RNA测序研究抗菌肽KT2治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的通过RNA测序(RNA-seq)研究抗菌肽KT2治疗溃疡性结肠炎(UC)小鼠的分子机制。方法用葡聚糖硫酸钠(DSS)构造小鼠UC模型,将60只小鼠随机分为对照组、DSS组、KT2组、mCRAMP组和美沙拉嗪组5组,每组12只。评估小鼠结肠炎症程度。从对照组、DSS组和KT2组中每组随机选4只小鼠的结肠组织进行测序,鉴定差异表达基因(DEGs)并进行基因富集分析,随后用定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)进行验证。结果KT2组小鼠炎症程度比mCRAMP组和美沙拉嗪组更低;KT2组与DSS组相比,共得到113个DEGs,其中下调DEGs71个,上调DEGs42个。基因富集分析显示下调DEGs主要与胶原代谢有关,上调DEGs主要与生物氧化有关,筛选出差异较大且研究甚少的DEGs进行qRT-PCR验证,发现Foxp3、FUT4、IFRD1、VEGF在DSS干预后表达下调,经抗菌肽KT2治疗后表达上调;Arg2、FXR在DSS干预后表达上调,经抗菌肽KT2治疗后表达下调。结论抗菌肽KT2治疗UC小鼠效果优于mCRAMP和美沙拉嗪;抗菌肽KT2可能通过上调Foxp3、FUT4、IFRD1、VEGF以及下调Arg2、FXR的表达治疗UC小鼠,提示上述基因可能参与抗菌肽KT2治疗UC的分子机制。