个1139bp的DNA片段。BLAST分析发现,其编码的氨基酸序列与多种植物来源的NBS-LRR类抗病蛋白及抗病蛋白同源物的相似性为40%~50%,并具有NBS-LRR类抗性基因所拥有的保守结构域:P-环、激酶2a、激酶3a和疏水结构域等区段。该抗病基因相似片段可作为分子标记来筛选香蕉的抗病基因。
关键词
香蕉
抗病基因相似序列
克隆
Keywords
banana(Musa spp. )
disease-resistant gene analogs(RGAs)
cloning
分类号
S432.23 [农业科学—植物病理学]
S668.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
柑橘黄龙病侵染相关抗病基因同源序列的克隆鉴定与表达分析
被引量:
1
2
作者
刘婷婷
殷幼平
林亚玉
贤家旭
陈世伟
王中康
机构
重庆大学生物工程学院基因研究中心
广西利添生物科技发展(合浦)有限公司
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期23-28,共6页
基金
国家自然科学基金(30971875)
文摘
[目的]从黄龙病耐病寄主植物cDNA中筛选抗病基因相关序列并对其进行表达分析研究。[方法]根据已克隆的植物抗性基因表达产物NBS-LRR保守区域设计简并引物,以耐HLB的柑橘属柚cDNA为模板扩增RGAs,并进行实时荧光定量PCR。[结果]通过RFLP分析及克隆测序共得到5个NBS类抗病基因相似序列(RGAs)片段,在GenBank上登录号为HM777043~HM777047。通过Clustalx、DNAMAN等软件分析5个RGAs及其推导的氨基酸的相似性,结果显示它们均含有典型NBS-LRR类抗性基因所具有的保守区域:P-loop、Kinase-2a、GL-PLAL,其与已克隆的烟草N、亚麻L6、拟南芥RPS2、RPS5、RPP8、RPM1等抗病基因在保守区域氨基酸水平上的相似性为19.71%~42.86%。根据得到的序列设计特异性引物,对5个RGAs在HLB侵染过程中的表达进行定量PCR,结果显示嫁接病芽接穗后的8次连续采样中5个RGA的表达受到不同程度的调控。[结论]表明5个RGAs可能与黄龙病的侵染有关。
关键词
柚cDNA
抗病基因相似序列
定量PCR
表达分析
Keywords
cDNA of Citrus maxima
resistance gene analogs(RGAs)
quantitative Real-time PCR
expression analysis
分类号
S436.661 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
香蕉中抗病基因相似序列的克隆与分析
阮小蕾
李华平
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
0
下载PDF
职称材料
2
柑橘黄龙病侵染相关抗病基因同源序列的克隆鉴定与表达分析
刘婷婷
殷幼平
林亚玉
贤家旭
陈世伟
王中康
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2012
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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