拟南芥TIR1与生长素IAA相互作用的分子对接及分子动力学研究

基于最新得到的拟南芥运输抑制剂响应蛋白质1(TIR1)与吲哚乙酸(IAA)复合物的晶体结构,使用分子对接方法和分子动力学方法对TIR1与生长素IAA相互作用的方式进行了研究.分子对接结果表明,通过逐级考察辅酶InsP6和中心水分子的影响,发现辅酶InsP6和中心水分子对生长素IAA正确结合到活性位点有重要作用.分子动力学结果表明,复合物体系在整个模拟过程中较为稳定,2个水分子相继作为中心水分子与生长素IAA形成了稳定的氢键作用,IAA与活性位点处残基的相互作用与晶体结构相比略有差异.