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基于BSA-seq技术挖掘糙皮侧耳抗螨候选基因
被引量:
1
1
作者
李辉平
骆昕
+6 位作者
侯子强
蒋宁
林金盛
侯立娟
徐平
马林
曲绍轩
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期1648-1656,共9页
根据前期不同糙皮侧耳菌株抗螨性差异调查结果,构建了糙皮侧耳孢子单核体群体,群体内479个菌株抗螨性呈正态分布。利用BSA-seq技术对高抗和高感混池进行SNP和InDel位点的欧氏距离关联分析,将抗螨性候选基因定位到一条染色体上,2个相邻...
根据前期不同糙皮侧耳菌株抗螨性差异调查结果,构建了糙皮侧耳孢子单核体群体,群体内479个菌株抗螨性呈正态分布。利用BSA-seq技术对高抗和高感混池进行SNP和InDel位点的欧氏距离关联分析,将抗螨性候选基因定位到一条染色体上,2个相邻候选区域总长度为1.75 Mb,内有基因605个,其中非同义突变基因353个,移码突变基因89个。经功能注释以及GO和KEGG通路富集等分析,发现26个候选基因参与了信号传导、防御过程和次级代谢相关通路,推测这些候选基因可能与糙皮侧耳抗螨性相关。
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关键词
糙皮侧耳(平菇)
抗螨候选基因
群体分离分析法
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职称材料
题名
基于BSA-seq技术挖掘糙皮侧耳抗螨候选基因
被引量:
1
1
作者
李辉平
骆昕
侯子强
蒋宁
林金盛
侯立娟
徐平
马林
曲绍轩
机构
江苏省农业科学院蔬菜研究所
江苏大学生命科学学院
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022年第6期1648-1656,共9页
基金
国家自然科学青年基金项目(32001911)
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-20)。
文摘
根据前期不同糙皮侧耳菌株抗螨性差异调查结果,构建了糙皮侧耳孢子单核体群体,群体内479个菌株抗螨性呈正态分布。利用BSA-seq技术对高抗和高感混池进行SNP和InDel位点的欧氏距离关联分析,将抗螨性候选基因定位到一条染色体上,2个相邻候选区域总长度为1.75 Mb,内有基因605个,其中非同义突变基因353个,移码突变基因89个。经功能注释以及GO和KEGG通路富集等分析,发现26个候选基因参与了信号传导、防御过程和次级代谢相关通路,推测这些候选基因可能与糙皮侧耳抗螨性相关。
关键词
糙皮侧耳(平菇)
抗螨候选基因
群体分离分析法
Keywords
Pleurotus ostreatus(oyster mushroom)
candidate anti-mite genes
bulked segregant analysis
分类号
S646.141 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于BSA-seq技术挖掘糙皮侧耳抗螨候选基因
李辉平
骆昕
侯子强
蒋宁
林金盛
侯立娟
徐平
马林
曲绍轩
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2022
1
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参考文献
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