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庄河大骨鸡抗粘液病毒基因和溶菌酶基因多态性的研究
1
作者
张雪莹
任慧慧
+2 位作者
田玉民
朱弘焱
苏玉虹
《现代畜牧兽医》
2015年第11期1-5,共5页
为研究庄河大骨鸡抗粘液病毒基因(myxovirus resistant,Mx)和溶菌酶基因(1ysozyme,LYZ)的多态性,本试验从大骨鸡血液中提取DNA,PCR扩增Mx和LYZ基因后分别进行RsaⅠ和HindⅢ酶切及琼脂糖凝胶电泳。研究结果表明,所选取的262只庄河大骨鸡M...
为研究庄河大骨鸡抗粘液病毒基因(myxovirus resistant,Mx)和溶菌酶基因(1ysozyme,LYZ)的多态性,本试验从大骨鸡血液中提取DNA,PCR扩增Mx和LYZ基因后分别进行RsaⅠ和HindⅢ酶切及琼脂糖凝胶电泳。研究结果表明,所选取的262只庄河大骨鸡Mx基因片段均能得到PCR扩增产物,产物大小为101 bp,经酶切后获得GG、GA和AA 3种基因型,基因型频率分别为0.744、0.229、0.027,因此大骨鸡Mx基因具有多态性;所选取的120只大骨鸡LYZ基因片段也均能得到PCR扩增产物,产物大小为590 bp,经酶切后仅获得一种基因型GG型,因此该基因此酶切位点上无多态性。本研究为庄河大骨鸡资源保存、品种选育和开发利用提供了科学依据。
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关键词
庄河大骨鸡
抗粘液病毒基因
溶菌酶
基因
内切酶Rsa
内切酶Hind
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职称材料
MxA抗病毒蛋白的研究概况
被引量:
3
2
作者
尹彦涛
夏平安
+4 位作者
崔保安
赵云航
王建举
党占国
柴春霞
《中国畜牧兽医》
CAS
2008年第1期87-89,共3页
MxA抗病毒蛋白是新发现的由I型干扰素(IFNα/β)诱导产生的分布于细胞质中的78 kD的蛋白质,具有广谱的抗病毒作用。随着对MxA研究的深入,现已清楚,MxA蛋白对多种RNA病毒和部分DNA病毒均有抑制作用(Arloric等,1990;Ordien等,2001),而且...
MxA抗病毒蛋白是新发现的由I型干扰素(IFNα/β)诱导产生的分布于细胞质中的78 kD的蛋白质,具有广谱的抗病毒作用。随着对MxA研究的深入,现已清楚,MxA蛋白对多种RNA病毒和部分DNA病毒均有抑制作用(Arloric等,1990;Ordien等,2001),而且其水平高低可以作为机体IFN诱导状态的适宜标志。因此开展MxA蛋白研究具有很高的医学价值。
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关键词
抗粘液病毒基因
MXA蛋白
抗
病毒
机制
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职称材料
6种鸡形目和雁形目禽类Mx蛋白编码基因的适应性进化
3
作者
李慧芳
韩威
+3 位作者
朱云芬
束婧婷
陈宽维
张学余
《家畜生态学报》
2010年第3期10-14,共5页
为进一步了解禽类Mx基因(myxo-virus resistance gene)进化历程,结构与功能变异及筛选新的潜在抗性位点。根据GenBank中已报道的6种鸡形目(galliform)和雁形目(anseriform)禽类Mx基因编码序列,联配后进行最适核苷酸替代模型筛查,序列重...
为进一步了解禽类Mx基因(myxo-virus resistance gene)进化历程,结构与功能变异及筛选新的潜在抗性位点。根据GenBank中已报道的6种鸡形目(galliform)和雁形目(anseriform)禽类Mx基因编码序列,联配后进行最适核苷酸替代模型筛查,序列重组事件和核苷酸替换的饱和性检验;并采用最大似然法检测各位点承受的选择压力。AIC信息量准则检验结果表明6种鸡形目和雁形目禽类Mx基因的最优核苷酸替代模型为"GTR+G",核苷酸替换的饱和性检测结果表明序列的核苷酸替换并未饱和。单一断裂点(single break-point)和遗传算法扫描(GARD)在联配序列中发现两个断裂点,分别位于162bp和999bp处,将联配序列分为3个独立非重组部分。密码子置换模型的"位点特异模型"检测到禽类Mx基因编码序列承受了正选择作用,似然比检验(LRT)确定模型M2a和M8为正选择位点优先检测模型(P<0.05,P<0.01),分别在3部分非重组序列中检测到4个、1个和3个后验概率大于95%的正选择位点,正选择位点主要分布于禽类Mx蛋白特有的N-端结构域和Mx蛋白抗病毒作用所必须的三联GTP酶结合区,可能与Mx蛋白的抗病毒活性有关。
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关键词
禽类
抗粘液病毒基因
密码子置换模型
适用性进化
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职称材料
题名
庄河大骨鸡抗粘液病毒基因和溶菌酶基因多态性的研究
1
作者
张雪莹
任慧慧
田玉民
朱弘焱
苏玉虹
机构
辽宁医学院畜牧兽医学院
出处
《现代畜牧兽医》
2015年第11期1-5,共5页
基金
辽宁省大学生创新课题(201410160010)
辽宁省科技厅计划项目(2014209006)
+1 种基金
辽宁省自然科学基金项目(2015020765)
辽宁医学院领军人物资助项目
文摘
为研究庄河大骨鸡抗粘液病毒基因(myxovirus resistant,Mx)和溶菌酶基因(1ysozyme,LYZ)的多态性,本试验从大骨鸡血液中提取DNA,PCR扩增Mx和LYZ基因后分别进行RsaⅠ和HindⅢ酶切及琼脂糖凝胶电泳。研究结果表明,所选取的262只庄河大骨鸡Mx基因片段均能得到PCR扩增产物,产物大小为101 bp,经酶切后获得GG、GA和AA 3种基因型,基因型频率分别为0.744、0.229、0.027,因此大骨鸡Mx基因具有多态性;所选取的120只大骨鸡LYZ基因片段也均能得到PCR扩增产物,产物大小为590 bp,经酶切后仅获得一种基因型GG型,因此该基因此酶切位点上无多态性。本研究为庄河大骨鸡资源保存、品种选育和开发利用提供了科学依据。
关键词
庄河大骨鸡
抗粘液病毒基因
溶菌酶
基因
内切酶Rsa
内切酶Hind
Keywords
Zhuanghe Dagu chicken
Myxovirus resistant gene
Lysozyme gene
Enzyme Rsa Ⅰ
Enzyme HindⅢ
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
MxA抗病毒蛋白的研究概况
被引量:
3
2
作者
尹彦涛
夏平安
崔保安
赵云航
王建举
党占国
柴春霞
机构
河南农业大学牧医工程学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
2008年第1期87-89,共3页
文摘
MxA抗病毒蛋白是新发现的由I型干扰素(IFNα/β)诱导产生的分布于细胞质中的78 kD的蛋白质,具有广谱的抗病毒作用。随着对MxA研究的深入,现已清楚,MxA蛋白对多种RNA病毒和部分DNA病毒均有抑制作用(Arloric等,1990;Ordien等,2001),而且其水平高低可以作为机体IFN诱导状态的适宜标志。因此开展MxA蛋白研究具有很高的医学价值。
关键词
抗粘液病毒基因
MXA蛋白
抗
病毒
机制
分类号
Q511 [生物学—生物化学]
下载PDF
职称材料
题名
6种鸡形目和雁形目禽类Mx蛋白编码基因的适应性进化
3
作者
李慧芳
韩威
朱云芬
束婧婷
陈宽维
张学余
机构
中国农业科学院家禽研究所
出处
《家畜生态学报》
2010年第3期10-14,共5页
基金
国家863计划项目(2008AA101009-7)
国家自然科技资源条件平台(2005DKA21101)
文摘
为进一步了解禽类Mx基因(myxo-virus resistance gene)进化历程,结构与功能变异及筛选新的潜在抗性位点。根据GenBank中已报道的6种鸡形目(galliform)和雁形目(anseriform)禽类Mx基因编码序列,联配后进行最适核苷酸替代模型筛查,序列重组事件和核苷酸替换的饱和性检验;并采用最大似然法检测各位点承受的选择压力。AIC信息量准则检验结果表明6种鸡形目和雁形目禽类Mx基因的最优核苷酸替代模型为"GTR+G",核苷酸替换的饱和性检测结果表明序列的核苷酸替换并未饱和。单一断裂点(single break-point)和遗传算法扫描(GARD)在联配序列中发现两个断裂点,分别位于162bp和999bp处,将联配序列分为3个独立非重组部分。密码子置换模型的"位点特异模型"检测到禽类Mx基因编码序列承受了正选择作用,似然比检验(LRT)确定模型M2a和M8为正选择位点优先检测模型(P<0.05,P<0.01),分别在3部分非重组序列中检测到4个、1个和3个后验概率大于95%的正选择位点,正选择位点主要分布于禽类Mx蛋白特有的N-端结构域和Mx蛋白抗病毒作用所必须的三联GTP酶结合区,可能与Mx蛋白的抗病毒活性有关。
关键词
禽类
抗粘液病毒基因
密码子置换模型
适用性进化
Keywords
avians
mx gene
codon substitution models
adaptive evolution
分类号
S811.5 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
庄河大骨鸡抗粘液病毒基因和溶菌酶基因多态性的研究
张雪莹
任慧慧
田玉民
朱弘焱
苏玉虹
《现代畜牧兽医》
2015
0
下载PDF
职称材料
2
MxA抗病毒蛋白的研究概况
尹彦涛
夏平安
崔保安
赵云航
王建举
党占国
柴春霞
《中国畜牧兽医》
CAS
2008
3
下载PDF
职称材料
3
6种鸡形目和雁形目禽类Mx蛋白编码基因的适应性进化
李慧芳
韩威
朱云芬
束婧婷
陈宽维
张学余
《家畜生态学报》
2010
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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