拓扑相关蠕虫仿真分析

从蠕虫传播的漏洞主机发现、代码传播以及代码启动3个方面提出了一个完整的数据包级拓扑相关蠕虫仿真模型,设计了基于有向图的SmallWorld拓扑结构生成算法,并通过选择性抽象在NS2上实现了一个完整的数据包级拓扑相关蠕虫仿真系统.最后,通过该仿真系统实验分析了逻辑拓扑结构和蠕虫代码启动方式对蠕虫传播的影响.仿真实验结果表明,该仿真系统可以为拓扑相关蠕虫研究提供重要的支持.

考虑拓扑相关热载荷的散热结构多相材料拓扑优化设计

针对热传导拓扑优化设计过程中拓扑相关热载荷问题,以结构散热弱度为目标函数,体积分数为约束条件,构建了多相材料散热结构拓扑优化数学模型。采用一种基于变密度理论的有序固体各向同性微结构材料惩罚模型法构建多相材料插值模型,分别进行拓扑相关热载荷与拓扑独立热载荷作用下的灵敏度分析,借助优化准则法推导设计变量的迭代格式,引入偏微分方程过滤方法抑制优化过程中出现的数值不稳定现象。通过2D与3D数值模型计算,获得考虑拓扑相关热载荷、拓扑独立热载荷以及耦合拓扑独立/相关热载荷在不同边界条件下对拓扑优化结果的影响规律。结果证明了所提方法在解决拓扑相关热载荷作用下散热结构多相材料拓扑优化设计问题方面的有效性与可行性。

拓扑相关热载荷作用下稳态热传导结构拓扑优化

针对热源随结构形式变化的稳态结构热传导拓扑优化问题,提出了以温度方差为目标函数来评价设计域内温度分布的均匀程度的方法,同时考虑结构内热源引起的热载荷的拓扑相关性,以高热导率材料的体积用量为约束建立了拓扑优化模型。采用正则化的Heaviside函数建立了材料插值模型,获得了清晰的0/1拓扑。数值算例验证了所提出的目标函数以及采用的求解方法的合理性与有效性。

拓扑相关荷载作用下结构拓扑优化的水平集方法

发展了一种利用水平集演化技术求解拓扑相关荷载作用下结构拓扑优化问题的数值方法。通过引入水平集函数,我们以隐含的方式对结构的拓扑和形状作了描述,从而把拓扑优化问题转化为了寻求最优水平集函数的数学规划问题。利用基于连续体概念的灵敏度分析技术,构造了用于驱动水平集演化的速度场。由于结构的边界可以用零水平集加以描述,因此利用适当的数学变换,我们可以方便地处理施加在结构上的拓扑相关荷载,这样就避免了以往算法中繁复的边界提取工作以及为了处理拓扑相关荷载所采取的特殊技巧。文末的数值算例表明了提出的优化方法在处理此类问题时所具有的独到的优越性。

一种QoS覆盖网络拓扑相关的方案

在覆盖网络中,物理网络和覆盖网络的拓扑是经常失配的。已提出的解决方案没有考虑到日渐增多的覆盖网络QoS需求。提出一种考虑覆盖网络QoS需求的拓扑相关的解决方案,该方案主要是交换节点的标号,保持网络不变。可以有效解决QoS覆盖网络拓扑相关的问题。

一种QoS覆盖网络拓扑相关的方案

在覆盖网络中,物理网络和覆盖网络的拓扑是经常失配的。为了解决这个问题,已经提出了很多的解决方案,但是这些方案没有考虑到日渐增多的覆盖网络QoS需求。本文将提出一种考虑了覆盖网络QoS需求的拓扑相关的解决方案,该方案主要是交换节点的标号,保持网络不变。可以有效解决QoS覆盖网络拓扑相关的问题。

基于拓扑相关性的改进型DV-Hop算法

在拓扑不规则的传感器网络中,传统的DV-Hop算法在平均跳距计算上不合理,使得节点的定位误差很大,针对这一问题,提出了一种基于拓扑相关性的改进算法。该算法的主要原理是根据网络拓扑相关性和跳数加权计算平均跳距,并对多个估算结果进行面积加权,有效地提高了定位精度。仿真结果表明,与传统DV-Hop相比,该算法在不增加额外硬件支持的前提下,更适合于随机分布网络中的节点定位。

饱和烷烃的热力学性质与分子结构的拓扑相关性研究

根据拓扑学原理 ,运用图论方法 ,以计算机为工具 ,对饱和烷烃的分子结构信息进行分析处理 ,定义了一个表征分子结构信息的内聚力指数 F ,并和拓扑指数 W,P一道 ,应用于微观结构与物性关系的研究之中 ,与饱和烷烃的热力学性质进行关联拟合 ,给出了相应的定量关系式 .

取代苯甲酸的生物降解性与拓扑相关性研究

基于表征生物降解性的原子点价(gi)构建新的自相关拓扑指数(mG),其中的1G不仅对取代芳烃呈现良好的结构选择性,而且与10种取代苯甲酸一级生物降解速率常数(-lgK)显著相关:-lgK=0.591 6+0.005 01G,R2=0.966 4。引入0G:-lgK=0.773 8-0.008 30G+0.006 31G,R2=0.977 5。结果表明,该方法具有物理意义明确,计算简单等优点。

基于密度聚类的染色质拓扑相关结构域识别方法

高通量染色质构象捕获(Hi-C)技术的快速发展为染色质结构分析提供了丰富的基因组位点间交互作用数据,但目前基于Hi-C数据的已有拓扑相关结构域(TAD)识别方法存在准确率低、参数敏感等问题。在此背景下,本文设计并实现了一种基于空间密度聚类的TAD识别方法。该方法首先对原始Hi-C数据进行预处理,得到归一化后的Hi-C接触矩阵数据;然后计算位点之间的距离矩阵,基于位点的核心距离和可达距离生成可达性图,并提取聚类簇;最后基于聚类结果和TAD提取边界。该方法能够识别出内聚性更高的TAD结构,且TAD边界处富集了更多的ChIP-seq因子。实验结果表明,本文方法在TAD识别中更准确,更具有现实意义。

有机化学品的自相关拓扑指数与生物毒性的定量关系

针对目前化学品生物毒性评价和预测中存在的问题，采用以范德华体积（Ｖ）和电负性（Ｅ）为结构参数的自相关拓扑指数法，建立了５４种有机化学品的分子结构与青锵鱼急性毒性（４８ｈＬＣ５０）的定量构效关系数学模型。对模型采用的范德华体积进行了修正，使其更能准确地描述分子的结构信息，经逐步回归分析得到的线性关系良好的定量构效关系方程ｌｏｇＬＣ５０＝０．０３＋０．３２Ｖ（１）＋１３．３３Ｅ（０）－６．８３Ｅ（２）－４．４８Ｅ（３）（Ｒ＝０．９５１３，Ｆ＝２４５．１），有可能应用于不同结构化学品的生物毒性预测。

取代芳烃的自相关拓扑与其生物活性、性质的关系研究

本文提出表征原子生物活性的特证值(A),由A_i建构自相关拓扑指数(~tF)其中1阶指数~1F与氯代苯的8种理化性质的相关性优于Kier的~1X^v.~1F与17种取代芳烃lgKow的相关系数为0.9949,计算值与实验值非常吻合.取代芳烃对水生生物的急性毒性与~1F的线性回归方程如下:发光菌:-lgEC_(50)2.677+0.015~1G,N=30,r=0.943,s=0.205呆鲦鱼:-lgLC_(50)=2.450+0.019~1F,N=20,r=0.936,s=0.

自相关拓扑指数与有机物生物活性的定量关系

采用自相关拓扑指数作为分子描述符，研究有机污染物的遗传毒性和急性毒性与分子结构的定量关系，建立了良好的构效关系方程。

有机化学品点价自相关拓扑指数与生物降解性的定量关系

采用分子拓扑学方法 ,以分子点价计算为基础 ,开发出新的自相关拓扑指数V和E .指数V和E分别用来表征有机化学品的分子体积和电负性 ,它们与氯代芳香类化合物分子的生物可降解性 (以生物降解速率常数K表示 )具有如下定量关系 :K =0 .0 44V1- 0 .0 94V5+ 4.483E0 - 4.2 0 1E2 - 0 .811(R =0 .990 2 ,S =0 .0 6 6 88,F =88.0 7) .进一步讨论了点价自相关拓扑指数对氯代芳香化合物生物降解性的影响 .

用结构信息自相关拓扑指数预测环烷烃的折光指数

原子特征值(βi)被定义为βi=(ni-1)(Xi/Xc)0.5·(ni—1)·mi-(mi/mc)0.5·hi。由βi构建结构信息自相关拓扑指数tF的公式为:tF=Σ(βi·βj)0.5。它们与74种环烷烃的折光指数(nD)的二元回归方程为:nD=-8.09900F-1.5+5.75371F-1.5+1.4741。环烷烃折光指数的计算值与实验值一致,平均误差为0.46%。

取代芳烃对绿藻、斜生栅列藻急性毒性的自相关拓扑指数

本文提出新的原子生物活性值 (ai) ,由其建构自相关拓扑指数 ( mL) . 1 6种氯代芳烃对绿藻的急性毒性 ( -lgEC50 )与其0 L ,1L的回归方程为 :-lgEC50 =0 6 1 99+2 6 1 6 3× 1 0 - 6 1L2 5+ 0 0 0 92 0 L ,r=0 936 3. 1 8种苯酚、苯胺类化合物对斜生栅列藻的急性毒性 ( -lgEC50 )可以表示为 :-lgEC50 =1 1 374 + 0 1 4 4 71L0 6+ 0 0 0 2 70 L,r=0 95 35 .用Jackknife法检验 ,以上模型具有总体稳健性 .

基于相关拓扑势的社团发现算法

针对传统算法社团划分精度较低以及模块度函数分辨率低的问题,提出一种基于相关拓扑势的社团发现算法,简称BITP算法。该算法考虑节点的相关性因素,引入相关拓扑势来衡量节点的影响力,寻找出其中的极大势值点,采用标签传播的思想对社团的规模进行控制。在人工合成网络和真实网络上,与多种算法进行实验对比,结果表明该算法多次运行结果相对稳定且社团划分精度较高。算法时间复杂度为O(n),且不需要先验知识,更适合大规模复杂网络上的社团结构挖掘。

胺、醇、醚类化合物电离能的自相关拓扑研究

原子的染色序数 fi 定义为 :fi=gi·xi,式中 gi 为原子i在分子中的序数 ,xi 为其染色系数 .基于fi 建立改进的原子序数自相关拓扑指数mF ,其中的1F对烷烃及其衍生物具有良好的结构选择性 .使用第一电离能 (Ip)与0 F ,1F的数量关系模型对 32种脂肪族胺、醇、醚进行估算、预测 。

一种新的自相关拓扑指数及其互补指数应用于不饱和链烃物理性质的QSPR研究

依据系统命名法的编号原则及不饱和链烃的结构特证,建立了原子的染色序数(ti),并在邻矩阵基础上由ti构建原子染色序数自相关指数(mR)及互补指数mR′,其中0R1、R、互补指数0R′1、R′,C原子个数(N)与炔烃的沸点、烯烃的热力学性质(标准生成焓、标准熵、标准熵和标准生成自由能)有良好的相关性,相关系数分别为0.999 2,0.999 4,0.999 4和0.994 1.该模型用于预测不饱和链烃的物理性质,计算简便,结果准确.

食品香味物质自相关拓扑指数与理化性质的定量关系

计算了食品中香味物质———酯类与酮类的自相关拓扑指数 ,分别与色谱保留值、阈值进行逐步回归分析 ,得出相应的QSPR方程。结果表明自相关拓扑指数与色谱保留值、阈值之间存在较好的线性关系。